MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 3866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009925	ATTAA	2	10	580	589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009925	GGTTA	2	10	1366	1375	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009925	ATAGG	2	10	2318	2327	40 %	20 %	40 %	0 %	158333234
4	NC_009925	GCAGT	2	10	11222	11231	20 %	20 %	40 %	20 %	158333244
5	NC_009925	GTAAA	2	10	12123	12132	60 %	20 %	20 %	0 %	158333245
6	NC_009925	CCAAA	2	10	12516	12525	60 %	0 %	0 %	40 %	158333245
7	NC_009925	ACCAC	2	10	15843	15852	40 %	0 %	0 %	60 %	158333247
8	NC_009925	GAGAA	2	10	16174	16183	60 %	0 %	40 %	0 %	158333247
9	NC_009925	GACCA	2	10	18700	18709	40 %	0 %	20 %	40 %	158333248
10	NC_009925	GAACA	2	10	19278	19287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009925	ATCCC	2	10	21970	21979	20 %	20 %	0 %	60 %	158333252
12	NC_009925	ACCCG	2	10	22874	22883	20 %	0 %	20 %	60 %	158333253
13	NC_009925	GCTGA	2	10	23784	23793	20 %	20 %	40 %	20 %	158333253
14	NC_009925	TTTGA	2	10	23850	23859	20 %	60 %	20 %	0 %	158333253
15	NC_009925	CTGGA	2	10	24155	24164	20 %	20 %	40 %	20 %	158333253
16	NC_009925	TTCGC	2	10	25820	25829	0 %	40 %	20 %	40 %	158333254
17	NC_009925	TTTGT	2	10	28714	28723	0 %	80 %	20 %	0 %	158333256
18	NC_009925	AGGAG	2	10	30570	30579	40 %	0 %	60 %	0 %	158333258
19	NC_009925	AATGG	2	10	31265	31274	40 %	20 %	40 %	0 %	158333259
20	NC_009925	CCGCC	2	10	32455	32464	0 %	0 %	20 %	80 %	158333260
21	NC_009925	CGGTT	2	10	36347	36356	0 %	40 %	40 %	20 %	158333264
22	NC_009925	CCAGA	2	10	36637	36646	40 %	0 %	20 %	40 %	158333264
23	NC_009925	GGAAA	2	10	36971	36980	60 %	0 %	40 %	0 %	158333264
24	NC_009925	CAACT	2	10	38861	38870	40 %	20 %	0 %	40 %	158333267
25	NC_009925	TGAGT	2	10	40364	40373	20 %	40 %	40 %	0 %	158333268
26	NC_009925	CAGGT	2	10	40374	40383	20 %	20 %	40 %	20 %	158333268
27	NC_009925	GATGT	2	10	41897	41906	20 %	40 %	40 %	0 %	158333270
28	NC_009925	GAACA	2	10	43569	43578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009925	AGGGA	2	10	46021	46030	40 %	0 %	60 %	0 %	158333276
30	NC_009925	CAAAA	2	10	47367	47376	80 %	0 %	0 %	20 %	158333278
31	NC_009925	GCTCA	2	10	49507	49516	20 %	20 %	20 %	40 %	158333278
32	NC_009925	TTGAA	2	10	49592	49601	40 %	40 %	20 %	0 %	158333278
33	NC_009925	ATTCG	2	10	49893	49902	20 %	40 %	20 %	20 %	158333279
34	NC_009925	CCACA	2	10	51668	51677	40 %	0 %	0 %	60 %	158333281
35	NC_009925	GTTTT	2	10	51767	51776	0 %	80 %	20 %	0 %	158333281
36	NC_009925	TCCGT	2	10	54462	54471	0 %	40 %	20 %	40 %	158333284
37	NC_009925	AAATA	2	10	56602	56611	80 %	20 %	0 %	0 %	158333287
38	NC_009925	TGGTC	2	10	61107	61116	0 %	40 %	40 %	20 %	158333294
39	NC_009925	TTTTC	2	10	63325	63334	0 %	80 %	0 %	20 %	158333297
40	NC_009925	AACTC	2	10	64305	64314	40 %	20 %	0 %	40 %	158333297
41	NC_009925	CCAAC	2	10	69279	69288	40 %	0 %	0 %	60 %	158333298
42	NC_009925	TCTTT	2	10	69299	69308	0 %	80 %	0 %	20 %	158333298
43	NC_009925	CTGAT	2	10	70544	70553	20 %	40 %	20 %	20 %	158333299
44	NC_009925	CTTTG	2	10	72608	72617	0 %	60 %	20 %	20 %	158333301
45	NC_009925	ACCAA	2	10	72650	72659	60 %	0 %	0 %	40 %	158333301
46	NC_009925	AAGAT	2	10	73246	73255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009925	CGAAC	2	10	74257	74266	40 %	0 %	20 %	40 %	158333303
48	NC_009925	GGTCA	2	10	76410	76419	20 %	20 %	40 %	20 %	158333304
49	NC_009925	TCCAG	2	10	79354	79363	20 %	20 %	20 %	40 %	158333304
50	NC_009925	TTGAT	2	10	85963	85972	20 %	60 %	20 %	0 %	158333310
51	NC_009925	AGCCA	2	10	88066	88075	40 %	0 %	20 %	40 %	158333312
52	NC_009925	GTTCC	2	10	88645	88654	0 %	40 %	20 %	40 %	158333313
53	NC_009925	AACAG	2	10	90414	90423	60 %	0 %	20 %	20 %	158333314
54	NC_009925	CCAGC	2	10	92531	92540	20 %	0 %	20 %	60 %	158333316
55	NC_009925	TGGAT	2	10	93437	93446	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009925	GCTAC	2	10	94348	94357	20 %	20 %	20 %	40 %	158333318
57	NC_009925	CGAAG	2	10	95501	95510	40 %	0 %	40 %	20 %	158333319
58	NC_009925	ACCAC	2	10	101931	101940	40 %	0 %	0 %	60 %	158333329
59	NC_009925	GCTTG	2	10	102285	102294	0 %	40 %	40 %	20 %	158333329
60	NC_009925	CAACA	2	10	103001	103010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009925	TTCGT	2	10	103165	103174	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009925	TCAAA	2	10	103871	103880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009925	TAAAT	2	10	103902	103911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009925	GACCA	2	10	105541	105550	40 %	0 %	20 %	40 %	158333332
65	NC_009925	CTCAA	2	10	106215	106224	40 %	20 %	0 %	40 %	158333334
66	NC_009925	AATCC	2	10	106598	106607	40 %	20 %	0 %	40 %	158333334
67	NC_009925	GATGT	2	10	107957	107966	20 %	40 %	40 %	0 %	158333334
68	NC_009925	GCCAT	2	10	108786	108795	20 %	20 %	20 %	40 %	158333334
69	NC_009925	CATAC	2	10	109470	109479	40 %	20 %	0 %	40 %	158333335
70	NC_009925	CCACA	2	10	115630	115639	40 %	0 %	0 %	60 %	158333337
71	NC_009925	CCCTT	2	10	116564	116573	0 %	40 %	0 %	60 %	158333338
72	NC_009925	TAGAG	2	10	120787	120796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009925	CGATT	2	10	122488	122497	20 %	40 %	20 %	20 %	158333346
74	NC_009925	TCTCT	2	10	123171	123180	0 %	60 %	0 %	40 %	158333347
75	NC_009925	AGGGA	2	10	124460	124469	40 %	0 %	60 %	0 %	158333349
76	NC_009925	GCCTT	2	10	126849	126858	0 %	40 %	20 %	40 %	158333354
77	NC_009925	TGATG	2	10	130033	130042	20 %	40 %	40 %	0 %	158333358
78	NC_009925	GTTCA	2	10	131232	131241	20 %	40 %	20 %	20 %	158333359
79	NC_009925	TCAAA	2	10	131582	131591	60 %	20 %	0 %	20 %	158333359
80	NC_009925	ATTCA	2	10	132159	132168	40 %	40 %	0 %	20 %	158333360
81	NC_009925	GGTTT	2	10	132312	132321	0 %	60 %	40 %	0 %	158333360
82	NC_009925	CGAGG	2	10	133436	133445	20 %	0 %	60 %	20 %	158333362
83	NC_009925	CGAGT	2	10	134745	134754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009925	CCAAG	2	10	137383	137392	40 %	0 %	20 %	40 %	158333368
85	NC_009925	CTGTA	2	10	141186	141195	20 %	40 %	20 %	20 %	158333370
86	NC_009925	CCCGG	2	10	143372	143381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_009925	TGGTT	2	10	145722	145731	0 %	60 %	40 %	0 %	158333374
88	NC_009925	TGGCT	2	10	147161	147170	0 %	40 %	40 %	20 %	158333376
89	NC_009925	TGGTC	2	10	154346	154355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009925	TTGAG	2	10	156169	156178	20 %	40 %	40 %	0 %	158333386
91	NC_009925	GGTAA	2	10	156647	156656	40 %	20 %	40 %	0 %	158333386
92	NC_009925	GTCTT	2	10	159543	159552	0 %	60 %	20 %	20 %	158333388
93	NC_009925	ACACC	2	10	160165	160174	40 %	0 %	0 %	60 %	158333389
94	NC_009925	TGCTC	2	10	160453	160462	0 %	40 %	20 %	40 %	158333389
95	NC_009925	CCAGT	2	10	165746	165755	20 %	20 %	20 %	40 %	158333393
96	NC_009925	TACAG	2	10	167347	167356	40 %	20 %	20 %	20 %	158333393
97	NC_009925	CTTGG	2	10	168528	168537	0 %	40 %	40 %	20 %	158333395
98	NC_009925	GGGAG	2	10	169246	169255	20 %	0 %	80 %	0 %	158333396
99	NC_009925	AACTG	2	10	171054	171063	40 %	20 %	20 %	20 %	158333399
100	NC_009925	GAAGA	2	10	171766	171775	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009925	CTGGA	2	10	175221	175230	20 %	20 %	40 %	20 %	158333400
102	NC_009925	GCAGT	2	10	179430	179439	20 %	20 %	40 %	20 %	158333403
103	NC_009925	TCTCT	2	10	182703	182712	0 %	60 %	0 %	40 %	158333406
104	NC_009925	CCATA	2	10	183139	183148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009925	AGTTG	2	10	184906	184915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009925	TTGGG	2	10	186332	186341	0 %	40 %	60 %	0 %	158333410
107	NC_009925	GGTTT	2	10	187078	187087	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009925	TATTT	2	10	187288	187297	20 %	80 %	0 %	0 %	158333411
109	NC_009925	ATTTT	2	10	188945	188954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009925	ATTTG	2	10	189918	189927	20 %	60 %	20 %	0 %	158333415
111	NC_009925	TTGAT	2	10	191082	191091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009925	GCCAT	2	10	193291	193300	20 %	20 %	20 %	40 %	158333421
113	NC_009925	TGATG	2	10	193631	193640	20 %	40 %	40 %	0 %	158333421
114	NC_009925	TATTT	2	10	199411	199420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009925	TTGCA	2	10	203073	203082	20 %	40 %	20 %	20 %	158333431
116	NC_009925	ACGTT	2	10	203777	203786	20 %	40 %	20 %	20 %	158333432
117	NC_009925	AGAGA	2	10	204812	204821	60 %	0 %	40 %	0 %	158333433
118	NC_009925	TTGCT	2	10	205410	205419	0 %	60 %	20 %	20 %	158333434
119	NC_009925	TAGGG	2	10	206384	206393	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009925	GCTCA	2	10	209201	209210	20 %	20 %	20 %	40 %	158333439
121	NC_009925	CTTGG	2	10	211404	211413	0 %	40 %	40 %	20 %	158333443
122	NC_009925	CCCAA	2	10	220090	220099	40 %	0 %	0 %	60 %	158333451
123	NC_009925	CGGGA	2	10	221616	221625	20 %	0 %	60 %	20 %	158333452
124	NC_009925	AATCA	2	10	222798	222807	60 %	20 %	0 %	20 %	158333452
125	NC_009925	ATTTA	2	10	225360	225369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009925	CGGTT	2	10	226389	226398	0 %	40 %	40 %	20 %	158333455
127	NC_009925	ATCCT	2	10	226472	226481	20 %	40 %	0 %	40 %	158333455
128	NC_009925	TCCTC	2	10	227068	227077	0 %	40 %	0 %	60 %	158333456
129	NC_009925	AGCGA	2	10	229007	229016	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009925	GCAAT	2	10	230664	230673	40 %	20 %	20 %	20 %	158333461
131	NC_009925	CTTGG	2	10	231173	231182	0 %	40 %	40 %	20 %	158333462
132	NC_009925	GATTT	2	10	231814	231823	20 %	60 %	20 %	0 %	158333464
133	NC_009925	ATTTT	2	10	232113	232122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009925	CCAAA	2	10	233343	233352	60 %	0 %	0 %	40 %	158333466
135	NC_009925	AGACA	2	10	233465	233474	60 %	0 %	20 %	20 %	158333466
136	NC_009925	AGATT	2	10	237220	237229	40 %	40 %	20 %	0 %	158333467
137	NC_009925	CGCAC	2	10	238567	238576	20 %	0 %	20 %	60 %	158333467
138	NC_009925	AGTCT	2	10	241038	241047	20 %	40 %	20 %	20 %	158333472
139	NC_009925	CTTGT	2	10	244168	244177	0 %	60 %	20 %	20 %	158333476
140	NC_009925	GTTTG	2	10	244686	244695	0 %	60 %	40 %	0 %	158333476
141	NC_009925	ATCCC	2	10	244746	244755	20 %	20 %	0 %	60 %	158333476
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145	NC_009925	GCCCT	2	10	247285	247294	0 %	20 %	20 %	60 %	158333478
146	NC_009925	TATTG	2	10	251232	251241	20 %	60 %	20 %	0 %	158333482
147	NC_009925	GGTCA	2	10	251383	251392	20 %	20 %	40 %	20 %	158333483
148	NC_009925	CTGGG	2	10	251932	251941	0 %	20 %	60 %	20 %	158333484
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151	NC_009925	TTGAT	2	10	255139	255148	20 %	60 %	20 %	0 %	158333485
152	NC_009925	GTTGA	2	10	256778	256787	20 %	40 %	40 %	0 %	158333486
153	NC_009925	ATCAA	2	10	258069	258078	60 %	20 %	0 %	20 %	158333487
154	NC_009925	CCAGT	2	10	258325	258334	20 %	20 %	20 %	40 %	158333487
155	NC_009925	TTAGC	2	10	260170	260179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009925	GTTTT	2	10	260520	260529	0 %	80 %	20 %	0 %	158333490
157	NC_009925	AAATA	2	10	260911	260920	80 %	20 %	0 %	0 %	158333490
158	NC_009925	TCCTG	2	10	261743	261752	0 %	40 %	20 %	40 %	158333490
159	NC_009925	AACCC	2	10	262606	262615	40 %	0 %	0 %	60 %	158333491
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162	NC_009925	AACCA	2	10	268430	268439	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_009925	GCCTG	2	10	272930	272939	0 %	20 %	40 %	40 %	158333502
164	NC_009925	AACAT	2	10	272979	272988	60 %	20 %	0 %	20 %	158333502
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169	NC_009925	TGTTT	2	10	278032	278041	0 %	80 %	20 %	0 %	158333507
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171	NC_009925	GCCAT	2	10	280390	280399	20 %	20 %	20 %	40 %	158333509
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175	NC_009925	CTTTT	2	10	292883	292892	0 %	80 %	0 %	20 %	158333520
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179	NC_009925	TGCTT	2	10	301496	301505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_009925	GCTCC	2	10	303781	303790	0 %	20 %	20 %	60 %	158333532
183	NC_009925	TCCAT	2	10	303944	303953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_009925	GAGTG	2	10	304649	304658	20 %	20 %	60 %	0 %	158333533
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195	NC_009925	TTCCA	2	10	319382	319391	20 %	40 %	0 %	40 %	158333548
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197	NC_009925	GGGGT	2	10	326129	326138	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009925	CTATC	2	10	330030	330039	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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232	NC_009925	TATTT	2	10	359466	359475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_009925	CCCAT	2	10	364739	364748	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
237	NC_009925	TCCAT	2	10	365839	365848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
238	NC_009925	TCTAA	2	10	367204	367213	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
239	NC_009925	GATTA	2	10	367250	367259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_009925	CAAAC	2	10	367290	367299	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
241	NC_009925	AAACA	2	10	367413	367422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_009925	CTTGA	2	10	368023	368032	20 %	40 %	20 %	20 %	158333594
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248	NC_009925	TCCAG	2	10	373798	373807	20 %	20 %	20 %	40 %	158333600
249	NC_009925	GCCAC	2	10	378262	378271	20 %	0 %	20 %	60 %	158333603
250	NC_009925	CTTCC	2	10	381363	381372	0 %	40 %	0 %	60 %	158333606
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252	NC_009925	CTTTT	2	10	384132	384141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_009925	ATCCT	2	10	385874	385883	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_009925	CAATT	2	10	387595	387604	40 %	40 %	0 %	20 %	158333612
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258	NC_009925	TCAGC	2	10	398799	398808	20 %	20 %	20 %	40 %	158333622
259	NC_009925	GGGTC	2	10	399086	399095	0 %	20 %	60 %	20 %	158333622
260	NC_009925	GAGCC	2	10	399712	399721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
261	NC_009925	CCAGC	2	10	400676	400685	20 %	0 %	20 %	60 %	158333624
262	NC_009925	TGATC	2	10	402025	402034	20 %	40 %	20 %	20 %	158333626
263	NC_009925	TCCAG	2	10	402066	402075	20 %	20 %	20 %	40 %	158333626
264	NC_009925	TCAAC	2	10	402670	402679	40 %	20 %	0 %	40 %	158333627
265	NC_009925	AAAAT	2	10	407777	407786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009925	AGATC	2	10	409425	409434	40 %	20 %	20 %	20 %	158333633
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