MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009925	ATTAA	2	10	580	589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009925	GGTTA	2	10	1366	1375	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009925	GAACA	2	10	19278	19287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009925	GAACA	2	10	43569	43578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009925	AAGAT	2	10	73246	73255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009925	TGGAT	2	10	93437	93446	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009925	CAACA	2	10	103001	103010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009925	TTCGT	2	10	103165	103174	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009925	TCAAA	2	10	103871	103880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009925	TAAAT	2	10	103902	103911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009925	TAGAG	2	10	120787	120796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009925	CGAGT	2	10	134745	134754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009925	CCCGG	2	10	143372	143381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009925	TGGTC	2	10	154346	154355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009925	GAAGA	2	10	171766	171775	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009925	CCATA	2	10	183139	183148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009925	AGTTG	2	10	184906	184915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009925	GGTTT	2	10	187078	187087	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009925	ATTTT	2	10	188945	188954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009925	TTGAT	2	10	191082	191091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009925	TATTT	2	10	199411	199420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009925	TAGGG	2	10	206384	206393	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009925	ATTTA	2	10	225360	225369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009925	AGCGA	2	10	229007	229016	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009925	ATTTT	2	10	232113	232122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009925	TTAGC	2	10	260170	260179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009925	AACCA	2	10	268430	268439	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009925	TGCTT	2	10	301496	301505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009925	TCCAT	2	10	303944	303953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009925	CGTGT	2	10	317984	317993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009925	AAAAG	2	10	318750	318759	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009925	CAACG	2	10	320436	320445	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009925	GGGGT	2	10	326129	326138	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009925	CTATC	2	10	330030	330039	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009925	TCAGA	2	10	330154	330163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009925	AGTTT	2	10	331920	331929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009925	TAGGT	2	10	331989	331998	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009925	TAAAG	2	10	338298	338307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009925	ACTTA	2	10	338934	338943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009925	CTAAT	2	10	340901	340910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009925	TTTCT	2	10	342112	342121	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009925	AAATC	2	10	344913	344922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009925	TTAAA	2	10	345402	345411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009925	ATTTA	2	10	359076	359085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009925	AAAGA	2	10	359227	359236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009925	TATTT	2	10	359466	359475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009925	CCCAT	2	10	364739	364748	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_009925	TCCAT	2	10	365839	365848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009925	TCTAA	2	10	367204	367213	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009925	GATTA	2	10	367250	367259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009925	CAAAC	2	10	367290	367299	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009925	AAACA	2	10	367413	367422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009925	TCCAA	2	10	370077	370086	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009925	CTTTT	2	10	384132	384141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009925	ATCCT	2	10	385874	385883	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009925	GAGCC	2	10	399712	399721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009925	AAAAT	2	10	407777	407786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009925	CCCAT	2	10	434922	434931	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009925	AGATG	2	10	441137	441146	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009925	TGCCT	2	10	460347	460356	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009925	CAATG	2	10	466277	466286	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009925	GAGTT	2	10	470630	470639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009925	TGTCT	2	10	480784	480793	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009925	AATTT	2	10	488718	488727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009925	TCCTT	2	10	491030	491039	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009925	TTGAA	2	10	498130	498139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009925	CAGCA	2	10	501580	501589	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009925	TTCAA	2	10	502675	502684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009925	ATTGA	2	10	520787	520796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009925	GACAA	2	10	526696	526705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009925	TAAAA	2	10	544419	544428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009925	TTGGA	2	10	556285	556294	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009925	TGGTT	2	10	556330	556339	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009925	TACTC	2	10	558186	558195	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009925	TATCG	2	10	558374	558383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009925	GGGCA	2	10	565096	565105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009925	TATGG	2	10	583868	583877	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009925	TTAAT	2	10	611293	611302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009925	AAAAT	2	10	620689	620698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009925	CACGG	2	10	623816	623825	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009925	AAGAT	2	10	629656	629665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009925	ATACG	2	10	652004	652013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009925	GACTT	2	10	656408	656417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009925	GGAGA	2	10	656465	656474	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009925	ATTGA	2	10	656604	656613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009925	TCAGT	2	10	657969	657978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009925	GAAAA	2	10	671767	671776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009925	CTTGG	2	10	672146	672155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009925	TTGGG	2	10	679858	679867	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009925	GATGG	2	10	719393	719402	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009925	ACCTG	2	10	722440	722449	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009925	ATTCA	2	10	758572	758581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009925	TTCTT	2	10	762013	762022	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009925	AATGC	2	10	767242	767251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009925	ATTCT	2	10	774183	774192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009925	GTGTT	2	10	799724	799733	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009925	TATTT	2	10	816450	816459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009925	CTCTC	2	10	832627	832636	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_009925	AAATT	2	10	848053	848062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009925	GAGAG	2	10	855623	855632	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009925	CCAAA	2	10	861621	861630	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009925	TCTGA	2	10	863407	863416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009925	CACCG	2	10	863875	863884	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_009925	TAGAA	2	10	869543	869552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009925	AAGAG	2	10	875138	875147	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009925	TGACC	2	10	890186	890195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009925	TAAGT	2	10	903159	903168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009925	ACACC	2	10	912090	912099	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_009925	ATGGG	2	10	944794	944803	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009925	GTTTA	2	10	962108	962117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009925	TTGCT	2	10	991718	991727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009925	GGCTT	2	10	1007687	1007696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009925	CTTTT	2	10	1010790	1010799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009925	GCAAA	2	10	1013424	1013433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009925	ATTTT	2	10	1015287	1015296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009925	GCTTA	2	10	1025862	1025871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009925	CAACT	2	10	1025943	1025952	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009925	CTAGG	2	10	1029883	1029892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009925	ATTAA	2	10	1036589	1036598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009925	TCAAT	2	10	1050134	1050143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009925	GATTG	2	10	1053519	1053528	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009925	TCAAA	2	10	1061660	1061669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009925	ATTTA	2	10	1067630	1067639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009925	TTCAG	2	10	1097898	1097907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009925	CCTTT	2	10	1105444	1105453	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009925	CAGCG	2	10	1107401	1107410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009925	GCCAA	2	10	1113848	1113857	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009925	TTCAT	2	10	1118896	1118905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009925	TAATC	2	10	1120143	1120152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009925	AAAAG	2	10	1123592	1123601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009925	TTAAT	2	10	1138012	1138021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009925	GAATT	2	10	1138909	1138918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009925	AGGCA	2	10	1148274	1148283	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009925	ACAAA	2	10	1148306	1148315	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009925	GACAA	2	10	1171468	1171477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009925	ATCAA	2	10	1172504	1172513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009925	ACGGT	2	10	1196408	1196417	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009925	GACAA	2	10	1198228	1198237	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009925	ATTGA	2	10	1230674	1230683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009925	CTATT	2	10	1232770	1232779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009925	AAATC	2	10	1266853	1266862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009925	AAAAT	3	15	1274882	1274896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009925	TGATC	2	10	1287730	1287739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009925	CATGC	2	10	1308285	1308294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009925	CTACA	2	10	1316934	1316943	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009925	CTTCG	2	10	1320689	1320698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_009925	TGCAC	2	10	1320789	1320798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_009925	ACTCA	2	10	1323549	1323558	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009925	CTTAG	2	10	1332834	1332843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_009925	TAAAA	2	10	1333552	1333561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009925	CAACA	2	10	1353544	1353553	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_009925	CCTGT	2	10	1353872	1353881	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_009925	CTTTG	2	10	1357884	1357893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_009925	TTAAG	2	10	1384964	1384973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009925	CAACG	2	10	1385116	1385125	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_009925	CTCAG	2	10	1407096	1407105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_009925	CTCCC	2	10	1408102	1408111	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
158	NC_009925	CACGA	2	10	1409613	1409622	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_009925	TTCAC	2	10	1410873	1410882	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_009925	TACCC	2	10	1422764	1422773	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
161	NC_009925	GTAAA	2	10	1435244	1435253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009925	TCATC	2	10	1438498	1438507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_009925	ACTTA	2	10	1483737	1483746	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_009925	AGCCA	2	10	1499615	1499624	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_009925	GGAAT	2	10	1501432	1501441	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009925	AGCAA	2	10	1516608	1516617	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_009925	CTTCA	2	10	1517707	1517716	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_009925	ATGGT	2	10	1530455	1530464	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009925	CAGTT	2	10	1540075	1540084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_009925	GTATT	2	10	1540343	1540352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009925	ATGAG	2	10	1546818	1546827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009925	TTAGC	2	10	1554874	1554883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_009925	ATTTA	2	10	1562337	1562346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009925	TTCAT	2	10	1584005	1584014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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178	NC_009925	ATTGT	2	10	1589825	1589834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_009925	TTTTG	2	10	1604853	1604862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009925	AGTTG	2	10	1630442	1630451	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009925	AATGC	2	10	1630463	1630472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_009925	TTAAT	2	10	1647543	1647552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009925	CTAAA	3	15	1648643	1648657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_009925	TTGGA	2	10	1721154	1721163	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009925	CTTTG	2	10	1788777	1788786	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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219	NC_009925	CCCAG	2	10	2046362	2046371	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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264	NC_009925	CTAAC	2	10	2393547	2393556	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_009925	ATTTA	2	10	2432114	2432123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009925	GCGAT	2	10	2442742	2442751	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_009925	CAAGA	2	10	2482677	2482686	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_009925	CCTTT	2	10	2482993	2483002	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
274	NC_009925	ACTCC	2	10	2489138	2489147	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
275	NC_009925	AAGTG	2	10	2500711	2500720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
276	NC_009925	GATCA	2	10	2529768	2529777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_009925	TTCCC	2	10	2562875	2562884	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
278	NC_009925	AGAGA	2	10	2568619	2568628	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009925	GAACA	2	10	2573884	2573893	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
280	NC_009925	TCTAA	2	10	2600356	2600365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
281	NC_009925	GACTG	2	10	2613410	2613419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_009925	CAGGG	2	10	2616905	2616914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_009925	TGAAG	2	10	2621971	2621980	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_009925	CTCAA	2	10	2623598	2623607	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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399	NC_009925	CTTGG	2	10	3661718	3661727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
400	NC_009925	AACAG	2	10	3662032	3662041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_009925	GTCAG	2	10	3718717	3718726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_009925	GATTC	2	10	3719326	3719335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_009925	TAACC	2	10	3725746	3725755	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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409	NC_009925	CTTCA	2	10	3736354	3736363	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
410	NC_009925	ATTTC	2	10	3762750	3762759	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_009925	GTTAG	2	10	3806916	3806925	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
413	NC_009925	ATGAA	2	10	3831835	3831844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_009925	CATCC	2	10	3910111	3910120	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
420	NC_009925	TGGAC	2	10	3922421	3922430	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_009925	TAATT	2	10	4537422	4537431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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