MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 15692

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_009925	AATA	2	8	6425878	6425885	75 %	25 %	0 %	0 %	158339420
15502	NC_009925	ATTC	2	8	6426180	6426187	25 %	50 %	0 %	25 %	158339420
15503	NC_009925	TAAT	2	8	6426518	6426525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_009925	TAAC	2	8	6426537	6426544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15505	NC_009925	ATTG	2	8	6426561	6426568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_009925	AAGG	2	8	6427091	6427098	50 %	0 %	50 %	0 %	158339421
15507	NC_009925	CTAG	2	8	6427206	6427213	25 %	25 %	25 %	25 %	158339422
15508	NC_009925	CTGT	2	8	6427228	6427235	0 %	50 %	25 %	25 %	158339422
15509	NC_009925	GGCA	2	8	6427763	6427770	25 %	0 %	50 %	25 %	158339422
15510	NC_009925	GATG	2	8	6427989	6427996	25 %	25 %	50 %	0 %	158339422
15511	NC_009925	TGCT	2	8	6428018	6428025	0 %	50 %	25 %	25 %	158339422
15512	NC_009925	GCTT	2	8	6428979	6428986	0 %	50 %	25 %	25 %	158339423
15513	NC_009925	CAAT	2	8	6429417	6429424	50 %	25 %	0 %	25 %	158339423
15514	NC_009925	CGTA	2	8	6429432	6429439	25 %	25 %	25 %	25 %	158339423
15515	NC_009925	GATT	2	8	6429597	6429604	25 %	50 %	25 %	0 %	158339423
15516	NC_009925	CATC	2	8	6430066	6430073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15517	NC_009925	TGCT	2	8	6430113	6430120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15518	NC_009925	GCCT	2	8	6430207	6430214	0 %	25 %	25 %	50 %	158339424
15519	NC_009925	ATCG	2	8	6430490	6430497	25 %	25 %	25 %	25 %	158339424
15520	NC_009925	ACCG	2	8	6430804	6430811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15521	NC_009925	TGGC	2	8	6430921	6430928	0 %	25 %	50 %	25 %	158339425
15522	NC_009925	AAGT	2	8	6431497	6431504	50 %	25 %	25 %	0 %	158339426
15523	NC_009925	ACAA	2	8	6432409	6432416	75 %	0 %	0 %	25 %	158339427
15524	NC_009925	TGCT	2	8	6433874	6433881	0 %	50 %	25 %	25 %	158339429
15525	NC_009925	CCCG	2	8	6434003	6434010	0 %	0 %	25 %	75 %	158339429
15526	NC_009925	TCAG	2	8	6434270	6434277	25 %	25 %	25 %	25 %	158339429
15527	NC_009925	ATCA	2	8	6437119	6437126	50 %	25 %	0 %	25 %	158339430
15528	NC_009925	CGAT	2	8	6437616	6437623	25 %	25 %	25 %	25 %	158339430
15529	NC_009925	CGAA	2	8	6439147	6439154	50 %	0 %	25 %	25 %	158339430
15530	NC_009925	ACTC	2	8	6439924	6439931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15531	NC_009925	ATCC	2	8	6440526	6440533	25 %	25 %	0 %	50 %	158339431
15532	NC_009925	TTTG	2	8	6441597	6441604	0 %	75 %	25 %	0 %	158339431
15533	NC_009925	GCAA	2	8	6441960	6441967	50 %	0 %	25 %	25 %	158339431
15534	NC_009925	GAAA	2	8	6442220	6442227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_009925	ATCT	2	8	6442267	6442274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15536	NC_009925	GTCT	2	8	6442435	6442442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15537	NC_009925	TAAG	2	8	6442628	6442635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_009925	GATT	2	8	6443186	6443193	25 %	50 %	25 %	0 %	158339433
15539	NC_009925	ATCA	2	8	6444302	6444309	50 %	25 %	0 %	25 %	158339433
15540	NC_009925	TTTA	2	8	6444733	6444740	25 %	75 %	0 %	0 %	158339434
15541	NC_009925	TGAA	2	8	6445216	6445223	50 %	25 %	25 %	0 %	158339434
15542	NC_009925	TCAC	2	8	6446422	6446429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_009925	TGGA	2	8	6446464	6446471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_009925	CTTG	2	8	6446768	6446775	0 %	50 %	25 %	25 %	158339435
15545	NC_009925	TGAA	2	8	6448432	6448439	50 %	25 %	25 %	0 %	158339437
15546	NC_009925	CTCA	2	8	6448565	6448572	25 %	25 %	0 %	50 %	158339437
15547	NC_009925	AACT	2	8	6448604	6448611	50 %	25 %	0 %	25 %	158339437
15548	NC_009925	AGAA	2	8	6449931	6449938	75 %	0 %	25 %	0 %	158339438
15549	NC_009925	TACC	2	8	6450093	6450100	25 %	25 %	0 %	50 %	158339438
15550	NC_009925	GAAG	2	8	6450955	6450962	50 %	0 %	50 %	0 %	158339438
15551	NC_009925	CTGG	2	8	6451024	6451031	0 %	25 %	50 %	25 %	158339438
15552	NC_009925	TTTG	2	8	6451480	6451487	0 %	75 %	25 %	0 %	158339438
15553	NC_009925	GGAA	2	8	6451666	6451673	50 %	0 %	50 %	0 %	158339438
15554	NC_009925	GGGT	2	8	6451683	6451690	0 %	25 %	75 %	0 %	158339438
15555	NC_009925	ATTT	2	8	6452139	6452146	25 %	75 %	0 %	0 %	158339438
15556	NC_009925	TCGG	2	8	6453372	6453379	0 %	25 %	50 %	25 %	158339438
15557	NC_009925	TTGA	2	8	6454515	6454522	25 %	50 %	25 %	0 %	158339439
15558	NC_009925	TTGT	2	8	6455146	6455153	0 %	75 %	25 %	0 %	158339440
15559	NC_009925	AGCA	2	8	6455679	6455686	50 %	0 %	25 %	25 %	158339441
15560	NC_009925	TGAG	2	8	6455936	6455943	25 %	25 %	50 %	0 %	158339442
15561	NC_009925	CAAC	2	8	6456117	6456124	50 %	0 %	0 %	50 %	158339442
15562	NC_009925	AGGA	2	8	6456512	6456519	50 %	0 %	50 %	0 %	158339443
15563	NC_009925	CTTG	2	8	6456628	6456635	0 %	50 %	25 %	25 %	158339443
15564	NC_009925	TGGT	2	8	6457519	6457526	0 %	50 %	50 %	0 %	158339443
15565	NC_009925	GAGG	2	8	6457602	6457609	25 %	0 %	75 %	0 %	158339444
15566	NC_009925	ACCA	2	8	6457732	6457739	50 %	0 %	0 %	50 %	158339444
15567	NC_009925	CACC	2	8	6458171	6458178	25 %	0 %	0 %	75 %	158339444
15568	NC_009925	AAAC	2	8	6458817	6458824	75 %	0 %	0 %	25 %	158339444
15569	NC_009925	CAGC	2	8	6459566	6459573	25 %	0 %	25 %	50 %	158339445
15570	NC_009925	TGCC	2	8	6460766	6460773	0 %	25 %	25 %	50 %	158339445
15571	NC_009925	GGTT	2	8	6460858	6460865	0 %	50 %	50 %	0 %	158339445
15572	NC_009925	ATAA	2	8	6461276	6461283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_009925	TTGC	2	8	6461550	6461557	0 %	50 %	25 %	25 %	158339446
15574	NC_009925	ATCA	2	8	6461742	6461749	50 %	25 %	0 %	25 %	158339446
15575	NC_009925	TCAA	2	8	6462166	6462173	50 %	25 %	0 %	25 %	158339446
15576	NC_009925	GATT	2	8	6462511	6462518	25 %	50 %	25 %	0 %	158339446
15577	NC_009925	TCAA	2	8	6462568	6462575	50 %	25 %	0 %	25 %	158339446
15578	NC_009925	CAGG	2	8	6462926	6462933	25 %	0 %	50 %	25 %	158339447
15579	NC_009925	GGCG	2	8	6462956	6462963	0 %	0 %	75 %	25 %	158339447
15580	NC_009925	ACGG	2	8	6463951	6463958	25 %	0 %	50 %	25 %	158339447
15581	NC_009925	CCCT	2	8	6464080	6464087	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15582	NC_009925	TGAC	2	8	6464454	6464461	25 %	25 %	25 %	25 %	158339448
15583	NC_009925	TCAT	2	8	6464607	6464614	25 %	50 %	0 %	25 %	158339448
15584	NC_009925	TGAC	2	8	6464751	6464758	25 %	25 %	25 %	25 %	158339448
15585	NC_009925	TCCA	2	8	6464886	6464893	25 %	25 %	0 %	50 %	158339448
15586	NC_009925	CCTG	2	8	6465679	6465686	0 %	25 %	25 %	50 %	158339449
15587	NC_009925	TTCC	2	8	6466382	6466389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15588	NC_009925	AGTC	2	8	6467185	6467192	25 %	25 %	25 %	25 %	158339450
15589	NC_009925	ATTT	2	8	6467801	6467808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_009925	AATT	2	8	6467952	6467959	50 %	50 %	0 %	0 %	158339451
15591	NC_009925	CCAG	2	8	6468924	6468931	25 %	0 %	25 %	50 %	158339452
15592	NC_009925	GTTG	2	8	6469400	6469407	0 %	50 %	50 %	0 %	158339453
15593	NC_009925	TTGA	2	8	6469600	6469607	25 %	50 %	25 %	0 %	158339453
15594	NC_009925	ATCA	2	8	6469951	6469958	50 %	25 %	0 %	25 %	158339453
15595	NC_009925	CGTT	2	8	6470401	6470408	0 %	50 %	25 %	25 %	158339453
15596	NC_009925	ATCC	2	8	6470671	6470678	25 %	25 %	0 %	50 %	158339453
15597	NC_009925	GGAG	2	8	6471571	6471578	25 %	0 %	75 %	0 %	158339454
15598	NC_009925	GGCA	2	8	6471763	6471770	25 %	0 %	50 %	25 %	158339454
15599	NC_009925	GCTG	2	8	6471852	6471859	0 %	25 %	50 %	25 %	158339454
15600	NC_009925	GATC	2	8	6472372	6472379	25 %	25 %	25 %	25 %	158339454
15601	NC_009925	TGTA	2	8	6472590	6472597	25 %	50 %	25 %	0 %	158339455
15602	NC_009925	CGCC	2	8	6473005	6473012	0 %	0 %	25 %	75 %	158339455
15603	NC_009925	ACGA	2	8	6473059	6473066	50 %	0 %	25 %	25 %	158339455
15604	NC_009925	AAGC	2	8	6473134	6473141	50 %	0 %	25 %	25 %	158339455
15605	NC_009925	TACT	2	8	6473347	6473354	25 %	50 %	0 %	25 %	158339455
15606	NC_009925	CTGG	2	8	6473384	6473391	0 %	25 %	50 %	25 %	158339455
15607	NC_009925	TGAT	2	8	6473448	6473455	25 %	50 %	25 %	0 %	158339455
15608	NC_009925	CAAT	2	8	6473462	6473469	50 %	25 %	0 %	25 %	158339455
15609	NC_009925	GCCT	2	8	6474059	6474066	0 %	25 %	25 %	50 %	158339456
15610	NC_009925	ACCA	2	8	6474158	6474165	50 %	0 %	0 %	50 %	158339456
15611	NC_009925	CTTG	2	8	6474439	6474446	0 %	50 %	25 %	25 %	158339456
15612	NC_009925	AATC	2	8	6475085	6475092	50 %	25 %	0 %	25 %	158339457
15613	NC_009925	TACC	2	8	6475603	6475610	25 %	25 %	0 %	50 %	158339457
15614	NC_009925	TGGT	2	8	6475730	6475737	0 %	50 %	50 %	0 %	158339457
15615	NC_009925	TTCT	2	8	6475769	6475776	0 %	75 %	0 %	25 %	158339457
15616	NC_009925	TGAA	2	8	6475835	6475842	50 %	25 %	25 %	0 %	158339457
15617	NC_009925	ATAG	2	8	6476004	6476011	50 %	25 %	25 %	0 %	158339457
15618	NC_009925	ATAA	2	8	6476251	6476258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_009925	AGCT	2	8	6476884	6476891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15620	NC_009925	ACCC	2	8	6477991	6477998	25 %	0 %	0 %	75 %	158339460
15621	NC_009925	ATAA	2	8	6478082	6478089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_009925	TAAT	2	8	6478184	6478191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_009925	TATC	2	8	6478461	6478468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15624	NC_009925	CTAA	2	8	6478501	6478508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15625	NC_009925	CAAA	2	8	6478814	6478821	75 %	0 %	0 %	25 %	158339462
15626	NC_009925	GTTT	2	8	6479773	6479780	0 %	75 %	25 %	0 %	158339464
15627	NC_009925	TCGT	2	8	6479797	6479804	0 %	50 %	25 %	25 %	158339464
15628	NC_009925	GATT	2	8	6479987	6479994	25 %	50 %	25 %	0 %	158339464
15629	NC_009925	AGCT	2	8	6480660	6480667	25 %	25 %	25 %	25 %	158339464
15630	NC_009925	TGGT	2	8	6481376	6481383	0 %	50 %	50 %	0 %	158339464
15631	NC_009925	GTTC	2	8	6482008	6482015	0 %	50 %	25 %	25 %	158339464
15632	NC_009925	TTTA	2	8	6482202	6482209	25 %	75 %	0 %	0 %	158339464
15633	NC_009925	AGCC	2	8	6482502	6482509	25 %	0 %	25 %	50 %	158339464
15634	NC_009925	TGAA	2	8	6483047	6483054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15635	NC_009925	ATGT	2	8	6483217	6483224	25 %	50 %	25 %	0 %	158339465
15636	NC_009925	AGCA	2	8	6483820	6483827	50 %	0 %	25 %	25 %	158339466
15637	NC_009925	TATT	2	8	6483951	6483958	25 %	75 %	0 %	0 %	158339466
15638	NC_009925	GATG	2	8	6484076	6484083	25 %	25 %	50 %	0 %	158339466
15639	NC_009925	GATT	2	8	6484298	6484305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15640	NC_009925	TGCT	2	8	6484633	6484640	0 %	50 %	25 %	25 %	158339467
15641	NC_009925	TATT	2	8	6485449	6485456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15642	NC_009925	GTCA	2	8	6485530	6485537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15643	NC_009925	TAAA	2	8	6485684	6485691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15644	NC_009925	GTTG	2	8	6485785	6485792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15645	NC_009925	CTTT	2	8	6485898	6485905	0 %	75 %	0 %	25 %	158339469
15646	NC_009925	CCAA	2	8	6485970	6485977	50 %	0 %	0 %	50 %	158339469
15647	NC_009925	ACAT	2	8	6486068	6486075	50 %	25 %	0 %	25 %	158339469
15648	NC_009925	TTGA	2	8	6486148	6486155	25 %	50 %	25 %	0 %	158339469
15649	NC_009925	TTCC	2	8	6486345	6486352	0 %	50 %	0 %	50 %	158339469
15650	NC_009925	AGGA	2	8	6486824	6486831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15651	NC_009925	AGAA	2	8	6486910	6486917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15652	NC_009925	TACC	2	8	6487136	6487143	25 %	25 %	0 %	50 %	158339470
15653	NC_009925	CTGA	2	8	6487206	6487213	25 %	25 %	25 %	25 %	158339470
15654	NC_009925	CTTG	2	8	6487882	6487889	0 %	50 %	25 %	25 %	158339470
15655	NC_009925	TAGG	2	8	6488252	6488259	25 %	25 %	50 %	0 %	158339471
15656	NC_009925	TCAT	2	8	6488454	6488461	25 %	50 %	0 %	25 %	158339471
15657	NC_009925	GCAG	2	8	6489207	6489214	25 %	0 %	50 %	25 %	158339472
15658	NC_009925	TGGG	2	8	6489420	6489427	0 %	25 %	75 %	0 %	158339472
15659	NC_009925	GGGA	2	8	6489743	6489750	25 %	0 %	75 %	0 %	158339472
15660	NC_009925	TGGG	2	8	6490377	6490384	0 %	25 %	75 %	0 %	158339472
15661	NC_009925	TAAA	2	8	6490559	6490566	75 %	25 %	0 %	0 %	158339472
15662	NC_009925	ATAA	2	8	6490745	6490752	75 %	25 %	0 %	0 %	158339472
15663	NC_009925	ATCG	2	8	6490795	6490802	25 %	25 %	25 %	25 %	158339472
15664	NC_009925	ATCA	2	8	6491003	6491010	50 %	25 %	0 %	25 %	158339472
15665	NC_009925	GATA	2	8	6491879	6491886	50 %	25 %	25 %	0 %	158339473
15666	NC_009925	CTGG	2	8	6492875	6492882	0 %	25 %	50 %	25 %	158339473
15667	NC_009925	GTGG	2	8	6492937	6492944	0 %	25 %	75 %	0 %	158339473
15668	NC_009925	ACTG	2	8	6493136	6493143	25 %	25 %	25 %	25 %	158339473
15669	NC_009925	ATCG	2	8	6493484	6493491	25 %	25 %	25 %	25 %	158339473
15670	NC_009925	AATA	2	8	6493755	6493762	75 %	25 %	0 %	0 %	158339474
15671	NC_009925	ATTT	2	8	6494204	6494211	25 %	75 %	0 %	0 %	158339474
15672	NC_009925	TCCA	2	8	6494812	6494819	25 %	25 %	0 %	50 %	158339474
15673	NC_009925	GGAA	2	8	6494853	6494860	50 %	0 %	50 %	0 %	158339474
15674	NC_009925	GTTG	2	8	6495534	6495541	0 %	50 %	50 %	0 %	158339475
15675	NC_009925	TTCA	2	8	6495664	6495671	25 %	50 %	0 %	25 %	158339475
15676	NC_009925	CGAT	2	8	6495776	6495783	25 %	25 %	25 %	25 %	158339475
15677	NC_009925	GACT	2	8	6496113	6496120	25 %	25 %	25 %	25 %	158339475
15678	NC_009925	GATG	2	8	6496536	6496543	25 %	25 %	50 %	0 %	158339475
15679	NC_009925	GTGG	2	8	6496694	6496701	0 %	25 %	75 %	0 %	158339475
15680	NC_009925	GCAA	2	8	6496909	6496916	50 %	0 %	25 %	25 %	158339476
15681	NC_009925	CCCA	2	8	6497181	6497188	25 %	0 %	0 %	75 %	158339476
15682	NC_009925	AACA	2	8	6497369	6497376	75 %	0 %	0 %	25 %	158339476
15683	NC_009925	TTCG	2	8	6497417	6497424	0 %	50 %	25 %	25 %	158339476
15684	NC_009925	GATC	2	8	6497971	6497978	25 %	25 %	25 %	25 %	158339477
15685	NC_009925	TCCG	2	8	6499719	6499726	0 %	25 %	25 %	50 %	158339477
15686	NC_009925	AACC	2	8	6500852	6500859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15687	NC_009925	TGAA	2	8	6501805	6501812	50 %	25 %	25 %	0 %	158339480
15688	NC_009925	TCGC	2	8	6501871	6501878	0 %	25 %	25 %	50 %	158339480
15689	NC_009925	TGAT	2	8	6502620	6502627	25 %	50 %	25 %	0 %	158339481
15690	NC_009925	GACT	2	8	6502741	6502748	25 %	25 %	25 %	25 %	158339482
15691	NC_009925	CCGT	2	8	6503003	6503010	0 %	25 %	25 %	50 %	158339482
15692	NC_009925	ATCC	2	8	6503121	6503128	25 %	25 %	0 %	50 %	158339482

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.