MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	AGTTAA	2	12	3249	3260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319063
2	NC_009922	GTTAAA	2	12	3911	3922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319063
3	NC_009922	AGCTGG	2	12	4122	4133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319063
4	NC_009922	GAAAAA	2	12	5625	5636	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158319065
5	NC_009922	AAACGA	2	12	5899	5910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158319065
6	NC_009922	CAGACG	2	12	6382	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319065
7	NC_009922	TGCAGC	2	12	6686	6697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319065
8	NC_009922	ATGCCA	2	12	7732	7743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158319066
9	NC_009922	ATTTTG	2	12	19294	19305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319073
10	NC_009922	ATACGG	2	12	21566	21577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158319075
11	NC_009922	AAAATG	2	12	27913	27924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319082
12	NC_009922	GATAAG	2	12	27973	27984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319082
13	NC_009922	AAGAAA	2	12	31194	31205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158319085
14	NC_009922	TTTTAG	2	12	35586	35597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319089
15	NC_009922	GGAACA	2	12	38213	38224	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158319092
16	NC_009922	TAGATA	2	12	40448	40459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319095
17	NC_009922	CAATAT	2	12	42978	42989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158319098
18	NC_009922	GCCATA	2	12	45251	45262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158319099
19	NC_009922	GATTGA	2	12	48044	48055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319102
20	NC_009922	ATGAAA	2	12	48482	48493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319103
21	NC_009922	ATGAAT	2	12	48565	48576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319103
22	NC_009922	GAAGCA	2	12	48775	48786	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158319103
23	NC_009922	TAAAGA	2	12	74375	74386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319115
24	NC_009922	TACTTC	2	12	78120	78131	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158319117
25	NC_009922	ATCTAT	2	12	80661	80672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158319118
26	NC_009922	AAAGGA	2	12	83947	83958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319122
27	NC_009922	ACAGAT	2	12	87325	87336	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319124
28	NC_009922	AACAGA	2	12	90996	91007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158319127
29	NC_009922	GTTGGC	2	12	95410	95421	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158319130
30	NC_009922	TTCAAC	2	12	96029	96040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319131
31	NC_009922	ATTACG	2	12	97674	97685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319132
32	NC_009922	TTTATG	2	12	98009	98020	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319132
33	NC_009922	CGGCAA	2	12	101005	101016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319135
34	NC_009922	ATTCAA	2	12	102333	102344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158319136
35	NC_009922	CTAAAG	2	12	103598	103609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319137
36	NC_009922	AATATG	2	12	107660	107671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319140
37	NC_009922	GTAGAG	2	12	108036	108047	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319140
38	NC_009922	GCTTTT	2	12	108324	108335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158319140
39	NC_009922	ATCAAA	2	12	112057	112068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158319144
40	NC_009922	GTAGAG	2	12	116773	116784	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319147
41	NC_009922	ATGCAT	2	12	117790	117801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319148
42	NC_009922	AATTGT	2	12	128716	128727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319159
43	NC_009922	CATCTA	2	12	130239	130250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319160
44	NC_009922	TGGTTT	2	12	130729	130740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319160
45	NC_009922	ACAAAC	2	12	134593	134604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319163
46	NC_009922	ATTGGA	2	12	135349	135360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319164
47	NC_009922	AATTAG	2	12	137900	137911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319167
48	NC_009922	AAAAGC	2	12	140757	140768	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158319170
49	NC_009922	AGAGGG	2	12	141377	141388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319171
50	NC_009922	GAAGAT	2	12	145785	145796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319176
51	NC_009922	AAGGAT	2	12	152173	152184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319183
52	NC_009922	CTTTGG	2	12	153222	153233	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158319183
53	NC_009922	AATTTC	2	12	158428	158439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158319190
54	NC_009922	TAGAAG	2	12	160703	160714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319193
55	NC_009922	AAGGAT	2	12	164193	164204	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319195
56	NC_009922	ATTGCT	2	12	167070	167081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158319197
57	NC_009922	TTACAG	2	12	167853	167864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319198
58	NC_009922	ACAATC	2	12	168993	169004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158319199
59	NC_009922	ATTATA	2	12	170818	170829	50 %	50 %	0 %	0 %	158319200
60	NC_009922	CCTTTG	2	12	170864	170875	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158319200
61	NC_009922	CATTAT	2	12	173661	173672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158319202
62	NC_009922	AACTAG	2	12	186526	186537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319215
63	NC_009922	CTTCAA	2	12	189549	189560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319218
64	NC_009922	ATATGA	2	12	189939	189950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319219
65	NC_009922	GATTTA	2	12	191518	191529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319220
66	NC_009922	GTTACA	2	12	192909	192920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319221
67	NC_009922	TTAGAA	2	12	193985	193996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319222
68	NC_009922	ATGGAA	2	12	194363	194374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319222
69	NC_009922	GCTACT	2	12	196195	196206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158319224
70	NC_009922	TTCAAT	2	12	196992	197003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158319225
71	NC_009922	GGAAGA	2	12	201647	201658	50 %	0 %	50 %	0 %	158319228
72	NC_009922	GTAGCC	2	12	202674	202685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319229
73	NC_009922	ATTTTT	2	12	203130	203141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	158319229
74	NC_009922	GAATAT	2	12	204890	204901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319231
75	NC_009922	ATGGAT	2	12	209532	209543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319234
76	NC_009922	GGTGCA	2	12	220049	220060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319243
77	NC_009922	GCACTT	2	12	220298	220309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158319243
78	NC_009922	TACAGC	2	12	220675	220686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158319243
79	NC_009922	GTTATT	2	12	220835	220846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319243
80	NC_009922	ATATGT	2	12	221790	221801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319244
81	NC_009922	AATGAA	2	12	224780	224791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319248
82	NC_009922	AATAAA	2	12	224930	224941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	158319248
83	NC_009922	AAATAC	2	12	226013	226024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158319249
84	NC_009922	AGGTAA	2	12	230381	230392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319253
85	NC_009922	ATAGAT	2	12	235115	235126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319256
86	NC_009922	TAGAAA	2	12	235896	235907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319256
87	NC_009922	AAAGAA	2	12	241730	241741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158319259
88	NC_009922	AAAAAT	2	12	247483	247494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	158319265
89	NC_009922	GTGAAG	2	12	256536	256547	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319274
90	NC_009922	CCATAA	2	12	257328	257339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158319275
91	NC_009922	ATGCAT	2	12	260756	260767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319278
92	NC_009922	TAAAGA	2	12	268058	268069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319283
93	NC_009922	TTTTAG	2	12	270487	270498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158319285
94	NC_009922	AATGCC	2	12	286026	286037	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158319294
95	NC_009922	TACCAA	2	12	287325	287336	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158319296
96	NC_009922	GCTGTT	2	12	289646	289657	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158319297
97	NC_009922	TATTTA	2	12	290715	290726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319298
98	NC_009922	CAATGG	2	12	300289	300300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158319305
99	NC_009922	AAATCT	2	12	300793	300804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158319306
100	NC_009922	AAAATA	2	12	309316	309327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	158319313
101	NC_009922	TCTGCT	2	12	311115	311126	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158319316
102	NC_009922	ATGGAG	2	12	311640	311651	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319316
103	NC_009922	CATTGC	2	12	314072	314083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158319317
104	NC_009922	AATTGC	2	12	316229	316240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319318
105	NC_009922	ATTAAA	2	12	318151	318162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319320
106	NC_009922	AGATTT	2	12	318668	318679	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319321
107	NC_009922	TATTGA	2	12	320250	320261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319323
108	NC_009922	TTAAGG	2	12	321524	321535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319325
109	NC_009922	AGATGT	2	12	321654	321665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319325
110	NC_009922	TTAAAG	2	12	321797	321808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319325
111	NC_009922	AGATGT	2	12	321927	321938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319325
112	NC_009922	AAAGTA	2	12	322108	322119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319325
113	NC_009922	GCTAAG	2	12	322618	322629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158319325
114	NC_009922	CTCTGT	2	12	323387	323398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158319326
115	NC_009922	AGCAGG	2	12	326286	326297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158319328
116	NC_009922	TGAAGG	2	12	326886	326897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158319328
117	NC_009922	TAGCGG	2	12	327908	327919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319329
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231	NC_009922	AGCAAA	2	12	682022	682033	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158319663
232	NC_009922	TGGCCA	2	12	690120	690131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319672
233	NC_009922	TGGGAT	2	12	692020	692031	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158319674
234	NC_009922	TTACAG	2	12	698420	698431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319678
235	NC_009922	TTGGTC	2	12	703858	703869	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158319683
236	NC_009922	TTGAAG	2	12	712545	712556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319690
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238	NC_009922	AATATA	2	12	727972	727983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319707
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340	NC_009922	TGTAGT	2	12	1046507	1046518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158319993
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346	NC_009922	TGAAAA	2	12	1055838	1055849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158320000
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447	NC_009922	TAGTGT	2	12	1368742	1368753	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158320302
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449	NC_009922	GAGGAA	2	12	1377915	1377926	50 %	0 %	50 %	0 %	158320310
450	NC_009922	TCAAGG	2	12	1385041	1385052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158320316
451	NC_009922	TAGCTA	2	12	1390938	1390949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158320324
452	NC_009922	GCAAGA	2	12	1391122	1391133	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158320324
453	NC_009922	AGCTAG	2	12	1395779	1395790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158320329
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