MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 1162

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009922	TGAAGC	2	12	2594017	2594028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321438
1002	NC_009922	TTAAAA	2	12	2595305	2595316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321439
1003	NC_009922	TGCTAC	2	12	2595519	2595530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158321439
1004	NC_009922	CCTCTT	2	12	2596473	2596484	0 %	50 %	0 %	50 %	158321440
1005	NC_009922	AGTTCT	2	12	2619676	2619687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158321442
1006	NC_009922	TTCTTT	2	12	2620518	2620529	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321444
1007	NC_009922	TAAAAT	2	12	2623439	2623450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321447
1008	NC_009922	CATCCC	2	12	2628159	2628170	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158321452
1009	NC_009922	CCATAG	2	12	2629127	2629138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321453
1010	NC_009922	TCCACA	2	12	2633748	2633759	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_009922	TTCATT	2	12	2637562	2637573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321462
1012	NC_009922	TGCAAA	2	12	2638084	2638095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158321462
1013	NC_009922	TAGGCA	2	12	2641642	2641653	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321465
1014	NC_009922	TTTCCT	2	12	2642989	2643000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321466
1015	NC_009922	ATATTT	2	12	2653427	2653438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321474
1016	NC_009922	GCTAAA	2	12	2667652	2667663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158321488
1017	NC_009922	ACCCCA	2	12	2667759	2667770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158321488
1018	NC_009922	ATGGGC	2	12	2676263	2676274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158321497
1019	NC_009922	CCTTGA	2	12	2680363	2680374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158321500
1020	NC_009922	ATAAGA	2	12	2692007	2692018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158321507
1021	NC_009922	CGATCA	2	12	2692265	2692276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321507
1022	NC_009922	CTAAAT	2	12	2692696	2692707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321508
1023	NC_009922	CTTTGC	2	12	2695697	2695708	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321511
1024	NC_009922	TAATTG	2	12	2696323	2696334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158321511
1025	NC_009922	CAGCAT	2	12	2698736	2698747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321514
1026	NC_009922	CTTCCA	2	12	2704736	2704747	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158321519
1027	NC_009922	TTTTTC	2	12	2706649	2706660	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321521
1028	NC_009922	ATTTTA	2	12	2709066	2709077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009922	ATCTTC	2	12	2713026	2713037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321528
1030	NC_009922	CCTCTA	2	12	2715715	2715726	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158321531
1031	NC_009922	ATATTA	2	12	2720145	2720156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009922	TATTTC	2	12	2720494	2720505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321536
1033	NC_009922	CCGCTA	2	12	2721378	2721389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158321537
1034	NC_009922	CCTAAA	3	18	2722904	2722921	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158321537
1035	NC_009922	CTTTAA	2	12	2730446	2730457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158321544
1036	NC_009922	GGTATA	2	12	2731871	2731882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321546
1037	NC_009922	GTCCTT	2	12	2732297	2732308	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321546
1038	NC_009922	AGATCT	2	12	2735552	2735563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158321551
1039	NC_009922	TCTGCT	2	12	2735681	2735692	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321551
1040	NC_009922	GCATCC	2	12	2738739	2738750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158321554
1041	NC_009922	ATCATG	2	12	2738751	2738762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158321554
1042	NC_009922	CGTGGC	2	12	2738843	2738854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158321554
1043	NC_009922	TTCGTG	2	12	2738865	2738876	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158321554
1044	NC_009922	CATGGC	2	12	2739903	2739914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158321555
1045	NC_009922	TTTAAA	2	12	2742844	2742855	50 %	50 %	0 %	0 %	158321558
1046	NC_009922	ACACCG	2	12	2751900	2751911	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158321567
1047	NC_009922	CCTCTA	2	12	2753529	2753540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158321570
1048	NC_009922	TTCCTT	2	12	2755455	2755466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321571
1049	NC_009922	GTGATG	2	12	2756487	2756498	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158321573
1050	NC_009922	TCTTTT	2	12	2756799	2756810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321573
1051	NC_009922	TATTGA	2	12	2760472	2760483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158321576
1052	NC_009922	ATTACG	2	12	2771451	2771462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158321590
1053	NC_009922	CTTCCT	2	12	2781325	2781336	0 %	50 %	0 %	50 %	158321601
1054	NC_009922	CTGTAT	2	12	2788320	2788331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158321607
1055	NC_009922	ATTAAA	2	12	2790115	2790126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321608
1056	NC_009922	CATTAC	2	12	2790543	2790554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321608
1057	NC_009922	TTTAGA	2	12	2790954	2790965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009922	TACTTC	2	12	2792331	2792342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321610
1059	NC_009922	TACTCA	2	12	2797796	2797807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009922	TTAGTA	2	12	2807280	2807291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158321622
1061	NC_009922	AAAATC	2	12	2808968	2808979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158321623
1062	NC_009922	CTAACT	2	12	2810406	2810417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321624
1063	NC_009922	TTCTAC	2	12	2811701	2811712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321624
1064	NC_009922	TCCAGT	2	12	2814827	2814838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158321624
1065	NC_009922	TACCGA	2	12	2820062	2820073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321626
1066	NC_009922	AACTTT	2	12	2822844	2822855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158321628
1067	NC_009922	GTTATT	2	12	2824055	2824066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158321629
1068	NC_009922	TTTTCT	2	12	2833343	2833354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321635
1069	NC_009922	TTTATT	2	12	2833501	2833512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	158321635
1070	NC_009922	CTAAAA	2	12	2838227	2838238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158321638
1071	NC_009922	AAGAAC	2	12	2838721	2838732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158321638
1072	NC_009922	GAAATA	2	12	2839480	2839491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158321638
1073	NC_009922	TTTATA	2	12	2841314	2841325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158321641
1074	NC_009922	CAGTAA	2	12	2845960	2845971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158321644
1075	NC_009922	TTGGTG	2	12	2846410	2846421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009922	AGTTGC	2	12	2849472	2849483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158321646
1077	NC_009922	AATACA	2	12	2851818	2851829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158321647
1078	NC_009922	ATCGAA	2	12	2852282	2852293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158321647
1079	NC_009922	TTTTCT	2	12	2852340	2852351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321647
1080	NC_009922	TTAAAT	2	12	2855434	2855445	50 %	50 %	0 %	0 %	158321649
1081	NC_009922	AATAAG	2	12	2859069	2859080	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158321653
1082	NC_009922	GCATGG	2	12	2860443	2860454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158321655
1083	NC_009922	ATACAT	2	12	2860940	2860951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321655
1084	NC_009922	CTTGGT	2	12	2868176	2868187	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158321662
1085	NC_009922	GATTCT	2	12	2870615	2870626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158321664
1086	NC_009922	AATATC	2	12	2870723	2870734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321664
1087	NC_009922	TTGCCT	2	12	2871667	2871678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321665
1088	NC_009922	GGTAAT	2	12	2877572	2877583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158321670
1089	NC_009922	GATATA	2	12	2879928	2879939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158321671
1090	NC_009922	CACCAA	2	12	2885624	2885635	50 %	0 %	0 %	50 %	158321675
1091	NC_009922	ATAATT	2	12	2887690	2887701	50 %	50 %	0 %	0 %	158321677
1092	NC_009922	CTATTT	2	12	2891498	2891509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321680
1093	NC_009922	TCTAAT	2	12	2893000	2893011	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158321682
1094	NC_009922	TAAGAT	2	12	2899011	2899022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158321686
1095	NC_009922	CCTCTT	2	12	2920734	2920745	0 %	50 %	0 %	50 %	158321708
1096	NC_009922	ACTTTT	2	12	2921953	2921964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321709
1097	NC_009922	ATTTTT	2	12	2922670	2922681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	158321710
1098	NC_009922	TTCATT	2	12	2923604	2923615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321710
1099	NC_009922	TCTCCT	2	12	2931223	2931234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_009922	GCCATA	2	12	2936863	2936874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321720
1101	NC_009922	TGACCA	2	12	2940687	2940698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321723
1102	NC_009922	TATTTC	2	12	2954686	2954697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321731
1103	NC_009922	ATCCAG	2	12	2954704	2954715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158321731
1104	NC_009922	CGATAG	2	12	2960200	2960211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321736
1105	NC_009922	ATTTAA	2	12	2960777	2960788	50 %	50 %	0 %	0 %	158321737
1106	NC_009922	TTCATC	2	12	2961099	2961110	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321737
1107	NC_009922	TCAAAA	2	12	2961486	2961497	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158321738
1108	NC_009922	TTGCCA	2	12	2962673	2962684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158321738
1109	NC_009922	CTTCTG	2	12	2965568	2965579	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321741
1110	NC_009922	GCCAAA	2	12	2967810	2967821	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158321742
1111	NC_009922	AAGCTG	2	12	2969024	2969035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321743
1112	NC_009922	CAATAA	2	12	2972410	2972421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1113	NC_009922	TCCAGC	2	12	2973896	2973907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158321749
1114	NC_009922	GGTTCA	2	12	2976496	2976507	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158321753
1115	NC_009922	TATCAA	2	12	2982821	2982832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321760
1116	NC_009922	ATTCTT	2	12	2985610	2985621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321762
1117	NC_009922	ATTACA	2	12	2986073	2986084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321762
1118	NC_009922	GAATAT	2	12	2986965	2986976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009922	CTTTTC	2	12	2990984	2990995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321767
1120	NC_009922	ATTCAT	2	12	2991407	2991418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158321767
1121	NC_009922	CTTTTA	2	12	2993251	2993262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1122	NC_009922	TTTTAG	2	12	2997893	2997904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009922	ATCTTG	2	12	3000103	3000114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158321776
1124	NC_009922	CTTTTT	2	12	3008745	3008756	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158321785
1125	NC_009922	TCAATA	2	12	3015660	3015671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321793
1126	NC_009922	CAATGG	2	12	3019449	3019460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321797
1127	NC_009922	TACCTT	2	12	3023984	3023995	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321801
1128	NC_009922	CCCATC	2	12	3027300	3027311	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158321803
1129	NC_009922	CTTCCA	2	12	3027334	3027345	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158321803
1130	NC_009922	GTTTAT	2	12	3029338	3029349	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009922	TCTCCC	2	12	3030964	3030975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321807
1132	NC_009922	TTAAAA	2	12	3037063	3037074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321811
1133	NC_009922	TGCAGA	2	12	3037658	3037669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158321811
1134	NC_009922	GCAACC	2	12	3037873	3037884	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158321811
1135	NC_009922	CCTATT	2	12	3042988	3042999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_009922	CCTTCC	2	12	3046326	3046337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158321817
1137	NC_009922	TCCAAT	2	12	3049007	3049018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158321819
1138	NC_009922	ATTAAT	2	12	3050698	3050709	50 %	50 %	0 %	0 %	158321820
1139	NC_009922	TTTGCC	2	12	3058614	3058625	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321830
1140	NC_009922	AATTTT	2	12	3062130	3062141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_009922	TCATTA	2	12	3062156	3062167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1142	NC_009922	TTTCAT	2	12	3065517	3065528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321836
1143	NC_009922	TATGGT	2	12	3073028	3073039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158321845
1144	NC_009922	TATAAA	2	12	3079727	3079738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158321849
1145	NC_009922	TTAAAT	2	12	3080937	3080948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_009922	ATTTGA	2	12	3083256	3083267	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_009922	TCTATA	2	12	3084053	3084064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1148	NC_009922	TTAAAT	2	12	3084213	3084224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_009922	TTCTTT	2	12	3085124	3085135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1150	NC_009922	CTGTAT	2	12	3086714	3086725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158321854
1151	NC_009922	CTTTCT	2	12	3087849	3087860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158321855
1152	NC_009922	ATTAAT	2	12	3091947	3091958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_009922	ACAACT	2	12	3092526	3092537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158321863
1154	NC_009922	CTATCT	2	12	3096649	3096660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321867
1155	NC_009922	AATAAA	2	12	3099619	3099630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_009922	AATCCA	2	12	3102789	3102800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158321874
1157	NC_009922	GGGATA	2	12	3104449	3104460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158321875
1158	NC_009922	TTCTAT	2	12	3113922	3113933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158321885
1159	NC_009922	TCTAAA	2	12	3114766	3114777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158321886
1160	NC_009922	TCTTCA	2	12	3118581	3118592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321889
1161	NC_009922	CCTTTG	2	12	3119666	3119677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158321890
1162	NC_009922	TACTTC	2	12	3121450	3121461	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158321891

< Previous 1 23Next >