MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 8924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTAT	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009922	ACAA	2	8	252	259	75 %	0 %	0 %	25 %	158319060
3	NC_009922	CGTT	2	8	416	423	0 %	50 %	25 %	25 %	158319060
4	NC_009922	ATGC	2	8	541	548	25 %	25 %	25 %	25 %	158319060
5	NC_009922	AAAT	2	8	1149	1156	75 %	25 %	0 %	0 %	158319060
6	NC_009922	TATC	2	8	1231	1238	25 %	50 %	0 %	25 %	158319060
7	NC_009922	CCTA	2	8	1260	1267	25 %	25 %	0 %	50 %	158319060
8	NC_009922	ATGC	2	8	1309	1316	25 %	25 %	25 %	25 %	158319060
9	NC_009922	TGTT	2	8	1472	1479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009922	TTTA	2	8	2307	2314	25 %	75 %	0 %	0 %	158319061
11	NC_009922	GAAG	2	8	2460	2467	50 %	0 %	50 %	0 %	158319061
12	NC_009922	TTGA	2	8	2557	2564	25 %	50 %	25 %	0 %	158319061
13	NC_009922	GAAA	2	8	3000	3007	75 %	0 %	25 %	0 %	158319062
14	NC_009922	AAGC	2	8	3431	3438	50 %	0 %	25 %	25 %	158319063
15	NC_009922	AGAT	2	8	3750	3757	50 %	25 %	25 %	0 %	158319063
16	NC_009922	CTTT	2	8	4103	4110	0 %	75 %	0 %	25 %	158319063
17	NC_009922	TAAT	2	8	4331	4338	50 %	50 %	0 %	0 %	158319063
18	NC_009922	TACT	2	8	5173	5180	25 %	50 %	0 %	25 %	158319065
19	NC_009922	TAAA	2	8	5581	5588	75 %	25 %	0 %	0 %	158319065
20	NC_009922	AAAG	2	8	5786	5793	75 %	0 %	25 %	0 %	158319065
21	NC_009922	AAGT	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	158319066
22	NC_009922	TAAA	2	8	7912	7919	75 %	25 %	0 %	0 %	158319066
23	NC_009922	AAGC	2	8	8058	8065	50 %	0 %	25 %	25 %	158319066
24	NC_009922	TAAT	2	8	8152	8159	50 %	50 %	0 %	0 %	158319066
25	NC_009922	CTAT	2	8	8465	8472	25 %	50 %	0 %	25 %	158319066
26	NC_009922	GAGT	2	8	8975	8982	25 %	25 %	50 %	0 %	158319066
27	NC_009922	TGGT	2	8	9545	9552	0 %	50 %	50 %	0 %	158319067
28	NC_009922	AAAG	2	8	9711	9718	75 %	0 %	25 %	0 %	158319067
29	NC_009922	ACTG	2	8	9850	9857	25 %	25 %	25 %	25 %	158319068
30	NC_009922	TATT	2	8	10149	10156	25 %	75 %	0 %	0 %	158319068
31	NC_009922	AATC	2	8	10386	10393	50 %	25 %	0 %	25 %	158319069
32	NC_009922	TAAA	2	8	10433	10440	75 %	25 %	0 %	0 %	158319069
33	NC_009922	GTAA	2	8	10642	10649	50 %	25 %	25 %	0 %	158319069
34	NC_009922	GTAC	2	8	12219	12226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009922	GCAA	2	8	13188	13195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009922	AGAA	2	8	13321	13328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009922	CATT	2	8	14218	14225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009922	GTTG	2	8	14591	14598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009922	AGGT	2	8	14756	14763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009922	ATTA	2	8	16290	16297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009922	AATT	2	8	16871	16878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009922	GGAT	2	8	17922	17929	25 %	25 %	50 %	0 %	158319071
43	NC_009922	TATC	2	8	18217	18224	25 %	50 %	0 %	25 %	158319072
44	NC_009922	TCAT	2	8	18309	18316	25 %	50 %	0 %	25 %	158319072
45	NC_009922	TGGT	2	8	18553	18560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009922	GGAA	2	8	19091	19098	50 %	0 %	50 %	0 %	158319073
47	NC_009922	ACAA	2	8	19806	19813	75 %	0 %	0 %	25 %	158319073
48	NC_009922	GTAG	2	8	20064	20071	25 %	25 %	50 %	0 %	158319073
49	NC_009922	AAAT	2	8	20172	20179	75 %	25 %	0 %	0 %	158319073
50	NC_009922	ATTT	2	8	20208	20215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009922	AAGT	2	8	20793	20800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009922	CCAG	2	8	20957	20964	25 %	0 %	25 %	50 %	158319075
53	NC_009922	ATTT	2	8	21447	21454	25 %	75 %	0 %	0 %	158319075
54	NC_009922	AATG	2	8	21607	21614	50 %	25 %	25 %	0 %	158319075
55	NC_009922	TTAC	2	8	21829	21836	25 %	50 %	0 %	25 %	158319075
56	NC_009922	ATGA	2	8	21874	21881	50 %	25 %	25 %	0 %	158319075
57	NC_009922	ATAA	2	8	22301	22308	75 %	25 %	0 %	0 %	158319075
58	NC_009922	GAAG	2	8	22652	22659	50 %	0 %	50 %	0 %	158319076
59	NC_009922	AATA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009922	GGAA	2	8	23617	23624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009922	ATTG	2	8	23787	23794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009922	GAAA	2	8	24326	24333	75 %	0 %	25 %	0 %	158319078
63	NC_009922	TTTA	2	8	24924	24931	25 %	75 %	0 %	0 %	158319078
64	NC_009922	AAAG	2	8	24946	24953	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009922	ATCA	2	8	25274	25281	50 %	25 %	0 %	25 %	158319079
66	NC_009922	TAAA	2	8	25831	25838	75 %	25 %	0 %	0 %	158319079
67	NC_009922	TTTG	2	8	25913	25920	0 %	75 %	25 %	0 %	158319079
68	NC_009922	TCTT	2	8	26261	26268	0 %	75 %	0 %	25 %	158319079
69	NC_009922	TCTT	2	8	26486	26493	0 %	75 %	0 %	25 %	158319080
70	NC_009922	CTTC	2	8	26684	26691	0 %	50 %	0 %	50 %	158319080
71	NC_009922	AATT	2	8	26939	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009922	GAAT	2	8	27137	27144	50 %	25 %	25 %	0 %	158319081
73	NC_009922	AAAG	2	8	27811	27818	75 %	0 %	25 %	0 %	158319082
74	NC_009922	TTAA	2	8	27940	27947	50 %	50 %	0 %	0 %	158319082
75	NC_009922	CTTC	2	8	28312	28319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009922	AGAA	2	8	28966	28973	75 %	0 %	25 %	0 %	158319084
77	NC_009922	TTGG	2	8	29148	29155	0 %	50 %	50 %	0 %	158319084
78	NC_009922	TTCT	2	8	29479	29486	0 %	75 %	0 %	25 %	158319084
79	NC_009922	AGAA	2	8	29835	29842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009922	GACA	2	8	30024	30031	50 %	0 %	25 %	25 %	158319085
81	NC_009922	ATCG	2	8	30696	30703	25 %	25 %	25 %	25 %	158319085
82	NC_009922	ATTA	2	8	30753	30760	50 %	50 %	0 %	0 %	158319085
83	NC_009922	AATT	2	8	30840	30847	50 %	50 %	0 %	0 %	158319085
84	NC_009922	TGAA	2	8	31124	31131	50 %	25 %	25 %	0 %	158319085
85	NC_009922	ATCA	2	8	32137	32144	50 %	25 %	0 %	25 %	158319086
86	NC_009922	TGCT	2	8	32320	32327	0 %	50 %	25 %	25 %	158319086
87	NC_009922	AGGG	2	8	32806	32813	25 %	0 %	75 %	0 %	158319086
88	NC_009922	AATG	2	8	34576	34583	50 %	25 %	25 %	0 %	158319087
89	NC_009922	GCCA	2	8	34745	34752	25 %	0 %	25 %	50 %	158319087
90	NC_009922	GATC	2	8	34852	34859	25 %	25 %	25 %	25 %	158319087
91	NC_009922	AGAT	2	8	35148	35155	50 %	25 %	25 %	0 %	158319088
92	NC_009922	GGAA	2	8	35192	35199	50 %	0 %	50 %	0 %	158319088
93	NC_009922	ATGG	2	8	36726	36733	25 %	25 %	50 %	0 %	158319090
94	NC_009922	TATG	2	8	36827	36834	25 %	50 %	25 %	0 %	158319090
95	NC_009922	GATG	2	8	37184	37191	25 %	25 %	50 %	0 %	158319091
96	NC_009922	CAAG	2	8	37280	37287	50 %	0 %	25 %	25 %	158319091
97	NC_009922	CATG	2	8	37603	37610	25 %	25 %	25 %	25 %	158319092
98	NC_009922	ATGG	2	8	37691	37698	25 %	25 %	50 %	0 %	158319092
99	NC_009922	GATG	2	8	38266	38273	25 %	25 %	50 %	0 %	158319092
100	NC_009922	TTTA	2	8	38279	38286	25 %	75 %	0 %	0 %	158319092
101	NC_009922	AGGT	2	8	38657	38664	25 %	25 %	50 %	0 %	158319093
102	NC_009922	CAAA	2	8	38749	38756	75 %	0 %	0 %	25 %	158319093
103	NC_009922	TTGC	2	8	38786	38793	0 %	50 %	25 %	25 %	158319093
104	NC_009922	TGGG	2	8	38893	38900	0 %	25 %	75 %	0 %	158319093
105	NC_009922	GATG	2	8	38999	39006	25 %	25 %	50 %	0 %	158319093
106	NC_009922	TAAA	2	8	39508	39515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009922	AAAG	2	8	39667	39674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009922	AGAA	2	8	40555	40562	75 %	0 %	25 %	0 %	158319096
109	NC_009922	ATTG	2	8	41857	41864	25 %	50 %	25 %	0 %	158319097
110	NC_009922	GTAA	2	8	41894	41901	50 %	25 %	25 %	0 %	158319097
111	NC_009922	AAAG	2	8	42065	42072	75 %	0 %	25 %	0 %	158319097
112	NC_009922	CTTT	2	8	42351	42358	0 %	75 %	0 %	25 %	158319097
113	NC_009922	AAGA	2	8	42459	42466	75 %	0 %	25 %	0 %	158319097
114	NC_009922	ATTG	2	8	42700	42707	25 %	50 %	25 %	0 %	158319097
115	NC_009922	ACCT	2	8	42720	42727	25 %	25 %	0 %	50 %	158319098
116	NC_009922	ATAA	2	8	42886	42893	75 %	25 %	0 %	0 %	158319098
117	NC_009922	CCTT	2	8	43057	43064	0 %	50 %	0 %	50 %	158319098
118	NC_009922	AATC	2	8	43163	43170	50 %	25 %	0 %	25 %	158319098
119	NC_009922	CATC	2	8	43547	43554	25 %	25 %	0 %	50 %	158319098
120	NC_009922	AATT	2	8	44261	44268	50 %	50 %	0 %	0 %	158319098
121	NC_009922	ATAA	2	8	44569	44576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009922	TGAA	2	8	44577	44584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009922	GAAG	2	8	45083	45090	50 %	0 %	50 %	0 %	158319099
124	NC_009922	TAGA	2	8	45517	45524	50 %	25 %	25 %	0 %	158319099
125	NC_009922	TGTA	2	8	45947	45954	25 %	50 %	25 %	0 %	158319100
126	NC_009922	AAAT	2	8	46226	46233	75 %	25 %	0 %	0 %	158319100
127	NC_009922	TGGA	2	8	47106	47113	25 %	25 %	50 %	0 %	158319101
128	NC_009922	TTAA	2	8	47261	47268	50 %	50 %	0 %	0 %	158319101
129	NC_009922	GTAT	2	8	47283	47290	25 %	50 %	25 %	0 %	158319101
130	NC_009922	AGAA	2	8	47587	47594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009922	AAAG	2	8	47835	47842	75 %	0 %	25 %	0 %	158319102
132	NC_009922	AGAA	2	8	48066	48073	75 %	0 %	25 %	0 %	158319102
133	NC_009922	TAAA	2	8	48099	48106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009922	TAAG	2	8	48877	48884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009922	GTAC	2	8	50770	50777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009922	GCAA	2	8	51739	51746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009922	AGAA	2	8	51872	51879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009922	CATT	2	8	52769	52776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009922	GTTG	2	8	53142	53149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009922	AGGT	2	8	53307	53314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009922	ATAA	2	8	55335	55342	75 %	25 %	0 %	0 %	158319105
142	NC_009922	TTGA	2	8	55356	55363	25 %	50 %	25 %	0 %	158319105
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144	NC_009922	ATTG	2	8	56270	56277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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