MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009921	GGTCAC	2	12	5699163	5699174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_009921	TCGACC	2	12	5706645	5706656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009921	CCGTGC	2	12	5708553	5708564	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
504	NC_009921	ACGCCA	2	12	5713887	5713898	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
505	NC_009921	CCTGCG	2	12	5728347	5728358	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
506	NC_009921	CGCGGG	2	12	5738822	5738833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009921	CGCCCG	2	12	5749646	5749657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_009921	TGAGCA	2	12	5815932	5815943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
509	NC_009921	CGTCGG	2	12	5828825	5828836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009921	GGCCCC	2	12	5861644	5861655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_009921	TCCCAC	2	12	5881766	5881777	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_009921	CCGCGC	2	12	5886261	5886272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_009921	CCCGAC	2	12	5892897	5892908	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_009921	CCACCG	2	12	5892987	5892998	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_009921	CGCCGG	2	12	5905013	5905024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009921	CACCGT	2	12	5921589	5921600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
517	NC_009921	GCCGGG	2	12	5926543	5926554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009921	CGGCCG	2	12	5941984	5941995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_009921	GAGCCC	2	12	5942065	5942076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
520	NC_009921	GCCACC	2	12	5948479	5948490	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_009921	GCCGCG	2	12	5966108	5966119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_009921	ATGCTC	2	12	5967140	5967151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009921	CGGAAC	2	12	5969510	5969521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009921	CCCGGC	2	12	5984376	5984387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_009921	GGCCCG	2	12	5992350	5992361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009921	GACAAG	2	12	6007380	6007391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_009921	CGGCGA	2	12	6013789	6013800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009921	CGCGAG	2	12	6018102	6018113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009921	GGTGCC	2	12	6022889	6022900	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009921	CGCGTC	2	12	6026419	6026430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
531	NC_009921	CGGCTG	2	12	6026751	6026762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009921	GGCAAC	2	12	6030773	6030784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009921	ATGACG	2	12	6030858	6030869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
534	NC_009921	CGGCCG	2	12	6031739	6031750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_009921	CGGCCG	2	12	6031940	6031951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_009921	CAGCGT	2	12	6032075	6032086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009921	CTTCAC	2	12	6033038	6033049	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_009921	CTTGCC	2	12	6038346	6038357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009921	GACCCG	2	12	6064721	6064732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
540	NC_009921	AGGCGA	2	12	6067181	6067192	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
541	NC_009921	ACGGCC	2	12	6068576	6068587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
542	NC_009921	GGCGGG	2	12	6069762	6069773	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
543	NC_009921	GGCGCG	2	12	6092080	6092091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009921	CCCCAC	2	12	6116113	6116124	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
545	NC_009921	GGCAAC	6	36	6176609	6176644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009921	CGCCAA	2	12	6176668	6176679	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
547	NC_009921	GCCGGG	2	12	6176714	6176725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009921	GTCCTG	2	12	6184126	6184137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009921	CGCCTC	2	12	6184592	6184603	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009921	GGATCG	2	12	6186942	6186953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
551	NC_009921	GGCCTG	2	12	6201037	6201048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009921	CCGGAA	2	12	6207934	6207945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009921	GGTCCG	2	12	6224856	6224867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009921	CGGGGG	2	12	6227461	6227472	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
555	NC_009921	CCCGCG	2	12	6268002	6268013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_009921	CTGGAG	2	12	6272972	6272983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
557	NC_009921	ACGTCA	2	12	6273851	6273862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_009921	CGTCAG	2	12	6277448	6277459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_009921	GCGACC	2	12	6303366	6303377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
560	NC_009921	CCCCTC	2	12	6311083	6311094	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
561	NC_009921	CCCGGC	2	12	6337779	6337790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_009921	TCGCCG	2	12	6341394	6341405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
563	NC_009921	GCCCGG	2	12	6343132	6343143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_009921	GGTGTC	2	12	6358404	6358415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
565	NC_009921	TGCCGT	2	12	6358600	6358611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009921	CCGGGC	2	12	6382326	6382337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_009921	CCGGTG	2	12	6415019	6415030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009921	GACCCT	2	12	6433325	6433336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
569	NC_009921	CAGGTT	2	12	6446209	6446220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_009921	GCGGGG	2	12	6448552	6448563	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_009921	GCGAGG	2	12	6448564	6448575	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_009921	CAGGTT	2	12	6453006	6453017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
573	NC_009921	CAGGTT	2	12	6455141	6455152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
574	NC_009921	ACCCGC	4	24	6456430	6456453	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_009921	CAGGTT	2	12	6473649	6473660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_009921	GCCCCG	2	12	6483464	6483475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_009921	CCGCAC	5	30	6486228	6486257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_009921	GTCGGG	2	12	6486394	6486405	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_009921	GGACCC	2	12	6486623	6486634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
580	NC_009921	CGGGGT	2	12	6489060	6489071	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
581	NC_009921	TCCGGG	2	12	6492743	6492754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009921	ACCTGG	2	12	6499199	6499210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009921	CAGGTT	2	12	6508625	6508636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
584	NC_009921	CCGACC	2	12	6570308	6570319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_009921	CCGGGC	2	12	6597302	6597313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_009921	ACATCC	2	12	6611884	6611895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_009921	CCATGG	2	12	6637152	6637163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009921	CACCCC	2	12	6639504	6639515	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
589	NC_009921	CGGGGC	2	12	6666095	6666106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009921	CCGGGC	2	12	6666107	6666118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_009921	ACATCG	2	12	6677981	6677992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009921	TGACGG	2	12	6685918	6685929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
593	NC_009921	TGTTGA	2	12	6693767	6693778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009921	CGTCAC	2	12	6699233	6699244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
595	NC_009921	AAGATC	2	12	6699287	6699298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_009921	TGGCGC	2	12	6699331	6699342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_009921	CCGGTG	2	12	6704707	6704718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_009921	TGGCGC	2	12	6714928	6714939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009921	TTTGCG	2	12	6715342	6715353	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
600	NC_009921	AGGATC	2	12	6715547	6715558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
601	NC_009921	ACCGGC	2	12	6718609	6718620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
602	NC_009921	CCGCAT	2	12	6733267	6733278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
603	NC_009921	TCCCGG	2	12	6739410	6739421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
604	NC_009921	CACCGA	2	12	6779190	6779201	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
605	NC_009921	GGTTTC	2	12	6781696	6781707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_009921	CGGCGC	2	12	6803898	6803909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_009921	CACCGC	4	24	6804164	6804187	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009921	CAGCCC	3	18	6808879	6808896	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_009921	CGGCGA	2	12	6826490	6826501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009921	CGGTCC	2	12	6826953	6826964	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
611	NC_009921	TGCCAC	2	12	6849797	6849808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
612	NC_009921	CTCGAC	2	12	6851466	6851477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
613	NC_009921	CGTCCG	2	12	6853874	6853885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
614	NC_009921	GCTGCC	2	12	6885455	6885466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009921	TTCCGG	4	24	6888802	6888825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009921	CGATAT	2	12	6890540	6890551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_009921	TCTGCG	2	12	6890698	6890709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009921	TCGTGA	2	12	6890761	6890772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
619	NC_009921	TCACAC	2	12	6909511	6909522	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_009921	GTCGGG	2	12	6909543	6909554	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
621	NC_009921	GGCAGG	4	24	6909560	6909583	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
622	NC_009921	GCTCGA	2	12	6916418	6916429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009921	TGACCA	2	12	6930335	6930346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_009921	CCGGCG	2	12	6930457	6930468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_009921	CCCGGT	2	12	6939855	6939866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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652	NC_009921	GTCATC	2	12	7250365	7250376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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744	NC_009921	CTCGCG	2	12	8014088	8014099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
745	NC_009921	CCCACT	2	12	8043008	8043019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
746	NC_009921	TGGCGG	2	12	8051447	8051458	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
747	NC_009921	ACGCAG	2	12	8054858	8054869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
748	NC_009921	GGCGAT	2	12	8062770	8062781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
749	NC_009921	GCCGGC	2	12	8081325	8081336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
750	NC_009921	GCCGTC	2	12	8090350	8090361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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752	NC_009921	CGGACA	2	12	8113308	8113319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_009921	GCCCAC	2	12	8504090	8504101	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
778	NC_009921	CGGTCG	2	12	8508369	8508380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_009921	GCCGGT	2	12	8509040	8509051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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781	NC_009921	CCCGGG	2	12	8509417	8509428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
782	NC_009921	GGTCAC	4	24	8539726	8539749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_009921	TGGCGC	2	12	8542237	8542248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_009921	GGCCTG	2	12	8553026	8553037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_009921	TGCTCG	2	12	8573619	8573630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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794	NC_009921	GTCGAC	2	12	8659502	8659513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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798	NC_009921	CTCGAC	2	12	8679837	8679848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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802	NC_009921	CCGCAG	2	12	8683064	8683075	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
803	NC_009921	GCCGAA	2	12	8721313	8721324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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805	NC_009921	TGACCG	2	12	8728290	8728301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.