MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	157964076
2	NC_009900	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	157964076
3	NC_009900	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	157964077
4	NC_009900	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	157964077
5	NC_009900	ACTTT	2	10	6684	6693	20 %	60 %	0 %	20 %	157964078
6	NC_009900	AATAC	2	10	7225	7234	60 %	20 %	0 %	20 %	157964078
7	NC_009900	ATCCA	2	10	7724	7733	40 %	20 %	0 %	40 %	157964079
8	NC_009900	TAACT	2	10	14443	14452	40 %	40 %	0 %	20 %	157964081
9	NC_009900	ATTTA	2	10	16106	16115	40 %	60 %	0 %	0 %	157964083
10	NC_009900	TTAAA	2	10	16267	16276	60 %	40 %	0 %	0 %	157964083
11	NC_009900	TTTTA	2	10	16874	16883	20 %	80 %	0 %	0 %	157964083
12	NC_009900	AGAAA	2	10	19924	19933	80 %	0 %	20 %	0 %	157964084
13	NC_009900	AAAGC	2	10	20177	20186	60 %	0 %	20 %	20 %	157964084
14	NC_009900	TAATA	2	10	21046	21055	60 %	40 %	0 %	0 %	157964084
15	NC_009900	CAAAG	2	10	21138	21147	60 %	0 %	20 %	20 %	157964084
16	NC_009900	AGCAG	2	10	21464	21473	40 %	0 %	40 %	20 %	157964084
17	NC_009900	TACCT	2	10	22621	22630	20 %	40 %	0 %	40 %	157964084
18	NC_009900	TTTGT	2	10	28596	28605	0 %	80 %	20 %	0 %	157964086
19	NC_009900	TCATT	2	10	30248	30257	20 %	60 %	0 %	20 %	157964090
20	NC_009900	TAATA	2	10	30537	30546	60 %	40 %	0 %	0 %	157964090
21	NC_009900	AGAAA	2	10	47016	47025	80 %	0 %	20 %	0 %	157964098
22	NC_009900	GTTTC	2	10	47456	47465	0 %	60 %	20 %	20 %	157964098
23	NC_009900	ATTTT	2	10	48005	48014	20 %	80 %	0 %	0 %	157964098
24	NC_009900	TTGAT	2	10	54187	54196	20 %	60 %	20 %	0 %	157964100
25	NC_009900	TAAAG	2	10	55214	55223	60 %	20 %	20 %	0 %	157964100
26	NC_009900	ATTAT	2	10	55287	55296	40 %	60 %	0 %	0 %	157964100
27	NC_009900	TCGGT	2	10	60738	60747	0 %	40 %	40 %	20 %	157964106
28	NC_009900	GCTTT	2	10	62153	62162	0 %	60 %	20 %	20 %	157964107
29	NC_009900	TAAAA	2	10	66874	66883	80 %	20 %	0 %	0 %	157964109
30	NC_009900	CTTTA	2	10	69692	69701	20 %	60 %	0 %	20 %	157964112
31	NC_009900	GCTTA	2	10	69880	69889	20 %	40 %	20 %	20 %	157964112
32	NC_009900	CATTT	2	10	70583	70592	20 %	60 %	0 %	20 %	157964112
33	NC_009900	TTAAA	2	10	70608	70617	60 %	40 %	0 %	0 %	157964112
34	NC_009900	ACATA	2	10	73403	73412	60 %	20 %	0 %	20 %	157964115
35	NC_009900	TTTCT	2	10	76631	76640	0 %	80 %	0 %	20 %	157964118
36	NC_009900	ATTTA	2	10	77049	77058	40 %	60 %	0 %	0 %	157964119
37	NC_009900	AAAAG	2	10	77825	77834	80 %	0 %	20 %	0 %	157964119
38	NC_009900	GGGTT	2	10	78035	78044	0 %	40 %	60 %	0 %	157964119
39	NC_009900	TTTAT	2	10	78411	78420	20 %	80 %	0 %	0 %	157964119
40	NC_009900	GCTTA	2	10	79553	79562	20 %	40 %	20 %	20 %	157964120
41	NC_009900	ACAAT	2	10	79917	79926	60 %	20 %	0 %	20 %	157964121
42	NC_009900	GTTAT	2	10	80542	80551	20 %	60 %	20 %	0 %	157964122
43	NC_009900	GTAGA	2	10	80848	80857	40 %	20 %	40 %	0 %	157964122
44	NC_009900	CAATG	2	10	83200	83209	40 %	20 %	20 %	20 %	157964124
45	NC_009900	ATAAA	2	10	83663	83672	80 %	20 %	0 %	0 %	157964125
46	NC_009900	ATTAA	2	10	84372	84381	60 %	40 %	0 %	0 %	157964125
47	NC_009900	GAAAA	2	10	84928	84937	80 %	0 %	20 %	0 %	157964126
48	NC_009900	GCTTG	2	10	85243	85252	0 %	40 %	40 %	20 %	157964126
49	NC_009900	CGCAT	3	15	92944	92958	20 %	20 %	20 %	40 %	157964131
50	NC_009900	TGAAA	2	10	96187	96196	60 %	20 %	20 %	0 %	157964133
51	NC_009900	TTTTA	2	10	98331	98340	20 %	80 %	0 %	0 %	157964134
52	NC_009900	TTGAT	2	10	98383	98392	20 %	60 %	20 %	0 %	157964134
53	NC_009900	ATTTA	2	10	100087	100096	40 %	60 %	0 %	0 %	157964136
54	NC_009900	TCAAA	2	10	101744	101753	60 %	20 %	0 %	20 %	157964138
55	NC_009900	TTAAT	2	10	102534	102543	40 %	60 %	0 %	0 %	157964139
56	NC_009900	AAACT	2	10	105104	105113	60 %	20 %	0 %	20 %	157964141
57	NC_009900	TTAGT	2	10	105455	105464	20 %	60 %	20 %	0 %	157964142
58	NC_009900	CCAAA	2	10	107892	107901	60 %	0 %	0 %	40 %	157964144
59	NC_009900	CGGAT	2	10	108440	108449	20 %	20 %	40 %	20 %	157964145
60	NC_009900	ATTAT	2	10	110136	110145	40 %	60 %	0 %	0 %	157964146
61	NC_009900	TTTTC	2	10	110998	111007	0 %	80 %	0 %	20 %	157964146
62	NC_009900	ATTTA	2	10	111869	111878	40 %	60 %	0 %	0 %	157964146
63	NC_009900	GCAAA	2	10	115851	115860	60 %	0 %	20 %	20 %	157964147
64	NC_009900	ATAAA	2	10	121769	121778	80 %	20 %	0 %	0 %	157964150
65	NC_009900	AAGTA	2	10	122375	122384	60 %	20 %	20 %	0 %	157964151
66	NC_009900	ATTCG	2	10	124207	124216	20 %	40 %	20 %	20 %	157964154
67	NC_009900	TAAAA	2	10	124547	124556	80 %	20 %	0 %	0 %	157964155
68	NC_009900	AAAAC	2	10	125243	125252	80 %	0 %	0 %	20 %	157964155
69	NC_009900	TTTAA	2	10	125319	125328	40 %	60 %	0 %	0 %	157964155
70	NC_009900	TGAAA	2	10	126769	126778	60 %	20 %	20 %	0 %	157964157
71	NC_009900	GCAAG	2	10	127382	127391	40 %	0 %	40 %	20 %	157964158
72	NC_009900	TTAAA	2	10	129321	129330	60 %	40 %	0 %	0 %	157964160
73	NC_009900	CTTGT	2	10	129811	129820	0 %	60 %	20 %	20 %	157964160
74	NC_009900	ATGAT	2	10	130876	130885	40 %	40 %	20 %	0 %	157964161
75	NC_009900	GGCTT	2	10	131212	131221	0 %	40 %	40 %	20 %	157964162
76	NC_009900	TTGCT	2	10	133044	133053	0 %	60 %	20 %	20 %	157964164
77	NC_009900	AAATC	2	10	134742	134751	60 %	20 %	0 %	20 %	157964167
78	NC_009900	TTAAC	2	10	135879	135888	40 %	40 %	0 %	20 %	157964168
79	NC_009900	TATAA	2	10	135971	135980	60 %	40 %	0 %	0 %	157964168
80	NC_009900	TTATA	2	10	136345	136354	40 %	60 %	0 %	0 %	157964169
81	NC_009900	TTTTA	2	10	137871	137880	20 %	80 %	0 %	0 %	157964170
82	NC_009900	GCTTT	2	10	139447	139456	0 %	60 %	20 %	20 %	157964171
83	NC_009900	TATGT	2	10	140097	140106	20 %	60 %	20 %	0 %	157964171
84	NC_009900	GTTTT	2	10	142692	142701	0 %	80 %	20 %	0 %	157964172
85	NC_009900	ACAAG	2	10	147223	147232	60 %	0 %	20 %	20 %	157964173
86	NC_009900	AGTTT	2	10	147565	147574	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
87	NC_009900	TTAGT	2	10	148088	148097	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
88	NC_009900	ATATA	2	10	148994	149003	60 %	40 %	0 %	0 %	157964174
89	NC_009900	TGCAG	2	10	149082	149091	20 %	20 %	40 %	20 %	157964174
90	NC_009900	GTTAT	2	10	149498	149507	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
91	NC_009900	AATTT	2	10	158864	158873	40 %	60 %	0 %	0 %	157964178
92	NC_009900	AGGTG	2	10	158970	158979	20 %	20 %	60 %	0 %	157964178
93	NC_009900	GAAGT	2	10	162845	162854	40 %	20 %	40 %	0 %	157964182
94	NC_009900	AAATT	2	10	166147	166156	60 %	40 %	0 %	0 %	157964187
95	NC_009900	TATCA	2	10	166524	166533	40 %	40 %	0 %	20 %	157964187
96	NC_009900	TAGCT	2	10	166611	166620	20 %	40 %	20 %	20 %	157964187
97	NC_009900	TATAT	2	10	166838	166847	40 %	60 %	0 %	0 %	157964188
98	NC_009900	TTATT	2	10	167473	167482	20 %	80 %	0 %	0 %	157964188
99	NC_009900	AATTT	2	10	167894	167903	40 %	60 %	0 %	0 %	157964189
100	NC_009900	ATTTT	2	10	168281	168290	20 %	80 %	0 %	0 %	157964189
101	NC_009900	AGCCG	2	10	168486	168495	20 %	0 %	40 %	40 %	157964189
102	NC_009900	TGTTT	2	10	172055	172064	0 %	80 %	20 %	0 %	157964192
103	NC_009900	TGGTG	2	10	172421	172430	0 %	40 %	60 %	0 %	157964193
104	NC_009900	TTAAT	2	10	173321	173330	40 %	60 %	0 %	0 %	157964195
105	NC_009900	AAGAA	2	10	174933	174942	80 %	0 %	20 %	0 %	157964195
106	NC_009900	CAGGG	2	10	175545	175554	20 %	0 %	60 %	20 %	157964196
107	NC_009900	ATATC	2	10	176319	176328	40 %	40 %	0 %	20 %	157964197
108	NC_009900	TGGAT	2	10	177097	177106	20 %	40 %	40 %	0 %	157964199
109	NC_009900	GTGCC	2	10	178561	178570	0 %	20 %	40 %	40 %	157964199
110	NC_009900	ACATA	2	10	179627	179636	60 %	20 %	0 %	20 %	157964200
111	NC_009900	ACAGA	2	10	179685	179694	60 %	0 %	20 %	20 %	157964201
112	NC_009900	TAAAA	2	10	180742	180751	80 %	20 %	0 %	0 %	157964202
113	NC_009900	TATAC	2	10	191165	191174	40 %	40 %	0 %	20 %	157964207
114	NC_009900	GTAGA	2	10	191574	191583	40 %	20 %	40 %	0 %	157964207
115	NC_009900	TAAAA	2	10	200771	200780	80 %	20 %	0 %	0 %	157964213
116	NC_009900	TAGCA	2	10	200882	200891	40 %	20 %	20 %	20 %	157964213
117	NC_009900	TAAAG	2	10	201764	201773	60 %	20 %	20 %	0 %	157964214
118	NC_009900	GAATT	2	10	205635	205644	40 %	40 %	20 %	0 %	157964218
119	NC_009900	ATATA	2	10	210786	210795	60 %	40 %	0 %	0 %	157964223
120	NC_009900	AATTT	2	10	210796	210805	40 %	60 %	0 %	0 %	157964223
121	NC_009900	AAAAC	2	10	211216	211225	80 %	0 %	0 %	20 %	157964224
122	NC_009900	AAAGT	2	10	211538	211547	60 %	20 %	20 %	0 %	157964224
123	NC_009900	AATAA	2	10	212104	212113	80 %	20 %	0 %	0 %	157964224
124	NC_009900	AATTA	2	10	212365	212374	60 %	40 %	0 %	0 %	157964224
125	NC_009900	TTAAA	2	10	214979	214988	60 %	40 %	0 %	0 %	157964227
126	NC_009900	GTGCG	2	10	215625	215634	0 %	20 %	60 %	20 %	157964227
127	NC_009900	AGCTA	2	10	215844	215853	40 %	20 %	20 %	20 %	157964227
128	NC_009900	CCTTG	2	10	216167	216176	0 %	40 %	20 %	40 %	157964227
129	NC_009900	ATATA	2	10	217417	217426	60 %	40 %	0 %	0 %	157964228
130	NC_009900	CAATA	2	10	218289	218298	60 %	20 %	0 %	20 %	157964228
131	NC_009900	CTTGT	2	10	219173	219182	0 %	60 %	20 %	20 %	157964230
132	NC_009900	TAAAG	2	10	219843	219852	60 %	20 %	20 %	0 %	157964230
133	NC_009900	AAGGC	2	10	222694	222703	40 %	0 %	40 %	20 %	157964233
134	NC_009900	TAAAT	2	10	229289	229298	60 %	40 %	0 %	0 %	157964240
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