MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 1282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009900	TATT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009900	ATTA	2	8	11213	11220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009900	TTTA	2	8	11367	11374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009900	GATT	2	8	11821	11828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009900	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009900	AATT	2	8	11856	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009900	CTTT	2	8	12407	12414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009900	AAAT	2	8	13367	13374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009900	TAAA	2	8	13663	13670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009900	TAAA	2	8	13821	13828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009900	TCAT	2	8	13944	13951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009900	GCAA	2	8	14290	14297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009900	TCTT	2	8	14368	14375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009900	TAAA	2	8	17756	17763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009900	GATA	2	8	17837	17844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009900	AGCA	2	8	17906	17913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009900	TAAA	2	8	18175	18182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009900	AAAC	2	8	18223	18230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009900	TTAT	2	8	18498	18505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009900	TTTA	2	8	24554	24561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009900	TTAT	2	8	25116	25123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009900	TAAA	2	8	25226	25233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009900	AGCA	2	8	25437	25444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009900	AAGT	2	8	25897	25904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009900	AAAG	2	8	25913	25920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009900	TAAT	2	8	26367	26374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009900	AAGA	2	8	26516	26523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009900	AAAT	2	8	26610	26617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009900	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009900	AAAT	2	8	26925	26932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009900	GTAC	2	8	27323	27330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009900	GAAA	2	8	27405	27412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009900	TAAA	2	8	27491	27498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009900	GATA	2	8	27580	27587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009900	TTAC	2	8	27793	27800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009900	TAAT	2	8	29078	29085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009900	AATT	2	8	33649	33656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009900	TAAA	2	8	35785	35792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009900	ATTT	2	8	35811	35818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009900	TTGT	2	8	35855	35862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009900	TATT	2	8	35934	35941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009900	AATG	2	8	36682	36689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009900	ATAA	2	8	37653	37660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009900	AACA	2	8	37748	37755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009900	CTGA	2	8	39743	39750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009900	ATTG	2	8	39918	39925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009900	TAAA	2	8	40079	40086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009900	ATTT	2	8	40184	40191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009900	ATTA	2	8	40424	40431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009900	TGCT	2	8	40547	40554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009900	GCTT	2	8	40675	40682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009900	ATTA	2	8	41167	41174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009900	AAAT	2	8	41377	41384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009900	TAAT	2	8	41478	41485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009900	AATT	2	8	41564	41571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009900	AAAT	2	8	41664	41671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009900	TAAT	2	8	43645	43652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009900	ATTA	3	12	43676	43687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009900	TAAA	2	8	43698	43705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009900	AGTA	2	8	43819	43826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009900	ATGA	2	8	43913	43920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009900	TAAC	2	8	44103	44110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009900	ATTC	2	8	44614	44621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009900	CGCA	2	8	44659	44666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009900	CAAG	2	8	45008	45015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009900	CAAT	2	8	45690	45697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009900	TCGG	2	8	46422	46429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009900	ATGT	2	8	46582	46589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009900	ATTT	2	8	46740	46747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009900	TTAC	2	8	46819	46826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009900	AGTA	2	8	49319	49326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009900	ATAC	2	8	49545	49552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009900	TTGC	2	8	49683	49690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009900	TGTT	2	8	50049	50056	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009900	TTAA	2	8	50137	50144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009900	ATCT	2	8	51141	51148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009900	TGCT	2	8	51305	51312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009900	TGCT	2	8	51625	51632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009900	TTTA	2	8	51729	51736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009900	TCAC	2	8	51838	51845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009900	TAAA	2	8	51878	51885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009900	ATTA	2	8	52990	52997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009900	ATTA	2	8	55818	55825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009900	TAAA	2	8	56438	56445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009900	ATCT	2	8	57643	57650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009900	TATT	2	8	58918	58925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009900	AACG	2	8	59030	59037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009900	TTAT	2	8	59364	59371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009900	TAAA	2	8	62737	62744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009900	ATTT	2	8	62763	62770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009900	ATTT	2	8	64751	64758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009900	CAAA	2	8	65186	65193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009900	TGTT	2	8	65210	65217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009900	CAAT	2	8	65529	65536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009900	TTAA	2	8	66917	66924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009900	ACAA	2	8	67060	67067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009900	GTAA	2	8	69288	69295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009900	AATA	2	8	75727	75734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009900	CAAT	2	8	75843	75850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009900	TAGA	2	8	76897	76904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009900	TAAA	2	8	76918	76925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009900	TTTA	2	8	76963	76970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009900	AATT	2	8	86645	86652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009900	ATTT	2	8	87672	87679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009900	TATC	2	8	88274	88281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009900	TAGC	2	8	88370	88377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009900	AAAC	2	8	88635	88642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009900	AAAT	2	8	88821	88828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009900	TGGT	2	8	89138	89145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009900	ATAG	2	8	89300	89307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009900	AGGT	2	8	89397	89404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009900	ATAA	2	8	94165	94172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009900	ATCT	2	8	96968	96975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009900	TTTA	2	8	97353	97360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009900	ATTT	2	8	97601	97608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009900	ATTA	2	8	99186	99193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009900	TCCA	2	8	102233	102240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009900	AAGC	2	8	102331	102338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009900	AAAG	2	8	109157	109164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009900	TTTA	2	8	109403	109410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009900	TTTA	2	8	109442	109449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009900	ATTA	2	8	115124	115131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009900	GAAA	2	8	115246	115253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009900	TAAA	2	8	115271	115278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009900	CTCA	2	8	119175	119182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009900	CAAA	2	8	119196	119203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009900	CTAT	2	8	119268	119275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009900	GGTA	2	8	119787	119794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009900	AAGT	2	8	122533	122540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009900	AAAT	2	8	123881	123888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009900	CTAC	2	8	124401	124408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009900	AGTA	2	8	124509	124516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009900	CGCT	2	8	127072	127079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009900	AATT	2	8	131569	131576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009900	TAAT	2	8	131591	131598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009900	TGTT	2	8	132073	132080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009900	TAAT	2	8	133430	133437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009900	TTTG	2	8	134256	134263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009900	CTGT	2	8	138970	138977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009900	TCGC	2	8	150331	150338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009900	TAAT	2	8	151453	151460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009900	TCTT	2	8	151609	151616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009900	ATTT	2	8	151688	151695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009900	TCGT	2	8	151718	151725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009900	TATT	2	8	152207	152214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009900	AAGC	2	8	152466	152473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009900	AATG	2	8	152549	152556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009900	GAAT	2	8	152612	152619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009900	AAAT	2	8	152678	152685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009900	GATA	2	8	153384	153391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009900	TAAA	2	8	153677	153684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009900	GATC	2	8	153729	153736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009900	GAAG	2	8	154042	154049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009900	ATTA	2	8	154360	154367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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