MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 2774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	ATTT	2	8	1465	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	157964075
2	NC_009900	GGCA	2	8	2255	2262	25 %	0 %	50 %	25 %	157964076
3	NC_009900	TTAT	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	157964076
4	NC_009900	TTAT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	157964076
5	NC_009900	CAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	0 %	25 %	157964077
6	NC_009900	TATT	2	8	3680	3687	25 %	75 %	0 %	0 %	157964077
7	NC_009900	TCGC	2	8	3810	3817	0 %	25 %	25 %	50 %	157964077
8	NC_009900	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	157964077
9	NC_009900	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	157964077
10	NC_009900	ATAA	2	8	6965	6972	75 %	25 %	0 %	0 %	157964078
11	NC_009900	ACTT	2	8	7350	7357	25 %	50 %	0 %	25 %	157964079
12	NC_009900	ATTT	2	8	7757	7764	25 %	75 %	0 %	0 %	157964079
13	NC_009900	CTGT	2	8	8178	8185	0 %	50 %	25 %	25 %	157964080
14	NC_009900	AGTA	2	8	14626	14633	50 %	25 %	25 %	0 %	157964081
15	NC_009900	GCTT	2	8	15158	15165	0 %	50 %	25 %	25 %	157964082
16	NC_009900	AATT	2	8	15507	15514	50 %	50 %	0 %	0 %	157964082
17	NC_009900	GCTT	2	8	15781	15788	0 %	50 %	25 %	25 %	157964082
18	NC_009900	GCTG	2	8	16124	16131	0 %	25 %	50 %	25 %	157964083
19	NC_009900	TCTA	2	8	16601	16608	25 %	50 %	0 %	25 %	157964083
20	NC_009900	CTTG	2	8	17082	17089	0 %	50 %	25 %	25 %	157964083
21	NC_009900	GTAA	2	8	19427	19434	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
22	NC_009900	AGAT	2	8	19687	19694	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
23	NC_009900	AGCA	2	8	19806	19813	50 %	0 %	25 %	25 %	157964084
24	NC_009900	AATG	2	8	20074	20081	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
25	NC_009900	ATTA	2	8	20423	20430	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
26	NC_009900	GAAT	2	8	20970	20977	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
27	NC_009900	CAAA	2	8	21089	21096	75 %	0 %	0 %	25 %	157964084
28	NC_009900	TAGT	2	8	21219	21226	25 %	50 %	25 %	0 %	157964084
29	NC_009900	AAGC	2	8	21830	21837	50 %	0 %	25 %	25 %	157964084
30	NC_009900	AATG	2	8	22483	22490	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
31	NC_009900	AAGT	2	8	22668	22675	50 %	25 %	25 %	0 %	157964084
32	NC_009900	AAAG	2	8	22784	22791	75 %	0 %	25 %	0 %	157964084
33	NC_009900	TTCA	2	8	23226	23233	25 %	50 %	0 %	25 %	157964084
34	NC_009900	AATA	2	8	23719	23726	75 %	25 %	0 %	0 %	157964084
35	NC_009900	TAAA	2	8	23865	23872	75 %	25 %	0 %	0 %	157964084
36	NC_009900	GCTA	2	8	27835	27842	25 %	25 %	25 %	25 %	157964085
37	NC_009900	CTAT	2	8	28581	28588	25 %	50 %	0 %	25 %	157964086
38	NC_009900	ATTT	2	8	28624	28631	25 %	75 %	0 %	0 %	157964086
39	NC_009900	TGTC	2	8	28688	28695	0 %	50 %	25 %	25 %	157964086
40	NC_009900	ATAC	2	8	29160	29167	50 %	25 %	0 %	25 %	157964088
41	NC_009900	ATAA	2	8	29584	29591	75 %	25 %	0 %	0 %	157964088
42	NC_009900	CACT	2	8	29678	29685	25 %	25 %	0 %	50 %	157964088
43	NC_009900	TATT	2	8	30502	30509	25 %	75 %	0 %	0 %	157964090
44	NC_009900	AATT	2	8	32156	32163	50 %	50 %	0 %	0 %	157964092
45	NC_009900	TACC	2	8	32246	32253	25 %	25 %	0 %	50 %	157964092
46	NC_009900	GTTA	2	8	32628	32635	25 %	50 %	25 %	0 %	157964092
47	NC_009900	TTAG	2	8	34230	34237	25 %	50 %	25 %	0 %	157964093
48	NC_009900	ACTA	2	8	34679	34686	50 %	25 %	0 %	25 %	157964093
49	NC_009900	TTCC	2	8	34765	34772	0 %	50 %	0 %	50 %	157964093
50	NC_009900	AGCA	2	8	38487	38494	50 %	0 %	25 %	25 %	157964094
51	NC_009900	GAAA	2	8	41869	41876	75 %	0 %	25 %	0 %	157964095
52	NC_009900	ATTT	2	8	41913	41920	25 %	75 %	0 %	0 %	157964095
53	NC_009900	ACAA	2	8	42183	42190	75 %	0 %	0 %	25 %	157964095
54	NC_009900	AAAT	2	8	42387	42394	75 %	25 %	0 %	0 %	157964096
55	NC_009900	ATAA	2	8	42863	42870	75 %	25 %	0 %	0 %	157964096
56	NC_009900	TGCC	2	8	47605	47612	0 %	25 %	25 %	50 %	157964098
57	NC_009900	TATC	2	8	48164	48171	25 %	50 %	0 %	25 %	157964098
58	NC_009900	TTAA	2	8	48187	48194	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
59	NC_009900	TTAT	2	8	53005	53012	25 %	75 %	0 %	0 %	157964100
60	NC_009900	TAAA	2	8	53215	53222	75 %	25 %	0 %	0 %	157964100
61	NC_009900	GAGG	2	8	53241	53248	25 %	0 %	75 %	0 %	157964100
62	NC_009900	TTAT	2	8	53838	53845	25 %	75 %	0 %	0 %	157964100
63	NC_009900	TGCT	2	8	53920	53927	0 %	50 %	25 %	25 %	157964100
64	NC_009900	GTGA	2	8	54027	54034	25 %	25 %	50 %	0 %	157964100
65	NC_009900	CCGC	2	8	54794	54801	0 %	0 %	25 %	75 %	157964100
66	NC_009900	GTTC	2	8	54805	54812	0 %	50 %	25 %	25 %	157964100
67	NC_009900	GACC	2	8	54823	54830	25 %	0 %	25 %	50 %	157964100
68	NC_009900	AAAT	2	8	55543	55550	75 %	25 %	0 %	0 %	157964100
69	NC_009900	TAAG	2	8	55955	55962	50 %	25 %	25 %	0 %	157964101
70	NC_009900	ATAA	2	8	56583	56590	75 %	25 %	0 %	0 %	157964102
71	NC_009900	CTTT	2	8	57283	57290	0 %	75 %	0 %	25 %	157964102
72	NC_009900	ACTT	2	8	57794	57801	25 %	50 %	0 %	25 %	157964103
73	NC_009900	ATAA	2	8	58284	58291	75 %	25 %	0 %	0 %	157964103
74	NC_009900	ATAA	2	8	58338	58345	75 %	25 %	0 %	0 %	157964103
75	NC_009900	CATC	2	8	58475	58482	25 %	25 %	0 %	50 %	157964103
76	NC_009900	ATTT	3	12	58651	58662	25 %	75 %	0 %	0 %	157964103
77	NC_009900	GTTT	2	8	59753	59760	0 %	75 %	25 %	0 %	157964104
78	NC_009900	AGAA	2	8	60005	60012	75 %	0 %	25 %	0 %	157964104
79	NC_009900	AAAG	2	8	60385	60392	75 %	0 %	25 %	0 %	157964105
80	NC_009900	TAAA	2	8	60452	60459	75 %	25 %	0 %	0 %	157964105
81	NC_009900	AAGA	2	8	61565	61572	75 %	0 %	25 %	0 %	157964107
82	NC_009900	AGTC	2	8	61800	61807	25 %	25 %	25 %	25 %	157964107
83	NC_009900	TAAT	2	8	62213	62220	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
84	NC_009900	ATTA	2	8	62289	62296	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
85	NC_009900	GAAT	2	8	63114	63121	50 %	25 %	25 %	0 %	157964108
86	NC_009900	CAAG	2	8	63345	63352	50 %	0 %	25 %	25 %	157964108
87	NC_009900	ATGG	2	8	63668	63675	25 %	25 %	50 %	0 %	157964108
88	NC_009900	AAGA	2	8	63953	63960	75 %	0 %	25 %	0 %	157964108
89	NC_009900	GAAA	2	8	64039	64046	75 %	0 %	25 %	0 %	157964108
90	NC_009900	AATT	2	8	64443	64450	50 %	50 %	0 %	0 %	157964108
91	NC_009900	TTAA	2	8	66314	66321	50 %	50 %	0 %	0 %	157964109
92	NC_009900	GGAA	2	8	66370	66377	50 %	0 %	50 %	0 %	157964109
93	NC_009900	GCAT	2	8	66422	66429	25 %	25 %	25 %	25 %	157964109
94	NC_009900	TGCT	2	8	66649	66656	0 %	50 %	25 %	25 %	157964109
95	NC_009900	AATT	2	8	67257	67264	50 %	50 %	0 %	0 %	157964110
96	NC_009900	TGTT	2	8	67517	67524	0 %	75 %	25 %	0 %	157964110
97	NC_009900	TGAT	2	8	68066	68073	25 %	50 %	25 %	0 %	157964110
98	NC_009900	AATT	2	8	68447	68454	50 %	50 %	0 %	0 %	157964110
99	NC_009900	AAAC	2	8	69021	69028	75 %	0 %	0 %	25 %	157964111
100	NC_009900	ATAA	2	8	69240	69247	75 %	25 %	0 %	0 %	157964111
101	NC_009900	TGTT	2	8	69534	69541	0 %	75 %	25 %	0 %	157964112
102	NC_009900	TTAT	2	8	69667	69674	25 %	75 %	0 %	0 %	157964112
103	NC_009900	AACT	2	8	70056	70063	50 %	25 %	0 %	25 %	157964112
104	NC_009900	GAAT	2	8	70828	70835	50 %	25 %	25 %	0 %	157964113
105	NC_009900	TAAT	2	8	70843	70850	50 %	50 %	0 %	0 %	157964113
106	NC_009900	TCAC	2	8	71061	71068	25 %	25 %	0 %	50 %	157964113
107	NC_009900	ATTT	2	8	71299	71306	25 %	75 %	0 %	0 %	157964113
108	NC_009900	TATT	2	8	71361	71368	25 %	75 %	0 %	0 %	157964113
109	NC_009900	CTTG	2	8	71780	71787	0 %	50 %	25 %	25 %	157964113
110	NC_009900	TGTA	2	8	72169	72176	25 %	50 %	25 %	0 %	157964113
111	NC_009900	TAAT	2	8	72506	72513	50 %	50 %	0 %	0 %	157964113
112	NC_009900	TTAG	2	8	72821	72828	25 %	50 %	25 %	0 %	157964114
113	NC_009900	AAGT	2	8	73177	73184	50 %	25 %	25 %	0 %	157964115
114	NC_009900	ATTT	2	8	73802	73809	25 %	75 %	0 %	0 %	157964116
115	NC_009900	AGAT	2	8	73881	73888	50 %	25 %	25 %	0 %	157964116
116	NC_009900	CAAT	2	8	74530	74537	50 %	25 %	0 %	25 %	157964117
117	NC_009900	ACTA	2	8	74568	74575	50 %	25 %	0 %	25 %	157964117
118	NC_009900	CAAT	2	8	74815	74822	50 %	25 %	0 %	25 %	157964117
119	NC_009900	TTGC	2	8	77669	77676	0 %	50 %	25 %	25 %	157964119
120	NC_009900	GATG	2	8	77770	77777	25 %	25 %	50 %	0 %	157964119
121	NC_009900	ATAG	2	8	77859	77866	50 %	25 %	25 %	0 %	157964119
122	NC_009900	TAAA	2	8	78511	78518	75 %	25 %	0 %	0 %	157964119
123	NC_009900	TAAA	2	8	78535	78542	75 %	25 %	0 %	0 %	157964119
124	NC_009900	TGTT	2	8	79331	79338	0 %	75 %	25 %	0 %	157964120
125	NC_009900	TGTT	2	8	79348	79355	0 %	75 %	25 %	0 %	157964120
126	NC_009900	TTCT	2	8	79618	79625	0 %	75 %	0 %	25 %	157964120
127	NC_009900	GGAT	2	8	79770	79777	25 %	25 %	50 %	0 %	157964120
128	NC_009900	TACT	2	8	79985	79992	25 %	50 %	0 %	25 %	157964121
129	NC_009900	ATTT	2	8	81997	82004	25 %	75 %	0 %	0 %	157964122
130	NC_009900	ATTT	2	8	82167	82174	25 %	75 %	0 %	0 %	157964122
131	NC_009900	AGTT	2	8	82238	82245	25 %	50 %	25 %	0 %	157964123
132	NC_009900	ATCA	2	8	82260	82267	50 %	25 %	0 %	25 %	157964123
133	NC_009900	AAGT	2	8	82427	82434	50 %	25 %	25 %	0 %	157964123
134	NC_009900	AATC	2	8	82509	82516	50 %	25 %	0 %	25 %	157964123
135	NC_009900	TAAA	2	8	82849	82856	75 %	25 %	0 %	0 %	157964124
136	NC_009900	ATCT	2	8	83029	83036	25 %	50 %	0 %	25 %	157964124
137	NC_009900	TGGT	2	8	84668	84675	0 %	50 %	50 %	0 %	157964126
138	NC_009900	GATG	2	8	85054	85061	25 %	25 %	50 %	0 %	157964126
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