MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 plasmid pRMA

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009897	AT	3	6	54	59	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009897	AT	3	6	218	223	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
3	NC_009897	AT	3	6	1106	1111	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
4	NC_009897	TA	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
5	NC_009897	TA	3	6	1306	1311	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
6	NC_009897	AT	3	6	1520	1525	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
7	NC_009897	TA	3	6	1643	1648	50 %	50 %	0 %	0 %	157954007
8	NC_009897	GA	3	6	2100	2105	50 %	0 %	50 %	0 %	157954007
9	NC_009897	AG	3	6	2420	2425	50 %	0 %	50 %	0 %	157954007
10	NC_009897	AG	3	6	2651	2656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009897	AT	3	6	3948	3953	50 %	50 %	0 %	0 %	157954009
12	NC_009897	AG	3	6	4434	4439	50 %	0 %	50 %	0 %	157954009
13	NC_009897	TA	3	6	4626	4631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009897	TA	3	6	4767	4772	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
15	NC_009897	TA	3	6	4908	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
16	NC_009897	AT	3	6	5056	5061	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
17	NC_009897	TA	3	6	5734	5739	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
18	NC_009897	AT	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
19	NC_009897	AT	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	157954010
20	NC_009897	TC	3	6	6225	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009897	TG	3	6	6475	6480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009897	TA	3	6	6584	6589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009897	CT	3	6	6629	6634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009897	TA	3	6	6653	6658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009897	GT	3	6	6809	6814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009897	AT	3	6	7012	7017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009897	TA	3	6	7061	7066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009897	AT	3	6	7088	7093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009897	TA	3	6	7422	7427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009897	AT	3	6	7627	7632	50 %	50 %	0 %	0 %	157954011
31	NC_009897	AG	4	8	7853	7860	50 %	0 %	50 %	0 %	157954011
32	NC_009897	TA	4	8	8047	8054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009897	AT	3	6	8366	8371	50 %	50 %	0 %	0 %	157954012
34	NC_009897	AT	3	6	9395	9400	50 %	50 %	0 %	0 %	157954013
35	NC_009897	AG	3	6	10021	10026	50 %	0 %	50 %	0 %	157954014
36	NC_009897	AT	3	6	10297	10302	50 %	50 %	0 %	0 %	157954014
37	NC_009897	AT	3	6	10585	10590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009897	CT	3	6	10739	10744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009897	TA	3	6	10901	10906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009897	TA	3	6	10993	10998	50 %	50 %	0 %	0 %	157954015
41	NC_009897	CT	3	6	11126	11131	0 %	50 %	0 %	50 %	157954015
42	NC_009897	AT	3	6	11816	11821	50 %	50 %	0 %	0 %	157954015
43	NC_009897	AT	3	6	11868	11873	50 %	50 %	0 %	0 %	157954015
44	NC_009897	TC	3	6	12322	12327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009897	CA	3	6	12450	12455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009897	AT	3	6	13228	13233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009897	GT	3	6	13238	13243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009897	CT	3	6	13581	13586	0 %	50 %	0 %	50 %	157954017
49	NC_009897	TA	3	6	13626	13631	50 %	50 %	0 %	0 %	157954017
50	NC_009897	AT	4	8	13945	13952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009897	TA	3	6	13956	13961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009897	CT	3	6	14316	14321	0 %	50 %	0 %	50 %	157954018
53	NC_009897	AT	3	6	14499	14504	50 %	50 %	0 %	0 %	157954018
54	NC_009897	AT	3	6	14572	14577	50 %	50 %	0 %	0 %	157954018
55	NC_009897	AT	3	6	14873	14878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009897	AT	4	8	14925	14932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009897	AT	4	8	14937	14944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.