MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009883	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	157826386
2	NC_009883	GAACAA	2	12	1539	1550	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157826388
3	NC_009883	TTATAA	2	12	2592	2603	50 %	50 %	0 %	0 %	157826389
4	NC_009883	AAGATA	2	12	3503	3514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826390
5	NC_009883	CTAATA	2	12	4514	4525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157826390
6	NC_009883	GCATTA	2	12	4852	4863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157826390
7	NC_009883	TTTCTT	2	12	8911	8922	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157826394
8	NC_009883	CAAGAG	2	12	9073	9084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157826394
9	NC_009883	CTAATA	2	12	9406	9417	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157826395
10	NC_009883	CCTTTT	2	12	10269	10280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826396
11	NC_009883	TCACTA	2	12	11096	11107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826396
12	NC_009883	TATAGG	2	12	21456	21467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826407
13	NC_009883	TTTTAA	2	12	21475	21486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826407
14	NC_009883	CAAGAA	2	12	28972	28983	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157826415
15	NC_009883	TTTAAA	2	12	29698	29709	50 %	50 %	0 %	0 %	157826415
16	NC_009883	ACTCAG	2	12	31112	31123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157826415
17	NC_009883	TGCATT	2	12	33843	33854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157826418
18	NC_009883	TAAACA	2	12	34984	34995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826419
19	NC_009883	AATATT	2	12	44019	44030	50 %	50 %	0 %	0 %	157826430
20	NC_009883	TTCAAT	2	12	53669	53680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157826440
21	NC_009883	CACTTC	2	12	53810	53821	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	157826440
22	NC_009883	TGCTTT	2	12	57967	57978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157826444
23	NC_009883	CCTTTA	2	12	60227	60238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157826447
24	NC_009883	TTTTAA	2	12	62077	62088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826448
25	NC_009883	AGCAAG	2	12	63314	63325	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157826450
26	NC_009883	CTTTTA	2	12	63670	63681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826450
27	NC_009883	AGTAAT	2	12	64400	64411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157826450
28	NC_009883	ACGATC	2	12	66035	66046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157826451
29	NC_009883	AGATGT	2	12	68447	68458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826454
30	NC_009883	TCAGAA	2	12	68658	68669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826454
31	NC_009883	ATTTTT	2	12	69517	69528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157826455
32	NC_009883	CTATAG	2	12	74778	74789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157826463
33	NC_009883	CAACTA	2	12	75377	75388	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157826464
34	NC_009883	TATATT	2	12	82326	82337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826471
35	NC_009883	TGAAAA	2	12	84855	84866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826472
36	NC_009883	GAATTT	2	12	89393	89404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157826477
37	NC_009883	TTTTAC	2	12	91585	91596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826480
38	NC_009883	TTTAAT	2	12	92075	92086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826480
39	NC_009883	CACCGC	2	12	94080	94091	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157826482
40	NC_009883	TAAAAT	2	12	95336	95347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826483
41	NC_009883	TAGAAA	2	12	95836	95847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826483
42	NC_009883	TAATTT	2	12	95959	95970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826483
43	NC_009883	TACCAT	2	12	99938	99949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826484
44	NC_009883	CGAAAA	2	12	100662	100673	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157826485
45	NC_009883	TATAAA	2	12	100701	100712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826485
46	NC_009883	TAAAAA	2	12	101278	101289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157826486
47	NC_009883	AGATTG	2	12	106562	106573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826489
48	NC_009883	TACTTG	2	12	107915	107926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157826491
49	NC_009883	GTTTTA	2	12	109522	109533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157826494
50	NC_009883	TAAATA	2	12	111223	111234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826496
51	NC_009883	ATTTAA	2	12	114342	114353	50 %	50 %	0 %	0 %	157826500
52	NC_009883	AATTAA	2	12	116034	116045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826501
53	NC_009883	CAAAAT	2	12	116342	116353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826501
54	NC_009883	TTAATG	2	12	117024	117035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157826503
55	NC_009883	TGAATC	2	12	119393	119404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157826505
56	NC_009883	ATCATA	2	12	121794	121805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157826507
57	NC_009883	TTTTCA	2	12	122063	122074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826507
58	NC_009883	TTTATT	2	12	127256	127267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157826514
59	NC_009883	TAAATC	2	12	127654	127665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157826515
60	NC_009883	TTTCTA	2	12	135414	135425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826519
61	NC_009883	ATATTA	2	12	141512	141523	50 %	50 %	0 %	0 %	157826525
62	NC_009883	TGGTAC	2	12	142665	142676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157826527
63	NC_009883	AAGCTG	2	12	146402	146413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826530
64	NC_009883	GCTGCA	2	12	153348	153359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157826538
65	NC_009883	TGCGGT	2	12	153644	153655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157826538
66	NC_009883	TTAAGC	2	12	154361	154372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157826540
67	NC_009883	AATTTT	2	12	155731	155742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826542
68	NC_009883	TAAGAA	2	12	157647	157658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826544
69	NC_009883	AGGTCC	2	12	165163	165174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157826552
70	NC_009883	CCTAAA	2	12	165446	165457	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157826552
71	NC_009883	ATACTA	2	12	170178	170189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157826559
72	NC_009883	ATCTTC	2	12	170591	170602	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157826559
73	NC_009883	TTGCTA	2	12	176190	176201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157826564
74	NC_009883	AGGTGG	2	12	178114	178125	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157826564
75	NC_009883	CAAAGT	2	12	179487	179498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826565
76	NC_009883	TATACC	2	12	179993	180004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826565
77	NC_009883	GCTAAT	2	12	181089	181100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157826566
78	NC_009883	ACTTTT	2	12	181797	181808	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826566
79	NC_009883	TAAAGA	2	12	181925	181936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826566
80	NC_009883	AAACAT	2	12	187549	187560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826567
81	NC_009883	ATTTAT	2	12	190755	190766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826568
82	NC_009883	AGCAAA	2	12	190943	190954	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157826568
83	NC_009883	AAAATC	2	12	191650	191661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826569
84	NC_009883	TTTAAA	2	12	196996	197007	50 %	50 %	0 %	0 %	157826575
85	NC_009883	TTTCTA	2	12	198558	198569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157826575
86	NC_009883	CATGAG	2	12	201600	201611	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826576
87	NC_009883	ATGAAT	2	12	202044	202055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157826577
88	NC_009883	GCTTGA	2	12	205356	205367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157826580
89	NC_009883	ATTTAA	2	12	210466	210477	50 %	50 %	0 %	0 %	157826586
90	NC_009883	AGCAGA	2	12	211889	211900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157826586
91	NC_009883	GGTAAA	2	12	212844	212855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157826588
92	NC_009883	TAAAAA	2	12	219976	219987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157826595
93	NC_009883	CTAAAG	2	12	223672	223683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826600
94	NC_009883	TTAATC	2	12	223697	223708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157826600
95	NC_009883	GATATT	2	12	224633	224644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157826602
96	NC_009883	GTTCTT	2	12	225668	225679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157826603
97	NC_009883	TAGTTT	2	12	234335	234346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157826611
98	NC_009883	ATCAGG	2	12	234480	234491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826611
99	NC_009883	ACCAGC	2	12	234534	234545	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157826611
100	NC_009883	ACGGAT	2	12	238632	238643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826616
101	NC_009883	AGATTT	2	12	249008	249019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157826618
102	NC_009883	ACCAAA	2	12	250194	250205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157826621
103	NC_009883	TTTTAT	2	12	254204	254215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157826623
104	NC_009883	CAAAAT	2	12	257000	257011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826626
105	NC_009883	TGCTTC	2	12	258118	258129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157826627
106	NC_009883	TTTAAA	2	12	259235	259246	50 %	50 %	0 %	0 %	157826628
107	NC_009883	GATTTT	2	12	265246	265257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157826637
108	NC_009883	TGGAGC	2	12	266815	266826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157826638
109	NC_009883	TTAAAG	2	12	268536	268547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157826639
110	NC_009883	AATGCA	2	12	270728	270739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826642
111	NC_009883	AAATCC	2	12	272240	272251	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157826644
112	NC_009883	TTTGGT	2	12	275206	275217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826648
113	NC_009883	GTTGAA	2	12	276749	276760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826650
114	NC_009883	GGTGAT	2	12	277229	277240	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157826650
115	NC_009883	GATATT	2	12	278075	278086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157826651
116	NC_009883	AAAGTA	2	12	278531	278542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157826651
117	NC_009883	TGTAGG	2	12	281152	281163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157826655
118	NC_009883	AAAGCA	2	12	286071	286082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157826661
119	NC_009883	TTTCTG	2	12	286366	286377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157826661
120	NC_009883	GTTTTT	2	12	287881	287892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157826662
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122	NC_009883	CTGTAG	2	12	290751	290762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157826667
123	NC_009883	GCAGAA	2	12	290951	290962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157826667
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133	NC_009883	GATAAT	2	12	332863	332874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157826706
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233	NC_009883	GATGCA	2	12	604036	604047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826986
234	NC_009883	ATTGTA	2	12	616414	616425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157827002
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239	NC_009883	TTCAGC	2	12	632708	632719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157827015
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459	NC_009883	ATAGCA	2	12	1247736	1247747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157827594
460	NC_009883	ATTACC	2	12	1248870	1248881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827595
461	NC_009883	CCTCAT	2	12	1253413	1253424	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	157827600
462	NC_009883	ATGATT	2	12	1256175	1256186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157827602
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464	NC_009883	AAAGAT	2	12	1258610	1258621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157827604
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