MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009883	GCAAG	2	10	6488	6497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009883	ATTAT	2	10	8680	8689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009883	ATTAT	2	10	9832	9841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009883	ATTTT	2	10	13055	13064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009883	ATCTT	2	10	20652	20661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009883	TTATA	2	10	20694	20703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009883	AAGAA	2	10	21662	21671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009883	ATATA	2	10	21676	21685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009883	AATTT	2	10	32054	32063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009883	GAGTA	2	10	35542	35551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009883	TTATA	2	10	39719	39728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009883	GATAA	2	10	44323	44332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009883	ACTAT	2	10	44591	44600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009883	TTATT	2	10	47253	47262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009883	AATAA	2	10	51595	51604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009883	TGAAT	2	10	52235	52244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009883	ATTTT	2	10	52266	52275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009883	AATTC	2	10	52367	52376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009883	TATAT	2	10	66792	66801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009883	AATAT	3	15	68835	68849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009883	AATTA	2	10	70390	70399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009883	ACAAT	2	10	75681	75690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009883	TCATT	2	10	79582	79591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009883	GGTTT	2	10	83333	83342	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009883	TTTAA	2	10	93974	93983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009883	CCAAG	2	10	97366	97375	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009883	TACCA	2	10	98539	98548	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009883	AGATA	2	10	102123	102132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009883	CGCTC	2	10	123322	123331	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_009883	ACTTC	2	10	126348	126357	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009883	AAGAA	2	10	132521	132530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009883	ATATA	2	10	132535	132544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009883	CAAAA	2	10	133130	133139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009883	TTTAA	2	10	163680	163689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009883	TTATA	2	10	167343	167352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009883	TTATA	2	10	172949	172958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009883	GTTAT	2	10	185717	185726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009883	TTTAC	2	10	186001	186010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009883	TAAAA	2	10	202900	202909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009883	TATTT	2	10	203402	203411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009883	TTAAT	2	10	212593	212602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009883	TTATA	2	10	217017	217026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009883	AATTA	2	10	217469	217478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009883	ATTTT	2	10	230299	230308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009883	AAGAA	2	10	230472	230481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009883	ATATA	2	10	230486	230495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009883	CGCTC	2	10	234140	234149	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_009883	AAATT	2	10	235035	235044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009883	AAGAA	2	10	237211	237220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009883	ATATA	2	10	237225	237234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009883	TTTTA	2	10	242043	242052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009883	ATTAC	2	10	242563	242572	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009883	ATTTT	2	10	242899	242908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009883	AAAAT	2	10	249264	249273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009883	AAAAT	2	10	251535	251544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009883	TTCAT	2	10	252227	252236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009883	TAATC	2	10	252841	252850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009883	TCATT	2	10	255443	255452	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009883	TAATT	2	10	256531	256540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009883	TTAAT	2	10	260778	260787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009883	TAAAT	2	10	261327	261336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009883	AGTAA	2	10	267646	267655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009883	TTTTA	2	10	276400	276409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009883	ATAAA	2	10	279092	279101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009883	TAATT	2	10	284309	284318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009883	ATATT	2	10	287585	287594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009883	ATCTT	2	10	291530	291539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009883	TCAAG	2	10	310043	310052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009883	TGTAA	2	10	319218	319227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009883	TCGCT	2	10	320033	320042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009883	ATTAA	2	10	322748	322757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009883	ATATG	2	10	323218	323227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009883	TAAAA	2	10	323458	323467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009883	TAATA	2	10	325933	325942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009883	AAAAC	2	10	325943	325952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009883	ATTAT	2	10	325980	325989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009883	TCATA	2	10	327123	327132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009883	TTCTT	2	10	329371	329380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009883	AAAAG	2	10	329408	329417	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009883	TATAC	2	10	331692	331701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009883	ACCAC	2	10	335673	335682	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_009883	ATTGG	2	10	336104	336113	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009883	AATCT	2	10	337058	337067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009883	TCGCT	2	10	337603	337612	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009883	ATTAT	2	10	338909	338918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009883	TCGCT	2	10	339019	339028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009883	AATTT	2	10	342608	342617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009883	ATTAA	2	10	358501	358510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009883	ACTAT	2	10	370855	370864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009883	GAATA	2	10	373942	373951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009883	AATAC	2	10	374170	374179	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009883	CAAAT	2	10	374273	374282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009883	TTTTG	2	10	374765	374774	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009883	ATATT	2	10	378330	378339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009883	TTTCT	2	10	378957	378966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009883	AGGGT	2	10	379456	379465	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009883	TTATA	2	10	383343	383352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009883	TAATA	2	10	383796	383805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009883	ATATT	2	10	383815	383824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009883	TAAAT	2	10	383864	383873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009883	ATTTG	2	10	385904	385913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009883	AAAAT	2	10	386999	387008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009883	CCTTA	2	10	402406	402415	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009883	TACCC	2	10	402891	402900	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_009883	ATAAA	2	10	409334	409343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009883	CCCAA	2	10	412130	412139	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_009883	CAAAC	2	10	415997	416006	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009883	ATTAT	2	10	422385	422394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009883	ATTTT	2	10	425682	425691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009883	ATTAT	2	10	428242	428251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009883	TTTAT	2	10	429789	429798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009883	AAGAA	2	10	433712	433721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009883	ATATA	2	10	433726	433735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009883	AGTAA	2	10	439004	439013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009883	CTTAA	2	10	441909	441918	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009883	TATGA	2	10	446038	446047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009883	GCAAG	2	10	446111	446120	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009883	TAAAA	2	10	455630	455639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009883	TTTTA	2	10	470092	470101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009883	CGATT	2	10	483884	483893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009883	ATGGA	2	10	484056	484065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009883	TATTT	2	10	488731	488740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009883	TTGTT	2	10	489882	489891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009883	AGATA	2	10	505259	505268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009883	CGCTC	2	10	511073	511082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_009883	ATATT	2	10	512893	512902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009883	AAGAA	2	10	513708	513717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009883	ATATA	2	10	513722	513731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009883	TCATT	2	10	515696	515705	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009883	ATATA	2	10	520714	520723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009883	TATAA	2	10	524084	524093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009883	TTTTA	2	10	533585	533594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009883	AATCG	2	10	538755	538764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009883	ACTTT	2	10	540927	540936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009883	TTTTC	2	10	541746	541755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009883	CGCTC	2	10	545691	545700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_009883	ATAAA	2	10	546881	546890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009883	TTAAA	2	10	548352	548361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009883	CTGCA	2	10	549082	549091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009883	AAATG	2	10	558212	558221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009883	ATATT	2	10	561241	561250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009883	ATTTT	2	10	561598	561607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009883	TAATA	2	10	564421	564430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009883	TTTAA	2	10	574073	574082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009883	AAACA	2	10	576119	576128	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009883	TAGAA	2	10	579594	579603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009883	TTATA	2	10	581556	581565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009883	TAATT	2	10	583983	583992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009883	TAGTT	2	10	589070	589079	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.