MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	TAACG	2	10	1074	1083	40 %	20 %	20 %	20 %	157825127
2	NC_009881	TTAAT	2	10	1960	1969	40 %	60 %	0 %	0 %	157825128
3	NC_009881	TTTTA	2	10	2516	2525	20 %	80 %	0 %	0 %	157825129
4	NC_009881	ATTTA	2	10	2869	2878	40 %	60 %	0 %	0 %	157825129
5	NC_009881	TAAAT	2	10	4828	4837	60 %	40 %	0 %	0 %	157825130
6	NC_009881	GTAGT	2	10	5148	5157	20 %	40 %	40 %	0 %	157825130
7	NC_009881	AGCAC	2	10	6241	6250	40 %	0 %	20 %	40 %	157825131
8	NC_009881	AAATT	2	10	9168	9177	60 %	40 %	0 %	0 %	157825136
9	NC_009881	TCATA	2	10	11471	11480	40 %	40 %	0 %	20 %	157825138
10	NC_009881	TCAGA	2	10	16388	16397	40 %	20 %	20 %	20 %	157825144
11	NC_009881	GAAAC	2	10	16946	16955	60 %	0 %	20 %	20 %	157825144
12	NC_009881	GAAAC	2	10	19551	19560	60 %	0 %	20 %	20 %	157825149
13	NC_009881	CATTA	2	10	21561	21570	40 %	40 %	0 %	20 %	157825154
14	NC_009881	AAGAT	2	10	22565	22574	60 %	20 %	20 %	0 %	157825155
15	NC_009881	GTATG	2	10	29606	29615	20 %	40 %	40 %	0 %	157825165
16	NC_009881	AAGCA	2	10	31897	31906	60 %	0 %	20 %	20 %	157825166
17	NC_009881	AGTAT	2	10	34203	34212	40 %	40 %	20 %	0 %	157825170
18	NC_009881	ACAAA	2	10	35844	35853	80 %	0 %	0 %	20 %	157825173
19	NC_009881	ATTTA	2	10	36158	36167	40 %	60 %	0 %	0 %	157825174
20	NC_009881	AGGTA	2	10	39328	39337	40 %	20 %	40 %	0 %	157825177
21	NC_009881	TCTTT	2	10	39693	39702	0 %	80 %	0 %	20 %	157825177
22	NC_009881	TTTCT	3	15	40949	40963	0 %	80 %	0 %	20 %	157825177
23	NC_009881	AATTT	2	10	47127	47136	40 %	60 %	0 %	0 %	157825182
24	NC_009881	AGTTA	2	10	47336	47345	40 %	40 %	20 %	0 %	157825182
25	NC_009881	TTAAA	2	10	48487	48496	60 %	40 %	0 %	0 %	157825184
26	NC_009881	TAAAC	2	10	50237	50246	60 %	20 %	0 %	20 %	157825186
27	NC_009881	TGTAA	2	10	52530	52539	40 %	40 %	20 %	0 %	157825189
28	NC_009881	TAAAA	2	10	59486	59495	80 %	20 %	0 %	0 %	157825197
29	NC_009881	TTTAT	2	10	60177	60186	20 %	80 %	0 %	0 %	157825199
30	NC_009881	AGTTA	2	10	61123	61132	40 %	40 %	20 %	0 %	157825200
31	NC_009881	ACAAA	2	10	61495	61504	80 %	0 %	0 %	20 %	157825200
32	NC_009881	ACTTT	2	10	62287	62296	20 %	60 %	0 %	20 %	157825201
33	NC_009881	GCTTA	2	10	62476	62485	20 %	40 %	20 %	20 %	157825201
34	NC_009881	TTAAA	2	10	63204	63213	60 %	40 %	0 %	0 %	157825201
35	NC_009881	TTAAT	2	10	63386	63395	40 %	60 %	0 %	0 %	157825202
36	NC_009881	AGATA	2	10	65267	65276	60 %	20 %	20 %	0 %	157825203
37	NC_009881	ATTTT	2	10	66473	66482	20 %	80 %	0 %	0 %	157825205
38	NC_009881	ATTTA	2	10	69218	69227	40 %	60 %	0 %	0 %	157825209
39	NC_009881	AAAAG	2	10	69994	70003	80 %	0 %	20 %	0 %	157825209
40	NC_009881	GGTTG	2	10	70205	70214	0 %	40 %	60 %	0 %	157825209
41	NC_009881	TTTAT	2	10	70580	70589	20 %	80 %	0 %	0 %	157825209
42	NC_009881	GCTTA	2	10	71766	71775	20 %	40 %	20 %	20 %	157825210
43	NC_009881	ACAAT	2	10	72127	72136	60 %	20 %	0 %	20 %	157825211
44	NC_009881	GTTAT	2	10	72752	72761	20 %	60 %	20 %	0 %	157825212
45	NC_009881	GTAGA	2	10	73058	73067	40 %	20 %	40 %	0 %	157825212
46	NC_009881	TAAAT	2	10	74782	74791	60 %	40 %	0 %	0 %	157825213
47	NC_009881	CAATG	2	10	75410	75419	40 %	20 %	20 %	20 %	157825214
48	NC_009881	ATAAA	2	10	75873	75882	80 %	20 %	0 %	0 %	157825215
49	NC_009881	ATTAA	2	10	76579	76588	60 %	40 %	0 %	0 %	157825215
50	NC_009881	GAAAA	2	10	77061	77070	80 %	0 %	20 %	0 %	157825216
51	NC_009881	TTTAG	2	10	80997	81006	20 %	60 %	20 %	0 %	157825220
52	NC_009881	TCAAA	2	10	82241	82250	60 %	20 %	0 %	20 %	157825221
53	NC_009881	ACCGC	2	10	84241	84250	20 %	0 %	20 %	60 %	157825222
54	NC_009881	CGTTA	2	10	85869	85878	20 %	40 %	20 %	20 %	157825225
55	NC_009881	TTGAT	2	10	89919	89928	20 %	60 %	20 %	0 %	157825228
56	NC_009881	GCAAA	2	10	90429	90438	60 %	0 %	20 %	20 %	157825228
57	NC_009881	ATTTA	2	10	91795	91804	40 %	60 %	0 %	0 %	157825230
58	NC_009881	TTAAT	2	10	94251	94260	40 %	60 %	0 %	0 %	157825233
59	NC_009881	AACCG	2	10	95667	95676	40 %	0 %	20 %	40 %	157825234
60	NC_009881	TATGT	2	10	98869	98878	20 %	60 %	20 %	0 %	157825237
61	NC_009881	TAATA	2	10	100871	100880	60 %	40 %	0 %	0 %	157825241
62	NC_009881	ATAAC	2	10	100939	100948	60 %	20 %	0 %	20 %	157825241
63	NC_009881	TTAAC	2	10	101345	101354	40 %	40 %	0 %	20 %	157825242
64	NC_009881	TATAT	2	10	101448	101457	40 %	60 %	0 %	0 %	157825242
65	NC_009881	TTGAT	2	10	101655	101664	20 %	60 %	20 %	0 %	157825242
66	NC_009881	TTTGT	2	10	104216	104225	0 %	80 %	20 %	0 %	157825242
67	NC_009881	ATTGT	2	10	104863	104872	20 %	60 %	20 %	0 %	157825242
68	NC_009881	TTAAC	2	10	107160	107169	40 %	40 %	0 %	20 %	157825243
69	NC_009881	TATAT	2	10	107263	107272	40 %	60 %	0 %	0 %	157825243
70	NC_009881	TTGAT	2	10	107470	107479	20 %	60 %	20 %	0 %	157825243
71	NC_009881	ATTAT	2	10	107651	107660	40 %	60 %	0 %	0 %	157825243
72	NC_009881	ATTTA	2	10	109399	109408	40 %	60 %	0 %	0 %	157825243
73	NC_009881	ATTTT	2	10	110885	110894	20 %	80 %	0 %	0 %	157825243
74	NC_009881	AAAGC	2	10	116183	116192	60 %	0 %	20 %	20 %	157825246
75	NC_009881	TTATA	2	10	119037	119046	40 %	60 %	0 %	0 %	157825249
76	NC_009881	TTGTC	2	10	119111	119120	0 %	60 %	20 %	20 %	157825249
77	NC_009881	ATAAA	2	10	119198	119207	80 %	20 %	0 %	0 %	157825249
78	NC_009881	TTTTG	2	10	119794	119803	0 %	80 %	20 %	0 %	157825250
79	NC_009881	TAAAA	2	10	121447	121456	80 %	20 %	0 %	0 %	157825252
80	NC_009881	AAAAC	2	10	122143	122152	80 %	0 %	0 %	20 %	157825252
81	NC_009881	TTTAA	2	10	122219	122228	40 %	60 %	0 %	0 %	157825252
82	NC_009881	TGAAA	2	10	123669	123678	60 %	20 %	20 %	0 %	157825254
83	NC_009881	ATTGA	2	10	128664	128673	40 %	40 %	20 %	0 %	157825263
84	NC_009881	GCAAG	2	10	130237	130246	40 %	0 %	40 %	20 %	157825264
85	NC_009881	ACTAT	2	10	130838	130847	40 %	40 %	0 %	20 %	157825266
86	NC_009881	CTTGT	2	10	132589	132598	0 %	60 %	20 %	20 %	157825268
87	NC_009881	ATGAT	2	10	133733	133742	40 %	40 %	20 %	0 %	157825269
88	NC_009881	GGCTT	2	10	134069	134078	0 %	40 %	40 %	20 %	157825270
89	NC_009881	AAATC	2	10	135482	135491	60 %	20 %	0 %	20 %	157825273
90	NC_009881	TTATA	2	10	137083	137092	40 %	60 %	0 %	0 %	157825274
91	NC_009881	TTTTA	2	10	138819	138828	20 %	80 %	0 %	0 %	157825275
92	NC_009881	TTAGA	2	10	139171	139180	40 %	40 %	20 %	0 %	157825275
93	NC_009881	TATGT	2	10	141102	141111	20 %	60 %	20 %	0 %	157825276
94	NC_009881	GTTTT	2	10	143313	143322	0 %	80 %	20 %	0 %	157825277
95	NC_009881	CTTGG	2	10	144130	144139	0 %	40 %	40 %	20 %	157825277
96	NC_009881	ATTGC	2	10	147640	147649	20 %	40 %	20 %	20 %	157825278
97	NC_009881	ACAAG	2	10	147907	147916	60 %	0 %	20 %	20 %	157825278
98	NC_009881	TTAGT	2	10	148764	148773	20 %	60 %	20 %	0 %	157825279
99	NC_009881	ATATA	2	10	149667	149676	60 %	40 %	0 %	0 %	157825279
100	NC_009881	TGCAG	2	10	149755	149764	20 %	20 %	40 %	20 %	157825279
101	NC_009881	AGATA	2	10	150778	150787	60 %	20 %	20 %	0 %	157825279
102	NC_009881	CAAAG	2	10	152693	152702	60 %	0 %	20 %	20 %	157825280
103	NC_009881	ATGCA	2	10	153097	153106	40 %	20 %	20 %	20 %	157825280
104	NC_009881	AGATC	2	10	154229	154238	40 %	20 %	20 %	20 %	157825280
105	NC_009881	AAAGA	2	10	155740	155749	80 %	0 %	20 %	0 %	157825283
106	NC_009881	AAAGA	2	10	158052	158061	80 %	0 %	20 %	0 %	157825285
107	NC_009881	AACGG	2	10	159010	159019	40 %	0 %	40 %	20 %	157825287
108	NC_009881	AGCAT	2	10	159689	159698	40 %	20 %	20 %	20 %	157825288
109	NC_009881	AATTT	2	10	160219	160228	40 %	60 %	0 %	0 %	157825289
110	NC_009881	AGGTG	2	10	160325	160334	20 %	20 %	60 %	0 %	157825289
111	NC_009881	GGGCG	2	10	161409	161418	0 %	0 %	80 %	20 %	157825290
112	NC_009881	AGGAT	2	10	162484	162493	40 %	20 %	40 %	0 %	157825290
113	NC_009881	ATATT	2	10	168238	168247	40 %	60 %	0 %	0 %	157825298
114	NC_009881	TAAGT	2	10	168318	168327	40 %	40 %	20 %	0 %	157825298
115	NC_009881	AATTT	2	10	169291	169300	40 %	60 %	0 %	0 %	157825299
116	NC_009881	ATTTT	2	10	169678	169687	20 %	80 %	0 %	0 %	157825299
117	NC_009881	AGCCG	2	10	169883	169892	20 %	0 %	40 %	40 %	157825299
118	NC_009881	GCTAA	2	10	171707	171716	40 %	20 %	20 %	20 %	157825302
119	NC_009881	CAAAA	2	10	173223	173232	80 %	0 %	0 %	20 %	157825303
120	NC_009881	TGGTG	2	10	173921	173930	0 %	40 %	60 %	0 %	157825304
121	NC_009881	TAACT	2	10	175032	175041	40 %	40 %	0 %	20 %	157825308
122	NC_009881	TTAAT	2	10	175317	175326	40 %	60 %	0 %	0 %	157825309
123	NC_009881	ATATC	2	10	178468	178477	40 %	40 %	0 %	20 %	157825311
124	NC_009881	AAGAT	2	10	179316	179325	60 %	20 %	20 %	0 %	157825313
125	NC_009881	ACATA	2	10	181733	181742	60 %	20 %	0 %	20 %	157825314
126	NC_009881	ACAGA	2	10	181792	181801	60 %	0 %	20 %	20 %	157825315
127	NC_009881	GCAAA	2	10	184029	184038	60 %	0 %	20 %	20 %	157825318
128	NC_009881	TATAC	2	10	193292	193301	40 %	40 %	0 %	20 %	157825321
129	NC_009881	GTAGA	2	10	193701	193710	40 %	20 %	40 %	0 %	157825321
130	NC_009881	AGGTG	2	10	196275	196284	20 %	20 %	60 %	0 %	157825323
131	NC_009881	CAAGG	2	10	197891	197900	40 %	0 %	40 %	20 %	157825324
132	NC_009881	CTTTT	2	10	201600	201609	0 %	80 %	0 %	20 %	157825327
133	NC_009881	TAAAA	2	10	202803	202812	80 %	20 %	0 %	0 %	157825327
134	NC_009881	TTTGC	2	10	202889	202898	0 %	60 %	20 %	20 %	157825327
135	NC_009881	TAGCA	2	10	202914	202923	40 %	20 %	20 %	20 %	157825327
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