MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 3664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	TAAT	2	8	587	594	50 %	50 %	0 %	0 %	157825126
2	NC_009881	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	157825126
3	NC_009881	ATTA	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	157825127
4	NC_009881	TTAT	2	8	2677	2684	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
5	NC_009881	CATT	2	8	2845	2852	25 %	50 %	0 %	25 %	157825129
6	NC_009881	TTAT	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
7	NC_009881	CTAA	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	157825130
8	NC_009881	TATT	2	8	3670	3677	25 %	75 %	0 %	0 %	157825130
9	NC_009881	AAAT	2	8	5104	5111	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
10	NC_009881	AATA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
11	NC_009881	ACCT	2	8	6378	6385	25 %	25 %	0 %	50 %	157825131
12	NC_009881	ACTT	2	8	6853	6860	25 %	50 %	0 %	25 %	157825133
13	NC_009881	ATTT	2	8	7260	7267	25 %	75 %	0 %	0 %	157825134
14	NC_009881	CCTG	2	8	7718	7725	0 %	25 %	25 %	50 %	157825135
15	NC_009881	AAAT	2	8	8979	8986	75 %	25 %	0 %	0 %	157825136
16	NC_009881	ATGG	2	8	9225	9232	25 %	25 %	50 %	0 %	157825136
17	NC_009881	GTTA	2	8	9541	9548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009881	CTAC	2	8	9618	9625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009881	ATTA	2	8	9844	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009881	ACTT	2	8	10158	10165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009881	ATTA	2	8	10222	10229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009881	CTTC	2	8	10759	10766	0 %	50 %	0 %	50 %	157825138
23	NC_009881	CTGT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	25 %	25 %	157825138
24	NC_009881	GATT	2	8	11390	11397	25 %	50 %	25 %	0 %	157825138
25	NC_009881	CTCA	2	8	11826	11833	25 %	25 %	0 %	50 %	157825138
26	NC_009881	AGCA	2	8	11934	11941	50 %	0 %	25 %	25 %	157825138
27	NC_009881	ATAA	2	8	12016	12023	75 %	25 %	0 %	0 %	157825138
28	NC_009881	TTTA	2	8	12639	12646	25 %	75 %	0 %	0 %	157825138
29	NC_009881	ATAA	2	8	12849	12856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009881	TTAA	2	8	12915	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009881	TAAA	2	8	13337	13344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009881	TAAA	2	8	13479	13486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009881	TTTA	2	8	14116	14123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009881	TAAA	2	8	14266	14273	75 %	25 %	0 %	0 %	157825140
35	NC_009881	AGCA	2	8	14372	14379	50 %	0 %	25 %	25 %	157825140
36	NC_009881	AGAT	2	8	14533	14540	50 %	25 %	25 %	0 %	157825141
37	NC_009881	TGCT	2	8	15273	15280	0 %	50 %	25 %	25 %	157825142
38	NC_009881	TAAC	2	8	15427	15434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009881	ATTT	2	8	15836	15843	25 %	75 %	0 %	0 %	157825143
40	NC_009881	AATG	2	8	15858	15865	50 %	25 %	25 %	0 %	157825143
41	NC_009881	ATTT	2	8	16117	16124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009881	GATA	2	8	16240	16247	50 %	25 %	25 %	0 %	157825144
43	NC_009881	AAGA	2	8	16454	16461	75 %	0 %	25 %	0 %	157825144
44	NC_009881	TGGC	2	8	16717	16724	0 %	25 %	50 %	25 %	157825144
45	NC_009881	TGAT	2	8	17109	17116	25 %	50 %	25 %	0 %	157825144
46	NC_009881	CTAT	2	8	17677	17684	25 %	50 %	0 %	25 %	157825145
47	NC_009881	TATT	2	8	17966	17973	25 %	75 %	0 %	0 %	157825146
48	NC_009881	AAAT	2	8	17995	18002	75 %	25 %	0 %	0 %	157825146
49	NC_009881	AAGT	2	8	18248	18255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009881	TATC	2	8	18300	18307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009881	AAAT	2	8	18890	18897	75 %	25 %	0 %	0 %	157825148
52	NC_009881	ACAT	2	8	19048	19055	50 %	25 %	0 %	25 %	157825148
53	NC_009881	TTCA	2	8	19428	19435	25 %	50 %	0 %	25 %	157825149
54	NC_009881	GCAC	2	8	20146	20153	25 %	0 %	25 %	50 %	157825150
55	NC_009881	TGCT	2	8	20402	20409	0 %	50 %	25 %	25 %	157825151
56	NC_009881	TGCT	2	8	20624	20631	0 %	50 %	25 %	25 %	157825152
57	NC_009881	ATTA	2	8	20768	20775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009881	ATTG	2	8	20936	20943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009881	TTTA	2	8	21059	21066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009881	ATTA	2	8	21451	21458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009881	ATAA	2	8	21476	21483	75 %	25 %	0 %	0 %	157825154
62	NC_009881	GTAA	2	8	21572	21579	50 %	25 %	25 %	0 %	157825154
63	NC_009881	TATT	2	8	21763	21770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009881	ATTA	2	8	21814	21821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009881	TTAT	2	8	21830	21837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009881	GTTT	2	8	21888	21895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009881	TGCT	2	8	22350	22357	0 %	50 %	25 %	25 %	157825155
68	NC_009881	TTCT	2	8	22869	22876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009881	TTTA	2	8	23011	23018	25 %	75 %	0 %	0 %	157825156
70	NC_009881	AGAA	2	8	23449	23456	75 %	0 %	25 %	0 %	157825156
71	NC_009881	TGGT	2	8	23462	23469	0 %	50 %	50 %	0 %	157825156
72	NC_009881	ATTT	2	8	23488	23495	25 %	75 %	0 %	0 %	157825156
73	NC_009881	GTTT	2	8	23694	23701	0 %	75 %	25 %	0 %	157825157
74	NC_009881	ATAA	2	8	23961	23968	75 %	25 %	0 %	0 %	157825157
75	NC_009881	TTTC	2	8	24003	24010	0 %	75 %	0 %	25 %	157825157
76	NC_009881	ATTT	2	8	24214	24221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009881	TTAA	2	8	24734	24741	50 %	50 %	0 %	0 %	157825159
78	NC_009881	ACAG	2	8	24912	24919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009881	ATTC	2	8	24997	25004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009881	AAAT	2	8	25191	25198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009881	AATT	2	8	25269	25276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009881	ATTT	2	8	25295	25302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009881	TGCT	2	8	26864	26871	0 %	50 %	25 %	25 %	157825162
84	NC_009881	TGTT	2	8	27584	27591	0 %	75 %	25 %	0 %	157825163
85	NC_009881	TTAC	2	8	28305	28312	25 %	50 %	0 %	25 %	157825164
86	NC_009881	ATAA	2	8	28317	28324	75 %	25 %	0 %	0 %	157825164
87	NC_009881	GGAA	2	8	29631	29638	50 %	0 %	50 %	0 %	157825165
88	NC_009881	AGTT	2	8	29714	29721	25 %	50 %	25 %	0 %	157825165
89	NC_009881	CATG	2	8	29739	29746	25 %	25 %	25 %	25 %	157825165
90	NC_009881	CTAA	2	8	30166	30173	50 %	25 %	0 %	25 %	157825165
91	NC_009881	CTGG	2	8	31048	31055	0 %	25 %	50 %	25 %	157825166
92	NC_009881	ACAT	2	8	31486	31493	50 %	25 %	0 %	25 %	157825166
93	NC_009881	TAAC	2	8	31582	31589	50 %	25 %	0 %	25 %	157825166
94	NC_009881	CATT	2	8	31798	31805	25 %	50 %	0 %	25 %	157825166
95	NC_009881	GCGA	2	8	32216	32223	25 %	0 %	50 %	25 %	157825167
96	NC_009881	AACT	2	8	32432	32439	50 %	25 %	0 %	25 %	157825168
97	NC_009881	AATA	2	8	33783	33790	75 %	25 %	0 %	0 %	157825169
98	NC_009881	AGAA	2	8	34018	34025	75 %	0 %	25 %	0 %	157825169
99	NC_009881	AAGT	2	8	34640	34647	50 %	25 %	25 %	0 %	157825171
100	NC_009881	TGTA	2	8	35158	35165	25 %	50 %	25 %	0 %	157825171
101	NC_009881	ATTA	2	8	35365	35372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009881	AGAC	2	8	35753	35760	50 %	0 %	25 %	25 %	157825173
103	NC_009881	TAAA	2	8	35817	35824	75 %	25 %	0 %	0 %	157825173
104	NC_009881	ATAG	2	8	35861	35868	50 %	25 %	25 %	0 %	157825173
105	NC_009881	AAGA	2	8	35917	35924	75 %	0 %	25 %	0 %	157825173
106	NC_009881	GCAA	2	8	36448	36455	50 %	0 %	25 %	25 %	157825174
107	NC_009881	TTTA	2	8	36890	36897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009881	AAAT	2	8	37631	37638	75 %	25 %	0 %	0 %	157825176
109	NC_009881	TTTA	2	8	38074	38081	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
110	NC_009881	TATT	2	8	38220	38227	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
111	NC_009881	TGAA	2	8	38713	38720	50 %	25 %	25 %	0 %	157825177
112	NC_009881	CTCG	2	8	39406	39413	0 %	25 %	25 %	50 %	157825177
113	NC_009881	TTGT	2	8	39597	39604	0 %	75 %	25 %	0 %	157825177
114	NC_009881	TGAA	2	8	40258	40265	50 %	25 %	25 %	0 %	157825177
115	NC_009881	ATCC	2	8	40470	40477	25 %	25 %	0 %	50 %	157825177
116	NC_009881	CTTT	2	8	41400	41407	0 %	75 %	0 %	25 %	157825177
117	NC_009881	CTGT	2	8	41727	41734	0 %	50 %	25 %	25 %	157825177
118	NC_009881	TTTA	2	8	42370	42377	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
119	NC_009881	TATC	2	8	43253	43260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009881	TTTA	2	8	43335	43342	25 %	75 %	0 %	0 %	157825178
121	NC_009881	TTTA	2	8	43698	43705	25 %	75 %	0 %	0 %	157825178
122	NC_009881	ATTA	2	8	44050	44057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009881	TGCT	2	8	44211	44218	0 %	50 %	25 %	25 %	157825179
124	NC_009881	TACA	2	8	44796	44803	50 %	25 %	0 %	25 %	157825180
125	NC_009881	TAAA	2	8	44850	44857	75 %	25 %	0 %	0 %	157825180
126	NC_009881	CAAG	2	8	44864	44871	50 %	0 %	25 %	25 %	157825180
127	NC_009881	TAGA	2	8	45255	45262	50 %	25 %	25 %	0 %	157825180
128	NC_009881	TTAC	2	8	45274	45281	25 %	50 %	0 %	25 %	157825180
129	NC_009881	AATT	2	8	46292	46299	50 %	50 %	0 %	0 %	157825181
130	NC_009881	AAGC	2	8	46494	46501	50 %	0 %	25 %	25 %	157825181
131	NC_009881	AAGC	2	8	46641	46648	50 %	0 %	25 %	25 %	157825181
132	NC_009881	TTAA	2	8	46657	46664	50 %	50 %	0 %	0 %	157825181
133	NC_009881	ATTC	2	8	46777	46784	25 %	50 %	0 %	25 %	157825181
134	NC_009881	CTAT	2	8	47047	47054	25 %	50 %	0 %	25 %	157825182
135	NC_009881	AAAC	2	8	47213	47220	75 %	0 %	0 %	25 %	157825182
136	NC_009881	TATT	2	8	47510	47517	25 %	75 %	0 %	0 %	157825183
137	NC_009881	GAAA	2	8	47812	47819	75 %	0 %	25 %	0 %	157825184
138	NC_009881	ATGA	2	8	47947	47954	50 %	25 %	25 %	0 %	157825184
139	NC_009881	TATT	2	8	48225	48232	25 %	75 %	0 %	0 %	157825184
140	NC_009881	TTTC	2	8	48770	48777	0 %	75 %	0 %	25 %	157825185
141	NC_009881	CATG	2	8	49326	49333	25 %	25 %	25 %	25 %	157825185
142	NC_009881	AGCA	2	8	49468	49475	50 %	0 %	25 %	25 %	157825185
143	NC_009881	GCTT	2	8	49756	49763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009881	AACT	2	8	50374	50381	50 %	25 %	0 %	25 %	157825186
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