MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 1081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	TAATA	2	10	672	681	60 %	40 %	0 %	0 %	157803190
2	NC_009879	TTTTA	2	10	2672	2681	20 %	80 %	0 %	0 %	157803193
3	NC_009879	GATAT	2	10	2967	2976	40 %	40 %	20 %	0 %	157803193
4	NC_009879	TTATT	2	10	3023	3032	20 %	80 %	0 %	0 %	157803193
5	NC_009879	GGTCA	2	10	4308	4317	20 %	20 %	40 %	20 %	157803194
6	NC_009879	TTTAG	2	10	4577	4586	20 %	60 %	20 %	0 %	157803194
7	NC_009879	ATAAA	2	10	5511	5520	80 %	20 %	0 %	0 %	157803194
8	NC_009879	ATGGG	2	10	9294	9303	20 %	20 %	60 %	0 %	157803198
9	NC_009879	AGCAG	2	10	9626	9635	40 %	0 %	40 %	20 %	157803198
10	NC_009879	TTAAT	2	10	9769	9778	40 %	60 %	0 %	0 %	157803198
11	NC_009879	AGATA	2	10	10371	10380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009879	ATTTT	2	10	12283	12292	20 %	80 %	0 %	0 %	157803201
13	NC_009879	TTTTA	2	10	12806	12815	20 %	80 %	0 %	0 %	157803201
14	NC_009879	AAGAA	2	10	15809	15818	80 %	0 %	20 %	0 %	157803204
15	NC_009879	AAGAA	2	10	15861	15870	80 %	0 %	20 %	0 %	157803204
16	NC_009879	AGATA	2	10	16155	16164	60 %	20 %	20 %	0 %	157803204
17	NC_009879	CCAAA	2	10	16324	16333	60 %	0 %	0 %	40 %	157803204
18	NC_009879	AAAAT	2	10	17492	17501	80 %	20 %	0 %	0 %	157803204
19	NC_009879	AGGAA	2	10	17859	17868	60 %	0 %	40 %	0 %	157803204
20	NC_009879	TAAAT	2	10	22339	22348	60 %	40 %	0 %	0 %	157803206
21	NC_009879	AATAA	2	10	24109	24118	80 %	20 %	0 %	0 %	157803210
22	NC_009879	CTATA	2	10	24515	24524	40 %	40 %	0 %	20 %	157803211
23	NC_009879	TAATA	2	10	24738	24747	60 %	40 %	0 %	0 %	157803211
24	NC_009879	TATCA	2	10	26405	26414	40 %	40 %	0 %	20 %	157803213
25	NC_009879	TATTT	2	10	27389	27398	20 %	80 %	0 %	0 %	157803213
26	NC_009879	ACCAT	2	10	28664	28673	40 %	20 %	0 %	40 %	157803214
27	NC_009879	AATAT	2	10	29803	29812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009879	TAATT	2	10	30062	30071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009879	ATTTA	2	10	31130	31139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009879	TAAGT	2	10	32865	32874	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009879	AGAAA	2	10	33482	33491	80 %	0 %	20 %	0 %	157803220
32	NC_009879	TTTCA	2	10	33923	33932	20 %	60 %	0 %	20 %	157803220
33	NC_009879	ATTTT	2	10	34471	34480	20 %	80 %	0 %	0 %	157803220
34	NC_009879	TTTAA	2	10	36619	36628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009879	TTGAT	2	10	37844	37853	20 %	60 %	20 %	0 %	157803222
36	NC_009879	ATATG	2	10	38037	38046	40 %	40 %	20 %	0 %	157803222
37	NC_009879	CTTTT	2	10	38525	38534	0 %	80 %	0 %	20 %	157803222
38	NC_009879	ATTAT	2	10	38944	38953	40 %	60 %	0 %	0 %	157803222
39	NC_009879	ACTTA	2	10	44779	44788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009879	TACCT	2	10	46127	46136	20 %	40 %	0 %	40 %	157803229
41	NC_009879	CATGA	2	10	46191	46200	40 %	20 %	20 %	20 %	157803229
42	NC_009879	TTTGT	2	10	49522	49531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009879	AACTA	2	10	50884	50893	60 %	20 %	0 %	20 %	157803232
44	NC_009879	ACAAA	2	10	51549	51558	80 %	0 %	0 %	20 %	157803233
45	NC_009879	AAAAC	2	10	51667	51676	80 %	0 %	0 %	20 %	157803233
46	NC_009879	CTATA	2	10	51977	51986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009879	GATAA	2	10	52076	52085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009879	TATAT	2	10	52165	52174	40 %	60 %	0 %	0 %	157803234
49	NC_009879	TGTTA	2	10	52202	52211	20 %	60 %	20 %	0 %	157803234
50	NC_009879	TTAAA	2	10	53272	53281	60 %	40 %	0 %	0 %	157803234
51	NC_009879	CCATA	2	10	56489	56498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009879	ATTTT	2	10	56524	56533	20 %	80 %	0 %	0 %	157803238
53	NC_009879	GGTAA	2	10	57574	57583	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009879	TTTCT	2	10	57694	57703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009879	GGTTG	2	10	58989	58998	0 %	40 %	60 %	0 %	157803239
56	NC_009879	TTTAT	2	10	59364	59373	20 %	80 %	0 %	0 %	157803239
57	NC_009879	GCTTA	2	10	60542	60551	20 %	40 %	20 %	20 %	157803240
58	NC_009879	ACAAT	2	10	60905	60914	60 %	20 %	0 %	20 %	157803241
59	NC_009879	GTTAT	2	10	61530	61539	20 %	60 %	20 %	0 %	157803242
60	NC_009879	GTAGA	2	10	61836	61845	40 %	20 %	40 %	0 %	157803242
61	NC_009879	AATAC	2	10	63320	63329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009879	CAATG	2	10	64158	64167	40 %	20 %	20 %	20 %	157803243
63	NC_009879	ATAAA	2	10	64621	64630	80 %	20 %	0 %	0 %	157803244
64	NC_009879	ATTAT	2	10	65056	65065	40 %	60 %	0 %	0 %	157803244
65	NC_009879	AATTA	2	10	65326	65335	60 %	40 %	0 %	0 %	157803244
66	NC_009879	ATTTT	2	10	65459	65468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009879	CAAAT	2	10	65480	65489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009879	GAAAA	2	10	65912	65921	80 %	0 %	20 %	0 %	157803245
69	NC_009879	TATTT	2	10	68753	68762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009879	ACAAT	2	10	68846	68855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009879	TATTT	2	10	73462	73471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009879	GTGAT	2	10	74533	74542	20 %	40 %	40 %	0 %	157803253
73	NC_009879	TGAAA	2	10	76328	76337	60 %	20 %	20 %	0 %	157803253
74	NC_009879	TTGAT	2	10	77680	77689	20 %	60 %	20 %	0 %	157803254
75	NC_009879	TTGTA	2	10	78453	78462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009879	ATTTA	2	10	79443	79452	40 %	60 %	0 %	0 %	157803256
77	NC_009879	AGATA	2	10	79696	79705	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009879	AATTA	2	10	79815	79824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009879	ATAAA	2	10	83872	83881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009879	TTAGT	2	10	84915	84924	20 %	60 %	20 %	0 %	157803263
81	NC_009879	TTTAT	2	10	87244	87253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009879	AAAAG	2	10	87933	87942	80 %	0 %	20 %	0 %	157803266
83	NC_009879	TAATA	2	10	88158	88167	60 %	40 %	0 %	0 %	157803266
84	NC_009879	ATAAC	2	10	88226	88235	60 %	20 %	0 %	20 %	157803266
85	NC_009879	TCATA	2	10	88255	88264	40 %	40 %	0 %	20 %	157803266
86	NC_009879	ATTAT	2	10	89322	89331	40 %	60 %	0 %	0 %	157803267
87	NC_009879	TCTTG	2	10	89808	89817	0 %	60 %	20 %	20 %	157803267
88	NC_009879	ATTTA	2	10	91157	91166	40 %	60 %	0 %	0 %	157803267
89	NC_009879	ATTTA	2	10	91337	91346	40 %	60 %	0 %	0 %	157803267
90	NC_009879	AATTT	2	10	92902	92911	40 %	60 %	0 %	0 %	157803267
91	NC_009879	ATAAA	2	10	95924	95933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009879	TAGTT	2	10	99062	99071	20 %	60 %	20 %	0 %	157803271
93	NC_009879	ATAAC	2	10	99408	99417	60 %	20 %	0 %	20 %	157803271
94	NC_009879	TAATA	2	10	100173	100182	60 %	40 %	0 %	0 %	157803271
95	NC_009879	TAAAA	2	10	102419	102428	80 %	20 %	0 %	0 %	157803274
96	NC_009879	AAAAT	2	10	102481	102490	80 %	20 %	0 %	0 %	157803274
97	NC_009879	TTTAA	2	10	103191	103200	40 %	60 %	0 %	0 %	157803274
98	NC_009879	TAGTT	2	10	103677	103686	20 %	60 %	20 %	0 %	157803275
99	NC_009879	ATGTT	2	10	107017	107026	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009879	CTTGT	2	10	107574	107583	0 %	60 %	20 %	20 %	157803278
101	NC_009879	TCTTA	2	10	107836	107845	20 %	60 %	0 %	20 %	157803278
102	NC_009879	TATAA	2	10	111541	111550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009879	TTATA	2	10	111910	111919	40 %	60 %	0 %	0 %	157803285
104	NC_009879	CTTTT	2	10	112428	112437	0 %	80 %	0 %	20 %	157803286
105	NC_009879	GTTTT	2	10	113153	113162	0 %	80 %	20 %	0 %	157803286
106	NC_009879	TTTTA	2	10	113602	113611	20 %	80 %	0 %	0 %	157803286
107	NC_009879	CCTCT	2	10	115688	115697	0 %	40 %	0 %	60 %	157803287
108	NC_009879	TATGT	2	10	115861	115870	20 %	60 %	20 %	0 %	157803287
109	NC_009879	AGGAG	2	10	117160	117169	40 %	0 %	60 %	0 %	157803287
110	NC_009879	GTTTT	2	10	118351	118360	0 %	80 %	20 %	0 %	157803288
111	NC_009879	CAGAA	2	10	122880	122889	60 %	0 %	20 %	20 %	157803289
112	NC_009879	TTAGT	2	10	123606	123615	20 %	60 %	20 %	0 %	157803290
113	NC_009879	TGCAG	2	10	124603	124612	20 %	20 %	40 %	20 %	157803290
114	NC_009879	ATGGT	2	10	126136	126145	20 %	40 %	40 %	0 %	157803291
115	NC_009879	TTGGC	2	10	127030	127039	0 %	40 %	40 %	20 %	157803291
116	NC_009879	TATTT	2	10	127073	127082	20 %	80 %	0 %	0 %	157803291
117	NC_009879	CAAAG	2	10	127465	127474	60 %	0 %	20 %	20 %	157803291
118	NC_009879	AATTT	2	10	129943	129952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009879	TATAA	2	10	130013	130022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009879	AAAGA	2	10	130508	130517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009879	TACTT	2	10	131842	131851	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009879	TATAA	2	10	132161	132170	60 %	40 %	0 %	0 %	157803294
123	NC_009879	AAATA	2	10	132225	132234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009879	AGTAT	2	10	133090	133099	40 %	40 %	20 %	0 %	157803296
125	NC_009879	CAATA	2	10	134656	134665	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009879	AATTT	2	10	134799	134808	40 %	60 %	0 %	0 %	157803299
127	NC_009879	AGGTG	2	10	134905	134914	20 %	20 %	60 %	0 %	157803299
128	NC_009879	GATTA	2	10	134950	134959	40 %	40 %	20 %	0 %	157803299
129	NC_009879	GCGGG	2	10	136211	136220	0 %	0 %	80 %	20 %	157803300
130	NC_009879	TTCCG	2	10	136581	136590	0 %	40 %	20 %	40 %	157803300
131	NC_009879	TATAT	2	10	142207	142216	40 %	60 %	0 %	0 %	157803307
132	NC_009879	AATTT	2	10	143406	143415	40 %	60 %	0 %	0 %	157803308
133	NC_009879	ATTTT	2	10	143793	143802	20 %	80 %	0 %	0 %	157803308
134	NC_009879	GTGAT	2	10	146925	146934	20 %	40 %	40 %	0 %	157803310
135	NC_009879	AAAAC	2	10	147805	147814	80 %	0 %	0 %	20 %	157803312
136	NC_009879	AAGAA	2	10	151183	151192	80 %	0 %	20 %	0 %	157803315
137	NC_009879	TGGAT	2	10	151239	151248	20 %	40 %	40 %	0 %	157803315
138	NC_009879	ATATC	2	10	152673	152682	40 %	40 %	0 %	20 %	157803318
139	NC_009879	AAGAT	2	10	153521	153530	60 %	20 %	20 %	0 %	157803320
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263	NC_009879	ATTCT	2	10	291701	291710	20 %	60 %	0 %	20 %	157803437
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272	NC_009879	ACATT	2	10	307988	307997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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