MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 3506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009879	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	157803192
3	NC_009879	GGCA	2	8	2326	2333	25 %	0 %	50 %	25 %	157803193
4	NC_009879	TTAT	2	8	2833	2840	25 %	75 %	0 %	0 %	157803193
5	NC_009879	TTAT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	157803193
6	NC_009879	AATA	2	8	5327	5334	75 %	25 %	0 %	0 %	157803194
7	NC_009879	AAGG	2	8	5399	5406	50 %	0 %	50 %	0 %	157803194
8	NC_009879	TCAC	2	8	5554	5561	25 %	25 %	0 %	50 %	157803194
9	NC_009879	TAGT	2	8	6018	6025	25 %	50 %	25 %	0 %	157803194
10	NC_009879	ACCT	2	8	6690	6697	25 %	25 %	0 %	50 %	157803195
11	NC_009879	ATAA	2	8	6781	6788	75 %	25 %	0 %	0 %	157803195
12	NC_009879	ATAA	2	8	6945	6952	75 %	25 %	0 %	0 %	157803195
13	NC_009879	TCAA	2	8	8294	8301	50 %	25 %	0 %	25 %	157803197
14	NC_009879	AGAA	2	8	8746	8753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009879	ATTT	2	8	8844	8851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009879	ATGA	2	8	9123	9130	50 %	25 %	25 %	0 %	157803198
17	NC_009879	CAAA	2	8	9309	9316	75 %	0 %	0 %	25 %	157803198
18	NC_009879	GATC	2	8	9578	9585	25 %	25 %	25 %	25 %	157803198
19	NC_009879	TTGG	2	8	9718	9725	0 %	50 %	50 %	0 %	157803198
20	NC_009879	TAAG	2	8	9894	9901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009879	TAAT	2	8	9915	9922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009879	TAAA	2	8	10112	10119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009879	TAAA	2	8	10139	10146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009879	AGAA	2	8	10349	10356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009879	GTTT	2	8	10510	10517	0 %	75 %	25 %	0 %	157803199
26	NC_009879	GTTT	2	8	11027	11034	0 %	75 %	25 %	0 %	157803200
27	NC_009879	TTAA	2	8	11069	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
28	NC_009879	AATT	2	8	11434	11441	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
29	NC_009879	ATGT	2	8	11684	11691	25 %	50 %	25 %	0 %	157803200
30	NC_009879	CGCA	2	8	12903	12910	25 %	0 %	25 %	50 %	157803201
31	NC_009879	CTTG	2	8	12924	12931	0 %	50 %	25 %	25 %	157803201
32	NC_009879	TAAT	2	8	13083	13090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009879	AAGC	2	8	13446	13453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009879	AGTA	2	8	13490	13497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009879	AATA	2	8	13559	13566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009879	TAAG	2	8	13634	13641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009879	CTAC	2	8	13850	13857	25 %	25 %	0 %	50 %	157803202
38	NC_009879	TTAT	2	8	14646	14653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009879	TAAT	2	8	14683	14690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009879	AAAG	2	8	15383	15390	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
41	NC_009879	AGAA	2	8	15987	15994	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
42	NC_009879	AGTA	2	8	16053	16060	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
43	NC_009879	AATG	2	8	16131	16138	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
44	NC_009879	GGAT	2	8	16391	16398	25 %	25 %	50 %	0 %	157803204
45	NC_009879	AGAA	2	8	16623	16630	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
46	NC_009879	TTAG	2	8	16762	16769	25 %	50 %	25 %	0 %	157803204
47	NC_009879	TAAG	2	8	18230	18237	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
48	NC_009879	GTAT	2	8	18338	18345	25 %	50 %	25 %	0 %	157803204
49	NC_009879	AATA	2	8	18960	18967	75 %	25 %	0 %	0 %	157803204
50	NC_009879	TAAA	2	8	19106	19113	75 %	25 %	0 %	0 %	157803204
51	NC_009879	ATCT	2	8	19620	19627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009879	TTAT	2	8	19819	19826	25 %	75 %	0 %	0 %	157803205
53	NC_009879	ATAA	2	8	19919	19926	75 %	25 %	0 %	0 %	157803205
54	NC_009879	ACTT	2	8	19974	19981	25 %	50 %	0 %	25 %	157803205
55	NC_009879	GCTA	2	8	20625	20632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009879	AATT	2	8	22077	22084	50 %	50 %	0 %	0 %	157803206
57	NC_009879	CGTT	2	8	22217	22224	0 %	50 %	25 %	25 %	157803206
58	NC_009879	TTTA	2	8	22541	22548	25 %	75 %	0 %	0 %	157803207
59	NC_009879	CTAT	2	8	22632	22639	25 %	50 %	0 %	25 %	157803207
60	NC_009879	ATTT	2	8	22675	22682	25 %	75 %	0 %	0 %	157803207
61	NC_009879	TGTC	2	8	22739	22746	0 %	50 %	25 %	25 %	157803207
62	NC_009879	TAAA	2	8	22788	22795	75 %	25 %	0 %	0 %	157803207
63	NC_009879	CATA	2	8	23055	23062	50 %	25 %	0 %	25 %	157803208
64	NC_009879	TTAA	2	8	23127	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009879	ATAC	2	8	23314	23321	50 %	25 %	0 %	25 %	157803209
66	NC_009879	ATAA	2	8	23738	23745	75 %	25 %	0 %	0 %	157803209
67	NC_009879	ACTT	2	8	23833	23840	25 %	50 %	0 %	25 %	157803209
68	NC_009879	TGAA	2	8	24184	24191	50 %	25 %	25 %	0 %	157803210
69	NC_009879	TATT	2	8	24703	24710	25 %	75 %	0 %	0 %	157803211
70	NC_009879	ACGA	2	8	24834	24841	50 %	0 %	25 %	25 %	157803211
71	NC_009879	ATTT	2	8	25134	25141	25 %	75 %	0 %	0 %	157803211
72	NC_009879	TTTA	2	8	25308	25315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009879	ACTA	2	8	26175	26182	50 %	25 %	0 %	25 %	157803213
74	NC_009879	AAGC	2	8	27019	27026	50 %	0 %	25 %	25 %	157803213
75	NC_009879	TTTG	2	8	27768	27775	0 %	75 %	25 %	0 %	157803213
76	NC_009879	AATT	2	8	27804	27811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009879	TTTA	2	8	27875	27882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009879	TTAG	2	8	28108	28115	25 %	50 %	25 %	0 %	157803214
79	NC_009879	AATT	2	8	28260	28267	50 %	50 %	0 %	0 %	157803214
80	NC_009879	TTCC	2	8	28643	28650	0 %	50 %	0 %	50 %	157803214
81	NC_009879	AGCA	2	8	29544	29551	50 %	0 %	25 %	25 %	157803215
82	NC_009879	TTAT	2	8	29740	29747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009879	ATGA	2	8	29891	29898	50 %	25 %	25 %	0 %	157803216
84	NC_009879	AAGT	2	8	30302	30309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009879	CTAG	2	8	30779	30786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009879	TTAA	2	8	30813	30820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009879	ATTT	2	8	30858	30865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009879	ACTT	2	8	31415	31422	25 %	50 %	0 %	25 %	157803217
89	NC_009879	AAAT	2	8	31439	31446	75 %	25 %	0 %	0 %	157803217
90	NC_009879	ATAA	2	8	31915	31922	75 %	25 %	0 %	0 %	157803217
91	NC_009879	AGTA	2	8	32407	32414	50 %	25 %	25 %	0 %	157803218
92	NC_009879	ATTT	2	8	32774	32781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009879	ATTA	3	12	32823	32834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009879	TAAA	2	8	32845	32852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009879	TTAC	2	8	33317	33324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009879	ATCA	2	8	33761	33768	50 %	25 %	0 %	25 %	157803220
97	NC_009879	TTAA	2	8	34653	34660	50 %	50 %	0 %	0 %	157803220
98	NC_009879	TTTA	2	8	34752	34759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009879	AAGT	2	8	35171	35178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009879	AGTA	2	8	35535	35542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009879	TTTC	2	8	36437	36444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009879	TAAA	2	8	36872	36879	75 %	25 %	0 %	0 %	157803222
103	NC_009879	AGCA	2	8	36951	36958	50 %	0 %	25 %	25 %	157803222
104	NC_009879	ATTG	2	8	37281	37288	25 %	50 %	25 %	0 %	157803222
105	NC_009879	TTAT	2	8	37495	37502	25 %	75 %	0 %	0 %	157803222
106	NC_009879	TGCT	2	8	37577	37584	0 %	50 %	25 %	25 %	157803222
107	NC_009879	GTGA	2	8	37684	37691	25 %	25 %	50 %	0 %	157803222
108	NC_009879	GGCA	2	8	38057	38064	25 %	0 %	50 %	25 %	157803222
109	NC_009879	GTTC	2	8	38462	38469	0 %	50 %	25 %	25 %	157803222
110	NC_009879	TAAG	2	8	39509	39516	50 %	25 %	25 %	0 %	157803223
111	NC_009879	ATAA	2	8	40196	40203	75 %	25 %	0 %	0 %	157803224
112	NC_009879	GTAC	2	8	40437	40444	25 %	25 %	25 %	25 %	157803224
113	NC_009879	CTTT	2	8	40896	40903	0 %	75 %	0 %	25 %	157803224
114	NC_009879	ATTA	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	157803225
115	NC_009879	ATAA	2	8	41726	41733	75 %	25 %	0 %	0 %	157803225
116	NC_009879	ATAA	2	8	41780	41787	75 %	25 %	0 %	0 %	157803225
117	NC_009879	CCAA	2	8	41909	41916	50 %	0 %	0 %	50 %	157803225
118	NC_009879	CATC	2	8	41917	41924	25 %	25 %	0 %	50 %	157803225
119	NC_009879	ATTT	3	12	42093	42104	25 %	75 %	0 %	0 %	157803225
120	NC_009879	CAAA	2	8	42213	42220	75 %	0 %	0 %	25 %	157803225
121	NC_009879	TAAT	2	8	42375	42382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009879	TATT	2	8	42606	42613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009879	GTTT	2	8	43220	43227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009879	AGAA	2	8	43472	43479	75 %	0 %	25 %	0 %	157803226
125	NC_009879	AAAG	2	8	43852	43859	75 %	0 %	25 %	0 %	157803227
126	NC_009879	TAAA	2	8	43919	43926	75 %	25 %	0 %	0 %	157803227
127	NC_009879	AAGA	2	8	45253	45260	75 %	0 %	25 %	0 %	157803229
128	NC_009879	TTTG	2	8	45361	45368	0 %	75 %	25 %	0 %	157803229
129	NC_009879	TAAT	2	8	45760	45767	50 %	50 %	0 %	0 %	157803229
130	NC_009879	GAAT	2	8	46654	46661	50 %	25 %	25 %	0 %	157803230
131	NC_009879	AAGT	2	8	46889	46896	50 %	25 %	25 %	0 %	157803230
132	NC_009879	ATGG	2	8	47211	47218	25 %	25 %	50 %	0 %	157803230
133	NC_009879	AAGA	2	8	47496	47503	75 %	0 %	25 %	0 %	157803230
134	NC_009879	GAAA	2	8	47582	47589	75 %	0 %	25 %	0 %	157803230
135	NC_009879	GAGG	2	8	47610	47617	25 %	0 %	75 %	0 %	157803230
136	NC_009879	TATG	2	8	47939	47946	25 %	50 %	25 %	0 %	157803230
137	NC_009879	GCTA	2	8	48077	48084	25 %	25 %	25 %	25 %	157803230
138	NC_009879	TTAA	2	8	48453	48460	50 %	50 %	0 %	0 %	157803231
139	NC_009879	GCAT	2	8	48561	48568	25 %	25 %	25 %	25 %	157803231
140	NC_009879	TTAA	2	8	49056	49063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009879	TGCT	2	8	50134	50141	0 %	50 %	25 %	25 %	157803232
142	NC_009879	TATT	2	8	50220	50227	25 %	75 %	0 %	0 %	157803232
143	NC_009879	ATTT	2	8	50230	50237	25 %	75 %	0 %	0 %	157803232
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