MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 18404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803190
2	NC_009879	TTC	2	6	33	38	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803190
3	NC_009879	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803190
4	NC_009879	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803190
5	NC_009879	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803190
6	NC_009879	TGG	2	6	572	577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157803190
7	NC_009879	CTA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803190
8	NC_009879	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803190
9	NC_009879	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803190
10	NC_009879	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803190
11	NC_009879	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009879	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009879	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009879	AAT	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009879	ATA	2	6	1179	1184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803191
16	NC_009879	TGA	2	6	1238	1243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803191
17	NC_009879	GTA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803191
18	NC_009879	AAT	2	6	1289	1294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803191
19	NC_009879	GCA	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803191
20	NC_009879	ATA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803192
21	NC_009879	GCA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803192
22	NC_009879	ATA	3	9	1751	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803192
23	NC_009879	TGA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803192
24	NC_009879	GCA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803192
25	NC_009879	GAA	2	6	1974	1979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803192
26	NC_009879	AAT	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803192
27	NC_009879	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803192
28	NC_009879	TTA	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803192
29	NC_009879	CTT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803192
30	NC_009879	TTC	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009879	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009879	TCC	3	9	2227	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009879	TTA	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009879	ATT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803193
35	NC_009879	TGA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803193
36	NC_009879	AGC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803193
37	NC_009879	ATA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803193
38	NC_009879	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803193
39	NC_009879	TAA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803193
40	NC_009879	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
41	NC_009879	TAT	2	6	3211	3216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
42	NC_009879	ATT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
43	NC_009879	GAT	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803194
44	NC_009879	AAG	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
45	NC_009879	ATT	2	6	3338	3343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
46	NC_009879	AAT	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
47	NC_009879	CAA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157803194
48	NC_009879	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
49	NC_009879	AGC	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803194
50	NC_009879	AAC	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157803194
51	NC_009879	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
52	NC_009879	GCC	2	6	3868	3873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803194
53	NC_009879	CCG	2	6	3874	3879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803194
54	NC_009879	TAT	2	6	4018	4023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
55	NC_009879	GCA	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803194
56	NC_009879	GAA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
57	NC_009879	CTA	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803194
58	NC_009879	CTA	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803194
59	NC_009879	TAA	2	6	4369	4374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
60	NC_009879	GGA	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157803194
61	NC_009879	AGG	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157803194
62	NC_009879	GGA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157803194
63	NC_009879	GAA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
64	NC_009879	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
65	NC_009879	AAG	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
66	NC_009879	GAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
67	NC_009879	TAA	2	6	4990	4995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
68	NC_009879	TGG	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157803194
69	NC_009879	TAT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
70	NC_009879	ATC	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803194
71	NC_009879	GAT	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803194
72	NC_009879	GTT	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803194
73	NC_009879	ATA	2	6	5436	5441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
74	NC_009879	ATT	2	6	5487	5492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
75	NC_009879	CAG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803194
76	NC_009879	GAT	2	6	5528	5533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803194
77	NC_009879	TGC	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157803194
78	NC_009879	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803194
79	NC_009879	CTA	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803194
80	NC_009879	AGT	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803194
81	NC_009879	TTG	2	6	5817	5822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803194
82	NC_009879	TTG	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803194
83	NC_009879	ATA	2	6	5868	5873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
84	NC_009879	TAA	2	6	5937	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
85	NC_009879	ATA	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803194
86	NC_009879	GAA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803194
87	NC_009879	ATG	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803194
88	NC_009879	GAG	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157803194
89	NC_009879	AGT	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009879	AAC	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009879	CTA	3	9	6358	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803195
92	NC_009879	AAT	2	6	6384	6389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803195
93	NC_009879	ATT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803195
94	NC_009879	TAC	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803195
95	NC_009879	CCG	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803195
96	NC_009879	ATC	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803195
97	NC_009879	ATT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803195
98	NC_009879	TAC	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803195
99	NC_009879	ATT	2	6	6738	6743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803195
100	NC_009879	ATT	3	9	6789	6797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803195
101	NC_009879	TAT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803195
102	NC_009879	GGT	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157803195
103	NC_009879	TAC	2	6	7023	7028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803195
104	NC_009879	CTT	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803196
105	NC_009879	TAG	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803196
106	NC_009879	CTA	2	6	7509	7514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803196
107	NC_009879	CAT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803196
108	NC_009879	ATA	3	9	7601	7609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803197
109	NC_009879	GCC	2	6	7648	7653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803197
110	NC_009879	CGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803197
111	NC_009879	TCC	2	6	7750	7755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157803197
112	NC_009879	CTA	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803197
113	NC_009879	ATA	2	6	7811	7816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803197
114	NC_009879	TCT	2	6	7877	7882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803197
115	NC_009879	TAG	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803197
116	NC_009879	ATT	2	6	7939	7944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803197
117	NC_009879	TGA	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803197
118	NC_009879	CGT	2	6	8049	8054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157803197
119	NC_009879	TAT	2	6	8154	8159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803197
120	NC_009879	TAA	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803197
121	NC_009879	CAA	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157803197
122	NC_009879	ATT	2	6	8252	8257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803197
123	NC_009879	AGC	3	9	8389	8397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803197
124	NC_009879	TAG	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803197
125	NC_009879	CTT	2	6	8463	8468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803197
126	NC_009879	ATA	2	6	8522	8527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803197
127	NC_009879	TAC	2	6	8586	8591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803197
128	NC_009879	TGG	3	9	8617	8625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009879	ATA	2	6	8696	8701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009879	GTT	2	6	8859	8864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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