MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 2753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	TA	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	157803190
2	NC_009879	AT	3	6	1020	1025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009879	AT	3	6	1630	1635	50 %	50 %	0 %	0 %	157803192
4	NC_009879	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	157803192
5	NC_009879	TA	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	157803193
6	NC_009879	TG	3	6	2748	2753	0 %	50 %	50 %	0 %	157803193
7	NC_009879	AT	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	157803193
8	NC_009879	AT	3	6	3428	3433	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
9	NC_009879	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	157803194
10	NC_009879	TG	3	6	4076	4081	0 %	50 %	50 %	0 %	157803194
11	NC_009879	AT	3	6	4178	4183	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
12	NC_009879	TC	3	6	4349	4354	0 %	50 %	0 %	50 %	157803194
13	NC_009879	AT	3	6	4488	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
14	NC_009879	AG	3	6	4507	4512	50 %	0 %	50 %	0 %	157803194
15	NC_009879	AG	3	6	4828	4833	50 %	0 %	50 %	0 %	157803194
16	NC_009879	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
17	NC_009879	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
18	NC_009879	AT	3	6	6100	6105	50 %	50 %	0 %	0 %	157803194
19	NC_009879	AT	3	6	6324	6329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009879	TC	3	6	6891	6896	0 %	50 %	0 %	50 %	157803195
21	NC_009879	TA	3	6	8200	8205	50 %	50 %	0 %	0 %	157803197
22	NC_009879	AT	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009879	AT	4	8	9875	9882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009879	TA	4	8	10162	10169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009879	TA	3	6	10239	10244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009879	AT	3	6	10389	10394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009879	TA	3	6	11092	11097	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
28	NC_009879	TA	3	6	11121	11126	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
29	NC_009879	TA	3	6	12220	12225	50 %	50 %	0 %	0 %	157803201
30	NC_009879	CT	3	6	12404	12409	0 %	50 %	0 %	50 %	157803201
31	NC_009879	AT	3	6	12602	12607	50 %	50 %	0 %	0 %	157803201
32	NC_009879	AT	3	6	13022	13027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009879	TA	3	6	13405	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009879	AT	3	6	13706	13711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009879	TG	3	6	14054	14059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009879	TA	3	6	14551	14556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009879	AT	3	6	14621	14626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40	NC_009879	AT	3	6	16983	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	157803204
41	NC_009879	AT	3	6	17059	17064	50 %	50 %	0 %	0 %	157803204
42	NC_009879	AT	3	6	17515	17520	50 %	50 %	0 %	0 %	157803204
43	NC_009879	AG	3	6	18097	18102	50 %	0 %	50 %	0 %	157803204
44	NC_009879	TA	3	6	18779	18784	50 %	50 %	0 %	0 %	157803204
45	NC_009879	AT	3	6	18836	18841	50 %	50 %	0 %	0 %	157803204
46	NC_009879	TA	3	6	19191	19196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009879	TA	3	6	20486	20491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_009879	GA	3	6	21018	21023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54	NC_009879	AG	3	6	23166	23171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_009879	AT	3	6	31692	31697	50 %	50 %	0 %	0 %	157803217
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69	NC_009879	AT	3	6	32152	32157	50 %	50 %	0 %	0 %	157803218
70	NC_009879	CT	3	6	32566	32571	0 %	50 %	0 %	50 %	157803218
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73	NC_009879	AT	3	6	33777	33782	50 %	50 %	0 %	0 %	157803220
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111	NC_009879	TA	4	8	54824	54831	50 %	50 %	0 %	0 %	157803235
112	NC_009879	AT	3	6	55116	55121	50 %	50 %	0 %	0 %	157803235
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115	NC_009879	AT	3	6	57213	57218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009879	AT	3	6	57711	57716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009879	AT	3	6	57829	57834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_009879	AT	3	6	58211	58216	50 %	50 %	0 %	0 %	157803239
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121	NC_009879	AT	3	6	59445	59450	50 %	50 %	0 %	0 %	157803239
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123	NC_009879	TA	3	6	60169	60174	50 %	50 %	0 %	0 %	157803240
124	NC_009879	TA	3	6	60345	60350	50 %	50 %	0 %	0 %	157803240
125	NC_009879	TA	3	6	60883	60888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_009879	TA	3	6	62928	62933	50 %	50 %	0 %	0 %	157803242
130	NC_009879	AT	4	8	63296	63303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009879	TA	3	6	63577	63582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009879	TA	3	6	63895	63900	50 %	50 %	0 %	0 %	157803243
133	NC_009879	AT	3	6	64033	64038	50 %	50 %	0 %	0 %	157803243
134	NC_009879	TA	3	6	64071	64076	50 %	50 %	0 %	0 %	157803243
135	NC_009879	TA	3	6	64079	64084	50 %	50 %	0 %	0 %	157803243
136	NC_009879	AT	3	6	64409	64414	50 %	50 %	0 %	0 %	157803243
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147	NC_009879	TA	3	6	70228	70233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009879	AT	3	6	70234	70239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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