MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter butzleri RM4018 chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009850	AGTTCA	2	12	25288	25299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009850	AAAAAT	2	12	30347	30358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009850	TAGTTG	2	12	68905	68916	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009850	CTAATT	2	12	85445	85456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009850	TATTTT	2	12	106992	107003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009850	CAAAAA	2	12	222355	222366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009850	GAATTT	2	12	222443	222454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009850	CAGATA	2	12	224024	224035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009850	TAAAAA	2	12	258205	258216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009850	ACTTAA	2	12	347405	347416	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009850	AAAATA	2	12	373361	373372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009850	ATAAAA	2	12	379371	379382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009850	GAAAAA	2	12	383266	383277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009850	TGAATA	2	12	441651	441662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009850	TAATTA	2	12	510294	510305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009850	AGTTTT	2	12	527422	527433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009850	ATAAAA	2	12	546700	546711	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009850	AATTAA	2	12	564941	564952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009850	GTTTAT	2	12	575411	575422	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009850	ATATTT	2	12	586896	586907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009850	TAATTA	2	12	601189	601200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009850	TTATTT	2	12	612084	612095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009850	AAATTA	2	12	632996	633007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009850	TTAATA	2	12	637400	637411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009850	TTAAAA	2	12	645677	645688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009850	ATTTAT	2	12	685321	685332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009850	TAATAT	2	12	812710	812721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009850	TTTTAT	2	12	853079	853090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009850	TAAAAT	2	12	895798	895809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009850	AACCAC	2	12	919686	919697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009850	AAATAA	2	12	1025632	1025643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009850	AAATTA	2	12	1043254	1043265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009850	TTTATA	2	12	1078069	1078080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009850	GAAAAA	2	12	1172577	1172588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009850	TAAATA	2	12	1175983	1175994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009850	TAATAT	2	12	1214523	1214534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009850	TTTATA	2	12	1215435	1215446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009850	AAATAT	2	12	1229366	1229377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009850	AAATAA	2	12	1231600	1231611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009850	TATTTA	2	12	1450698	1450709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009850	TAAAAA	2	12	1466313	1466324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009850	TTTTAA	2	12	1497145	1497156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009850	ATAAAA	2	12	1565421	1565432	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009850	ATTTTT	2	12	1565976	1565987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009850	TAGTGA	2	12	1571923	1571934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009850	ATTTTT	2	12	1584861	1584872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009850	CAAAAT	2	12	1631537	1631548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009850	ATTTTT	2	12	1668135	1668146	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009850	GATTTT	2	12	1671627	1671638	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009850	TTATTG	2	12	1677806	1677817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009850	ATTGTG	2	12	1680809	1680820	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009850	TTTATA	2	12	1690377	1690388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009850	ATAAAT	2	12	1840613	1840624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009850	ATTTAT	2	12	1840632	1840643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009850	CTAAAA	2	12	1854336	1854347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009850	TTACTA	2	12	1854390	1854401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009850	ACTTTA	2	12	1876294	1876305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009850	AATAAA	2	12	1878169	1878180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009850	TTTAAT	2	12	1929454	1929465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009850	CTTTAA	2	12	2018727	2018738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009850	TATAAA	2	12	2160429	2160440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009850	AGCAAA	2	12	2237167	2237178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009850	TAAAAA	2	12	2264722	2264733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009850	ATTTTA	2	12	2290617	2290628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009850	TAATAT	2	12	2293695	2293706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009850	TTTAAA	2	12	2304837	2304848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.