MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter butzleri RM4018 chromosome

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009850	TTAAA	2	10	13264	13273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009850	AGTTA	2	10	29086	29095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009850	ATTTT	2	10	48476	48485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009850	AAAGC	2	10	50971	50980	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009850	ATTTT	2	10	51031	51040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009850	TCTTT	2	10	57334	57343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009850	AGATA	2	10	65766	65775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009850	AAAAG	2	10	78371	78380	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009850	TAAAT	2	10	82959	82968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009850	ATAAA	2	10	118071	118080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009850	TATAA	2	10	123886	123895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009850	TATAA	2	10	132718	132727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009850	TTTCT	2	10	134231	134240	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009850	TAAAA	2	10	144177	144186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009850	TATAG	2	10	146867	146876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009850	TTAAT	2	10	156617	156626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009850	AATAA	2	10	162717	162726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009850	GTCTC	2	10	169848	169857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009850	GTCTC	2	10	170076	170085	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009850	TTCTA	2	10	183296	183305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009850	AAACA	2	10	221917	221926	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009850	TAGAT	2	10	223131	223140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009850	TCAGG	2	10	223301	223310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009850	ATTTT	2	10	223530	223539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009850	TTCAA	2	10	224346	224355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009850	TTTAT	2	10	226296	226305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009850	AGTAA	2	10	239637	239646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009850	AAATT	2	10	268124	268133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009850	ATTTA	2	10	274387	274396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009850	ATGTA	2	10	282035	282044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009850	AATTT	2	10	285678	285687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009850	TTCTA	2	10	331743	331752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009850	TATAA	2	10	344493	344502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009850	TGCAA	2	10	344519	344528	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009850	TATAC	2	10	344603	344612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009850	AATAA	2	10	347510	347519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009850	TAAAT	2	10	368363	368372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009850	TTAAT	2	10	368391	368400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009850	TAAAA	2	10	368432	368441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009850	CATTT	2	10	372934	372943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009850	AATTT	2	10	377268	377277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009850	ATAAG	2	10	380994	381003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009850	ATCTT	2	10	400093	400102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009850	ATATT	2	10	409687	409696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009850	TGATA	2	10	418208	418217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009850	TTAAT	2	10	431395	431404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009850	TTAAA	2	10	433540	433549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009850	TTAAA	2	10	433629	433638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009850	TTTTA	2	10	445028	445037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009850	CTTTT	2	10	453318	453327	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009850	TTAAA	2	10	469397	469406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009850	TCTTT	2	10	483265	483274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009850	AAAGA	2	10	483280	483289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009850	AAAAG	2	10	483293	483302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009850	GGGTA	2	10	485867	485876	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009850	CTTTC	2	10	489781	489790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009850	TTAAT	2	10	490881	490890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009850	ATTTT	2	10	499537	499546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009850	TTAGT	2	10	500905	500914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009850	AGCAT	2	10	516982	516991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009850	AACTA	2	10	519369	519378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009850	CAAAA	2	10	519675	519684	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009850	AACTA	2	10	519751	519760	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009850	AATAA	2	10	519787	519796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009850	ATCTA	2	10	527608	527617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009850	ATAAA	2	10	553696	553705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009850	AAATA	2	10	573587	573596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009850	ATATT	2	10	581397	581406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009850	TTAAA	2	10	592557	592566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009850	TCTTT	2	10	600969	600978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009850	TGTTA	2	10	601285	601294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009850	AATTA	2	10	603665	603674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009850	TAAAA	2	10	622805	622814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009850	ATAAA	2	10	633303	633312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009850	CAATA	2	10	637476	637485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009850	TAATA	2	10	645588	645597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009850	TTAAA	2	10	645649	645658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009850	TAAAT	2	10	664098	664107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009850	TAATA	2	10	709672	709681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009850	ATATT	2	10	709704	709713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009850	ATAAA	2	10	733868	733877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009850	TTATT	2	10	740284	740293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009850	TAAAT	2	10	744730	744739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009850	TGTAA	2	10	748073	748082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009850	AATTA	2	10	788515	788524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009850	ATATA	2	10	791536	791545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009850	AAATA	2	10	791563	791572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009850	TATTT	2	10	794102	794111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009850	AAAGT	2	10	794220	794229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009850	TAAAA	2	10	798691	798700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009850	AGATA	4	20	798769	798788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009850	TTAAA	2	10	812750	812759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009850	TATAA	2	10	842070	842079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009850	TGTAT	2	10	847695	847704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009850	TCGTG	2	10	848509	848518	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009850	AGTGA	2	10	849844	849853	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009850	CCGTA	2	10	851302	851311	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009850	TTATT	2	10	868918	868927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009850	TATAA	2	10	885202	885211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009850	ATTAT	2	10	902749	902758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009850	TATAT	2	10	915645	915654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009850	ATTTG	2	10	920787	920796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009850	TAAAT	2	10	956995	957004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009850	ATAAA	2	10	966853	966862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009850	TAAAT	2	10	969257	969266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009850	TATAA	2	10	998168	998177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009850	TAAAT	2	10	1019467	1019476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009850	ATTTT	2	10	1025584	1025593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009850	TAAAG	2	10	1063054	1063063	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009850	ATTTT	2	10	1066640	1066649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009850	TGCAC	2	10	1080740	1080749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009850	GTTTT	2	10	1080766	1080775	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009850	ATATT	2	10	1096950	1096959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009850	AATAT	2	10	1100275	1100284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009850	TAAAA	2	10	1113768	1113777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009850	AATAT	2	10	1117896	1117905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009850	ATTTA	2	10	1155226	1155235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009850	CTTTT	2	10	1158167	1158176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009850	TAATT	2	10	1160674	1160683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009850	TAAAA	2	10	1160694	1160703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009850	GAATT	2	10	1172589	1172598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009850	ATTAT	2	10	1202847	1202856	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009850	TTACA	2	10	1223880	1223889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009850	TATTT	2	10	1229174	1229183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009850	TAAAT	2	10	1244525	1244534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009850	TATTT	2	10	1252132	1252141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009850	TTTAT	2	10	1263472	1263481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009850	TATAA	2	10	1270462	1270471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009850	ATCTA	2	10	1283615	1283624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009850	TTTTA	2	10	1286548	1286557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009850	TTATA	2	10	1305338	1305347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009850	CTTAT	2	10	1320118	1320127	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009850	AAGGT	2	10	1326059	1326068	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009850	TTATT	2	10	1326086	1326095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009850	ACTAA	2	10	1326494	1326503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009850	ATCAC	2	10	1326533	1326542	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009850	AAAGA	2	10	1329186	1329195	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009850	TAAAA	2	10	1334824	1334833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009850	TTTAT	2	10	1341367	1341376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009850	TGCTC	2	10	1348430	1348439	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009850	TATAA	2	10	1349218	1349227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009850	TTTTC	2	10	1350668	1350677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009850	TAGTT	2	10	1368749	1368758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009850	TCTTT	2	10	1407996	1408005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009850	ATTTT	2	10	1421759	1421768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009850	TTATA	2	10	1422042	1422051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009850	TTAAA	2	10	1434071	1434080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009850	TTGTT	2	10	1437964	1437973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009850	ATTTT	2	10	1679260	1679269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009850	CTTTT	2	10	1688442	1688451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_009850	AGTTG	2	10	1703238	1703247	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009850	ATTTT	2	10	1709729	1709738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_009850	ATTGA	2	10	2291236	2291245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009850	TGATT	2	10	2293801	2293810	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009850	TCTTT	2	10	2307144	2307153	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_009850	ATTTT	2	10	2315479	2315488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009850	TTTTA	2	10	2334402	2334411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.