MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus pumilus SAFR-032 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009848	TTCTTA	2	12	24065	24076	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009848	TTAATA	2	12	60849	60860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009848	AATGAA	2	12	61917	61928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009848	TCGATT	2	12	69516	69527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009848	AGTCAA	2	12	76166	76177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009848	AATAAA	2	12	166029	166040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009848	ATTTTT	2	12	174086	174097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009848	GTATAT	2	12	182830	182841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009848	CATAAA	2	12	199216	199227	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009848	TGAAAT	2	12	226655	226666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009848	TTGCAT	2	12	231673	231684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009848	ACCTTC	2	12	235344	235355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009848	ACCTTC	2	12	235541	235552	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009848	TGTGAA	2	12	294758	294769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009848	AGAAAA	2	12	367860	367871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009848	AGAAAT	2	12	370321	370332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009848	AAAATA	2	12	528787	528798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009848	TGAATT	2	12	542636	542647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009848	TCTTTT	2	12	560301	560312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009848	TGAAAA	2	12	590902	590913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009848	AGAGTC	2	12	681598	681609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009848	ATTCGT	2	12	682049	682060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009848	TTTACG	2	12	770198	770209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009848	TTGTGT	2	12	784019	784030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009848	GCGGCA	2	12	784392	784403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009848	GATAGG	2	12	817803	817814	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009848	TCACGA	2	12	850334	850345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009848	ACCTTT	2	12	870179	870190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009848	TCAATT	2	12	873143	873154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009848	TTAACT	2	12	911917	911928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009848	GAAATC	2	12	934910	934921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009848	AGAAAG	2	12	945536	945547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009848	AATGAA	2	12	980646	980657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009848	TCATTT	2	12	1003401	1003412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009848	AAAACA	2	12	1004687	1004698	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009848	TGATAA	2	12	1062718	1062729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009848	AAATGA	2	12	1102070	1102081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009848	AAAAGG	2	12	1111385	1111396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009848	AACCTT	2	12	1118615	1118626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009848	GAAAAA	2	12	1139771	1139782	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009848	TAAAAA	2	12	1140134	1140145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009848	AAGAGA	2	12	1242533	1242544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009848	CCTTTT	2	12	1253207	1253218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009848	AAAGAG	2	12	1261173	1261184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009848	TTTCGT	2	12	1328771	1328782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009848	ATCATT	2	12	1367052	1367063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009848	TTCTTT	2	12	1368188	1368199	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009848	ATCATT	2	12	1371765	1371776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009848	AAAGGA	2	12	1385086	1385097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009848	TGAAAA	2	12	1415493	1415504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009848	GAAATC	2	12	1418886	1418897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009848	ATTCAG	2	12	1454252	1454263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009848	TTGCAG	2	12	1598808	1598819	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009848	TGGTTT	2	12	1644115	1644126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009848	ATGGTA	2	12	1656738	1656749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009848	ATTAAG	2	12	1664171	1664182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009848	ATGAGA	2	12	1683447	1683458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009848	GTTTTT	2	12	1700600	1700611	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009848	AAAGAG	2	12	1702570	1702581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009848	ACGTGT	2	12	1707184	1707195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009848	AGTGAG	2	12	1751344	1751355	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009848	AATTGA	2	12	1752148	1752159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009848	GATTTT	2	12	1766048	1766059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009848	ACATCT	2	12	1766156	1766167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009848	TTTTTA	2	12	1769260	1769271	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009848	CTTTAT	2	12	1779691	1779702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009848	TCAAGG	2	12	1782143	1782154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009848	AGGTTG	2	12	1786941	1786952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009848	ATTGTC	2	12	1794211	1794222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009848	TTTTTC	2	12	1914296	1914307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009848	CTTTTT	2	12	1918439	1918450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009848	CTTTTA	2	12	1933165	1933176	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009848	CTTTTT	2	12	1940909	1940920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009848	TATGTA	2	12	1981161	1981172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009848	TTCTGC	2	12	1987229	1987240	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009848	CATTTT	2	12	1996676	1996687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009848	TCTCAT	2	12	2049488	2049499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009848	TGTATA	2	12	2057327	2057338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009848	TAGTAT	2	12	2067804	2067815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009848	AAAAGG	2	12	2069589	2069600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009848	TATAAA	2	12	2075336	2075347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009848	GGAAAA	2	12	2106212	2106223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009848	CCATGA	2	12	2127001	2127012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009848	TTTTTA	2	12	2141553	2141564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009848	AAATGT	2	12	2228233	2228244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009848	TACTTG	2	12	2249961	2249972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009848	AAGAGA	2	12	2262490	2262501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009848	TTGTTT	2	12	2270861	2270872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009848	TGACTT	2	12	2294303	2294314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009848	CTAATA	2	12	2320227	2320238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009848	GGAGAA	2	12	2324134	2324145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009848	CTAATA	2	12	2324179	2324190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009848	AATTTT	2	12	2335025	2335036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009848	AAAAGA	2	12	2410778	2410789	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009848	CTTTTC	2	12	2414164	2414175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009848	TGATTT	2	12	2428912	2428923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009848	GGGCGC	2	12	2438906	2438917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009848	AAAAAG	2	12	2454206	2454217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009848	GAAAAA	2	12	2471685	2471696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009848	TTTGCA	2	12	2541770	2541781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009848	CTTTAA	2	12	2566125	2566136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009848	ATTATC	2	12	2603538	2603549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009848	ATCATA	2	12	2645801	2645812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009848	GCAACT	2	12	2684802	2684813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009848	TTTATA	2	12	2717628	2717639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009848	GAATTA	2	12	2733167	2733178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009848	CAATGG	2	12	2742387	2742398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009848	AGATGG	2	12	2742910	2742921	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009848	CTCCAA	2	12	2752143	2752154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009848	TTTTCT	2	12	2755774	2755785	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009848	GAAATC	2	12	2782827	2782838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009848	TATTAC	2	12	2819348	2819359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009848	CAAAAA	2	12	2915809	2915820	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009848	TTTTAT	2	12	2942970	2942981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009848	AATGAT	2	12	2980590	2980601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009848	AATTGA	2	12	2980759	2980770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009848	TGATTT	2	12	3012381	3012392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009848	TTAGCT	2	12	3013524	3013535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009848	TTTAAG	2	12	3014125	3014136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009848	CTTCCC	2	12	3036389	3036400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009848	TCATTT	2	12	3052252	3052263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009848	TCCTGT	2	12	3111035	3111046	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009848	TTTCAT	2	12	3142188	3142199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009848	ATAAAA	2	12	3148064	3148075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009848	TGTTTT	2	12	3246084	3246095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009848	TCATCC	2	12	3246117	3246128	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.