MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9215 chromosome

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009840	AATTT	2	10	117	126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009840	TCATT	2	10	30356	30365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009840	ATATT	2	10	33571	33580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009840	CAATA	2	10	42003	42012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009840	TTTTA	2	10	56126	56135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009840	TTTGA	2	10	66328	66337	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009840	TTGTA	2	10	73034	73043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009840	AATTT	2	10	73126	73135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009840	TAAAT	2	10	78387	78396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009840	TAAAT	2	10	109699	109708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009840	AGATT	2	10	114691	114700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009840	AATTT	2	10	128953	128962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009840	TTATT	2	10	161840	161849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009840	AATTC	2	10	169064	169073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009840	TATTT	2	10	192013	192022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009840	TTAAA	2	10	220773	220782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009840	ATCTA	2	10	232459	232468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009840	TAATT	2	10	236541	236550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009840	TTTTG	2	10	283470	283479	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009840	ATTGT	2	10	300577	300586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009840	CAATT	2	10	319852	319861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009840	TCGTG	2	10	320905	320914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009840	GGGAG	2	10	322425	322434	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009840	GGTGG	2	10	323540	323549	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009840	TTAAA	2	10	329994	330003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009840	TAAGT	2	10	333664	333673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009840	TCTTT	2	10	337811	337820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009840	GTTTT	2	10	338814	338823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009840	CATAA	2	10	340139	340148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009840	ATTTT	2	10	340722	340731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009840	TTATT	2	10	342480	342489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009840	TTTTA	2	10	344926	344935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009840	ATTTT	2	10	347642	347651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009840	TAAAA	2	10	347729	347738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009840	ATTAA	2	10	348635	348644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009840	ATTTA	2	10	349959	349968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009840	AATTT	2	10	350295	350304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009840	TGAAA	2	10	350947	350956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009840	CTTTT	2	10	357433	357442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009840	GAAAT	2	10	361929	361938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009840	AAGTG	2	10	372006	372015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009840	AAAGA	2	10	407339	407348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009840	ATCTT	2	10	412972	412981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009840	TAATT	2	10	420472	420481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009840	AATTA	2	10	427374	427383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009840	TAAAT	2	10	428049	428058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009840	TTTAA	2	10	437509	437518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009840	AATTA	2	10	442054	442063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009840	TTTTA	2	10	442124	442133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009840	ATTTA	2	10	447437	447446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009840	ATTAA	2	10	451735	451744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009840	CTTAA	2	10	451775	451784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009840	GTATT	2	10	484492	484501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009840	TTGAA	2	10	527700	527709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009840	ACCTT	2	10	530211	530220	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009840	ACATT	2	10	533440	533449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009840	ATTTG	2	10	536288	536297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009840	GCTAT	2	10	540373	540382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009840	TTTTC	2	10	547453	547462	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009840	TTTAA	2	10	552456	552465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009840	AAAAT	2	10	567568	567577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009840	ATTTA	2	10	572833	572842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009840	TTTCT	2	10	575868	575877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009840	ATTTT	2	10	575889	575898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009840	ATTCA	2	10	622562	622571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009840	TTAAA	2	10	631063	631072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009840	AAAAT	2	10	633708	633717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009840	ATTTT	2	10	636507	636516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009840	ATTTT	2	10	658299	658308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009840	TAATT	2	10	675581	675590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009840	TTAAT	2	10	675591	675600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009840	TATTT	2	10	678534	678543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009840	CTTTT	2	10	689928	689937	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009840	TTTTA	2	10	690132	690141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009840	GATTT	2	10	690319	690328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009840	TTTCT	2	10	690545	690554	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009840	GTTGC	2	10	690875	690884	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009840	ACTTA	2	10	691488	691497	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009840	GTCGA	2	10	691578	691587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009840	TTGCT	2	10	697208	697217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009840	ATTTG	2	10	697331	697340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009840	TAATA	2	10	719558	719567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009840	TAATG	2	10	719587	719596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009840	TTTGA	2	10	721719	721728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009840	TAATT	2	10	721755	721764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009840	TTCGT	2	10	726206	726215	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009840	ATTTA	2	10	763406	763415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009840	AAAAT	2	10	764540	764549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009840	TTCGC	2	10	777411	777420	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009840	ATTTA	2	10	779735	779744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009840	CTATT	2	10	788744	788753	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009840	TTAAA	2	10	790012	790021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009840	AATTT	2	10	790819	790828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009840	TAAAA	2	10	795241	795250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009840	TTTGA	2	10	813880	813889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009840	ATTTA	2	10	829019	829028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009840	AAATT	2	10	834742	834751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009840	ATTTT	2	10	834763	834772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009840	CTAAT	2	10	840065	840074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009840	ATATT	2	10	864840	864849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009840	TTTAA	2	10	891978	891987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009840	TCATA	2	10	893730	893739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009840	AATTA	2	10	900907	900916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009840	ATATT	2	10	900922	900931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009840	AATTA	2	10	905278	905287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009840	GTTAA	2	10	905651	905660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009840	ATTTA	2	10	907738	907747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009840	TAATA	2	10	921783	921792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009840	ATTAA	2	10	944161	944170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009840	TAAAA	2	10	944937	944946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009840	TTCAA	2	10	947820	947829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009840	TTTAT	2	10	949402	949411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009840	AAATT	2	10	950586	950595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009840	AAAAT	2	10	951928	951937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009840	TCTTT	2	10	962490	962499	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009840	AAAAT	2	10	965838	965847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009840	TAATA	2	10	965931	965940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009840	TTAAT	2	10	968606	968615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009840	TAAAT	2	10	969440	969449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009840	AAATT	2	10	977633	977642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009840	TAATT	4	20	979645	979664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009840	TAATT	2	10	989939	989948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009840	ATCAA	2	10	994586	994595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009840	TTATA	2	10	995133	995142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009840	ATTAA	2	10	1011560	1011569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009840	ATTAA	2	10	1029042	1029051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009840	TAAAA	2	10	1033239	1033248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009840	CATAT	2	10	1074283	1074292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009840	TTAAT	2	10	1074334	1074343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009840	TTTAT	2	10	1077982	1077991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009840	GGAAT	2	10	1079963	1079972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009840	CATAA	2	10	1080886	1080895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009840	CAAAA	2	10	1091507	1091516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009840	ATTTA	2	10	1092987	1092996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009840	TTAGT	2	10	1095186	1095195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009840	AATTT	2	10	1095196	1095205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009840	CAAAA	2	10	1098700	1098709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009840	AAGTA	2	10	1101861	1101870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009840	AAGTT	2	10	1101899	1101908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009840	TTTTA	2	10	1103298	1103307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009840	AATTA	2	10	1103764	1103773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009840	ATTTA	2	10	1106570	1106579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009840	TCAAG	2	10	1108737	1108746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009840	GTTTT	2	10	1110387	1110396	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009840	AAATT	2	10	1118902	1118911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009840	AAAAT	2	10	1119119	1119128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009840	TTATA	2	10	1119154	1119163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.