MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009839	AATTTA	2	12	19356	19367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009839	TTTTAT	2	12	26559	26570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009839	TATTTA	2	12	39493	39504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009839	TTTATT	2	12	43261	43272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009839	TACAGC	2	12	76869	76880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009839	CTTTTA	2	12	77023	77034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009839	ATTTTT	2	12	174245	174256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009839	ATATTA	2	12	180532	180543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009839	AAATTT	2	12	210090	210101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009839	TATTTT	2	12	212087	212098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009839	TTAATT	2	12	226969	226980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009839	TATATT	2	12	227542	227553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009839	AAAAAT	2	12	228951	228962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009839	TGGTTT	2	12	230610	230621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009839	TATATT	2	12	243716	243727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009839	TATAAA	2	12	243854	243865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009839	TAAAAT	2	12	279042	279053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009839	TAAATT	2	12	349412	349423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009839	TATTTT	2	12	373303	373314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009839	TGTGTT	2	12	380733	380744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009839	TTTTGT	2	12	396753	396764	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009839	TTAAAA	2	12	397810	397821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009839	TATTTA	2	12	405365	405376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009839	TTTATT	2	12	409133	409144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009839	ATTTTA	2	12	465351	465362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009839	TATAAA	2	12	468029	468040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009839	ATCTTA	2	12	468055	468066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009839	AATTTA	2	12	482891	482902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009839	AAAATA	2	12	499255	499266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009839	TTTTAA	2	12	527839	527850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009839	TAATAG	2	12	618875	618886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009839	ATTTAA	2	12	627818	627829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009839	TTTATT	2	12	637970	637981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009839	TAAATT	2	12	638039	638050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009839	CTTAAA	2	12	646273	646284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009839	TTAAAA	2	12	647956	647967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009839	AAAAAT	2	12	650809	650820	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009839	ATTTTT	2	12	655192	655203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009839	ATAATT	2	12	678806	678817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009839	TTAAAT	2	12	698378	698389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009839	TATTTA	2	12	708543	708554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009839	TTTATT	2	12	712311	712322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009839	AAATTT	2	12	712431	712442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009839	TTATTT	2	12	713725	713736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009839	AAATTT	2	12	774457	774468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009839	AATTTT	2	12	787755	787766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009839	AAATTA	2	12	816461	816472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009839	ACAAAG	2	12	830077	830088	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009839	TTTTTA	2	12	832550	832561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009839	AATAAA	2	12	878946	878957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009839	TCAAAT	2	12	885277	885288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009839	TAAAAA	2	12	885359	885370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009839	ATCTTA	2	12	914083	914094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009839	ATTATA	2	12	917035	917046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009839	TATAAA	2	12	919773	919784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009839	ATCTTA	2	12	919799	919810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009839	ATTTTG	2	12	971162	971173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009839	TTATAA	2	12	996231	996242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009839	ATTTTA	2	12	1046358	1046369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009839	TTAATT	2	12	1148938	1148949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009839	AAATTT	2	12	1149936	1149947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009839	TTAATT	2	12	1177046	1177057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009839	CAAAAA	2	12	1309255	1309266	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009839	TTAATT	2	12	1318528	1318539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009839	ACTAAA	2	12	1437140	1437151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009839	TATAAT	2	12	1445658	1445669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009839	CAAAAA	2	12	1471771	1471782	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009839	ATAAAA	2	12	1479208	1479219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009839	ATTTTT	2	12	1501948	1501959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009839	TTAATT	2	12	1502021	1502032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009839	TAAATT	2	12	1568282	1568293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009839	ATTTTT	2	12	1571583	1571594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009839	TAAAAA	2	12	1615644	1615655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009839	AGGAAT	2	12	1616012	1616023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009839	AAGCCT	2	12	1624671	1624682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.