MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009839	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009839	TATAT	2	10	37047	37056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009839	CTTTT	2	10	37335	37344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009839	CTTTT	2	10	37506	37515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009839	GGTAA	2	10	37818	37827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009839	TCGTG	2	10	38614	38623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009839	TCTTT	2	10	39642	39651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009839	CCGTA	2	10	41543	41552	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009839	ATTAT	2	10	43600	43609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009839	AGCTT	2	10	61155	61164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009839	AATAA	2	10	75746	75755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009839	AAAAT	2	10	76797	76806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009839	TCTCT	2	10	82291	82300	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009839	TTAAT	2	10	90431	90440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009839	TATTT	2	10	90499	90508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009839	GTATA	2	10	90515	90524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009839	TTAAA	2	10	95255	95264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009839	ATTGT	2	10	95295	95304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009839	AAGAT	2	10	100710	100719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009839	TTATT	2	10	101509	101518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009839	TTAAA	2	10	102535	102544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009839	TATTT	2	10	160600	160609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009839	TTATT	2	10	174812	174821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009839	TATTT	2	10	181969	181978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009839	TAAAA	2	10	192160	192169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009839	AAAAT	2	10	196328	196337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009839	AAGTG	2	10	199214	199223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009839	AGGAT	2	10	200398	200407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009839	TAAAA	2	10	201756	201765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009839	AAAAT	2	10	227054	227063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009839	AAATT	2	10	228890	228899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009839	CTTTT	2	10	228935	228944	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009839	GATTT	2	10	230544	230553	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009839	CATAA	2	10	237395	237404	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009839	ATATT	2	10	248263	248272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009839	ATTAA	2	10	251541	251550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009839	TTAAT	2	10	253457	253466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009839	ATAAA	2	10	278997	279006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009839	AATTT	2	10	286949	286958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009839	TTAAA	2	10	311896	311905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009839	TTTTA	2	10	330814	330823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009839	ATTAA	2	10	346884	346893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009839	CTTTT	2	10	403207	403216	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009839	CTTTT	2	10	403378	403387	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009839	GGTAA	2	10	403690	403699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009839	TCGTG	2	10	404486	404495	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009839	TCTTT	2	10	405514	405523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009839	CCGTA	2	10	407415	407424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009839	CTTAT	2	10	414511	414520	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009839	ATTTT	2	10	419037	419046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009839	TAAAT	2	10	440322	440331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009839	TTGCT	2	10	443684	443693	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009839	GATTT	2	10	457519	457528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009839	ATATT	2	10	465244	465253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009839	AATAA	2	10	465262	465271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009839	TAATT	2	10	465279	465288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009839	AAAAT	2	10	515298	515307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009839	GTTTT	2	10	518394	518403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009839	AAATA	2	10	518703	518712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009839	CATTC	2	10	519419	519428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009839	TTTAA	2	10	519454	519463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009839	TTTTA	2	10	527709	527718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009839	AAAAT	2	10	527743	527752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009839	AATTA	2	10	530203	530212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009839	ATTTG	2	10	546042	546051	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009839	TAAAA	2	10	559904	559913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009839	TTTTA	2	10	581710	581719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009839	GAAAA	2	10	599324	599333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009839	TTTGC	2	10	602845	602854	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009839	AATTA	2	10	618893	618902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009839	TTTAA	2	10	627877	627886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009839	AAAAT	2	10	646207	646216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009839	ATTTT	2	10	646254	646263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009839	TAAAA	2	10	646297	646306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009839	GCTTA	2	10	649202	649211	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009839	TAAAA	3	15	665525	665539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009839	ATAAA	2	10	666348	666357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009839	ATTTA	2	10	667933	667942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009839	TTTAA	2	10	675262	675271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009839	TAAAA	2	10	698325	698334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009839	AAAAT	2	10	698395	698404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009839	ATTTT	2	10	698416	698425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009839	ATTTT	2	10	698488	698497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009839	TTGTA	2	10	704354	704363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009839	CTTTT	2	10	706385	706394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009839	CTTTT	2	10	706556	706565	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009839	GGTAA	2	10	706868	706877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009839	TCGTG	2	10	707664	707673	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009839	TCTTT	2	10	708692	708701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009839	CCGTA	2	10	710593	710602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009839	ATTTA	2	10	720188	720197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009839	TTTTC	2	10	750557	750566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009839	ATTTT	2	10	816449	816458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009839	TTTTA	2	10	816640	816649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009839	AGGTT	2	10	822087	822096	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009839	AAAAT	2	10	830149	830158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009839	AAAAT	2	10	861031	861040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009839	ATTTT	2	10	866695	866704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009839	CTTAA	2	10	878842	878851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009839	TAAAT	2	10	879609	879618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009839	GGAAA	2	10	879858	879867	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009839	AAGAA	2	10	880731	880740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009839	AAAAT	2	10	904936	904945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009839	TTAAT	2	10	916913	916922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009839	AATTA	2	10	943171	943180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009839	TAAAA	2	10	971801	971810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009839	AGCAG	2	10	975004	975013	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009839	TTTAT	2	10	977626	977635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009839	TTAAT	2	10	982725	982734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009839	GTTTT	2	10	1018094	1018103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009839	TATAT	2	10	1062590	1062599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009839	TTTTA	2	10	1068024	1068033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009839	AAATT	2	10	1112500	1112509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009839	TTTAA	2	10	1116103	1116112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009839	AGTTT	2	10	1130412	1130421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009839	ATTTT	2	10	1134602	1134611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009839	TATCA	2	10	1140580	1140589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009839	TAAAA	2	10	1142987	1142996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009839	TTTTA	2	10	1148066	1148075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009839	TTTAT	2	10	1169764	1169773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009839	AAACT	2	10	1169793	1169802	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009839	TTTAA	2	10	1169814	1169823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009839	ATTTA	2	10	1173808	1173817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009839	TATTT	2	10	1189911	1189920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009839	TTTAT	2	10	1189959	1189968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009839	AATTT	2	10	1191708	1191717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009839	TTTCT	2	10	1197180	1197189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009839	ATGTG	2	10	1236119	1236128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009839	TTTAA	2	10	1236266	1236275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009839	AAAAT	2	10	1236287	1236296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009839	TTTAA	2	10	1245720	1245729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009839	AATAT	2	10	1255784	1255793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009839	ATTTT	2	10	1258822	1258831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009839	TATAT	2	10	1258847	1258856	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009839	TTTAG	2	10	1258902	1258911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009839	TATTT	2	10	1284912	1284921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009839	TAAAG	2	10	1285208	1285217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009839	ACAAA	2	10	1285863	1285872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009839	AAAGA	2	10	1285920	1285929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009839	TAATA	2	10	1321223	1321232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009839	AGAAA	2	10	1337264	1337273	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009839	ATTTA	2	10	1352476	1352485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009839	TTTAA	2	10	1373834	1373843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009839	AAATT	2	10	1379790	1379799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009839	TAAAA	2	10	1400498	1400507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009839	ATAAA	2	10	1424647	1424656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.