MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	TTTGT	2	10	1410	1419	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009838	GACAA	2	10	1545	1554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009838	CCCCT	2	10	1834	1843	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_009838	CTGGG	2	10	12581	12590	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009838	CTGGG	2	10	13337	13346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009838	CTGGG	2	10	15043	15052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009838	CATTA	2	10	15158	15167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009838	CTGGG	2	10	15292	15301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009838	GACTG	2	10	15864	15873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009838	TTATC	2	10	49409	49418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009838	ATATT	2	10	49420	49429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009838	GATAA	2	10	49443	49452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009838	AAGCC	2	10	61725	61734	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009838	TTAAA	2	10	76763	76772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009838	GCGCT	2	10	81872	81881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009838	CAATT	2	10	83574	83583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009838	TTATA	2	10	83588	83597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009838	CGCGG	2	10	97444	97453	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009838	CCCGC	2	10	100784	100793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_009838	GGCCT	2	10	107396	107405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009838	ACGTC	2	10	108733	108742	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009838	TTCAT	2	10	135215	135224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009838	TAATT	2	10	135243	135252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009838	TCAAA	2	10	142495	142504	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009838	AAGCA	2	10	152531	152540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009838	GGTGT	2	10	152618	152627	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009838	TGTTA	2	10	152819	152828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009838	ATTTT	2	10	185776	185785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009838	TTCCC	2	10	188541	188550	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_009838	TAAAA	2	10	202412	202421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009838	TGATC	2	10	205075	205084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009838	TGATC	2	10	208130	208139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009838	AGCTG	2	10	210655	210664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009838	AAACA	2	10	219353	219362	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009838	AGAAA	2	10	219376	219385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009838	TAATT	2	10	222775	222784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009838	GATCA	2	10	229555	229564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009838	CATCT	2	10	230574	230583	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009838	TAAAA	2	10	241010	241019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.