MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	ATCC	2	8	22	29	25 %	25 %	0 %	50 %	157412015
2	NC_009838	CTAT	2	8	253	260	25 %	50 %	0 %	25 %	157412015
3	NC_009838	TGAT	2	8	506	513	25 %	50 %	25 %	0 %	157412015
4	NC_009838	GTTG	2	8	534	541	0 %	50 %	50 %	0 %	157412015
5	NC_009838	TATT	2	8	645	652	25 %	75 %	0 %	0 %	157412015
6	NC_009838	CTTT	2	8	2031	2038	0 %	75 %	0 %	25 %	157412016
7	NC_009838	TGTT	2	8	2110	2117	0 %	75 %	25 %	0 %	157412016
8	NC_009838	CATG	2	8	2391	2398	25 %	25 %	25 %	25 %	157412017
9	NC_009838	CATT	2	8	2532	2539	25 %	50 %	0 %	25 %	157412017
10	NC_009838	ATGA	2	8	2754	2761	50 %	25 %	25 %	0 %	157412018
11	NC_009838	AAAG	2	8	2841	2848	75 %	0 %	25 %	0 %	157412018
12	NC_009838	TACA	2	8	2925	2932	50 %	25 %	0 %	25 %	157412018
13	NC_009838	ATGA	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	157412018
14	NC_009838	GAGT	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	157412018
15	NC_009838	CAAA	2	8	3750	3757	75 %	0 %	0 %	25 %	157412019
16	NC_009838	CAGC	2	8	3826	3833	25 %	0 %	25 %	50 %	157412019
17	NC_009838	AGAT	2	8	5126	5133	50 %	25 %	25 %	0 %	157412020
18	NC_009838	CGAA	2	8	5217	5224	50 %	0 %	25 %	25 %	157412020
19	NC_009838	AAGA	2	8	5381	5388	75 %	0 %	25 %	0 %	157412021
20	NC_009838	AAGG	2	8	5873	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	157412021
21	NC_009838	TATT	2	8	6756	6763	25 %	75 %	0 %	0 %	157412022
22	NC_009838	CTAA	2	8	7207	7214	50 %	25 %	0 %	25 %	157412023
23	NC_009838	GATA	2	8	7641	7648	50 %	25 %	25 %	0 %	157412023
24	NC_009838	AAAC	2	8	8503	8510	75 %	0 %	0 %	25 %	157412024
25	NC_009838	CTGT	2	8	9166	9173	0 %	50 %	25 %	25 %	157412025
26	NC_009838	GTAA	2	8	9456	9463	50 %	25 %	25 %	0 %	157412025
27	NC_009838	TGTA	2	8	9744	9751	25 %	50 %	25 %	0 %	157412025
28	NC_009838	ATCA	2	8	11170	11177	50 %	25 %	0 %	25 %	157412025
29	NC_009838	CTTC	2	8	11191	11198	0 %	50 %	0 %	50 %	157412025
30	NC_009838	AAAC	2	8	11227	11234	75 %	0 %	0 %	25 %	157412025
31	NC_009838	TAAA	2	8	16377	16384	75 %	25 %	0 %	0 %	157412026
32	NC_009838	TCCA	2	8	17681	17688	25 %	25 %	0 %	50 %	157412027
33	NC_009838	TTTA	2	8	17801	17808	25 %	75 %	0 %	0 %	157412027
34	NC_009838	GAAG	2	8	17815	17822	50 %	0 %	50 %	0 %	157412027
35	NC_009838	AATA	2	8	18479	18486	75 %	25 %	0 %	0 %	157412027
36	NC_009838	TAAA	2	8	18742	18749	75 %	25 %	0 %	0 %	157412028
37	NC_009838	TTAG	2	8	18822	18829	25 %	50 %	25 %	0 %	157412028
38	NC_009838	TAAC	2	8	19016	19023	50 %	25 %	0 %	25 %	157412029
39	NC_009838	ACTG	2	8	19397	19404	25 %	25 %	25 %	25 %	157412029
40	NC_009838	CAGT	2	8	19410	19417	25 %	25 %	25 %	25 %	157412029
41	NC_009838	TTTC	2	8	19519	19526	0 %	75 %	0 %	25 %	157412030
42	NC_009838	TTGT	2	8	20348	20355	0 %	75 %	25 %	0 %	157412031
43	NC_009838	CCTA	2	8	20584	20591	25 %	25 %	0 %	50 %	157412031
44	NC_009838	CAAA	2	8	21063	21070	75 %	0 %	0 %	25 %	157412031
45	NC_009838	AGAA	2	8	21164	21171	75 %	0 %	25 %	0 %	157412031
46	NC_009838	GAAA	2	8	21706	21713	75 %	0 %	25 %	0 %	157412032
47	NC_009838	TATT	2	8	22611	22618	25 %	75 %	0 %	0 %	157412032
48	NC_009838	GAAA	2	8	22707	22714	75 %	0 %	25 %	0 %	157412033
49	NC_009838	CCTT	2	8	23038	23045	0 %	50 %	0 %	50 %	157412033
50	NC_009838	GCCA	2	8	24216	24223	25 %	0 %	25 %	50 %	157412034
51	NC_009838	TTCA	2	8	24979	24986	25 %	50 %	0 %	25 %	157412035
52	NC_009838	GTTT	2	8	26673	26680	0 %	75 %	25 %	0 %	157412038
53	NC_009838	TCAA	2	8	26835	26842	50 %	25 %	0 %	25 %	157412038
54	NC_009838	TTTC	2	8	26914	26921	0 %	75 %	0 %	25 %	157412038
55	NC_009838	GATT	2	8	27416	27423	25 %	50 %	25 %	0 %	157412038
56	NC_009838	CTGA	2	8	28836	28843	25 %	25 %	25 %	25 %	157412038
57	NC_009838	TGGT	2	8	28921	28928	0 %	50 %	50 %	0 %	157412038
58	NC_009838	GACA	2	8	29327	29334	50 %	0 %	25 %	25 %	157412038
59	NC_009838	GGAA	2	8	29545	29552	50 %	0 %	50 %	0 %	157412038
60	NC_009838	AGTA	2	8	29670	29677	50 %	25 %	25 %	0 %	157412038
61	NC_009838	CTGT	2	8	29745	29752	0 %	50 %	25 %	25 %	157412038
62	NC_009838	GATA	2	8	30263	30270	50 %	25 %	25 %	0 %	157412038
63	NC_009838	AACC	2	8	30467	30474	50 %	0 %	0 %	50 %	157412038
64	NC_009838	AAGT	2	8	30692	30699	50 %	25 %	25 %	0 %	157412038
65	NC_009838	TGCC	2	8	31147	31154	0 %	25 %	25 %	50 %	157412039
66	NC_009838	TGAT	2	8	31169	31176	25 %	50 %	25 %	0 %	157412039
67	NC_009838	ATGG	2	8	31309	31316	25 %	25 %	50 %	0 %	157412039
68	NC_009838	TTGA	2	8	31390	31397	25 %	50 %	25 %	0 %	157412039
69	NC_009838	TAAA	2	8	31527	31534	75 %	25 %	0 %	0 %	157412040
70	NC_009838	AGCA	2	8	31632	31639	50 %	0 %	25 %	25 %	157412040
71	NC_009838	CAAA	2	8	31778	31785	75 %	0 %	0 %	25 %	157412040
72	NC_009838	GAAA	2	8	32039	32046	75 %	0 %	25 %	0 %	157412040
73	NC_009838	TACG	2	8	32142	32149	25 %	25 %	25 %	25 %	157412040
74	NC_009838	AAAG	2	8	32188	32195	75 %	0 %	25 %	0 %	157412040
75	NC_009838	TCAG	2	8	32292	32299	25 %	25 %	25 %	25 %	157412040
76	NC_009838	ATGG	2	8	32551	32558	25 %	25 %	50 %	0 %	157412040
77	NC_009838	ATGG	2	8	32823	32830	25 %	25 %	50 %	0 %	157412040
78	NC_009838	GTCA	2	8	33276	33283	25 %	25 %	25 %	25 %	157412041
79	NC_009838	CAAT	2	8	34650	34657	50 %	25 %	0 %	25 %	157412042
80	NC_009838	AAGG	2	8	34670	34677	50 %	0 %	50 %	0 %	157412042
81	NC_009838	AAAC	2	8	35966	35973	75 %	0 %	0 %	25 %	157412042
82	NC_009838	GGTT	2	8	35984	35991	0 %	50 %	50 %	0 %	157412042
83	NC_009838	CGGT	2	8	36465	36472	0 %	25 %	50 %	25 %	157412042
84	NC_009838	AGGT	2	8	37374	37381	25 %	25 %	50 %	0 %	157412042
85	NC_009838	ATTG	2	8	37970	37977	25 %	50 %	25 %	0 %	157412043
86	NC_009838	AGAA	2	8	38088	38095	75 %	0 %	25 %	0 %	157412043
87	NC_009838	ATTT	2	8	38964	38971	25 %	75 %	0 %	0 %	157412044
88	NC_009838	ATGG	2	8	39462	39469	25 %	25 %	50 %	0 %	157412044
89	NC_009838	ATGG	2	8	39841	39848	25 %	25 %	50 %	0 %	157412044
90	NC_009838	TCAA	2	8	39857	39864	50 %	25 %	0 %	25 %	157412044
91	NC_009838	AAAC	2	8	40766	40773	75 %	0 %	0 %	25 %	157412045
92	NC_009838	ATGT	2	8	41535	41542	25 %	50 %	25 %	0 %	157412045
93	NC_009838	ATTT	2	8	41552	41559	25 %	75 %	0 %	0 %	157412045
94	NC_009838	TGAC	2	8	41689	41696	25 %	25 %	25 %	25 %	157412046
95	NC_009838	AATT	2	8	42308	42315	50 %	50 %	0 %	0 %	157412047
96	NC_009838	AATC	2	8	42899	42906	50 %	25 %	0 %	25 %	157412047
97	NC_009838	CAGG	2	8	44891	44898	25 %	0 %	50 %	25 %	157412049
98	NC_009838	TTGA	2	8	44972	44979	25 %	50 %	25 %	0 %	157412049
99	NC_009838	ACTG	2	8	45395	45402	25 %	25 %	25 %	25 %	157412049
100	NC_009838	ATAA	2	8	45533	45540	75 %	25 %	0 %	0 %	157412049
101	NC_009838	TAAA	2	8	45854	45861	75 %	25 %	0 %	0 %	157412050
102	NC_009838	GAAT	2	8	46031	46038	50 %	25 %	25 %	0 %	157412050
103	NC_009838	TATT	2	8	46253	46260	25 %	75 %	0 %	0 %	157412050
104	NC_009838	TACA	2	8	47985	47992	50 %	25 %	0 %	25 %	157412051
105	NC_009838	CTGG	2	8	48234	48241	0 %	25 %	50 %	25 %	157412052
106	NC_009838	GGAT	2	8	48489	48496	25 %	25 %	50 %	0 %	157412052
107	NC_009838	TATC	2	8	48769	48776	25 %	50 %	0 %	25 %	157412052
108	NC_009838	CAGC	2	8	49035	49042	25 %	0 %	25 %	50 %	157412052
109	NC_009838	GGAT	2	8	49327	49334	25 %	25 %	50 %	0 %	157412052
110	NC_009838	GATA	2	8	49747	49754	50 %	25 %	25 %	0 %	157412053
111	NC_009838	TCAT	2	8	49892	49899	25 %	50 %	0 %	25 %	157412053
112	NC_009838	AGCA	2	8	49950	49957	50 %	0 %	25 %	25 %	157412053
113	NC_009838	TGAT	2	8	50165	50172	25 %	50 %	25 %	0 %	157412053
114	NC_009838	TTGT	2	8	50622	50629	0 %	75 %	25 %	0 %	157412054
115	NC_009838	TATG	2	8	51335	51342	25 %	50 %	25 %	0 %	157412055
116	NC_009838	AAAG	2	8	51448	51455	75 %	0 %	25 %	0 %	157412055
117	NC_009838	TTCT	2	8	51461	51468	0 %	75 %	0 %	25 %	157412055
118	NC_009838	AGAA	2	8	51622	51629	75 %	0 %	25 %	0 %	157412055
119	NC_009838	AATG	2	8	52198	52205	50 %	25 %	25 %	0 %	157412056
120	NC_009838	AGTT	2	8	52215	52222	25 %	50 %	25 %	0 %	157412056
121	NC_009838	ATTT	2	8	52412	52419	25 %	75 %	0 %	0 %	157412056
122	NC_009838	CTTG	2	8	52736	52743	0 %	50 %	25 %	25 %	157412056
123	NC_009838	GCAG	2	8	52892	52899	25 %	0 %	50 %	25 %	157412056
124	NC_009838	TAAT	2	8	53113	53120	50 %	50 %	0 %	0 %	157412056
125	NC_009838	CTTT	2	8	53224	53231	0 %	75 %	0 %	25 %	157412057
126	NC_009838	TTCG	2	8	53290	53297	0 %	50 %	25 %	25 %	157412057
127	NC_009838	ATTT	2	8	53423	53430	25 %	75 %	0 %	0 %	157412057
128	NC_009838	CTTT	2	8	54410	54417	0 %	75 %	0 %	25 %	157412058
129	NC_009838	ATGA	2	8	55516	55523	50 %	25 %	25 %	0 %	157412059
130	NC_009838	AGTT	2	8	56101	56108	25 %	50 %	25 %	0 %	157412060
131	NC_009838	TTTC	2	8	57921	57928	0 %	75 %	0 %	25 %	157412064
132	NC_009838	AACT	2	8	58541	58548	50 %	25 %	0 %	25 %	157412064
133	NC_009838	AATA	2	8	58611	58618	75 %	25 %	0 %	0 %	157412064
134	NC_009838	CCAA	2	8	58732	58739	50 %	0 %	0 %	50 %	157412064
135	NC_009838	CAGC	2	8	58843	58850	25 %	0 %	25 %	50 %	157412065
136	NC_009838	CCTG	2	8	59066	59073	0 %	25 %	25 %	50 %	157412065
137	NC_009838	TACA	2	8	59169	59176	50 %	25 %	0 %	25 %	157412065
138	NC_009838	GTCT	2	8	59404	59411	0 %	50 %	25 %	25 %	157412065
139	NC_009838	AGTT	2	8	60528	60535	25 %	50 %	25 %	0 %	157412066
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141	NC_009838	TGAT	2	8	61195	61202	25 %	50 %	25 %	0 %	157412066
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