MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 335

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	157412015
2	NC_009838	GC	3	6	403	408	0 %	0 %	50 %	50 %	157412015
3	NC_009838	TC	3	6	637	642	0 %	50 %	0 %	50 %	157412015
4	NC_009838	AC	3	6	1272	1277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009838	CT	3	6	2414	2419	0 %	50 %	0 %	50 %	157412017
6	NC_009838	CT	3	6	3119	3124	0 %	50 %	0 %	50 %	157412018
7	NC_009838	AT	3	6	4908	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	157412020
8	NC_009838	TA	3	6	5478	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	157412021
9	NC_009838	CA	3	6	5800	5805	50 %	0 %	0 %	50 %	157412021
10	NC_009838	AG	3	6	5882	5887	50 %	0 %	50 %	0 %	157412021
11	NC_009838	CT	3	6	7786	7791	0 %	50 %	0 %	50 %	157412023
12	NC_009838	CT	3	6	7955	7960	0 %	50 %	0 %	50 %	157412023
13	NC_009838	CT	3	6	8589	8594	0 %	50 %	0 %	50 %	157412024
14	NC_009838	CA	3	6	9662	9667	50 %	0 %	0 %	50 %	157412025
15	NC_009838	CA	3	6	11252	11257	50 %	0 %	0 %	50 %	157412025
16	NC_009838	GA	3	6	13219	13224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009838	GA	3	6	13975	13980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009838	GA	3	6	15423	15428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009838	AG	3	6	16048	16053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009838	AT	3	6	16185	16190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009838	TC	3	6	16390	16395	0 %	50 %	0 %	50 %	157412026
22	NC_009838	AG	3	6	17657	17662	50 %	0 %	50 %	0 %	157412027
23	NC_009838	CA	3	6	18273	18278	50 %	0 %	0 %	50 %	157412027
24	NC_009838	GA	3	6	19065	19070	50 %	0 %	50 %	0 %	157412029
25	NC_009838	AC	3	6	20882	20887	50 %	0 %	0 %	50 %	157412031
26	NC_009838	TC	3	6	20890	20895	0 %	50 %	0 %	50 %	157412031
27	NC_009838	AG	3	6	21578	21583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009838	CA	3	6	21732	21737	50 %	0 %	0 %	50 %	157412032
29	NC_009838	AG	3	6	22473	22478	50 %	0 %	50 %	0 %	157412032
30	NC_009838	GA	3	6	23279	23284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009838	TC	3	6	23633	23638	0 %	50 %	0 %	50 %	157412034
32	NC_009838	CT	3	6	25059	25064	0 %	50 %	0 %	50 %	157412035
33	NC_009838	TC	3	6	25772	25777	0 %	50 %	0 %	50 %	157412037
34	NC_009838	CA	3	6	28265	28270	50 %	0 %	0 %	50 %	157412038
35	NC_009838	TC	3	6	28414	28419	0 %	50 %	0 %	50 %	157412038
36	NC_009838	AC	3	6	28585	28590	50 %	0 %	0 %	50 %	157412038
37	NC_009838	TA	3	6	28597	28602	50 %	50 %	0 %	0 %	157412038
38	NC_009838	AT	3	6	30197	30202	50 %	50 %	0 %	0 %	157412038
39	NC_009838	AG	3	6	30394	30399	50 %	0 %	50 %	0 %	157412038
40	NC_009838	AG	3	6	31034	31039	50 %	0 %	50 %	0 %	157412039
41	NC_009838	TG	3	6	31097	31102	0 %	50 %	50 %	0 %	157412039
42	NC_009838	CT	3	6	33049	33054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009838	TA	3	6	33668	33673	50 %	50 %	0 %	0 %	157412041
44	NC_009838	TA	3	6	33689	33694	50 %	50 %	0 %	0 %	157412041
45	NC_009838	TG	3	6	33996	34001	0 %	50 %	50 %	0 %	157412041
46	NC_009838	CT	3	6	34688	34693	0 %	50 %	0 %	50 %	157412042
47	NC_009838	GA	3	6	34764	34769	50 %	0 %	50 %	0 %	157412042
48	NC_009838	CA	3	6	35068	35073	50 %	0 %	0 %	50 %	157412042
49	NC_009838	TG	3	6	35210	35215	0 %	50 %	50 %	0 %	157412042
50	NC_009838	AG	3	6	39633	39638	50 %	0 %	50 %	0 %	157412044
51	NC_009838	TC	3	6	39743	39748	0 %	50 %	0 %	50 %	157412044
52	NC_009838	TA	4	8	40670	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009838	AT	3	6	41633	41638	50 %	50 %	0 %	0 %	157412046
54	NC_009838	GA	4	8	41763	41770	50 %	0 %	50 %	0 %	157412046
55	NC_009838	GA	3	6	41891	41896	50 %	0 %	50 %	0 %	157412046
56	NC_009838	TA	3	6	42337	42342	50 %	50 %	0 %	0 %	157412047
57	NC_009838	GT	4	8	43384	43391	0 %	50 %	50 %	0 %	157412048
58	NC_009838	AT	3	6	46223	46228	50 %	50 %	0 %	0 %	157412050
59	NC_009838	AG	3	6	46461	46466	50 %	0 %	50 %	0 %	157412050
60	NC_009838	AT	3	6	47274	47279	50 %	50 %	0 %	0 %	157412050
61	NC_009838	AG	3	6	48131	48136	50 %	0 %	50 %	0 %	157412052
62	NC_009838	TA	3	6	48245	48250	50 %	50 %	0 %	0 %	157412052
63	NC_009838	TC	3	6	48472	48477	0 %	50 %	0 %	50 %	157412052
64	NC_009838	AT	3	6	49898	49903	50 %	50 %	0 %	0 %	157412053
65	NC_009838	TA	3	6	50018	50023	50 %	50 %	0 %	0 %	157412053
66	NC_009838	AT	3	6	50914	50919	50 %	50 %	0 %	0 %	157412054
67	NC_009838	TA	3	6	50963	50968	50 %	50 %	0 %	0 %	157412054
68	NC_009838	GA	3	6	51182	51187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009838	AT	4	8	52269	52276	50 %	50 %	0 %	0 %	157412056
70	NC_009838	TC	3	6	52680	52685	0 %	50 %	0 %	50 %	157412056
71	NC_009838	TA	3	6	52832	52837	50 %	50 %	0 %	0 %	157412056
72	NC_009838	AT	5	10	53853	53862	50 %	50 %	0 %	0 %	157412057
73	NC_009838	TC	3	6	54035	54040	0 %	50 %	0 %	50 %	157412057
74	NC_009838	AT	3	6	56079	56084	50 %	50 %	0 %	0 %	157412060
75	NC_009838	CA	3	6	56487	56492	50 %	0 %	0 %	50 %	157412061
76	NC_009838	TA	3	6	56729	56734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009838	TG	3	6	58074	58079	0 %	50 %	50 %	0 %	157412064
78	NC_009838	CT	3	6	58695	58700	0 %	50 %	0 %	50 %	157412064
79	NC_009838	TG	3	6	59810	59815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009838	CT	3	6	59971	59976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009838	CT	3	6	61487	61492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009838	GT	3	6	61567	61572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009838	TC	4	8	61803	61810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009838	CA	3	6	62119	62124	50 %	0 %	0 %	50 %	157412067
85	NC_009838	TG	3	6	62328	62333	0 %	50 %	50 %	0 %	157412067
86	NC_009838	AC	3	6	67848	67853	50 %	0 %	0 %	50 %	157412071
87	NC_009838	GA	3	6	68708	68713	50 %	0 %	50 %	0 %	157412072
88	NC_009838	AG	3	6	69189	69194	50 %	0 %	50 %	0 %	157412073
89	NC_009838	CG	3	6	71396	71401	0 %	0 %	50 %	50 %	157412075
90	NC_009838	TG	3	6	71703	71708	0 %	50 %	50 %	0 %	157412076
91	NC_009838	CA	3	6	71716	71721	50 %	0 %	0 %	50 %	157412076
92	NC_009838	CT	3	6	71882	71887	0 %	50 %	0 %	50 %	157412076
93	NC_009838	AG	3	6	72441	72446	50 %	0 %	50 %	0 %	157412076
94	NC_009838	TG	3	6	73397	73402	0 %	50 %	50 %	0 %	157412077
95	NC_009838	TC	3	6	73417	73422	0 %	50 %	0 %	50 %	157412077
96	NC_009838	AC	3	6	74490	74495	50 %	0 %	0 %	50 %	157412078
97	NC_009838	AC	3	6	75245	75250	50 %	0 %	0 %	50 %	157412079
98	NC_009838	AG	3	6	75567	75572	50 %	0 %	50 %	0 %	157412080
99	NC_009838	CA	4	8	79182	79189	50 %	0 %	0 %	50 %	157412084
100	NC_009838	TG	4	8	79844	79851	0 %	50 %	50 %	0 %	157412084
101	NC_009838	TC	3	6	80918	80923	0 %	50 %	0 %	50 %	157412086
102	NC_009838	AT	3	6	81694	81699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009838	AT	3	6	81814	81819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009838	AT	3	6	81864	81869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009838	GA	3	6	82688	82693	50 %	0 %	50 %	0 %	157412087
106	NC_009838	AT	3	6	82737	82742	50 %	50 %	0 %	0 %	157412087
107	NC_009838	AT	3	6	83604	83609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009838	CA	3	6	85192	85197	50 %	0 %	0 %	50 %	157412089
109	NC_009838	AG	3	6	86271	86276	50 %	0 %	50 %	0 %	157412091
110	NC_009838	AT	3	6	86889	86894	50 %	50 %	0 %	0 %	157412092
111	NC_009838	AT	3	6	87449	87454	50 %	50 %	0 %	0 %	157412092
112	NC_009838	TC	3	6	88127	88132	0 %	50 %	0 %	50 %	157412236
113	NC_009838	CG	3	6	88245	88250	0 %	0 %	50 %	50 %	157412236
114	NC_009838	CT	3	6	89201	89206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009838	GC	3	6	91172	91177	0 %	0 %	50 %	50 %	157412096
116	NC_009838	GC	3	6	91399	91404	0 %	0 %	50 %	50 %	157412096
117	NC_009838	GC	3	6	91935	91940	0 %	0 %	50 %	50 %	157412097
118	NC_009838	GT	3	6	92802	92807	0 %	50 %	50 %	0 %	157412097
119	NC_009838	GC	4	8	93315	93322	0 %	0 %	50 %	50 %	157412097
120	NC_009838	GC	3	6	94102	94107	0 %	0 %	50 %	50 %	157412097
121	NC_009838	GC	3	6	94797	94802	0 %	0 %	50 %	50 %	157412098
122	NC_009838	GC	3	6	95696	95701	0 %	0 %	50 %	50 %	157412100
123	NC_009838	GC	3	6	95807	95812	0 %	0 %	50 %	50 %	157412100
124	NC_009838	CA	3	6	96750	96755	50 %	0 %	0 %	50 %	229776987
125	NC_009838	GA	3	6	96852	96857	50 %	0 %	50 %	0 %	229776987
126	NC_009838	AT	3	6	97568	97573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009838	GC	3	6	97718	97723	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
128	NC_009838	CG	3	6	98072	98077	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
129	NC_009838	GC	3	6	98421	98426	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
130	NC_009838	AT	3	6	98497	98502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009838	GC	5	10	98646	98655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009838	CG	3	6	98669	98674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009838	GC	4	8	98878	98885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009838	GC	3	6	99268	99273	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
135	NC_009838	CG	3	6	100014	100019	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
136	NC_009838	GC	3	6	100239	100244	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
137	NC_009838	GC	3	6	100391	100396	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
138	NC_009838	GC	3	6	100926	100931	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
139	NC_009838	CG	3	6	100963	100968	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
140	NC_009838	CG	3	6	101029	101034	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
141	NC_009838	GC	3	6	101226	101231	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
142	NC_009838	GC	3	6	101409	101414	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
143	NC_009838	GC	3	6	101451	101456	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
144	NC_009838	CG	3	6	102053	102058	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
145	NC_009838	GC	3	6	102357	102362	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.