MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	157412015
2	NC_009838	GC	3	6	403	408	0 %	0 %	50 %	50 %	157412015
3	NC_009838	TC	3	6	637	642	0 %	50 %	0 %	50 %	157412015
4	NC_009838	CT	3	6	2414	2419	0 %	50 %	0 %	50 %	157412017
5	NC_009838	CT	3	6	3119	3124	0 %	50 %	0 %	50 %	157412018
6	NC_009838	AT	3	6	4908	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	157412020
7	NC_009838	TA	3	6	5478	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	157412021
8	NC_009838	CA	3	6	5800	5805	50 %	0 %	0 %	50 %	157412021
9	NC_009838	AG	3	6	5882	5887	50 %	0 %	50 %	0 %	157412021
10	NC_009838	CT	3	6	7786	7791	0 %	50 %	0 %	50 %	157412023
11	NC_009838	CT	3	6	7955	7960	0 %	50 %	0 %	50 %	157412023
12	NC_009838	CT	3	6	8589	8594	0 %	50 %	0 %	50 %	157412024
13	NC_009838	CA	3	6	9662	9667	50 %	0 %	0 %	50 %	157412025
14	NC_009838	CA	3	6	11252	11257	50 %	0 %	0 %	50 %	157412025
15	NC_009838	TC	3	6	16390	16395	0 %	50 %	0 %	50 %	157412026
16	NC_009838	AG	3	6	17657	17662	50 %	0 %	50 %	0 %	157412027
17	NC_009838	CA	3	6	18273	18278	50 %	0 %	0 %	50 %	157412027
18	NC_009838	GA	3	6	19065	19070	50 %	0 %	50 %	0 %	157412029
19	NC_009838	AC	3	6	20882	20887	50 %	0 %	0 %	50 %	157412031
20	NC_009838	TC	3	6	20890	20895	0 %	50 %	0 %	50 %	157412031
21	NC_009838	CA	3	6	21732	21737	50 %	0 %	0 %	50 %	157412032
22	NC_009838	AG	3	6	22473	22478	50 %	0 %	50 %	0 %	157412032
23	NC_009838	TC	3	6	23633	23638	0 %	50 %	0 %	50 %	157412034
24	NC_009838	CT	3	6	25059	25064	0 %	50 %	0 %	50 %	157412035
25	NC_009838	TC	3	6	25772	25777	0 %	50 %	0 %	50 %	157412037
26	NC_009838	CA	3	6	28265	28270	50 %	0 %	0 %	50 %	157412038
27	NC_009838	TC	3	6	28414	28419	0 %	50 %	0 %	50 %	157412038
28	NC_009838	AC	3	6	28585	28590	50 %	0 %	0 %	50 %	157412038
29	NC_009838	TA	3	6	28597	28602	50 %	50 %	0 %	0 %	157412038
30	NC_009838	AT	3	6	30197	30202	50 %	50 %	0 %	0 %	157412038
31	NC_009838	AG	3	6	30394	30399	50 %	0 %	50 %	0 %	157412038
32	NC_009838	AG	3	6	31034	31039	50 %	0 %	50 %	0 %	157412039
33	NC_009838	TG	3	6	31097	31102	0 %	50 %	50 %	0 %	157412039
34	NC_009838	TA	3	6	33668	33673	50 %	50 %	0 %	0 %	157412041
35	NC_009838	TA	3	6	33689	33694	50 %	50 %	0 %	0 %	157412041
36	NC_009838	TG	3	6	33996	34001	0 %	50 %	50 %	0 %	157412041
37	NC_009838	CT	3	6	34688	34693	0 %	50 %	0 %	50 %	157412042
38	NC_009838	GA	3	6	34764	34769	50 %	0 %	50 %	0 %	157412042
39	NC_009838	CA	3	6	35068	35073	50 %	0 %	0 %	50 %	157412042
40	NC_009838	TG	3	6	35210	35215	0 %	50 %	50 %	0 %	157412042
41	NC_009838	AG	3	6	39633	39638	50 %	0 %	50 %	0 %	157412044
42	NC_009838	TC	3	6	39743	39748	0 %	50 %	0 %	50 %	157412044
43	NC_009838	AT	3	6	41633	41638	50 %	50 %	0 %	0 %	157412046
44	NC_009838	GA	4	8	41763	41770	50 %	0 %	50 %	0 %	157412046
45	NC_009838	GA	3	6	41891	41896	50 %	0 %	50 %	0 %	157412046
46	NC_009838	TA	3	6	42337	42342	50 %	50 %	0 %	0 %	157412047
47	NC_009838	GT	4	8	43384	43391	0 %	50 %	50 %	0 %	157412048
48	NC_009838	AT	3	6	46223	46228	50 %	50 %	0 %	0 %	157412050
49	NC_009838	AG	3	6	46461	46466	50 %	0 %	50 %	0 %	157412050
50	NC_009838	AT	3	6	47274	47279	50 %	50 %	0 %	0 %	157412050
51	NC_009838	AG	3	6	48131	48136	50 %	0 %	50 %	0 %	157412052
52	NC_009838	TA	3	6	48245	48250	50 %	50 %	0 %	0 %	157412052
53	NC_009838	TC	3	6	48472	48477	0 %	50 %	0 %	50 %	157412052
54	NC_009838	AT	3	6	49898	49903	50 %	50 %	0 %	0 %	157412053
55	NC_009838	TA	3	6	50018	50023	50 %	50 %	0 %	0 %	157412053
56	NC_009838	AT	3	6	50914	50919	50 %	50 %	0 %	0 %	157412054
57	NC_009838	TA	3	6	50963	50968	50 %	50 %	0 %	0 %	157412054
58	NC_009838	AT	4	8	52269	52276	50 %	50 %	0 %	0 %	157412056
59	NC_009838	TC	3	6	52680	52685	0 %	50 %	0 %	50 %	157412056
60	NC_009838	TA	3	6	52832	52837	50 %	50 %	0 %	0 %	157412056
61	NC_009838	AT	5	10	53853	53862	50 %	50 %	0 %	0 %	157412057
62	NC_009838	TC	3	6	54035	54040	0 %	50 %	0 %	50 %	157412057
63	NC_009838	AT	3	6	56079	56084	50 %	50 %	0 %	0 %	157412060
64	NC_009838	CA	3	6	56487	56492	50 %	0 %	0 %	50 %	157412061
65	NC_009838	TG	3	6	58074	58079	0 %	50 %	50 %	0 %	157412064
66	NC_009838	CT	3	6	58695	58700	0 %	50 %	0 %	50 %	157412064
67	NC_009838	CA	3	6	62119	62124	50 %	0 %	0 %	50 %	157412067
68	NC_009838	TG	3	6	62328	62333	0 %	50 %	50 %	0 %	157412067
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70	NC_009838	GA	3	6	68708	68713	50 %	0 %	50 %	0 %	157412072
71	NC_009838	AG	3	6	69189	69194	50 %	0 %	50 %	0 %	157412073
72	NC_009838	CG	3	6	71396	71401	0 %	0 %	50 %	50 %	157412075
73	NC_009838	TG	3	6	71703	71708	0 %	50 %	50 %	0 %	157412076
74	NC_009838	CA	3	6	71716	71721	50 %	0 %	0 %	50 %	157412076
75	NC_009838	CT	3	6	71882	71887	0 %	50 %	0 %	50 %	157412076
76	NC_009838	AG	3	6	72441	72446	50 %	0 %	50 %	0 %	157412076
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81	NC_009838	AG	3	6	75567	75572	50 %	0 %	50 %	0 %	157412080
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83	NC_009838	TG	4	8	79844	79851	0 %	50 %	50 %	0 %	157412084
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88	NC_009838	AG	3	6	86271	86276	50 %	0 %	50 %	0 %	157412091
89	NC_009838	AT	3	6	86889	86894	50 %	50 %	0 %	0 %	157412092
90	NC_009838	AT	3	6	87449	87454	50 %	50 %	0 %	0 %	157412092
91	NC_009838	TC	3	6	88127	88132	0 %	50 %	0 %	50 %	157412236
92	NC_009838	CG	3	6	88245	88250	0 %	0 %	50 %	50 %	157412236
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104	NC_009838	GC	3	6	97718	97723	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
105	NC_009838	CG	3	6	98072	98077	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
106	NC_009838	GC	3	6	98421	98426	0 %	0 %	50 %	50 %	157412102
107	NC_009838	GC	3	6	99268	99273	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
108	NC_009838	CG	3	6	100014	100019	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
109	NC_009838	GC	3	6	100239	100244	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
110	NC_009838	GC	3	6	100391	100396	0 %	0 %	50 %	50 %	157412103
111	NC_009838	GC	3	6	100926	100931	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
112	NC_009838	CG	3	6	100963	100968	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
113	NC_009838	CG	3	6	101029	101034	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
114	NC_009838	GC	3	6	101226	101231	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
115	NC_009838	GC	3	6	101409	101414	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
116	NC_009838	GC	3	6	101451	101456	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
117	NC_009838	CG	3	6	102053	102058	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
118	NC_009838	GC	3	6	102357	102362	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
119	NC_009838	GC	5	10	102389	102398	0 %	0 %	50 %	50 %	157412104
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121	NC_009838	TG	3	6	102644	102649	0 %	50 %	50 %	0 %	157412105
122	NC_009838	CG	3	6	102948	102953	0 %	0 %	50 %	50 %	157412105
123	NC_009838	CG	3	6	103365	103370	0 %	0 %	50 %	50 %	157412105
124	NC_009838	CG	3	6	103656	103661	0 %	0 %	50 %	50 %	157412105
125	NC_009838	GC	3	6	103736	103741	0 %	0 %	50 %	50 %	157412105
126	NC_009838	CG	3	6	103841	103846	0 %	0 %	50 %	50 %	157412105
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.