MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009837	TAAC	2	8	3257	3264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009837	ACGG	2	8	5830	5837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009837	ACTG	2	8	7017	7024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009837	ATTT	2	8	7249	7256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009837	ATTT	2	8	7275	7282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009837	GTCA	2	8	7288	7295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009837	AGTA	2	8	7469	7476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009837	GGCG	2	8	15095	15102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009837	CAGT	2	8	17443	17450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009837	ATTA	2	8	18914	18921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009837	AGGG	2	8	35973	35980	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009837	AAAT	2	8	41546	41553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009837	GACT	2	8	41660	41667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009837	TTCT	2	8	41668	41675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009837	CAGA	2	8	52852	52859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009837	AAGT	2	8	52967	52974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009837	CGGG	2	8	53360	53367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009837	CCCG	2	8	53441	53448	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009837	CATT	2	8	55836	55843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009837	GACA	2	8	55877	55884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009837	TATT	2	8	75641	75648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009837	CTTC	2	8	77794	77801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009837	ATCA	2	8	92190	92197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009837	TTCT	2	8	97887	97894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009837	ATAC	2	8	98798	98805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009837	GGCT	2	8	101754	101761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009837	CGAA	2	8	101776	101783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009837	CCTT	2	8	102491	102498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009837	AAAC	2	8	102647	102654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009837	TTTC	2	8	103149	103156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009837	GGGC	2	8	103194	103201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009837	AAAT	2	8	106544	106551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009837	ATAA	2	8	106617	106624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009837	TTTA	2	8	106664	106671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009837	TCAT	2	8	108091	108098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009837	GGCA	2	8	108223	108230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009837	CTTT	2	8	110671	110678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009837	CTAT	2	8	112895	112902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009837	ATTA	2	8	113466	113473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009837	TCAG	2	8	123222	123229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009837	CTTA	2	8	125440	125447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009837	TGAT	2	8	125792	125799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009837	CCAG	2	8	125856	125863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009837	TGGT	2	8	125866	125873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009837	GGTA	2	8	126635	126642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009837	ATGT	2	8	126939	126946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009837	TGAA	2	8	128824	128831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009837	AAGA	2	8	128954	128961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009837	TGAC	2	8	129255	129262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009837	CTAA	2	8	129585	129592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009837	GCAG	2	8	130843	130850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009837	AAGT	2	8	131270	131277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009837	AGAT	2	8	131302	131309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009837	GGGA	2	8	134043	134050	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009837	GATG	2	8	135732	135739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009837	AGGA	2	8	135779	135786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009837	GTCT	2	8	138541	138548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009837	CAGC	2	8	139436	139443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009837	AATT	2	8	149502	149509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009837	CCAA	2	8	152190	152197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009837	TCCA	2	8	152233	152240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009837	ACAA	2	8	152504	152511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009837	TTAA	2	8	152512	152519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009837	ATTG	2	8	157288	157295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009837	ATGA	2	8	158844	158851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009837	AAGT	2	8	158995	159002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009837	TCAG	2	8	159067	159074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009837	CAGG	2	8	159123	159130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009837	AGTG	2	8	160219	160226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009837	CTGT	2	8	160265	160272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009837	TTTG	2	8	161284	161291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009837	AACA	2	8	161539	161546	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009837	AAAG	2	8	161681	161688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009837	TTAC	2	8	161844	161851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009837	AAAT	2	8	163981	163988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009837	CCTC	2	8	164808	164815	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009837	CCAG	2	8	165010	165017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009837	CTGG	2	8	165149	165156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009837	AATC	2	8	165220	165227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009837	AAAG	2	8	165252	165259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009837	GTTT	2	8	165357	165364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009837	GTTT	2	8	165425	165432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009837	TGAT	2	8	165954	165961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009837	ATTT	2	8	165962	165969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009837	CTTC	2	8	166072	166079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009837	CCAT	2	8	169284	169291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009837	AATT	2	8	169388	169395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009837	AAAT	2	8	169516	169523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.