MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009837	GC	3	6	824	829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009837	GC	3	6	1777	1782	0 %	0 %	50 %	50 %	229776985
3	NC_009837	GC	3	6	2321	2326	0 %	0 %	50 %	50 %	157418087
4	NC_009837	AG	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	157418087
5	NC_009837	TG	3	6	3790	3795	0 %	50 %	50 %	0 %	157418088
6	NC_009837	AC	3	6	5737	5742	50 %	0 %	0 %	50 %	157418090
7	NC_009837	GA	3	6	6239	6244	50 %	0 %	50 %	0 %	157418091
8	NC_009837	CG	3	6	6513	6518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009837	CA	3	6	6962	6967	50 %	0 %	0 %	50 %	157418092
10	NC_009837	CG	3	6	7806	7811	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
11	NC_009837	GA	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	157418094
12	NC_009837	GC	3	6	8247	8252	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
13	NC_009837	GC	3	6	9190	9195	0 %	0 %	50 %	50 %	157418095
14	NC_009837	TG	3	6	9381	9386	0 %	50 %	50 %	0 %	157418095
15	NC_009837	CG	3	6	9660	9665	0 %	0 %	50 %	50 %	157418095
16	NC_009837	CG	3	6	9773	9778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009837	GC	3	6	10832	10837	0 %	0 %	50 %	50 %	157418097
18	NC_009837	GA	3	6	11181	11186	50 %	0 %	50 %	0 %	157418098
19	NC_009837	AG	3	6	11425	11430	50 %	0 %	50 %	0 %	157418098
20	NC_009837	CG	3	6	11439	11444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009837	CA	3	6	11953	11958	50 %	0 %	0 %	50 %	157418099
22	NC_009837	CG	3	6	12101	12106	0 %	0 %	50 %	50 %	157418099
23	NC_009837	TG	3	6	13378	13383	0 %	50 %	50 %	0 %	157418099
24	NC_009837	AC	3	6	13593	13598	50 %	0 %	0 %	50 %	157418100
25	NC_009837	TC	3	6	13744	13749	0 %	50 %	0 %	50 %	157418100
26	NC_009837	AG	3	6	14576	14581	50 %	0 %	50 %	0 %	157418101
27	NC_009837	TG	3	6	14804	14809	0 %	50 %	50 %	0 %	157418102
28	NC_009837	GT	4	8	14956	14963	0 %	50 %	50 %	0 %	157418103
29	NC_009837	GT	3	6	14969	14974	0 %	50 %	50 %	0 %	157418103
30	NC_009837	CG	3	6	15261	15266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009837	AG	4	8	15988	15995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009837	TC	3	6	16311	16316	0 %	50 %	0 %	50 %	157418107
33	NC_009837	TA	4	8	17405	17412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009837	TG	4	8	17473	17480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009837	CT	3	6	18208	18213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009837	GT	3	6	18339	18344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009837	TC	3	6	18720	18725	0 %	50 %	0 %	50 %	157418109
38	NC_009837	AG	3	6	19222	19227	50 %	0 %	50 %	0 %	157418110
39	NC_009837	TA	3	6	19519	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	157418110
40	NC_009837	AT	3	6	19564	19569	50 %	50 %	0 %	0 %	157418110
41	NC_009837	CT	3	6	21036	21041	0 %	50 %	0 %	50 %	157418114
42	NC_009837	AT	3	6	21248	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	157418114
43	NC_009837	GC	3	6	22192	22197	0 %	0 %	50 %	50 %	157418115
44	NC_009837	GC	3	6	23255	23260	0 %	0 %	50 %	50 %	157418116
45	NC_009837	CG	3	6	23950	23955	0 %	0 %	50 %	50 %	157418117
46	NC_009837	CT	3	6	24263	24268	0 %	50 %	0 %	50 %	157418118
47	NC_009837	CG	3	6	25989	25994	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
48	NC_009837	GT	3	6	26425	26430	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
49	NC_009837	GC	3	6	27013	27018	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
50	NC_009837	AG	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	157418122
51	NC_009837	TG	3	6	27282	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
52	NC_009837	CA	3	6	27907	27912	50 %	0 %	0 %	50 %	157418122
53	NC_009837	CG	3	6	27956	27961	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
54	NC_009837	TG	3	6	34009	34014	0 %	50 %	50 %	0 %	157418130
55	NC_009837	AT	3	6	34363	34368	50 %	50 %	0 %	0 %	157418131
56	NC_009837	CT	3	6	34402	34407	0 %	50 %	0 %	50 %	157418131
57	NC_009837	CA	3	6	34478	34483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009837	TC	3	6	34810	34815	0 %	50 %	0 %	50 %	157418132
59	NC_009837	AT	3	6	35549	35554	50 %	50 %	0 %	0 %	157418134
60	NC_009837	GA	3	6	35612	35617	50 %	0 %	50 %	0 %	157418134
61	NC_009837	AT	3	6	35832	35837	50 %	50 %	0 %	0 %	157418135
62	NC_009837	CA	3	6	36114	36119	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
63	NC_009837	AC	3	6	36872	36877	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
64	NC_009837	AC	3	6	38030	38035	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
65	NC_009837	GT	3	6	38663	38668	0 %	50 %	50 %	0 %	157418136
66	NC_009837	CA	3	6	38847	38852	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
67	NC_009837	CT	3	6	40233	40238	0 %	50 %	0 %	50 %	157418137
68	NC_009837	AT	3	6	40372	40377	50 %	50 %	0 %	0 %	157418137
69	NC_009837	TC	3	6	40637	40642	0 %	50 %	0 %	50 %	157418137
70	NC_009837	AT	3	6	41985	41990	50 %	50 %	0 %	0 %	157418139
71	NC_009837	AC	3	6	42605	42610	50 %	0 %	0 %	50 %	157418139
72	NC_009837	GT	3	6	42944	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	157418139
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74	NC_009837	AT	3	6	44115	44120	50 %	50 %	0 %	0 %	157418140
75	NC_009837	TC	3	6	44341	44346	0 %	50 %	0 %	50 %	157418140
76	NC_009837	AC	4	8	45025	45032	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
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79	NC_009837	GA	3	6	47432	47437	50 %	0 %	50 %	0 %	157418141
80	NC_009837	CA	3	6	47554	47559	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
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82	NC_009837	AG	3	6	51294	51299	50 %	0 %	50 %	0 %	157418143
83	NC_009837	TG	3	6	52016	52021	0 %	50 %	50 %	0 %	157418144
84	NC_009837	TG	3	6	52707	52712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009837	AT	3	6	52778	52783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009837	TA	3	6	53420	53425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009837	AG	4	8	53716	53723	50 %	0 %	50 %	0 %	157418147
88	NC_009837	GC	3	6	55170	55175	0 %	0 %	50 %	50 %	229776983
89	NC_009837	AC	3	6	55609	55614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009837	CA	3	6	55941	55946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009837	TG	3	6	56618	56623	0 %	50 %	50 %	0 %	157418152
92	NC_009837	GA	3	6	57010	57015	50 %	0 %	50 %	0 %	157418153
93	NC_009837	GA	3	6	57180	57185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009837	TG	3	6	57564	57569	0 %	50 %	50 %	0 %	157418154
95	NC_009837	CA	3	6	58585	58590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009837	TA	3	6	60438	60443	50 %	50 %	0 %	0 %	157418156
97	NC_009837	AT	3	6	61125	61130	50 %	50 %	0 %	0 %	157418156
98	NC_009837	CA	3	6	61334	61339	50 %	0 %	0 %	50 %	157418156
99	NC_009837	AT	3	6	62377	62382	50 %	50 %	0 %	0 %	157418156
100	NC_009837	TG	3	6	63879	63884	0 %	50 %	50 %	0 %	157418159
101	NC_009837	GA	3	6	63999	64004	50 %	0 %	50 %	0 %	157418159
102	NC_009837	AG	3	6	65834	65839	50 %	0 %	50 %	0 %	157418160
103	NC_009837	AC	3	6	66113	66118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009837	CA	3	6	66693	66698	50 %	0 %	0 %	50 %	157418161
105	NC_009837	CG	3	6	66877	66882	0 %	0 %	50 %	50 %	157418161
106	NC_009837	CT	3	6	67279	67284	0 %	50 %	0 %	50 %	157418161
107	NC_009837	CT	3	6	67338	67343	0 %	50 %	0 %	50 %	157418161
108	NC_009837	CA	3	6	67490	67495	50 %	0 %	0 %	50 %	157418162
109	NC_009837	TG	4	8	67958	67965	0 %	50 %	50 %	0 %	157418162
110	NC_009837	TC	3	6	68072	68077	0 %	50 %	0 %	50 %	157418162
111	NC_009837	TA	3	6	68914	68919	50 %	50 %	0 %	0 %	157418163
112	NC_009837	CT	3	6	69020	69025	0 %	50 %	0 %	50 %	157418163
113	NC_009837	TC	3	6	69622	69627	0 %	50 %	0 %	50 %	157418163
114	NC_009837	GT	3	6	69681	69686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009837	TC	3	6	69813	69818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009837	TA	3	6	70325	70330	50 %	50 %	0 %	0 %	157418164
117	NC_009837	TC	3	6	71521	71526	0 %	50 %	0 %	50 %	157418165
118	NC_009837	CT	3	6	72877	72882	0 %	50 %	0 %	50 %	157418167
119	NC_009837	CA	4	8	73007	73014	50 %	0 %	0 %	50 %	157418167
120	NC_009837	AT	3	6	73872	73877	50 %	50 %	0 %	0 %	157418168
121	NC_009837	AT	4	8	75237	75244	50 %	50 %	0 %	0 %	157418169
122	NC_009837	CT	3	6	76372	76377	0 %	50 %	0 %	50 %	157418170
123	NC_009837	GT	3	6	76989	76994	0 %	50 %	50 %	0 %	157418170
124	NC_009837	GA	3	6	77450	77455	50 %	0 %	50 %	0 %	157418172
125	NC_009837	CA	3	6	77757	77762	50 %	0 %	0 %	50 %	157418173
126	NC_009837	AG	3	6	78293	78298	50 %	0 %	50 %	0 %	157418174
127	NC_009837	AG	3	6	79094	79099	50 %	0 %	50 %	0 %	157418176
128	NC_009837	CA	3	6	80478	80483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009837	AG	3	6	81458	81463	50 %	0 %	50 %	0 %	157418178
130	NC_009837	AT	4	8	81739	81746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009837	TA	3	6	82397	82402	50 %	50 %	0 %	0 %	157418179
132	NC_009837	AT	3	6	84065	84070	50 %	50 %	0 %	0 %	157418179
133	NC_009837	AC	3	6	84846	84851	50 %	0 %	0 %	50 %	157418179
134	NC_009837	AT	3	6	85458	85463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_009837	GC	3	6	89333	89338	0 %	0 %	50 %	50 %	157418184
140	NC_009837	GC	4	8	89438	89445	0 %	0 %	50 %	50 %	157418184
141	NC_009837	GC	3	6	89674	89679	0 %	0 %	50 %	50 %	157418184
142	NC_009837	AC	3	6	89847	89852	50 %	0 %	0 %	50 %	157418184
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144	NC_009837	AT	3	6	91918	91923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009837	CT	3	6	92129	92134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.