MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009837	GC	3	6	1777	1782	0 %	0 %	50 %	50 %	229776985
2	NC_009837	GC	3	6	2321	2326	0 %	0 %	50 %	50 %	157418087
3	NC_009837	AG	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	157418087
4	NC_009837	TG	3	6	3790	3795	0 %	50 %	50 %	0 %	157418088
5	NC_009837	AC	3	6	5737	5742	50 %	0 %	0 %	50 %	157418090
6	NC_009837	GA	3	6	6239	6244	50 %	0 %	50 %	0 %	157418091
7	NC_009837	CA	3	6	6962	6967	50 %	0 %	0 %	50 %	157418092
8	NC_009837	CG	3	6	7806	7811	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
9	NC_009837	GA	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	157418094
10	NC_009837	GC	3	6	8247	8252	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
11	NC_009837	GC	3	6	9190	9195	0 %	0 %	50 %	50 %	157418095
12	NC_009837	TG	3	6	9381	9386	0 %	50 %	50 %	0 %	157418095
13	NC_009837	CG	3	6	9660	9665	0 %	0 %	50 %	50 %	157418095
14	NC_009837	GC	3	6	10832	10837	0 %	0 %	50 %	50 %	157418097
15	NC_009837	GA	3	6	11181	11186	50 %	0 %	50 %	0 %	157418098
16	NC_009837	AG	3	6	11425	11430	50 %	0 %	50 %	0 %	157418098
17	NC_009837	CA	3	6	11953	11958	50 %	0 %	0 %	50 %	157418099
18	NC_009837	CG	3	6	12101	12106	0 %	0 %	50 %	50 %	157418099
19	NC_009837	TG	3	6	13378	13383	0 %	50 %	50 %	0 %	157418099
20	NC_009837	AC	3	6	13593	13598	50 %	0 %	0 %	50 %	157418100
21	NC_009837	TC	3	6	13744	13749	0 %	50 %	0 %	50 %	157418100
22	NC_009837	AG	3	6	14576	14581	50 %	0 %	50 %	0 %	157418101
23	NC_009837	TG	3	6	14804	14809	0 %	50 %	50 %	0 %	157418102
24	NC_009837	GT	4	8	14956	14963	0 %	50 %	50 %	0 %	157418103
25	NC_009837	GT	3	6	14969	14974	0 %	50 %	50 %	0 %	157418103
26	NC_009837	TC	3	6	16311	16316	0 %	50 %	0 %	50 %	157418107
27	NC_009837	TC	3	6	18720	18725	0 %	50 %	0 %	50 %	157418109
28	NC_009837	AG	3	6	19222	19227	50 %	0 %	50 %	0 %	157418110
29	NC_009837	TA	3	6	19519	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	157418110
30	NC_009837	AT	3	6	19564	19569	50 %	50 %	0 %	0 %	157418110
31	NC_009837	CT	3	6	21036	21041	0 %	50 %	0 %	50 %	157418114
32	NC_009837	AT	3	6	21248	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	157418114
33	NC_009837	GC	3	6	22192	22197	0 %	0 %	50 %	50 %	157418115
34	NC_009837	GC	3	6	23255	23260	0 %	0 %	50 %	50 %	157418116
35	NC_009837	CG	3	6	23950	23955	0 %	0 %	50 %	50 %	157418117
36	NC_009837	CT	3	6	24263	24268	0 %	50 %	0 %	50 %	157418118
37	NC_009837	CG	3	6	25989	25994	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
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39	NC_009837	GC	3	6	27013	27018	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
40	NC_009837	AG	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	157418122
41	NC_009837	TG	3	6	27282	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
42	NC_009837	CA	3	6	27907	27912	50 %	0 %	0 %	50 %	157418122
43	NC_009837	CG	3	6	27956	27961	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
44	NC_009837	TG	3	6	34009	34014	0 %	50 %	50 %	0 %	157418130
45	NC_009837	AT	3	6	34363	34368	50 %	50 %	0 %	0 %	157418131
46	NC_009837	CT	3	6	34402	34407	0 %	50 %	0 %	50 %	157418131
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48	NC_009837	AT	3	6	35549	35554	50 %	50 %	0 %	0 %	157418134
49	NC_009837	GA	3	6	35612	35617	50 %	0 %	50 %	0 %	157418134
50	NC_009837	AT	3	6	35832	35837	50 %	50 %	0 %	0 %	157418135
51	NC_009837	CA	3	6	36114	36119	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
52	NC_009837	AC	3	6	36872	36877	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
53	NC_009837	AC	3	6	38030	38035	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
54	NC_009837	GT	3	6	38663	38668	0 %	50 %	50 %	0 %	157418136
55	NC_009837	CA	3	6	38847	38852	50 %	0 %	0 %	50 %	157418136
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60	NC_009837	AC	3	6	42605	42610	50 %	0 %	0 %	50 %	157418139
61	NC_009837	GT	3	6	42944	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	157418139
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63	NC_009837	AT	3	6	44115	44120	50 %	50 %	0 %	0 %	157418140
64	NC_009837	TC	3	6	44341	44346	0 %	50 %	0 %	50 %	157418140
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66	NC_009837	AG	3	6	46342	46347	50 %	0 %	50 %	0 %	157418141
67	NC_009837	CA	3	6	46933	46938	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
68	NC_009837	GA	3	6	47432	47437	50 %	0 %	50 %	0 %	157418141
69	NC_009837	CA	3	6	47554	47559	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
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109	NC_009837	AT	3	6	84065	84070	50 %	50 %	0 %	0 %	157418179
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112	NC_009837	CG	3	6	88784	88789	0 %	0 %	50 %	50 %	157418183
113	NC_009837	GC	3	6	89008	89013	0 %	0 %	50 %	50 %	157418184
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115	NC_009837	GC	3	6	89333	89338	0 %	0 %	50 %	50 %	157418184
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.