MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3	NC_009837	T	6	6	961	966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009837	A	6	6	2036	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	229776985
5	NC_009837	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	157418087
6	NC_009837	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	157418087
7	NC_009837	G	7	7	4176	4182	0 %	0 %	100 %	0 %	157418089
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10	NC_009837	A	6	6	5519	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	157418090
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13	NC_009837	T	6	6	7052	7057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009837	A	6	6	7072	7077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009837	A	6	6	7367	7372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009837	A	6	6	7878	7883	100 %	0 %	0 %	0 %	157418094
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18	NC_009837	A	6	6	8479	8484	100 %	0 %	0 %	0 %	157418094
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20	NC_009837	A	6	6	10415	10420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009837	A	6	6	11029	11034	100 %	0 %	0 %	0 %	157418097
22	NC_009837	A	8	8	16067	16074	100 %	0 %	0 %	0 %	157418106
23	NC_009837	A	6	6	16124	16129	100 %	0 %	0 %	0 %	157418106
24	NC_009837	G	9	9	16347	16355	0 %	0 %	100 %	0 %	157418107
25	NC_009837	T	6	6	16375	16380	0 %	100 %	0 %	0 %	157418107
26	NC_009837	A	6	6	17256	17261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29	NC_009837	A	6	6	18225	18230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009837	A	6	6	18298	18303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009837	T	7	7	18344	18350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009837	A	6	6	18439	18444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.