MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Serratia proteamaculans 568 chromosome

Total Repeats: 3397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009832	TTGCT	2	10	109	118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009832	GTTTG	2	10	1373	1382	0 %	60 %	40 %	0 %	157368251
3	NC_009832	CCTGA	2	10	1966	1975	20 %	20 %	20 %	40 %	157368252
4	NC_009832	GGCCA	2	10	2161	2170	20 %	0 %	40 %	40 %	157368253
5	NC_009832	TGACT	2	10	6569	6578	20 %	40 %	20 %	20 %	157368257
6	NC_009832	GCGTG	2	10	6737	6746	0 %	20 %	60 %	20 %	157368257
7	NC_009832	GCCAT	2	10	8030	8039	20 %	20 %	20 %	40 %	157368259
8	NC_009832	ATTAC	2	10	9639	9648	40 %	40 %	0 %	20 %	157368260
9	NC_009832	CGTGG	2	10	9911	9920	0 %	20 %	60 %	20 %	157368260
10	NC_009832	ACCGT	2	10	11096	11105	20 %	20 %	20 %	40 %	157368260
11	NC_009832	AGGTG	2	10	11306	11315	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009832	ACCGC	2	10	14287	14296	20 %	0 %	20 %	60 %	157368263
13	NC_009832	GCAAA	2	10	16400	16409	60 %	0 %	20 %	20 %	157368266
14	NC_009832	TGGCG	2	10	17782	17791	0 %	20 %	60 %	20 %	157368267
15	NC_009832	CGACG	2	10	20346	20355	20 %	0 %	40 %	40 %	157368270
16	NC_009832	TGACC	2	10	20637	20646	20 %	20 %	20 %	40 %	157368270
17	NC_009832	TAAAA	2	10	22135	22144	80 %	20 %	0 %	0 %	157368271
18	NC_009832	CATCG	2	10	22392	22401	20 %	20 %	20 %	40 %	157368272
19	NC_009832	TCCAG	2	10	24482	24491	20 %	20 %	20 %	40 %	157368274
20	NC_009832	ATCTA	2	10	24792	24801	40 %	40 %	0 %	20 %	157368274
21	NC_009832	GCGCA	2	10	25398	25407	20 %	0 %	40 %	40 %	157368275
22	NC_009832	TCGGC	2	10	25603	25612	0 %	20 %	40 %	40 %	157368275
23	NC_009832	ATGCC	2	10	26041	26050	20 %	20 %	20 %	40 %	157368275
24	NC_009832	TTCTC	2	10	27447	27456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009832	CAACC	2	10	28431	28440	40 %	0 %	0 %	60 %	157368277
26	NC_009832	TTGCG	2	10	29165	29174	0 %	40 %	40 %	20 %	157368277
27	NC_009832	AGTGA	2	10	29708	29717	40 %	20 %	40 %	0 %	157368279
28	NC_009832	TTCTT	2	10	30567	30576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009832	TTCTC	2	10	35368	35377	0 %	60 %	0 %	40 %	157368284
30	NC_009832	CACTG	2	10	35787	35796	20 %	20 %	20 %	40 %	157368284
31	NC_009832	GTAAA	2	10	42143	42152	60 %	20 %	20 %	0 %	157368290
32	NC_009832	TTACC	2	10	43176	43185	20 %	40 %	0 %	40 %	157368291
33	NC_009832	AAGGC	2	10	44656	44665	40 %	0 %	40 %	20 %	157368293
34	NC_009832	GAGCA	2	10	45303	45312	40 %	0 %	40 %	20 %	157368293
35	NC_009832	CGTCG	2	10	46396	46405	0 %	20 %	40 %	40 %	157368294
36	NC_009832	GAAAA	2	10	46406	46415	80 %	0 %	20 %	0 %	157368294
37	NC_009832	CGATG	2	10	47432	47441	20 %	20 %	40 %	20 %	157368295
38	NC_009832	TGGGG	2	10	50244	50253	0 %	20 %	80 %	0 %	157368299
39	NC_009832	TGCCG	2	10	50508	50517	0 %	20 %	40 %	40 %	157368299
40	NC_009832	CGCCA	2	10	52588	52597	20 %	0 %	20 %	60 %	157368302
41	NC_009832	CCAGC	2	10	53518	53527	20 %	0 %	20 %	60 %	157368302
42	NC_009832	GTCCA	2	10	55150	55159	20 %	20 %	20 %	40 %	157368303
43	NC_009832	CGTGG	2	10	55875	55884	0 %	20 %	60 %	20 %	157368303
44	NC_009832	GGGCA	2	10	56567	56576	20 %	0 %	60 %	20 %	157368305
45	NC_009832	GCCAT	2	10	56841	56850	20 %	20 %	20 %	40 %	157368306
46	NC_009832	AACAT	2	10	57775	57784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009832	GCCTT	2	10	62303	62312	0 %	40 %	20 %	40 %	157368311
48	NC_009832	GGCCG	2	10	63602	63611	0 %	0 %	60 %	40 %	157368312
49	NC_009832	GGCCG	2	10	64714	64723	0 %	0 %	60 %	40 %	157368314
50	NC_009832	GCTGG	2	10	66084	66093	0 %	20 %	60 %	20 %	157368314
51	NC_009832	AATTT	2	10	68561	68570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009832	CGCTG	2	10	68901	68910	0 %	20 %	40 %	40 %	157368317
53	NC_009832	CGGTG	2	10	69071	69080	0 %	20 %	60 %	20 %	157368317
54	NC_009832	GCGGT	2	10	69745	69754	0 %	20 %	60 %	20 %	157368317
55	NC_009832	CGAAC	2	10	70046	70055	40 %	0 %	20 %	40 %	157368317
56	NC_009832	CTGGG	2	10	70892	70901	0 %	20 %	60 %	20 %	157368318
57	NC_009832	CAAGC	2	10	71680	71689	40 %	0 %	20 %	40 %	157368319
58	NC_009832	ATCAA	2	10	74127	74136	60 %	20 %	0 %	20 %	157368320
59	NC_009832	CCGCA	2	10	74143	74152	20 %	0 %	20 %	60 %	157368320
60	NC_009832	CCAGG	2	10	74766	74775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009832	CGGTG	2	10	77852	77861	0 %	20 %	60 %	20 %	157368322
62	NC_009832	TCACG	2	10	78577	78586	20 %	20 %	20 %	40 %	157368323
63	NC_009832	GCTGC	2	10	78703	78712	0 %	20 %	40 %	40 %	157368323
64	NC_009832	TAACG	2	10	82273	82282	40 %	20 %	20 %	20 %	157368327
65	NC_009832	CAGTT	2	10	84846	84855	20 %	40 %	20 %	20 %	157368329
66	NC_009832	TCCTT	2	10	85162	85171	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009832	GCAAG	2	10	88647	88656	40 %	0 %	40 %	20 %	157368333
68	NC_009832	GGCGC	2	10	89262	89271	0 %	0 %	60 %	40 %	157368333
69	NC_009832	GCAAT	2	10	90076	90085	40 %	20 %	20 %	20 %	157368334
70	NC_009832	GAAAG	2	10	92654	92663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009832	GAGCA	2	10	93165	93174	40 %	0 %	40 %	20 %	157368337
72	NC_009832	TGCGC	2	10	94992	95001	0 %	20 %	40 %	40 %	157368339
73	NC_009832	CTGGC	2	10	96471	96480	0 %	20 %	40 %	40 %	157368340
74	NC_009832	GGGGC	2	10	99716	99725	0 %	0 %	80 %	20 %	157368342
75	NC_009832	TGGCG	2	10	100037	100046	0 %	20 %	60 %	20 %	157368342
76	NC_009832	GGCCG	2	10	100965	100974	0 %	0 %	60 %	40 %	157368343
77	NC_009832	AGGAG	2	10	103132	103141	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009832	GCGTG	2	10	105220	105229	0 %	20 %	60 %	20 %	157368347
79	NC_009832	GATCT	2	10	108058	108067	20 %	40 %	20 %	20 %	157368349
80	NC_009832	GCGAT	2	10	108430	108439	20 %	20 %	40 %	20 %	157368349
81	NC_009832	GGCGG	2	10	109235	109244	0 %	0 %	80 %	20 %	157368350
82	NC_009832	ATGAC	2	10	111365	111374	40 %	20 %	20 %	20 %	157368351
83	NC_009832	CTGCG	2	10	115760	115769	0 %	20 %	40 %	40 %	157368356
84	NC_009832	AAAGA	2	10	117651	117660	80 %	0 %	20 %	0 %	157368358
85	NC_009832	AATTT	2	10	118288	118297	40 %	60 %	0 %	0 %	157368358
86	NC_009832	AAGGG	2	10	119422	119431	40 %	0 %	60 %	0 %	157368358
87	NC_009832	TCCGT	2	10	120106	120115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_009832	AGCAA	2	10	120279	120288	60 %	0 %	20 %	20 %	157368359
89	NC_009832	TTTTA	2	10	121347	121356	20 %	80 %	0 %	0 %	157368360
90	NC_009832	TTCGG	2	10	124202	124211	0 %	40 %	40 %	20 %	157368362
91	NC_009832	GATGC	2	10	127341	127350	20 %	20 %	40 %	20 %	157368367
92	NC_009832	CGGTT	2	10	129008	129017	0 %	40 %	40 %	20 %	157368369
93	NC_009832	CACGG	2	10	133714	133723	20 %	0 %	40 %	40 %	157368373
94	NC_009832	CTTTG	2	10	138051	138060	0 %	60 %	20 %	20 %	157368378
95	NC_009832	TCTCG	2	10	139085	139094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009832	ATGAA	2	10	140388	140397	60 %	20 %	20 %	0 %	157368380
97	NC_009832	GCACG	2	10	140686	140695	20 %	0 %	40 %	40 %	157368380
98	NC_009832	GACAG	2	10	147993	148002	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009832	GCATA	2	10	148142	148151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009832	ATCAC	2	10	148438	148447	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009832	CAGGC	2	10	149453	149462	20 %	0 %	40 %	40 %	157368387
102	NC_009832	TGGCG	2	10	152061	152070	0 %	20 %	60 %	20 %	157368389
103	NC_009832	GGTAA	2	10	152343	152352	40 %	20 %	40 %	0 %	157368390
104	NC_009832	CATCA	2	10	152826	152835	40 %	20 %	0 %	40 %	157368390
105	NC_009832	GCCGG	2	10	155592	155601	0 %	0 %	60 %	40 %	157368392
106	NC_009832	GCGCC	2	10	162625	162634	0 %	0 %	40 %	60 %	157368398
107	NC_009832	CCGCG	2	10	162824	162833	0 %	0 %	40 %	60 %	157368398
108	NC_009832	CGAAT	2	10	164062	164071	40 %	20 %	20 %	20 %	157368399
109	NC_009832	GGGAT	2	10	164945	164954	20 %	20 %	60 %	0 %	157368399
110	NC_009832	GTGCG	2	10	166278	166287	0 %	20 %	60 %	20 %	157368400
111	NC_009832	TTCCG	2	10	167489	167498	0 %	40 %	20 %	40 %	157368400
112	NC_009832	ATCCG	2	10	173500	173509	20 %	20 %	20 %	40 %	157368403
113	NC_009832	TCAGC	2	10	173789	173798	20 %	20 %	20 %	40 %	157368403
114	NC_009832	ACGCC	2	10	181874	181883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_009832	GGAGT	2	10	183430	183439	20 %	20 %	60 %	0 %	157368411
116	NC_009832	TGAAT	2	10	183940	183949	40 %	40 %	20 %	0 %	157368411
117	NC_009832	GGCCT	2	10	186511	186520	0 %	20 %	40 %	40 %	157368413
118	NC_009832	GCTGG	2	10	187724	187733	0 %	20 %	60 %	20 %	157368414
119	NC_009832	CGAGC	2	10	188207	188216	20 %	0 %	40 %	40 %	157368415
120	NC_009832	CGATG	2	10	191048	191057	20 %	20 %	40 %	20 %	157368418
121	NC_009832	GGCCG	2	10	192412	192421	0 %	0 %	60 %	40 %	157368419
122	NC_009832	AGCGT	2	10	193232	193241	20 %	20 %	40 %	20 %	157368420
123	NC_009832	GGCCG	2	10	193862	193871	0 %	0 %	60 %	40 %	157368420
124	NC_009832	CTGGC	2	10	193931	193940	0 %	20 %	40 %	40 %	157368420
125	NC_009832	TACCG	2	10	203211	203220	20 %	20 %	20 %	40 %	157368428
126	NC_009832	CCGGC	2	10	206696	206705	0 %	0 %	40 %	60 %	157368431
127	NC_009832	GCATC	2	10	209261	209270	20 %	20 %	20 %	40 %	157368435
128	NC_009832	GGCGC	2	10	209908	209917	0 %	0 %	60 %	40 %	157368435
129	NC_009832	CGCTG	2	10	213423	213432	0 %	20 %	40 %	40 %	157368438
130	NC_009832	CCACG	2	10	214368	214377	20 %	0 %	20 %	60 %	157368438
131	NC_009832	TGTCC	2	10	214484	214493	0 %	40 %	20 %	40 %	157368439
132	NC_009832	AAATA	2	10	215231	215240	80 %	20 %	0 %	0 %	157368439
133	NC_009832	GCACG	2	10	219747	219756	20 %	0 %	40 %	40 %	157368444
134	NC_009832	CCAGA	2	10	219841	219850	40 %	0 %	20 %	40 %	157368444
135	NC_009832	GATTT	2	10	222874	222883	20 %	60 %	20 %	0 %	157368447
136	NC_009832	TTTCG	2	10	224906	224915	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009832	CGGTG	2	10	225415	225424	0 %	20 %	60 %	20 %	157368449
138	NC_009832	TGCCG	2	10	226430	226439	0 %	20 %	40 %	40 %	157368449
139	NC_009832	TGCGG	2	10	227829	227838	0 %	20 %	60 %	20 %	157368450
140	NC_009832	CCAGG	2	10	228547	228556	20 %	0 %	40 %	40 %	157368451
141	NC_009832	GCCAT	2	10	228799	228808	20 %	20 %	20 %	40 %	157368451
142	NC_009832	GCGCT	2	10	230087	230096	0 %	20 %	40 %	40 %	157368453
143	NC_009832	CAATG	2	10	230721	230730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009832	CATGC	2	10	231662	231671	20 %	20 %	20 %	40 %	157368455
145	NC_009832	CCCAA	2	10	234099	234108	40 %	0 %	0 %	60 %	157368457
146	NC_009832	CAATG	2	10	234724	234733	40 %	20 %	20 %	20 %	157368458
147	NC_009832	CAACC	2	10	238155	238164	40 %	0 %	0 %	60 %	157368459
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149	NC_009832	TGTGG	2	10	240693	240702	0 %	40 %	60 %	0 %	157368462
150	NC_009832	TGGCC	2	10	241486	241495	0 %	20 %	40 %	40 %	157368463
151	NC_009832	CCGTT	2	10	244353	244362	0 %	40 %	20 %	40 %	157368464
152	NC_009832	GGAAC	2	10	245096	245105	40 %	0 %	40 %	20 %	157368465
153	NC_009832	TAATT	2	10	246432	246441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009832	AAATG	2	10	246483	246492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009832	GCCAG	2	10	247482	247491	20 %	0 %	40 %	40 %	157368468
156	NC_009832	GGCCA	2	10	254013	254022	20 %	0 %	40 %	40 %	157368474
157	NC_009832	GCCGC	2	10	254372	254381	0 %	0 %	40 %	60 %	157368474
158	NC_009832	GCAGC	2	10	255100	255109	20 %	0 %	40 %	40 %	157368475
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161	NC_009832	CTGGG	2	10	262771	262780	0 %	20 %	60 %	20 %	157368482
162	NC_009832	GCATG	2	10	263321	263330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_009832	TCCCG	2	10	264846	264855	0 %	20 %	20 %	60 %	157368484
164	NC_009832	GTCGT	2	10	265098	265107	0 %	40 %	40 %	20 %	157368484
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168	NC_009832	GCATT	2	10	276520	276529	20 %	40 %	20 %	20 %	157368495
169	NC_009832	GTATC	2	10	281611	281620	20 %	40 %	20 %	20 %	157368499
170	NC_009832	TGGCG	2	10	283063	283072	0 %	20 %	60 %	20 %	157368502
171	NC_009832	GCCTG	2	10	284455	284464	0 %	20 %	40 %	40 %	157368504
172	NC_009832	GTACG	2	10	284514	284523	20 %	20 %	40 %	20 %	157368504
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174	NC_009832	CAATA	2	10	285721	285730	60 %	20 %	0 %	20 %	157368505
175	NC_009832	CCAAA	2	10	289280	289289	60 %	0 %	0 %	40 %	157368509
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177	NC_009832	CGCGC	2	10	292972	292981	0 %	0 %	40 %	60 %	157368511
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181	NC_009832	CATTG	2	10	299033	299042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_009832	AGGCT	2	10	301992	302001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_009832	CGGTA	2	10	304321	304330	20 %	20 %	40 %	20 %	157368516
184	NC_009832	GAGAA	2	10	304362	304371	60 %	0 %	40 %	0 %	157368516
185	NC_009832	TGGTT	2	10	304414	304423	0 %	60 %	40 %	0 %	157368516
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196	NC_009832	TGGTT	2	10	319643	319652	0 %	60 %	40 %	0 %	157368527
197	NC_009832	TCCGT	2	10	320278	320287	0 %	40 %	20 %	40 %	157368527
198	NC_009832	CCGGG	2	10	321947	321956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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214	NC_009832	TGATC	2	10	357121	357130	20 %	40 %	20 %	20 %	157368551
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223	NC_009832	CTGGC	2	10	364995	365004	0 %	20 %	40 %	40 %	157368559
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232	NC_009832	GGCGC	2	10	378027	378036	0 %	0 %	60 %	40 %	157368575
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236	NC_009832	ACGGT	2	10	385266	385275	20 %	20 %	40 %	20 %	157368584
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238	NC_009832	GGTGT	2	10	387249	387258	0 %	40 %	60 %	0 %	157368586
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241	NC_009832	CGCAT	2	10	389577	389586	20 %	20 %	20 %	40 %	157368587
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244	NC_009832	ACCTC	2	10	391697	391706	20 %	20 %	0 %	60 %	157368589
245	NC_009832	GGAGA	2	10	392714	392723	40 %	0 %	60 %	0 %	157368590
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248	NC_009832	CGCGG	2	10	395731	395740	0 %	0 %	60 %	40 %	157368593
249	NC_009832	CGTTC	2	10	399351	399360	0 %	40 %	20 %	40 %	157368595
250	NC_009832	TTATT	2	10	399970	399979	20 %	80 %	0 %	0 %	157368596
251	NC_009832	TGGCG	2	10	401763	401772	0 %	20 %	60 %	20 %	157368598
252	NC_009832	CGCTG	2	10	404945	404954	0 %	20 %	40 %	40 %	157368601
253	NC_009832	GCTGG	2	10	407970	407979	0 %	20 %	60 %	20 %	157368605
254	NC_009832	GCTGC	2	10	408427	408436	0 %	20 %	40 %	40 %	157368605
255	NC_009832	GTCAG	2	10	408935	408944	20 %	20 %	40 %	20 %	157368606
256	NC_009832	CCTGC	2	10	409676	409685	0 %	20 %	20 %	60 %	157368607
257	NC_009832	CCCGG	2	10	411096	411105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
258	NC_009832	CGGGG	2	10	411502	411511	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
259	NC_009832	CGGGG	2	10	411542	411551	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
260	NC_009832	TACGA	2	10	412976	412985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_009832	GCACC	2	10	414424	414433	20 %	0 %	20 %	60 %	157368612
262	NC_009832	TCGGT	2	10	415632	415641	0 %	40 %	40 %	20 %	157368613
263	NC_009832	AGATC	2	10	417659	417668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_009832	CGACC	2	10	418135	418144	20 %	0 %	20 %	60 %	157368615
265	NC_009832	CGTCT	2	10	419219	419228	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_009832	TCAAA	2	10	419817	419826	60 %	20 %	0 %	20 %	157368619
267	NC_009832	TTTGG	2	10	420485	420494	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_009832	AAACA	2	10	422434	422443	80 %	0 %	0 %	20 %	157368621
269	NC_009832	TGACC	2	10	422529	422538	20 %	20 %	20 %	40 %	157368621
270	NC_009832	ACCTG	2	10	423650	423659	20 %	20 %	20 %	40 %	157368623
271	NC_009832	TAGTT	2	10	424228	424237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009832	TCTGA	2	10	425676	425685	20 %	40 %	20 %	20 %	157368624
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