MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 12986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009831	CTTT	2	8	114	121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009831	ATTT	2	8	354	361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009831	CACG	2	8	1017	1024	25 %	0 %	25 %	50 %	157373142
4	NC_009831	CTTG	2	8	1258	1265	0 %	50 %	25 %	25 %	157373142
5	NC_009831	GATC	2	8	1705	1712	25 %	25 %	25 %	25 %	157373142
6	NC_009831	TATT	2	8	3636	3643	25 %	75 %	0 %	0 %	157373144
7	NC_009831	CTTT	2	8	4041	4048	0 %	75 %	0 %	25 %	157373145
8	NC_009831	GTTA	2	8	4387	4394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009831	AATT	2	8	4505	4512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009831	GATC	2	8	4621	4628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009831	ATGG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	50 %	0 %	157373147
12	NC_009831	TTTA	2	8	5489	5496	25 %	75 %	0 %	0 %	157373147
13	NC_009831	AGAC	2	8	5633	5640	50 %	0 %	25 %	25 %	157373147
14	NC_009831	AACC	2	8	6047	6054	50 %	0 %	0 %	50 %	157373147
15	NC_009831	AGTG	2	8	6327	6334	25 %	25 %	50 %	0 %	157373148
16	NC_009831	TCAC	2	8	6336	6343	25 %	25 %	0 %	50 %	157373148
17	NC_009831	AGGA	2	8	6410	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
18	NC_009831	AATT	2	8	9821	9828	50 %	50 %	0 %	0 %	157373150
19	NC_009831	AATG	2	8	10893	10900	50 %	25 %	25 %	0 %	157373150
20	NC_009831	GCAT	2	8	11561	11568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009831	GCAG	2	8	11654	11661	25 %	0 %	50 %	25 %	157373151
22	NC_009831	CAGC	2	8	12433	12440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009831	ATCT	2	8	12952	12959	25 %	50 %	0 %	25 %	157373152
24	NC_009831	TCCA	2	8	13076	13083	25 %	25 %	0 %	50 %	157373152
25	NC_009831	TCTG	3	12	14029	14040	0 %	50 %	25 %	25 %	157373153
26	NC_009831	ATCG	2	8	14042	14049	25 %	25 %	25 %	25 %	157373153
27	NC_009831	AGTT	2	8	14198	14205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009831	AGTA	2	8	14233	14240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009831	TCAG	2	8	14720	14727	25 %	25 %	25 %	25 %	157373154
30	NC_009831	AGGG	2	8	14858	14865	25 %	0 %	75 %	0 %	157373154
31	NC_009831	GCGT	2	8	16590	16597	0 %	25 %	50 %	25 %	157373155
32	NC_009831	TCTT	2	8	16825	16832	0 %	75 %	0 %	25 %	157373155
33	NC_009831	GCTT	2	8	17256	17263	0 %	50 %	25 %	25 %	157373155
34	NC_009831	ACCA	2	8	17472	17479	50 %	0 %	0 %	50 %	157373155
35	NC_009831	CAAG	2	8	17983	17990	50 %	0 %	25 %	25 %	157373156
36	NC_009831	AGGC	2	8	18025	18032	25 %	0 %	50 %	25 %	157373156
37	NC_009831	CATA	2	8	18172	18179	50 %	25 %	0 %	25 %	157373156
38	NC_009831	CCAC	2	8	18300	18307	25 %	0 %	0 %	75 %	157373156
39	NC_009831	AAGT	2	8	18315	18322	50 %	25 %	25 %	0 %	157373156
40	NC_009831	CTTT	2	8	18794	18801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009831	TGAG	2	8	19673	19680	25 %	25 %	50 %	0 %	157373158
42	NC_009831	AGCA	2	8	19743	19750	50 %	0 %	25 %	25 %	157373158
43	NC_009831	GACC	2	8	19973	19980	25 %	0 %	25 %	50 %	157373158
44	NC_009831	TGGT	2	8	20018	20025	0 %	50 %	50 %	0 %	157373158
45	NC_009831	TCTA	2	8	20840	20847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009831	TACA	2	8	21401	21408	50 %	25 %	0 %	25 %	157373159
47	NC_009831	AACC	2	8	21502	21509	50 %	0 %	0 %	50 %	157373159
48	NC_009831	TAGA	2	8	21543	21550	50 %	25 %	25 %	0 %	157373159
49	NC_009831	TGGA	2	8	21901	21908	25 %	25 %	50 %	0 %	157373159
50	NC_009831	ATGG	2	8	23273	23280	25 %	25 %	50 %	0 %	157373159
51	NC_009831	AAGC	2	8	23389	23396	50 %	0 %	25 %	25 %	157373159
52	NC_009831	CTGA	2	8	23552	23559	25 %	25 %	25 %	25 %	157373159
53	NC_009831	GATA	2	8	23947	23954	50 %	25 %	25 %	0 %	157373159
54	NC_009831	GGCT	2	8	24080	24087	0 %	25 %	50 %	25 %	157373159
55	NC_009831	TGCG	2	8	24510	24517	0 %	25 %	50 %	25 %	157373160
56	NC_009831	CTTG	2	8	24803	24810	0 %	50 %	25 %	25 %	157373160
57	NC_009831	TGGC	2	8	24916	24923	0 %	25 %	50 %	25 %	157373161
58	NC_009831	TAAC	2	8	26486	26493	50 %	25 %	0 %	25 %	157373163
59	NC_009831	TGGA	2	8	26835	26842	25 %	25 %	50 %	0 %	157373163
60	NC_009831	TTCC	2	8	27244	27251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009831	TCTT	2	8	27601	27608	0 %	75 %	0 %	25 %	157373164
62	NC_009831	GCCA	2	8	27809	27816	25 %	0 %	25 %	50 %	157373164
63	NC_009831	CTTT	2	8	28493	28500	0 %	75 %	0 %	25 %	157373164
64	NC_009831	TTGC	2	8	29408	29415	0 %	50 %	25 %	25 %	157373164
65	NC_009831	CTAA	2	8	29804	29811	50 %	25 %	0 %	25 %	157373165
66	NC_009831	AATC	2	8	30488	30495	50 %	25 %	0 %	25 %	157373165
67	NC_009831	TTCC	2	8	30511	30518	0 %	50 %	0 %	50 %	157373165
68	NC_009831	CTTC	2	8	30832	30839	0 %	50 %	0 %	50 %	157373165
69	NC_009831	GCCA	2	8	31314	31321	25 %	0 %	25 %	50 %	157373166
70	NC_009831	CTCA	2	8	31542	31549	25 %	25 %	0 %	50 %	157373166
71	NC_009831	AGAT	2	8	31658	31665	50 %	25 %	25 %	0 %	157373166
72	NC_009831	GCTG	2	8	32387	32394	0 %	25 %	50 %	25 %	157373167
73	NC_009831	GATT	2	8	33888	33895	25 %	50 %	25 %	0 %	157373168
74	NC_009831	ACTG	2	8	33988	33995	25 %	25 %	25 %	25 %	157373168
75	NC_009831	TAGC	2	8	35248	35255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009831	GAAT	2	8	35521	35528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009831	TTTG	2	8	35974	35981	0 %	75 %	25 %	0 %	157373171
78	NC_009831	TTCT	2	8	36332	36339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009831	AGCG	2	8	36873	36880	25 %	0 %	50 %	25 %	157373172
80	NC_009831	CTTT	2	8	36915	36922	0 %	75 %	0 %	25 %	157373172
81	NC_009831	GATA	2	8	37202	37209	50 %	25 %	25 %	0 %	157373172
82	NC_009831	TGAT	2	8	37416	37423	25 %	50 %	25 %	0 %	157373172
83	NC_009831	TGCC	2	8	37441	37448	0 %	25 %	25 %	50 %	157373172
84	NC_009831	TAAT	2	8	37755	37762	50 %	50 %	0 %	0 %	157373172
85	NC_009831	ATGC	2	8	37877	37884	25 %	25 %	25 %	25 %	157373172
86	NC_009831	TTGG	2	8	38104	38111	0 %	50 %	50 %	0 %	157373173
87	NC_009831	TGAG	2	8	38344	38351	25 %	25 %	50 %	0 %	157373173
88	NC_009831	CCTG	2	8	38890	38897	0 %	25 %	25 %	50 %	157373173
89	NC_009831	AGCG	2	8	39381	39388	25 %	0 %	50 %	25 %	157373173
90	NC_009831	ATCC	2	8	39535	39542	25 %	25 %	0 %	50 %	157373174
91	NC_009831	AGGA	2	8	39668	39675	50 %	0 %	50 %	0 %	157373174
92	NC_009831	TTCC	2	8	40126	40133	0 %	50 %	0 %	50 %	157373174
93	NC_009831	TTGC	2	8	40574	40581	0 %	50 %	25 %	25 %	157373174
94	NC_009831	GACA	2	8	40718	40725	50 %	0 %	25 %	25 %	157373174
95	NC_009831	TTTC	2	8	41643	41650	0 %	75 %	0 %	25 %	157373175
96	NC_009831	CATA	2	8	42295	42302	50 %	25 %	0 %	25 %	157373176
97	NC_009831	TCGT	2	8	42477	42484	0 %	50 %	25 %	25 %	157373177
98	NC_009831	TATC	2	8	42641	42648	25 %	50 %	0 %	25 %	157373177
99	NC_009831	TGGG	2	8	44340	44347	0 %	25 %	75 %	0 %	157373178
100	NC_009831	ATCG	2	8	44989	44996	25 %	25 %	25 %	25 %	157373179
101	NC_009831	ATGG	2	8	45217	45224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009831	TCTT	2	8	45725	45732	0 %	75 %	0 %	25 %	157373180
103	NC_009831	AATA	2	8	46189	46196	75 %	25 %	0 %	0 %	157373180
104	NC_009831	TGAT	2	8	46214	46221	25 %	50 %	25 %	0 %	157373180
105	NC_009831	CTTG	2	8	46356	46363	0 %	50 %	25 %	25 %	157373180
106	NC_009831	GTGA	2	8	46832	46839	25 %	25 %	50 %	0 %	157373180
107	NC_009831	GATC	2	8	47283	47290	25 %	25 %	25 %	25 %	157373181
108	NC_009831	TTGC	2	8	48062	48069	0 %	50 %	25 %	25 %	157373182
109	NC_009831	CCCA	2	8	48285	48292	25 %	0 %	0 %	75 %	157373182
110	NC_009831	ATAG	2	8	48500	48507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009831	GCAG	2	8	48704	48711	25 %	0 %	50 %	25 %	157373183
112	NC_009831	TCAA	2	8	49105	49112	50 %	25 %	0 %	25 %	157373183
113	NC_009831	CCCA	2	8	49664	49671	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009831	GAAA	2	8	49761	49768	75 %	0 %	25 %	0 %	157373184
115	NC_009831	CTAC	2	8	50935	50942	25 %	25 %	0 %	50 %	157373186
116	NC_009831	TACA	2	8	51306	51313	50 %	25 %	0 %	25 %	157373186
117	NC_009831	CCAA	2	8	51672	51679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009831	AGGT	2	8	52410	52417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009831	TGCT	2	8	52428	52435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009831	TGTT	2	8	53521	53528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009831	ATAA	2	8	53698	53705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009831	GCGA	2	8	54086	54093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009831	AACT	2	8	54179	54186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009831	CTGA	2	8	54265	54272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009831	CGTC	2	8	54790	54797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009831	AAAG	2	8	54913	54920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009831	ATTG	2	8	55685	55692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009831	GAAG	2	8	56470	56477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009831	TAGA	2	8	56840	56847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009831	ATAG	2	8	57073	57080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009831	GTTA	2	8	58269	58276	25 %	50 %	25 %	0 %	157373187
132	NC_009831	GGCA	2	8	59027	59034	25 %	0 %	50 %	25 %	157373187
133	NC_009831	TTGT	2	8	59368	59375	0 %	75 %	25 %	0 %	157373187
134	NC_009831	TCCC	2	8	59942	59949	0 %	25 %	0 %	75 %	157373187
135	NC_009831	GAAG	2	8	59971	59978	50 %	0 %	50 %	0 %	157373187
136	NC_009831	TCAG	2	8	60573	60580	25 %	25 %	25 %	25 %	157373187
137	NC_009831	GCTG	2	8	61195	61202	0 %	25 %	50 %	25 %	157373189
138	NC_009831	TGTT	2	8	61652	61659	0 %	75 %	25 %	0 %	157373190
139	NC_009831	CTGC	2	8	62232	62239	0 %	25 %	25 %	50 %	157373190
140	NC_009831	GATC	2	8	62353	62360	25 %	25 %	25 %	25 %	157373190
141	NC_009831	ATGG	2	8	62361	62368	25 %	25 %	50 %	0 %	157373190
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143	NC_009831	CATA	2	8	63291	63298	50 %	25 %	0 %	25 %	157373191
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