MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	CCACG	2	10	2643	2652	20 %	0 %	20 %	60 %	157283833
2	NC_009806	GCGCA	2	10	2699	2708	20 %	0 %	40 %	40 %	157283833
3	NC_009806	GCGAC	2	10	4973	4982	20 %	0 %	40 %	40 %	157283834
4	NC_009806	CAGGT	2	10	6107	6116	20 %	20 %	40 %	20 %	157283836
5	NC_009806	CGTGC	2	10	7862	7871	0 %	20 %	40 %	40 %	157283837
6	NC_009806	GCTTC	2	10	8415	8424	0 %	40 %	20 %	40 %	157283838
7	NC_009806	GCACC	2	10	14512	14521	20 %	0 %	20 %	60 %	157283846
8	NC_009806	CGGTG	2	10	18049	18058	0 %	20 %	60 %	20 %	157283849
9	NC_009806	GTTCT	2	10	18448	18457	0 %	60 %	20 %	20 %	157283850
10	NC_009806	AGTCG	2	10	19122	19131	20 %	20 %	40 %	20 %	157283851
11	NC_009806	GCCAG	2	10	19773	19782	20 %	0 %	40 %	40 %	157283852
12	NC_009806	GCCCG	2	10	24175	24184	0 %	0 %	40 %	60 %	157283854
13	NC_009806	ACGCC	2	10	24359	24368	20 %	0 %	20 %	60 %	157283854
14	NC_009806	CCAGC	2	10	24542	24551	20 %	0 %	20 %	60 %	157283854
15	NC_009806	CCGCG	2	10	25179	25188	0 %	0 %	40 %	60 %	157283854
16	NC_009806	GGATC	2	10	25768	25777	20 %	20 %	40 %	20 %	157283855
17	NC_009806	ACCGG	2	10	27151	27160	20 %	0 %	40 %	40 %	157283856
18	NC_009806	CTGCG	2	10	27348	27357	0 %	20 %	40 %	40 %	157283856
19	NC_009806	GCGGT	2	10	27391	27400	0 %	20 %	60 %	20 %	157283856
20	NC_009806	GCTCG	2	10	28113	28122	0 %	20 %	40 %	40 %	157283856
21	NC_009806	GGGTG	2	10	28439	28448	0 %	20 %	80 %	0 %	157283856
22	NC_009806	TCCGA	2	10	28912	28921	20 %	20 %	20 %	40 %	157283857
23	NC_009806	GCCGA	2	10	30300	30309	20 %	0 %	40 %	40 %	157283859
24	NC_009806	TCCCT	2	10	34377	34386	0 %	40 %	0 %	60 %	157283862
25	NC_009806	TGGAC	2	10	34415	34424	20 %	20 %	40 %	20 %	157283862
26	NC_009806	CCCAC	2	10	35462	35471	20 %	0 %	0 %	80 %	157283863
27	NC_009806	CGCGG	2	10	36062	36071	0 %	0 %	60 %	40 %	157283864
28	NC_009806	CCGAC	2	10	37837	37846	20 %	0 %	20 %	60 %	157283866
29	NC_009806	CCCAC	2	10	38145	38154	20 %	0 %	0 %	80 %	157283867
30	NC_009806	GTGGC	2	10	38381	38390	0 %	20 %	60 %	20 %	157283867
31	NC_009806	TCGGC	2	10	39529	39538	0 %	20 %	40 %	40 %	157283868
32	NC_009806	CCCCG	2	10	40531	40540	0 %	0 %	20 %	80 %	157283869
33	NC_009806	GCCGC	2	10	41923	41932	0 %	0 %	40 %	60 %	157283870
34	NC_009806	AGCGG	2	10	45200	45209	20 %	0 %	60 %	20 %	157283873
35	NC_009806	CGGGG	2	10	45507	45516	0 %	0 %	80 %	20 %	157283873
36	NC_009806	GGCTC	2	10	46430	46439	0 %	20 %	40 %	40 %	157283874
37	NC_009806	CCGGG	2	10	48486	48495	0 %	0 %	60 %	40 %	157283875
38	NC_009806	CAGGC	2	10	50204	50213	20 %	0 %	40 %	40 %	157283876
39	NC_009806	CCAGC	2	10	54018	54027	20 %	0 %	20 %	60 %	157283881
40	NC_009806	CAGCA	2	10	54183	54192	40 %	0 %	20 %	40 %	157283881
41	NC_009806	CGCTG	2	10	54291	54300	0 %	20 %	40 %	40 %	157283881
42	NC_009806	CGGGG	2	10	56014	56023	0 %	0 %	80 %	20 %	157283883
43	NC_009806	CGTAC	2	10	60221	60230	20 %	20 %	20 %	40 %	157283888
44	NC_009806	CACCG	2	10	60354	60363	20 %	0 %	20 %	60 %	157283888
45	NC_009806	CGCGG	2	10	61002	61011	0 %	0 %	60 %	40 %	157283889
46	NC_009806	CCGGC	2	10	61451	61460	0 %	0 %	40 %	60 %	157283889
47	NC_009806	GCGCC	2	10	61755	61764	0 %	0 %	40 %	60 %	157283889
48	NC_009806	GACCC	2	10	61913	61922	20 %	0 %	20 %	60 %	157283889
49	NC_009806	CCCCG	2	10	62415	62424	0 %	0 %	20 %	80 %	157283890
50	NC_009806	CCTCA	2	10	62571	62580	20 %	20 %	0 %	60 %	157283890
51	NC_009806	CACAA	2	10	63690	63699	60 %	0 %	0 %	40 %	157283891
52	NC_009806	CACCG	2	10	64375	64384	20 %	0 %	20 %	60 %	157283892
53	NC_009806	GATCG	2	10	68016	68025	20 %	20 %	40 %	20 %	157283896
54	NC_009806	CAGCC	2	10	68689	68698	20 %	0 %	20 %	60 %	157283898
55	NC_009806	CGTGG	2	10	70890	70899	0 %	20 %	60 %	20 %	157283900
56	NC_009806	GCTGC	2	10	74244	74253	0 %	20 %	40 %	40 %	157283904
57	NC_009806	CACTG	2	10	76189	76198	20 %	20 %	20 %	40 %	157283905
58	NC_009806	GCGCT	2	10	76882	76891	0 %	20 %	40 %	40 %	157283906
59	NC_009806	TCCGG	2	10	77115	77124	0 %	20 %	40 %	40 %	157283906
60	NC_009806	CCTGT	2	10	78741	78750	0 %	40 %	20 %	40 %	157283907
61	NC_009806	CGCTG	2	10	79471	79480	0 %	20 %	40 %	40 %	157283909
62	NC_009806	CGTGG	2	10	79818	79827	0 %	20 %	60 %	20 %	157283910
63	NC_009806	CACCG	2	10	80018	80027	20 %	0 %	20 %	60 %	157283911
64	NC_009806	GGCCG	2	10	81236	81245	0 %	0 %	60 %	40 %	157283913
65	NC_009806	GGCCA	2	10	82105	82114	20 %	0 %	40 %	40 %	157283913
66	NC_009806	CGTGG	2	10	82423	82432	0 %	20 %	60 %	20 %	157283913
67	NC_009806	GCACC	2	10	82461	82470	20 %	0 %	20 %	60 %	157283913
68	NC_009806	CCGCG	2	10	83064	83073	0 %	0 %	40 %	60 %	157283913
69	NC_009806	CCCCA	2	10	83588	83597	20 %	0 %	0 %	80 %	157283913
70	NC_009806	GGTCC	2	10	86407	86416	0 %	20 %	40 %	40 %	157283916
71	NC_009806	TCGGC	2	10	87865	87874	0 %	20 %	40 %	40 %	157283916
72	NC_009806	CGAGC	2	10	88472	88481	20 %	0 %	40 %	40 %	157283916
73	NC_009806	CTCGA	2	10	88664	88673	20 %	20 %	20 %	40 %	157283916
74	NC_009806	CCACC	2	10	89365	89374	20 %	0 %	0 %	80 %	157283917
75	NC_009806	TGGGG	2	10	92052	92061	0 %	20 %	80 %	0 %	157283919
76	NC_009806	GTCCA	2	10	95866	95875	20 %	20 %	20 %	40 %	157283923
77	NC_009806	CGGGC	2	10	97266	97275	0 %	0 %	60 %	40 %	157283924
78	NC_009806	CCCCG	2	10	97690	97699	0 %	0 %	20 %	80 %	157283924
79	NC_009806	GCACC	2	10	99950	99959	20 %	0 %	20 %	60 %	157283927
80	NC_009806	GCGCC	2	10	100424	100433	0 %	0 %	40 %	60 %	157283927
81	NC_009806	GCCGG	2	10	100998	101007	0 %	0 %	60 %	40 %	157283927
82	NC_009806	GGGTG	2	10	101517	101526	0 %	20 %	80 %	0 %	157283928
83	NC_009806	TCCAG	2	10	102147	102156	20 %	20 %	20 %	40 %	157283929
84	NC_009806	GCCCA	2	10	102344	102353	20 %	0 %	20 %	60 %	157283929
85	NC_009806	CCCGT	2	10	104686	104695	0 %	20 %	20 %	60 %	157283931
86	NC_009806	TCCTG	2	10	107745	107754	0 %	40 %	20 %	40 %	157283933
87	NC_009806	GTTGC	2	10	107820	107829	0 %	40 %	40 %	20 %	157283933
88	NC_009806	CGGCG	2	10	110474	110483	0 %	0 %	60 %	40 %	157283937
89	NC_009806	GTCGT	2	10	111093	111102	0 %	40 %	40 %	20 %	157283937
90	NC_009806	GAGGG	2	10	112426	112435	20 %	0 %	80 %	0 %	157283937
91	NC_009806	GGCGG	2	10	113420	113429	0 %	0 %	80 %	20 %	157283938
92	NC_009806	GGCGT	2	10	113502	113511	0 %	20 %	60 %	20 %	157283938
93	NC_009806	GGGCG	2	10	115120	115129	0 %	0 %	80 %	20 %	157283939
94	NC_009806	CTGGC	2	10	115800	115809	0 %	20 %	40 %	40 %	157283940
95	NC_009806	GGGAC	2	10	116075	116084	20 %	0 %	60 %	20 %	157283940
96	NC_009806	CACGG	2	10	123169	123178	20 %	0 %	40 %	40 %	157283944
97	NC_009806	GCGGT	2	10	123227	123236	0 %	20 %	60 %	20 %	157283944
98	NC_009806	CGGGT	2	10	126404	126413	0 %	20 %	60 %	20 %	157283946
99	NC_009806	GGCGG	2	10	126429	126438	0 %	0 %	80 %	20 %	157283946
100	NC_009806	CTCCA	2	10	127414	127423	20 %	20 %	0 %	60 %	157283946
101	NC_009806	GGATG	2	10	129086	129095	20 %	20 %	60 %	0 %	157283946
102	NC_009806	CGCCT	2	10	129442	129451	0 %	20 %	20 %	60 %	157283947
103	NC_009806	GATGC	2	10	129944	129953	20 %	20 %	40 %	20 %	157283947
104	NC_009806	GCCGG	2	10	130449	130458	0 %	0 %	60 %	40 %	157283949
105	NC_009806	TCGGC	2	10	139088	139097	0 %	20 %	40 %	40 %	157283957
106	NC_009806	CCCGT	2	10	143194	143203	0 %	20 %	20 %	60 %	157283960
107	NC_009806	CCGGC	2	10	143790	143799	0 %	0 %	40 %	60 %	157283961
108	NC_009806	ACGCG	2	10	144995	145004	20 %	0 %	40 %	40 %	157283963
109	NC_009806	CCGCG	2	10	145022	145031	0 %	0 %	40 %	60 %	157283963
110	NC_009806	GCGCG	2	10	146322	146331	0 %	0 %	60 %	40 %	157283965
111	NC_009806	CGCAC	2	10	147843	147852	20 %	0 %	20 %	60 %	157283966
112	NC_009806	ACCTC	2	10	148850	148859	20 %	20 %	0 %	60 %	157283966
113	NC_009806	CGAGC	2	10	149725	149734	20 %	0 %	40 %	40 %	157283966
114	NC_009806	CTGCT	2	10	150733	150742	0 %	40 %	20 %	40 %	157283967
115	NC_009806	CGGCA	2	10	151598	151607	20 %	0 %	40 %	40 %	157283968
116	NC_009806	GGGCC	2	10	154206	154215	0 %	0 %	60 %	40 %	157283970
117	NC_009806	GCCTC	2	10	156234	156243	0 %	20 %	20 %	60 %	157283973
118	NC_009806	GACGC	2	10	157272	157281	20 %	0 %	40 %	40 %	157283974
119	NC_009806	GTGCG	2	10	157755	157764	0 %	20 %	60 %	20 %	157283974
120	NC_009806	AGGGG	2	10	158764	158773	20 %	0 %	80 %	0 %	157283976
121	NC_009806	AGGCC	2	10	158903	158912	20 %	0 %	40 %	40 %	157283976
122	NC_009806	AGCTG	2	10	160343	160352	20 %	20 %	40 %	20 %	157283979
123	NC_009806	CTCGT	2	10	161291	161300	0 %	40 %	20 %	40 %	157283980
124	NC_009806	ACGTC	2	10	164001	164010	20 %	20 %	20 %	40 %	157283983
125	NC_009806	GGCCG	2	10	165581	165590	0 %	0 %	60 %	40 %	157283986
126	NC_009806	CGGGC	2	10	165895	165904	0 %	0 %	60 %	40 %	157283987
127	NC_009806	GGAGG	2	10	166476	166485	20 %	0 %	80 %	0 %	157283987
128	NC_009806	GGGTG	2	10	166616	166625	0 %	20 %	80 %	0 %	157283987
129	NC_009806	CCGCC	2	10	167004	167013	0 %	0 %	20 %	80 %	157283988
130	NC_009806	GTCCA	2	10	167161	167170	20 %	20 %	20 %	40 %	157283988
131	NC_009806	CCCAT	2	10	167644	167653	20 %	20 %	0 %	60 %	157283988
132	NC_009806	GGCTG	2	10	169108	169117	0 %	20 %	60 %	20 %	157283990
133	NC_009806	CGGCG	2	10	171269	171278	0 %	0 %	60 %	40 %	157283994
134	NC_009806	TCGTC	2	10	172144	172153	0 %	40 %	20 %	40 %	157283996
135	NC_009806	CCCAC	2	10	173286	173295	20 %	0 %	0 %	80 %	157283998
136	NC_009806	CGCGG	2	10	173940	173949	0 %	0 %	60 %	40 %	157283999
137	NC_009806	CCAGG	2	10	173997	174006	20 %	0 %	40 %	40 %	157283999
138	NC_009806	TGCGC	2	10	174029	174038	0 %	20 %	40 %	40 %	157283999
139	NC_009806	ACGCC	2	10	179844	179853	20 %	0 %	20 %	60 %	157284009
140	NC_009806	CGTGC	2	10	181026	181035	0 %	20 %	40 %	40 %	157284011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.