MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	AGTG	2	8	455	462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009806	GCAG	2	8	724	731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009806	CCCA	2	8	1582	1589	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009806	GGCT	2	8	2204	2211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009806	GGTA	2	8	5865	5872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009806	CCTG	2	8	11015	11022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009806	ACGG	2	8	13104	13111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009806	GTCG	2	8	13127	13134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009806	CGGG	2	8	15583	15590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009806	CGGG	2	8	15596	15603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009806	CGGG	2	8	15609	15616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009806	TCCA	2	8	22668	22675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009806	ACCC	2	8	25520	25527	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009806	TGGC	2	8	25546	25553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009806	GGCG	2	8	28643	28650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009806	CGGA	2	8	28732	28739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009806	CCTT	2	8	28824	28831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009806	CCCG	2	8	31052	31059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009806	TCCT	2	8	31974	31981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009806	TTTC	2	8	34628	34635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009806	GCTA	2	8	34832	34839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009806	GCCG	2	8	35105	35112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009806	AGCT	2	8	35965	35972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009806	GCAC	2	8	39196	39203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009806	GGGT	2	8	39788	39795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009806	CCGG	2	8	39971	39978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009806	CCCG	2	8	39987	39994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009806	CTGC	2	8	40995	41002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009806	GCTC	2	8	46106	46113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009806	GCCG	2	8	46182	46189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009806	ACCG	2	8	46235	46242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009806	AAGC	2	8	46847	46854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009806	GGCA	2	8	46905	46912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009806	GGGC	2	8	50678	50685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009806	GCTG	2	8	62075	62082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009806	GCCG	2	8	63792	63799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009806	CCGC	3	12	63801	63812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009806	GGGT	2	8	65029	65036	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009806	TGAC	2	8	65200	65207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009806	GGCA	2	8	66460	66467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009806	GCCC	2	8	66515	66522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_009806	ACGA	2	8	66731	66738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009806	TCGC	2	8	68891	68898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009806	CTGC	2	8	70303	70310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009806	GTGC	2	8	72695	72702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009806	CCCG	2	8	73101	73108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_009806	TGAG	2	8	73157	73164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009806	ACCG	2	8	78062	78069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009806	GGCC	3	12	80266	80277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009806	TCGC	2	8	80286	80293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009806	CAGG	2	8	80590	80597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009806	CTCC	2	8	80666	80673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_009806	ACCG	2	8	94357	94364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009806	CTCC	2	8	95436	95443	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009806	AGGA	2	8	95683	95690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009806	CCAC	2	8	98957	98964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009806	CGGG	2	8	101304	101311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009806	AGCC	2	8	102961	102968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009806	CGGC	2	8	103753	103760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009806	CGGC	2	8	106399	106406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009806	GGGC	2	8	109795	109802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009806	AGGG	2	8	114667	114674	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009806	GGGC	2	8	118240	118247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009806	GCGA	2	8	118301	118308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009806	CGCT	2	8	120222	120229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009806	CGCT	2	8	120437	120444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009806	AGGT	2	8	122276	122283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009806	GTTG	2	8	130340	130347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009806	AGGT	2	8	132360	132367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009806	CGCA	2	8	133629	133636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009806	CGCA	2	8	133641	133648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009806	CGCA	2	8	133653	133660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009806	CGCA	2	8	133665	133672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009806	CGCA	2	8	133677	133684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009806	CGCA	2	8	133689	133696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009806	CGCA	2	8	133701	133708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009806	CGCA	2	8	133713	133720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009806	CGCA	2	8	133737	133744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009806	CGCA	2	8	133917	133924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009806	CGCA	2	8	133929	133936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009806	CGCA	2	8	134085	134092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009806	CTCA	2	8	135286	135293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009806	CGCA	2	8	135363	135370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009806	CGCA	2	8	135375	135382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009806	CGCA	2	8	135387	135394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009806	CGCA	2	8	135399	135406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009806	CGCA	2	8	135423	135430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009806	GCGA	2	8	136587	136594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009806	CGCA	2	8	150965	150972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009806	CGCA	2	8	150977	150984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009806	CGCA	2	8	150989	150996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009806	CGCA	2	8	151001	151008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009806	CGCA	2	8	151013	151020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009806	CGCA	2	8	151025	151032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009806	CGCA	2	8	151037	151044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009806	CGCA	2	8	151049	151056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009806	CGCC	2	8	151174	151181	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009806	ACCT	2	8	151251	151258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009806	AGTG	2	8	154450	154457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009806	CACC	2	8	154499	154506	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_009806	CGCC	2	8	154578	154585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_009806	CCCA	2	8	156039	156046	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009806	AGGT	2	8	159411	159418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009806	CCGC	2	8	160771	160778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_009806	GTTC	2	8	160993	161000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009806	GAGG	2	8	162734	162741	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009806	GGGT	2	8	163196	163203	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009806	TGCG	2	8	164982	164989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009806	GCCC	2	8	168756	168763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009806	CAGG	2	8	168854	168861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009806	CTGT	2	8	170423	170430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009806	CGGG	3	12	170498	170509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009806	GCGG	2	8	171340	171347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009806	GGCG	2	8	171917	171924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009806	GCGG	2	8	173125	173132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009806	GCGG	2	8	173790	173797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009806	GCGG	2	8	176083	176090	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009806	AGGT	3	12	176813	176824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009806	GGCG	2	8	176844	176851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009806	TCGG	2	8	176859	176866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009806	GTGG	2	8	177108	177115	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009806	TGGT	2	8	177699	177706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009806	AGGG	2	8	178270	178277	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009806	GTTC	2	8	179036	179043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009806	GCGG	2	8	179088	179095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009806	GTCC	2	8	180729	180736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009806	CGGG	2	8	181392	181399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.