MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	GC	3	6	369	374	0 %	0 %	50 %	50 %	157283829
2	NC_009806	CG	4	8	407	414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009806	GC	3	6	1623	1628	0 %	0 %	50 %	50 %	157283831
4	NC_009806	CA	3	6	1992	1997	50 %	0 %	0 %	50 %	157283832
5	NC_009806	CA	3	6	2224	2229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009806	GC	4	8	2415	2422	0 %	0 %	50 %	50 %	157283833
7	NC_009806	GT	3	6	3640	3645	0 %	50 %	50 %	0 %	157283833
8	NC_009806	TC	3	6	3883	3888	0 %	50 %	0 %	50 %	157283833
9	NC_009806	CT	3	6	4176	4181	0 %	50 %	0 %	50 %	157283834
10	NC_009806	CG	3	6	4423	4428	0 %	0 %	50 %	50 %	157283834
11	NC_009806	CT	3	6	6402	6407	0 %	50 %	0 %	50 %	157283836
12	NC_009806	TC	3	6	7328	7333	0 %	50 %	0 %	50 %	157283837
13	NC_009806	CG	3	6	8226	8231	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
14	NC_009806	GC	3	6	8440	8445	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
15	NC_009806	CG	3	6	8663	8668	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
16	NC_009806	GC	3	6	9108	9113	0 %	0 %	50 %	50 %	157283839
17	NC_009806	CT	3	6	9464	9469	0 %	50 %	0 %	50 %	157283839
18	NC_009806	CG	3	6	10177	10182	0 %	0 %	50 %	50 %	157283840
19	NC_009806	CG	3	6	10560	10565	0 %	0 %	50 %	50 %	157283841
20	NC_009806	GT	3	6	11229	11234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009806	GT	3	6	11242	11247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009806	GT	3	6	11255	11260	0 %	50 %	50 %	0 %	157283842
23	NC_009806	CG	3	6	12193	12198	0 %	0 %	50 %	50 %	157283844
24	NC_009806	GA	3	6	12388	12393	50 %	0 %	50 %	0 %	157283844
25	NC_009806	GC	3	6	14625	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	157283846
26	NC_009806	TC	3	6	15502	15507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009806	CG	3	6	15571	15576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009806	CG	3	6	16029	16034	0 %	0 %	50 %	50 %	157283847
29	NC_009806	GT	3	6	16914	16919	0 %	50 %	50 %	0 %	157283848
30	NC_009806	CA	3	6	17455	17460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009806	CT	3	6	17665	17670	0 %	50 %	0 %	50 %	157283849
32	NC_009806	CG	3	6	17911	17916	0 %	0 %	50 %	50 %	157283849
33	NC_009806	GC	3	6	18422	18427	0 %	0 %	50 %	50 %	157283850
34	NC_009806	CA	3	6	18895	18900	50 %	0 %	0 %	50 %	157283850
35	NC_009806	GC	3	6	19365	19370	0 %	0 %	50 %	50 %	157283851
36	NC_009806	CT	3	6	20224	20229	0 %	50 %	0 %	50 %	157283852
37	NC_009806	GC	3	6	20647	20652	0 %	0 %	50 %	50 %	157283852
38	NC_009806	GT	3	6	22596	22601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009806	CG	3	6	22632	22637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009806	CG	3	6	22842	22847	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
41	NC_009806	GC	3	6	23670	23675	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
42	NC_009806	CA	3	6	23884	23889	50 %	0 %	0 %	50 %	157283854
43	NC_009806	GC	3	6	25269	25274	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
44	NC_009806	CG	3	6	25275	25280	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
45	NC_009806	CT	3	6	26051	26056	0 %	50 %	0 %	50 %	157283855
46	NC_009806	GC	3	6	26753	26758	0 %	0 %	50 %	50 %	157283856
47	NC_009806	GT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	50 %	0 %	157283856
48	NC_009806	GA	3	6	28539	28544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009806	GC	4	8	28786	28793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009806	GC	3	6	30514	30519	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
51	NC_009806	GC	3	6	30604	30609	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
52	NC_009806	GC	3	6	30636	30641	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
53	NC_009806	GC	3	6	30816	30821	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
54	NC_009806	GC	3	6	31127	31132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009806	GC	3	6	31144	31149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009806	CG	3	6	32046	32051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009806	GC	3	6	32858	32863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009806	CG	3	6	33064	33069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009806	GT	3	6	33137	33142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009806	CG	4	8	33624	33631	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
61	NC_009806	GC	3	6	33657	33662	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
62	NC_009806	CG	3	6	34233	34238	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
63	NC_009806	AC	3	6	34434	34439	50 %	0 %	0 %	50 %	157283862
64	NC_009806	GT	3	6	34689	34694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009806	CG	3	6	35580	35585	0 %	0 %	50 %	50 %	157283863
66	NC_009806	TA	3	6	37386	37391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009806	GC	4	8	38166	38173	0 %	0 %	50 %	50 %	157283867
68	NC_009806	CG	3	6	38603	38608	0 %	0 %	50 %	50 %	157283867
69	NC_009806	AG	3	6	39446	39451	50 %	0 %	50 %	0 %	157283868
70	NC_009806	GC	3	6	40055	40060	0 %	0 %	50 %	50 %	157283869
71	NC_009806	GC	3	6	40686	40691	0 %	0 %	50 %	50 %	157283869
72	NC_009806	CG	3	6	41751	41756	0 %	0 %	50 %	50 %	157283870
73	NC_009806	CG	3	6	43478	43483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009806	GC	3	6	43721	43726	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
75	NC_009806	GC	3	6	43826	43831	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
76	NC_009806	CA	3	6	44614	44619	50 %	0 %	0 %	50 %	157283873
77	NC_009806	GC	3	6	44837	44842	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
78	NC_009806	CG	3	6	45254	45259	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
79	NC_009806	GC	3	6	45387	45392	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
80	NC_009806	CG	3	6	45463	45468	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
81	NC_009806	GC	3	6	45738	45743	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
82	NC_009806	CG	3	6	46188	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009806	GC	4	8	46290	46297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009806	CG	3	6	46542	46547	0 %	0 %	50 %	50 %	157283874
85	NC_009806	TC	3	6	47041	47046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009806	GC	3	6	47294	47299	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
87	NC_009806	GC	3	6	48538	48543	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
88	NC_009806	AG	3	6	49004	49009	50 %	0 %	50 %	0 %	157283876
89	NC_009806	GA	3	6	49129	49134	50 %	0 %	50 %	0 %	157283876
90	NC_009806	CG	3	6	49775	49780	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
91	NC_009806	CG	4	8	49959	49966	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
92	NC_009806	CG	3	6	50356	50361	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
93	NC_009806	GC	3	6	50897	50902	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
94	NC_009806	GC	3	6	50990	50995	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
95	NC_009806	GC	3	6	51086	51091	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
96	NC_009806	GC	3	6	51123	51128	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
97	NC_009806	CG	3	6	51791	51796	0 %	0 %	50 %	50 %	157283878
98	NC_009806	CG	3	6	51855	51860	0 %	0 %	50 %	50 %	157283878
99	NC_009806	GA	3	6	52807	52812	50 %	0 %	50 %	0 %	157283880
100	NC_009806	GC	3	6	53983	53988	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
101	NC_009806	GC	3	6	54626	54631	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
102	NC_009806	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
103	NC_009806	CG	3	6	56159	56164	0 %	0 %	50 %	50 %	157283883
104	NC_009806	GC	3	6	56636	56641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009806	GC	3	6	56827	56832	0 %	0 %	50 %	50 %	157283884
106	NC_009806	GC	3	6	57554	57559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009806	CG	3	6	57872	57877	0 %	0 %	50 %	50 %	157283885
108	NC_009806	GC	3	6	57973	57978	0 %	0 %	50 %	50 %	157283885
109	NC_009806	GC	3	6	59359	59364	0 %	0 %	50 %	50 %	157283887
110	NC_009806	CG	3	6	60787	60792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009806	GC	3	6	61249	61254	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
112	NC_009806	CG	3	6	61683	61688	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
113	NC_009806	CG	3	6	61953	61958	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
114	NC_009806	GT	3	6	62431	62436	0 %	50 %	50 %	0 %	157283890
115	NC_009806	GC	3	6	66318	66323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009806	GC	3	6	66537	66542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009806	GC	3	6	67239	67244	0 %	0 %	50 %	50 %	157283895
118	NC_009806	CG	3	6	67611	67616	0 %	0 %	50 %	50 %	157283896
119	NC_009806	CG	3	6	67671	67676	0 %	0 %	50 %	50 %	157283896
120	NC_009806	CT	3	6	67718	67723	0 %	50 %	0 %	50 %	157283896
121	NC_009806	TG	4	8	68110	68117	0 %	50 %	50 %	0 %	157283896
122	NC_009806	CG	3	6	68726	68731	0 %	0 %	50 %	50 %	157283898
123	NC_009806	GC	3	6	69477	69482	0 %	0 %	50 %	50 %	157283899
124	NC_009806	GC	3	6	70223	70228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009806	GC	3	6	70273	70278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009806	CG	3	6	70297	70302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009806	CG	3	6	71862	71867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009806	GC	3	6	72924	72929	0 %	0 %	50 %	50 %	157283903
129	NC_009806	GC	3	6	74252	74257	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
130	NC_009806	GC	3	6	74513	74518	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
131	NC_009806	GC	3	6	74556	74561	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
132	NC_009806	GC	3	6	74746	74751	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
133	NC_009806	CG	3	6	75411	75416	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
134	NC_009806	GC	3	6	75629	75634	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
135	NC_009806	GC	3	6	76498	76503	0 %	0 %	50 %	50 %	157283905
136	NC_009806	CT	3	6	76700	76705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009806	CA	3	6	77989	77994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009806	GC	3	6	78092	78097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009806	CA	3	6	78112	78117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009806	CG	3	6	78261	78266	0 %	0 %	50 %	50 %	157283907
141	NC_009806	CG	3	6	78777	78782	0 %	0 %	50 %	50 %	157283907
142	NC_009806	CG	3	6	79000	79005	0 %	0 %	50 %	50 %	157283908
143	NC_009806	CG	4	8	79031	79038	0 %	0 %	50 %	50 %	157283908
144	NC_009806	GC	3	6	80748	80753	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
145	NC_009806	CG	3	6	80766	80771	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
146	NC_009806	AG	3	6	80807	80812	50 %	0 %	50 %	0 %	157283913
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.