MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009802	AAATTT	2	12	12496	12507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009802	AAATTT	2	12	14630	14641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009802	CTAAAA	2	12	15412	15423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009802	TGAGGC	2	12	15764	15775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009802	AAAATG	2	12	21212	21223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009802	GCTGAT	2	12	22180	22191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009802	TAAAAA	2	12	41865	41876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009802	ATAATT	2	12	44295	44306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009802	TTTAAA	2	12	45720	45731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009802	CTTTTC	2	12	70880	70891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009802	GCCAAG	2	12	71000	71011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009802	TTTAAA	2	12	78182	78193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009802	CTTTTA	2	12	83404	83415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009802	TTTAAA	2	12	86297	86308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009802	ATCCTT	2	12	99432	99443	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009802	ATTTAA	2	12	111459	111470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009802	TTTAAA	2	12	140533	140544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009802	AATCCA	2	12	158521	158532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009802	GCTTGA	2	12	182509	182520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009802	AGATTA	2	12	200285	200296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009802	ACAAAA	2	12	213579	213590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009802	TTTTAT	2	12	224833	224844	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009802	AATTTA	2	12	227333	227344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009802	TTTAAA	2	12	254035	254046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009802	AGGCTG	2	12	271574	271585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009802	GCGGGA	2	12	275723	275734	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009802	AATTTA	2	12	287808	287819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009802	TTTAAA	2	12	291116	291127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009802	TTTAAA	2	12	292463	292474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009802	CAAAAT	2	12	331184	331195	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009802	TGCCAA	2	12	331217	331228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009802	AAGATG	2	12	336135	336146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009802	ATCTTA	2	12	343142	343153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009802	CTTTTG	2	12	351196	351207	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009802	TTTAAA	2	12	353546	353557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009802	GTTTAT	2	12	380882	380893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009802	TTTATA	2	12	381611	381622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009802	AAATTT	2	12	385078	385089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009802	AAAATA	2	12	388399	388410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009802	TTTAAA	2	12	389000	389011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009802	ACTTCG	2	12	403507	403518	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009802	TTTAAA	2	12	408545	408556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009802	ATAATT	2	12	412783	412794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009802	TAAAAA	2	12	422753	422764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009802	AAATTT	2	12	424507	424518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009802	ATTAAA	2	12	427466	427477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009802	GTCGTA	2	12	438996	439007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009802	CTAAAG	2	12	439273	439284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009802	GAGCTT	2	12	480035	480046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009802	ACAAAA	2	12	484142	484153	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009802	TTTAAA	2	12	493837	493848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009802	AAATTT	2	12	494157	494168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009802	AAAAAC	2	12	499057	499068	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009802	CAAAAG	2	12	499238	499249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009802	GTAAAT	2	12	499330	499341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009802	CATCGT	2	12	499359	499370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009802	ACTTAG	2	12	500784	500795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009802	ATTTAA	2	12	522019	522030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009802	GGCTCT	2	12	523459	523470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009802	TTTTTA	2	12	535092	535103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009802	AAGCTA	2	12	544540	544551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009802	ATATAA	2	12	545795	545806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009802	GATAAA	2	12	546408	546419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009802	GGGCGA	2	12	549055	549066	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009802	CAAGAT	2	12	549802	549813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009802	TTAGCC	2	12	550440	550451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009802	ATTTTT	2	12	580638	580649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009802	TTCTAG	2	12	581779	581790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009802	GGCGAG	2	12	583172	583183	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009802	TAAAAA	2	12	588800	588811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009802	TTTAAA	2	12	606262	606273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009802	AAAGAA	2	12	622986	622997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009802	ATTTTA	2	12	670081	670092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009802	TATTAC	2	12	673927	673938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009802	AGTTGA	2	12	675562	675573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009802	CTTTTT	2	12	678482	678493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009802	TTAGAG	2	12	712256	712267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009802	TTTAAA	2	12	719466	719477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009802	ATCTTT	2	12	733019	733030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009802	GTAAAA	2	12	733102	733113	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009802	TTTAAA	2	12	736816	736827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009802	AAATTT	2	12	741954	741965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009802	AAATTT	2	12	768078	768089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009802	TCTTTA	2	12	778357	778368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009802	CTAGCT	2	12	789339	789350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009802	AGTGGC	2	12	789368	789379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009802	GCGTAG	2	12	790404	790415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009802	TTATTT	2	12	820790	820801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009802	AAATTT	2	12	837876	837887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009802	TTTAAA	2	12	837945	837956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009802	ATTTAA	2	12	842045	842056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009802	TTTAAA	2	12	842410	842421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009802	AAATTT	2	12	844686	844697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009802	CCCTGA	2	12	859535	859546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009802	AAATTT	2	12	873737	873748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009802	AATTTA	2	12	877297	877308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009802	ATTTAT	2	12	903518	903529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009802	AATTTA	2	12	936740	936751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009802	AGAGAA	2	12	966338	966349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009802	TGGAAA	2	12	977059	977070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009802	TTTAAA	2	12	977278	977289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009802	TTTGTT	2	12	978684	978695	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009802	CAAAAA	2	12	999491	999502	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009802	ATAAAT	2	12	999653	999664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009802	TTTAAA	2	12	1020416	1020427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009802	TAAATT	2	12	1031366	1031377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009802	TAAAAT	2	12	1045035	1045046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009802	TTTAAA	2	12	1061096	1061107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009802	GCCAAA	2	12	1063370	1063381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009802	GCTTAT	2	12	1066823	1066834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009802	TAAATA	2	12	1090271	1090282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009802	CGAAGT	2	12	1109645	1109656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009802	AAATTA	2	12	1118861	1118872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009802	ATTTTA	2	12	1163278	1163289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009802	TTTTGT	2	12	1169402	1169413	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009802	AAATTT	2	12	1189447	1189458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009802	TAAATT	2	12	1194909	1194920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009802	TAATAT	2	12	1209457	1209468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009802	ATTTAT	2	12	1246543	1246554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009802	ATTTAA	2	12	1247594	1247605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009802	GTATCT	2	12	1253688	1253699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009802	CCTTTA	2	12	1274874	1274885	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009802	TAGCGA	2	12	1275474	1275485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009802	TTTAAG	2	12	1277646	1277657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009802	TAAATT	2	12	1290163	1290174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009802	TTAAAA	2	12	1290313	1290324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009802	CTGGCA	2	12	1308198	1308209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009802	AAAACC	2	12	1308937	1308948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009802	AGAGAA	2	12	1310399	1310410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009802	TCATCT	2	12	1311666	1311677	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009802	GCCAAA	2	12	1313975	1313986	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009802	CTTTTT	2	12	1337958	1337969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_009802	TTTAAA	2	12	1366686	1366697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_009802	AAATTT	2	12	1391325	1391336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009802	TTTAAA	2	12	1412649	1412660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009802	TTTAAA	2	12	1412784	1412795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009802	TTAAAT	2	12	1440684	1440695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009802	TTTAAA	2	12	1444135	1444146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_009802	TTAAAT	2	12	1659179	1659190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.