MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009802	ATTTT	2	10	12605	12614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009802	GCGCA	2	10	14506	14515	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009802	AAAAT	2	10	20698	20707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009802	TTTTA	2	10	33060	33069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009802	TAAAT	2	10	41141	41150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009802	AAATT	2	10	42014	42023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009802	AAAAG	2	10	48933	48942	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009802	ATTTA	2	10	115647	115656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009802	CGTAA	2	10	118158	118167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009802	AATAA	2	10	118178	118187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009802	AATAA	2	10	119065	119074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009802	AGCTT	2	10	140724	140733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009802	CTAAA	2	10	140820	140829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009802	AAACT	2	10	141212	141221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009802	AAAAG	2	10	142179	142188	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009802	CAAAT	2	10	142319	142328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009802	GTTTT	2	10	142857	142866	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009802	GCAAA	2	10	143068	143077	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009802	AAGCT	2	10	143883	143892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009802	ACTAA	2	10	144723	144732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009802	AAACT	2	10	145869	145878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009802	ATTTT	2	10	165505	165514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009802	ATTTT	2	10	169422	169431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009802	TCGCC	2	10	173454	173463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009802	ATTAA	2	10	177601	177610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009802	GCAAA	2	10	188981	188990	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009802	ATTTT	2	10	196594	196603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009802	AAAAT	2	10	197264	197273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009802	AAATT	2	10	197789	197798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009802	AGAAA	2	10	214470	214479	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009802	CATAT	2	10	215500	215509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009802	AACTA	2	10	215889	215898	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009802	AAAAT	2	10	218073	218082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009802	TTAGT	2	10	218734	218743	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009802	GAGTG	2	10	223601	223610	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009802	AAAAG	2	10	223773	223782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009802	AAAAC	2	10	251707	251716	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009802	GCAAA	2	10	252170	252179	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009802	ATAAA	2	10	254237	254246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009802	AATTT	2	10	254247	254256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009802	TAAAT	2	10	263930	263939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009802	TACTC	2	10	270825	270834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009802	GTGAT	2	10	271019	271028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009802	GGCTT	2	10	283621	283630	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009802	CTTTG	2	10	290700	290709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009802	GATAG	2	10	291480	291489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009802	GCTTT	2	10	292136	292145	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009802	TTTTA	2	10	305565	305574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009802	ATCTA	2	10	320299	320308	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009802	GGCGA	2	10	327591	327600	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009802	TCGCT	2	10	327637	327646	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009802	AGATG	2	10	327662	327671	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009802	TTGGT	2	10	339045	339054	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009802	AAGCA	2	10	343017	343026	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009802	ATTTT	2	10	369414	369423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009802	AAAAT	2	10	415902	415911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009802	TTATC	2	10	427526	427535	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009802	CTCGT	2	10	439381	439390	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009802	AGCTG	2	10	440044	440053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009802	TTTGA	2	10	445952	445961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009802	ATTTT	2	10	471669	471678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009802	AAACT	2	10	479979	479988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009802	AATTT	2	10	484247	484256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009802	AATTT	2	10	493881	493890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009802	AAAAT	2	10	495040	495049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009802	CAAAA	2	10	500018	500027	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009802	ATTTT	2	10	501940	501949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009802	AAAAT	2	10	507487	507496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009802	GTCTT	2	10	513466	513475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009802	CTTTG	2	10	523495	523504	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009802	AAGCA	2	10	531785	531794	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009802	TAAAA	2	10	537446	537455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009802	CGCTA	2	10	544986	544995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009802	CAAAT	2	10	545405	545414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009802	TTTGC	2	10	545913	545922	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009802	ATTTT	2	10	546755	546764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009802	TAAGC	2	10	548407	548416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009802	AAATG	2	10	550944	550953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009802	TAAAT	2	10	558274	558283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009802	TAAAC	2	10	565758	565767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009802	ACAAA	2	10	566020	566029	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009802	TTGGC	2	10	581984	581993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009802	AGAGA	2	10	582069	582078	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009802	ATGAG	2	10	583896	583905	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009802	TACGC	2	10	589833	589842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009802	TAAAA	2	10	594698	594707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009802	TAAAT	2	10	598635	598644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009802	CGATG	2	10	607446	607455	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009802	CTAGC	2	10	617483	617492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009802	ATGAG	2	10	623680	623689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009802	AGATG	2	10	623813	623822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009802	TCACC	2	10	624284	624293	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009802	GATGA	2	10	637861	637870	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009802	TTTGA	2	10	638101	638110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009802	TTTTA	2	10	655690	655699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009802	AAGTT	2	10	657694	657703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009802	CAAAA	2	10	688554	688563	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009802	CTCAT	2	10	697210	697219	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009802	GCTTT	2	10	708583	708592	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009802	TCGTG	2	10	709653	709662	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009802	CCGTA	2	10	712432	712441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009802	ATTTT	2	10	716076	716085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009802	CTCAT	2	10	719515	719524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009802	CTCAT	2	10	719626	719635	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009802	GCCTT	2	10	732460	732469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009802	AAAAT	2	10	733729	733738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009802	CTTTG	2	10	742205	742214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009802	TGTTT	2	10	742570	742579	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009802	GCACT	2	10	756057	756066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009802	AGAAT	2	10	756283	756292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009802	TTAAA	2	10	758151	758160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009802	AAATC	2	10	759726	759735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009802	AATAA	2	10	759866	759875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009802	TAGCT	2	10	797672	797681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009802	CTTTT	2	10	797695	797704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009802	CAAGT	2	10	820780	820789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009802	ATTTT	2	10	820825	820834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009802	TTTAA	2	10	824868	824877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009802	ATTTT	2	10	825360	825369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009802	TAAGC	2	10	829063	829072	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009802	TTTGC	2	10	837834	837843	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009802	ATTTT	2	10	850623	850632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009802	AAGAT	2	10	860038	860047	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009802	TATAA	2	10	887345	887354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009802	TAAAT	2	10	899352	899361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009802	TATTT	2	10	899666	899675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009802	TTTAT	2	10	903242	903251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009802	TAGAG	2	10	920953	920962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009802	TAAAT	2	10	923125	923134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009802	AAACT	2	10	929268	929277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009802	ACCTC	2	10	930374	930383	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_009802	CGATG	2	10	931269	931278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009802	CAAGG	2	10	933016	933025	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009802	GATAT	2	10	933103	933112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009802	CTAAA	2	10	933436	933445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009802	ATATA	2	10	938108	938117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009802	CTTTT	2	10	940487	940496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009802	AAAAT	2	10	950440	950449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009802	ATTTT	2	10	966143	966152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009802	TCACT	2	10	966471	966480	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009802	AAGAT	2	10	967744	967753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009802	CACGC	2	10	968067	968076	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_009802	TGGTG	2	10	978765	978774	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009802	AAATT	2	10	1015654	1015663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009802	TAAAA	2	10	1055722	1055731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009802	TAATA	2	10	1064638	1064647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009802	AAGAA	2	10	1082407	1082416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009802	AGCTT	2	10	1082654	1082663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_009802	TAAAA	2	10	1196464	1196473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_009802	AAAGA	2	10	1364766	1364775	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_009802	TCATC	2	10	2038263	2038272	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
273	NC_009802	GTTTT	2	10	2038521	2038530	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009802	TTTTC	2	10	2039977	2039986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.