MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 3272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	157158747
2	NC_009801	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	157158096
3	NC_009801	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	157156183
4	NC_009801	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	157158697
5	NC_009801	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	157158038
6	NC_009801	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	157155398
7	NC_009801	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	157155398
8	NC_009801	GTTTT	2	10	20576	20585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009801	TTTAT	2	10	21632	21641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009801	ATTGC	2	10	22954	22963	20 %	40 %	20 %	20 %	157159091
11	NC_009801	TTAAT	2	10	23577	23586	40 %	60 %	0 %	0 %	157157495
12	NC_009801	CAGTA	2	10	29868	29877	40 %	20 %	20 %	20 %	157155637
13	NC_009801	ATTTA	2	10	32425	32434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009801	GCGAA	2	10	35663	35672	40 %	0 %	40 %	20 %	157159012
15	NC_009801	CCGTT	2	10	36557	36566	0 %	40 %	20 %	40 %	157159012
16	NC_009801	CACGG	2	10	36934	36943	20 %	0 %	40 %	40 %	157159012
17	NC_009801	CGAAT	2	10	39643	39652	40 %	20 %	20 %	20 %	157155167
18	NC_009801	CCATG	2	10	41181	41190	20 %	20 %	20 %	40 %	157156920
19	NC_009801	CCGTA	2	10	42827	42836	20 %	20 %	20 %	40 %	157156236
20	NC_009801	TTAAA	2	10	43565	43574	60 %	40 %	0 %	0 %	157156236
21	NC_009801	ACCCA	2	10	44308	44317	40 %	0 %	0 %	60 %	157157828
22	NC_009801	TTTGA	2	10	45935	45944	20 %	60 %	20 %	0 %	157158533
23	NC_009801	CGGCG	2	10	46186	46195	0 %	0 %	60 %	40 %	157158533
24	NC_009801	AATCA	2	10	46468	46477	60 %	20 %	0 %	20 %	157155244
25	NC_009801	CGGTT	2	10	47423	47432	0 %	40 %	40 %	20 %	157156667
26	NC_009801	TGGCG	2	10	49114	49123	0 %	20 %	60 %	20 %	157154973
27	NC_009801	TGCAC	2	10	50876	50885	20 %	20 %	20 %	40 %	157155009
28	NC_009801	AGGGC	2	10	51961	51970	20 %	0 %	60 %	20 %	157159263
29	NC_009801	GGCGC	2	10	51995	52004	0 %	0 %	60 %	40 %	157159263
30	NC_009801	GAAAC	2	10	52808	52817	60 %	0 %	20 %	20 %	157159263
31	NC_009801	AACGT	2	10	54720	54729	40 %	20 %	20 %	20 %	157157398
32	NC_009801	GCGTC	2	10	57704	57713	0 %	20 %	40 %	40 %	157155530
33	NC_009801	ATGTT	2	10	58518	58527	20 %	60 %	20 %	0 %	157155793
34	NC_009801	CTTCG	2	10	58951	58960	0 %	40 %	20 %	40 %	157155793
35	NC_009801	TGCGT	2	10	59237	59246	0 %	40 %	40 %	20 %	157155793
36	NC_009801	AAAGT	2	10	64971	64980	60 %	20 %	20 %	0 %	157157613
37	NC_009801	AGTCG	2	10	65940	65949	20 %	20 %	40 %	20 %	157156108
38	NC_009801	GGTGA	2	10	67219	67228	20 %	20 %	60 %	0 %	157156108
39	NC_009801	TCGCG	2	10	69826	69835	0 %	20 %	40 %	40 %	157155370
40	NC_009801	TAGTG	2	10	77304	77313	20 %	40 %	40 %	0 %	157158860
41	NC_009801	GATGG	2	10	78192	78201	20 %	20 %	60 %	0 %	157155626
42	NC_009801	ATTTT	2	10	79020	79029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009801	CTGGA	2	10	80092	80101	20 %	20 %	40 %	20 %	157156264
44	NC_009801	CTGGT	2	10	83385	83394	0 %	40 %	40 %	20 %	157157195
45	NC_009801	GACCG	2	10	83933	83942	20 %	0 %	40 %	40 %	157159154
46	NC_009801	ATGTT	2	10	86482	86491	20 %	60 %	20 %	0 %	157158356
47	NC_009801	AAAAC	2	10	86897	86906	80 %	0 %	0 %	20 %	157158356
48	NC_009801	TGCAT	2	10	87424	87433	20 %	40 %	20 %	20 %	157157875
49	NC_009801	ATTCC	2	10	87594	87603	20 %	40 %	0 %	40 %	157157875
50	NC_009801	AGTTC	2	10	92687	92696	20 %	40 %	20 %	20 %	157154775
51	NC_009801	CGTGG	2	10	94060	94069	0 %	20 %	60 %	20 %	157158087
52	NC_009801	TATCG	2	10	94567	94576	20 %	40 %	20 %	20 %	157158087
53	NC_009801	GCCTG	2	10	98899	98908	0 %	20 %	40 %	40 %	157156086
54	NC_009801	GTTTG	2	10	99343	99352	0 %	60 %	40 %	0 %	157156086
55	NC_009801	ACCGT	2	10	100812	100821	20 %	20 %	20 %	40 %	157156576
56	NC_009801	ATCAG	2	10	102585	102594	40 %	20 %	20 %	20 %	157154862
57	NC_009801	AGCCG	2	10	104353	104362	20 %	0 %	40 %	40 %	157155564
58	NC_009801	GCGCA	2	10	106681	106690	20 %	0 %	40 %	40 %	157157630
59	NC_009801	TGGCG	2	10	107675	107684	0 %	20 %	60 %	20 %	157156227
60	NC_009801	CCGGC	2	10	110645	110654	0 %	0 %	40 %	60 %	157156803
61	NC_009801	CGCGG	2	10	113854	113863	0 %	0 %	60 %	40 %	157156967
62	NC_009801	ATCCC	2	10	116098	116107	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_009801	CATCG	2	10	116111	116120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009801	TAACG	2	10	116805	116814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009801	ATGCC	2	10	117264	117273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009801	AATGC	2	10	118547	118556	40 %	20 %	20 %	20 %	157158124
67	NC_009801	TCTGT	2	10	119493	119502	0 %	60 %	20 %	20 %	157156557
68	NC_009801	GCATG	2	10	120586	120595	20 %	20 %	40 %	20 %	157157834
69	NC_009801	AGCAG	2	10	121924	121933	40 %	0 %	40 %	20 %	157156546
70	NC_009801	TCAGC	2	10	122792	122801	20 %	20 %	20 %	40 %	157156546
71	NC_009801	CGAAG	2	10	123839	123848	40 %	0 %	40 %	20 %	157156176
72	NC_009801	ACACG	2	10	123972	123981	40 %	0 %	20 %	40 %	157156176
73	NC_009801	TCGCG	2	10	124233	124242	0 %	20 %	40 %	40 %	157156176
74	NC_009801	GCATC	2	10	124323	124332	20 %	20 %	20 %	40 %	157156176
75	NC_009801	GACTG	2	10	125641	125650	20 %	20 %	40 %	20 %	157155188
76	NC_009801	AGAGC	2	10	126051	126060	40 %	0 %	40 %	20 %	157155188
77	NC_009801	AGGCG	2	10	131323	131332	20 %	0 %	60 %	20 %	157156701
78	NC_009801	GGTTG	2	10	132076	132085	0 %	40 %	60 %	0 %	157156701
79	NC_009801	TCTGG	2	10	134722	134731	0 %	40 %	40 %	20 %	157154794
80	NC_009801	GCGAT	2	10	135918	135927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009801	GGGCA	2	10	136133	136142	20 %	0 %	60 %	20 %	157155236
82	NC_009801	CAGCG	2	10	136412	136421	20 %	0 %	40 %	40 %	157158809
83	NC_009801	GGCTG	2	10	139123	139132	0 %	20 %	60 %	20 %	157157987
84	NC_009801	CCGTC	2	10	143242	143251	0 %	20 %	20 %	60 %	157155923
85	NC_009801	GTGAA	2	10	143252	143261	40 %	20 %	40 %	0 %	157155923
86	NC_009801	GGCAT	2	10	143414	143423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009801	GTTCA	2	10	143639	143648	20 %	40 %	20 %	20 %	157158806
88	NC_009801	ATCCA	2	10	143965	143974	40 %	20 %	0 %	40 %	157158806
89	NC_009801	GTAAG	2	10	144178	144187	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009801	CTTTA	2	10	145228	145237	20 %	60 %	0 %	20 %	157157883
91	NC_009801	TGGCG	2	10	145455	145464	0 %	20 %	60 %	20 %	157157883
92	NC_009801	TCCTC	2	10	145898	145907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009801	CGGGC	2	10	146643	146652	0 %	0 %	60 %	40 %	157156843
94	NC_009801	TTTCA	2	10	147768	147777	20 %	60 %	0 %	20 %	157157631
95	NC_009801	GGGAG	2	10	149093	149102	20 %	0 %	80 %	0 %	157156067
96	NC_009801	TGAAG	2	10	150991	151000	40 %	20 %	40 %	0 %	157158907
97	NC_009801	ACCGC	2	10	151096	151105	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_009801	GCGGT	2	10	151115	151124	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009801	TTTGC	2	10	158081	158090	0 %	60 %	20 %	20 %	157155344
100	NC_009801	AAATT	2	10	158522	158531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009801	GCGAG	2	10	159889	159898	20 %	0 %	60 %	20 %	157159375
102	NC_009801	GGCGT	2	10	160327	160336	0 %	20 %	60 %	20 %	157159375
103	NC_009801	ATCAG	2	10	160965	160974	40 %	20 %	20 %	20 %	157159053
104	NC_009801	ACCAC	2	10	163230	163239	40 %	0 %	0 %	60 %	157154764
105	NC_009801	GGCGT	2	10	164933	164942	0 %	20 %	60 %	20 %	157156250
106	NC_009801	CGACG	2	10	165972	165981	20 %	0 %	40 %	40 %	157156250
107	NC_009801	TTATC	2	10	168884	168893	20 %	60 %	0 %	20 %	157157969
108	NC_009801	AAAAC	2	10	169959	169968	80 %	0 %	0 %	20 %	157157325
109	NC_009801	TGGTT	2	10	170216	170225	0 %	60 %	40 %	0 %	157157325
110	NC_009801	AACCT	2	10	172297	172306	40 %	20 %	0 %	40 %	157155549
111	NC_009801	TGGTC	2	10	172339	172348	0 %	40 %	40 %	20 %	157155549
112	NC_009801	TGGCG	2	10	173584	173593	0 %	20 %	60 %	20 %	157155293
113	NC_009801	CGGCG	2	10	174214	174223	0 %	0 %	60 %	40 %	157155293
114	NC_009801	TGGTG	2	10	174226	174235	0 %	40 %	60 %	0 %	157155293
115	NC_009801	TTCCA	2	10	174825	174834	20 %	40 %	0 %	40 %	157155293
116	NC_009801	GGTCC	2	10	179148	179157	0 %	20 %	40 %	40 %	157157282
117	NC_009801	ACGGG	2	10	181065	181074	20 %	0 %	60 %	20 %	157155851
118	NC_009801	GTGAT	2	10	183224	183233	20 %	40 %	40 %	0 %	157155195
119	NC_009801	GTGAT	2	10	183515	183524	20 %	40 %	40 %	0 %	157155195
120	NC_009801	TACGT	2	10	183760	183769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009801	TGGCC	2	10	185485	185494	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009801	GCCAG	2	10	187234	187243	20 %	0 %	40 %	40 %	157157798
123	NC_009801	GTTCT	2	10	188675	188684	0 %	60 %	20 %	20 %	157157798
124	NC_009801	CTGAA	2	10	190667	190676	40 %	20 %	20 %	20 %	157159281
125	NC_009801	AAGCG	2	10	190731	190740	40 %	0 %	40 %	20 %	157159281
126	NC_009801	TGGTG	2	10	192637	192646	0 %	40 %	60 %	0 %	157155844
127	NC_009801	TGCAC	2	10	192763	192772	20 %	20 %	20 %	40 %	157155844
128	NC_009801	TGCGC	2	10	193156	193165	0 %	20 %	40 %	40 %	157155844
129	NC_009801	AAATA	2	10	193378	193387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009801	GTCTG	2	10	193463	193472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009801	CATGG	2	10	194999	195008	20 %	20 %	40 %	20 %	157156618
132	NC_009801	CAGAT	2	10	196038	196047	40 %	20 %	20 %	20 %	157155987
133	NC_009801	ACTTT	2	10	196171	196180	20 %	60 %	0 %	20 %	157155987
134	NC_009801	GACGT	2	10	200091	200100	20 %	20 %	40 %	20 %	157155563
135	NC_009801	CGACG	2	10	201918	201927	20 %	0 %	40 %	40 %	157154842
136	NC_009801	ATGCC	2	10	204486	204495	20 %	20 %	20 %	40 %	157158059
137	NC_009801	GGATG	2	10	204748	204757	20 %	20 %	60 %	0 %	157158059
138	NC_009801	TGGCC	2	10	205812	205821	0 %	20 %	40 %	40 %	157158983
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141	NC_009801	GGTGG	2	10	207292	207301	0 %	20 %	80 %	0 %	157158983
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169	NC_009801	TTTGT	2	10	262129	262138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_009801	ACGGT	2	10	266859	266868	20 %	20 %	40 %	20 %	157158534
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177	NC_009801	GGTGT	2	10	268755	268764	0 %	40 %	60 %	0 %	157158534
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179	NC_009801	GGGCA	2	10	270213	270222	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
180	NC_009801	AAAAG	2	10	270691	270700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009801	GTAAC	2	10	271052	271061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_009801	CGCTT	2	10	381210	381219	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
243	NC_009801	CACGG	2	10	382807	382816	20 %	0 %	40 %	40 %	157156208
244	NC_009801	TGGCG	2	10	384901	384910	0 %	20 %	60 %	20 %	157158231
245	NC_009801	CGAAG	2	10	385606	385615	40 %	0 %	40 %	20 %	157158231
246	NC_009801	GTGGC	2	10	389065	389074	0 %	20 %	60 %	20 %	157157602
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248	NC_009801	TGCGC	2	10	392922	392931	0 %	20 %	40 %	40 %	157156161
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250	NC_009801	CGCAG	2	10	398079	398088	20 %	0 %	40 %	40 %	157154977
251	NC_009801	AGACC	2	10	399075	399084	40 %	0 %	20 %	40 %	157154977
252	NC_009801	TGACC	2	10	399798	399807	20 %	20 %	20 %	40 %	157154977
253	NC_009801	TTGCG	2	10	401011	401020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
254	NC_009801	TTTTC	2	10	401124	401133	0 %	80 %	0 %	20 %	157155643
255	NC_009801	CCGGT	2	10	403272	403281	0 %	20 %	40 %	40 %	157159034
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257	NC_009801	GCGAA	2	10	404427	404436	40 %	0 %	40 %	20 %	157159034
258	NC_009801	GCGCA	2	10	408347	408356	20 %	0 %	40 %	40 %	157156149
259	NC_009801	TGGCG	2	10	409073	409082	0 %	20 %	60 %	20 %	157155206
260	NC_009801	GTTTG	2	10	409917	409926	0 %	60 %	40 %	0 %	157155702
261	NC_009801	GGCGC	2	10	410101	410110	0 %	0 %	60 %	40 %	157155702
262	NC_009801	CTTAC	2	10	410973	410982	20 %	40 %	0 %	40 %	157158343
263	NC_009801	TTGCG	2	10	412239	412248	0 %	40 %	40 %	20 %	157157121
264	NC_009801	ACACC	2	10	415872	415881	40 %	0 %	0 %	60 %	157155529
265	NC_009801	ATCAT	2	10	417176	417185	40 %	40 %	0 %	20 %	157156377
266	NC_009801	GACCG	2	10	418932	418941	20 %	0 %	40 %	40 %	157157826
267	NC_009801	ACGGA	2	10	422018	422027	40 %	0 %	40 %	20 %	157156861
268	NC_009801	GCACA	2	10	422231	422240	40 %	0 %	20 %	40 %	157156861
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270	NC_009801	CAGTG	2	10	423765	423774	20 %	20 %	40 %	20 %	157155082
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274	NC_009801	GATGG	2	10	434943	434952	20 %	20 %	60 %	0 %	157156143
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364	NC_009801	GTTTC	2	10	592714	592723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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374	NC_009801	CTTGC	2	10	608612	608621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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382	NC_009801	TTTTC	2	10	619068	619077	0 %	80 %	0 %	20 %	157156750
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386	NC_009801	GTCAG	2	10	632047	632056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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388	NC_009801	CGCCA	2	10	634793	634802	20 %	0 %	20 %	60 %	157157247
389	NC_009801	GCAGT	2	10	635272	635281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
390	NC_009801	GGGAT	2	10	635869	635878	20 %	20 %	60 %	0 %	157157006
391	NC_009801	CCGGT	2	10	637945	637954	0 %	20 %	40 %	40 %	157155493
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396	NC_009801	GGCGC	2	10	646060	646069	0 %	0 %	60 %	40 %	157157391
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