MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 2719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	157158747
2	NC_009801	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	157158096
3	NC_009801	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	157156183
4	NC_009801	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	157158697
5	NC_009801	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	157158038
6	NC_009801	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	157155398
7	NC_009801	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	157155398
8	NC_009801	ATTGC	2	10	22954	22963	20 %	40 %	20 %	20 %	157159091
9	NC_009801	TTAAT	2	10	23577	23586	40 %	60 %	0 %	0 %	157157495
10	NC_009801	CAGTA	2	10	29868	29877	40 %	20 %	20 %	20 %	157155637
11	NC_009801	GCGAA	2	10	35663	35672	40 %	0 %	40 %	20 %	157159012
12	NC_009801	CCGTT	2	10	36557	36566	0 %	40 %	20 %	40 %	157159012
13	NC_009801	CACGG	2	10	36934	36943	20 %	0 %	40 %	40 %	157159012
14	NC_009801	CGAAT	2	10	39643	39652	40 %	20 %	20 %	20 %	157155167
15	NC_009801	CCATG	2	10	41181	41190	20 %	20 %	20 %	40 %	157156920
16	NC_009801	CCGTA	2	10	42827	42836	20 %	20 %	20 %	40 %	157156236
17	NC_009801	TTAAA	2	10	43565	43574	60 %	40 %	0 %	0 %	157156236
18	NC_009801	ACCCA	2	10	44308	44317	40 %	0 %	0 %	60 %	157157828
19	NC_009801	TTTGA	2	10	45935	45944	20 %	60 %	20 %	0 %	157158533
20	NC_009801	CGGCG	2	10	46186	46195	0 %	0 %	60 %	40 %	157158533
21	NC_009801	AATCA	2	10	46468	46477	60 %	20 %	0 %	20 %	157155244
22	NC_009801	CGGTT	2	10	47423	47432	0 %	40 %	40 %	20 %	157156667
23	NC_009801	TGGCG	2	10	49114	49123	0 %	20 %	60 %	20 %	157154973
24	NC_009801	TGCAC	2	10	50876	50885	20 %	20 %	20 %	40 %	157155009
25	NC_009801	AGGGC	2	10	51961	51970	20 %	0 %	60 %	20 %	157159263
26	NC_009801	GGCGC	2	10	51995	52004	0 %	0 %	60 %	40 %	157159263
27	NC_009801	GAAAC	2	10	52808	52817	60 %	0 %	20 %	20 %	157159263
28	NC_009801	AACGT	2	10	54720	54729	40 %	20 %	20 %	20 %	157157398
29	NC_009801	GCGTC	2	10	57704	57713	0 %	20 %	40 %	40 %	157155530
30	NC_009801	ATGTT	2	10	58518	58527	20 %	60 %	20 %	0 %	157155793
31	NC_009801	CTTCG	2	10	58951	58960	0 %	40 %	20 %	40 %	157155793
32	NC_009801	TGCGT	2	10	59237	59246	0 %	40 %	40 %	20 %	157155793
33	NC_009801	AAAGT	2	10	64971	64980	60 %	20 %	20 %	0 %	157157613
34	NC_009801	AGTCG	2	10	65940	65949	20 %	20 %	40 %	20 %	157156108
35	NC_009801	GGTGA	2	10	67219	67228	20 %	20 %	60 %	0 %	157156108
36	NC_009801	TCGCG	2	10	69826	69835	0 %	20 %	40 %	40 %	157155370
37	NC_009801	TAGTG	2	10	77304	77313	20 %	40 %	40 %	0 %	157158860
38	NC_009801	GATGG	2	10	78192	78201	20 %	20 %	60 %	0 %	157155626
39	NC_009801	CTGGA	2	10	80092	80101	20 %	20 %	40 %	20 %	157156264
40	NC_009801	CTGGT	2	10	83385	83394	0 %	40 %	40 %	20 %	157157195
41	NC_009801	GACCG	2	10	83933	83942	20 %	0 %	40 %	40 %	157159154
42	NC_009801	ATGTT	2	10	86482	86491	20 %	60 %	20 %	0 %	157158356
43	NC_009801	AAAAC	2	10	86897	86906	80 %	0 %	0 %	20 %	157158356
44	NC_009801	TGCAT	2	10	87424	87433	20 %	40 %	20 %	20 %	157157875
45	NC_009801	ATTCC	2	10	87594	87603	20 %	40 %	0 %	40 %	157157875
46	NC_009801	AGTTC	2	10	92687	92696	20 %	40 %	20 %	20 %	157154775
47	NC_009801	CGTGG	2	10	94060	94069	0 %	20 %	60 %	20 %	157158087
48	NC_009801	TATCG	2	10	94567	94576	20 %	40 %	20 %	20 %	157158087
49	NC_009801	GCCTG	2	10	98899	98908	0 %	20 %	40 %	40 %	157156086
50	NC_009801	GTTTG	2	10	99343	99352	0 %	60 %	40 %	0 %	157156086
51	NC_009801	ACCGT	2	10	100812	100821	20 %	20 %	20 %	40 %	157156576
52	NC_009801	ATCAG	2	10	102585	102594	40 %	20 %	20 %	20 %	157154862
53	NC_009801	AGCCG	2	10	104353	104362	20 %	0 %	40 %	40 %	157155564
54	NC_009801	GCGCA	2	10	106681	106690	20 %	0 %	40 %	40 %	157157630
55	NC_009801	TGGCG	2	10	107675	107684	0 %	20 %	60 %	20 %	157156227
56	NC_009801	CCGGC	2	10	110645	110654	0 %	0 %	40 %	60 %	157156803
57	NC_009801	CGCGG	2	10	113854	113863	0 %	0 %	60 %	40 %	157156967
58	NC_009801	AATGC	2	10	118547	118556	40 %	20 %	20 %	20 %	157158124
59	NC_009801	TCTGT	2	10	119493	119502	0 %	60 %	20 %	20 %	157156557
60	NC_009801	GCATG	2	10	120586	120595	20 %	20 %	40 %	20 %	157157834
61	NC_009801	AGCAG	2	10	121924	121933	40 %	0 %	40 %	20 %	157156546
62	NC_009801	TCAGC	2	10	122792	122801	20 %	20 %	20 %	40 %	157156546
63	NC_009801	CGAAG	2	10	123839	123848	40 %	0 %	40 %	20 %	157156176
64	NC_009801	ACACG	2	10	123972	123981	40 %	0 %	20 %	40 %	157156176
65	NC_009801	TCGCG	2	10	124233	124242	0 %	20 %	40 %	40 %	157156176
66	NC_009801	GCATC	2	10	124323	124332	20 %	20 %	20 %	40 %	157156176
67	NC_009801	GACTG	2	10	125641	125650	20 %	20 %	40 %	20 %	157155188
68	NC_009801	AGAGC	2	10	126051	126060	40 %	0 %	40 %	20 %	157155188
69	NC_009801	AGGCG	2	10	131323	131332	20 %	0 %	60 %	20 %	157156701
70	NC_009801	GGTTG	2	10	132076	132085	0 %	40 %	60 %	0 %	157156701
71	NC_009801	TCTGG	2	10	134722	134731	0 %	40 %	40 %	20 %	157154794
72	NC_009801	GGGCA	2	10	136133	136142	20 %	0 %	60 %	20 %	157155236
73	NC_009801	CAGCG	2	10	136412	136421	20 %	0 %	40 %	40 %	157158809
74	NC_009801	GGCTG	2	10	139123	139132	0 %	20 %	60 %	20 %	157157987
75	NC_009801	CCGTC	2	10	143242	143251	0 %	20 %	20 %	60 %	157155923
76	NC_009801	GTGAA	2	10	143252	143261	40 %	20 %	40 %	0 %	157155923
77	NC_009801	GTTCA	2	10	143639	143648	20 %	40 %	20 %	20 %	157158806
78	NC_009801	ATCCA	2	10	143965	143974	40 %	20 %	0 %	40 %	157158806
79	NC_009801	CTTTA	2	10	145228	145237	20 %	60 %	0 %	20 %	157157883
80	NC_009801	TGGCG	2	10	145455	145464	0 %	20 %	60 %	20 %	157157883
81	NC_009801	CGGGC	2	10	146643	146652	0 %	0 %	60 %	40 %	157156843
82	NC_009801	TTTCA	2	10	147768	147777	20 %	60 %	0 %	20 %	157157631
83	NC_009801	GGGAG	2	10	149093	149102	20 %	0 %	80 %	0 %	157156067
84	NC_009801	TGAAG	2	10	150991	151000	40 %	20 %	40 %	0 %	157158907
85	NC_009801	TTTGC	2	10	158081	158090	0 %	60 %	20 %	20 %	157155344
86	NC_009801	GCGAG	2	10	159889	159898	20 %	0 %	60 %	20 %	157159375
87	NC_009801	GGCGT	2	10	160327	160336	0 %	20 %	60 %	20 %	157159375
88	NC_009801	ATCAG	2	10	160965	160974	40 %	20 %	20 %	20 %	157159053
89	NC_009801	ACCAC	2	10	163230	163239	40 %	0 %	0 %	60 %	157154764
90	NC_009801	GGCGT	2	10	164933	164942	0 %	20 %	60 %	20 %	157156250
91	NC_009801	CGACG	2	10	165972	165981	20 %	0 %	40 %	40 %	157156250
92	NC_009801	TTATC	2	10	168884	168893	20 %	60 %	0 %	20 %	157157969
93	NC_009801	AAAAC	2	10	169959	169968	80 %	0 %	0 %	20 %	157157325
94	NC_009801	TGGTT	2	10	170216	170225	0 %	60 %	40 %	0 %	157157325
95	NC_009801	AACCT	2	10	172297	172306	40 %	20 %	0 %	40 %	157155549
96	NC_009801	TGGTC	2	10	172339	172348	0 %	40 %	40 %	20 %	157155549
97	NC_009801	TGGCG	2	10	173584	173593	0 %	20 %	60 %	20 %	157155293
98	NC_009801	CGGCG	2	10	174214	174223	0 %	0 %	60 %	40 %	157155293
99	NC_009801	TGGTG	2	10	174226	174235	0 %	40 %	60 %	0 %	157155293
100	NC_009801	TTCCA	2	10	174825	174834	20 %	40 %	0 %	40 %	157155293
101	NC_009801	GGTCC	2	10	179148	179157	0 %	20 %	40 %	40 %	157157282
102	NC_009801	ACGGG	2	10	181065	181074	20 %	0 %	60 %	20 %	157155851
103	NC_009801	GTGAT	2	10	183224	183233	20 %	40 %	40 %	0 %	157155195
104	NC_009801	GTGAT	2	10	183515	183524	20 %	40 %	40 %	0 %	157155195
105	NC_009801	GCCAG	2	10	187234	187243	20 %	0 %	40 %	40 %	157157798
106	NC_009801	GTTCT	2	10	188675	188684	0 %	60 %	20 %	20 %	157157798
107	NC_009801	CTGAA	2	10	190667	190676	40 %	20 %	20 %	20 %	157159281
108	NC_009801	AAGCG	2	10	190731	190740	40 %	0 %	40 %	20 %	157159281
109	NC_009801	TGGTG	2	10	192637	192646	0 %	40 %	60 %	0 %	157155844
110	NC_009801	TGCAC	2	10	192763	192772	20 %	20 %	20 %	40 %	157155844
111	NC_009801	TGCGC	2	10	193156	193165	0 %	20 %	40 %	40 %	157155844
112	NC_009801	CATGG	2	10	194999	195008	20 %	20 %	40 %	20 %	157156618
113	NC_009801	CAGAT	2	10	196038	196047	40 %	20 %	20 %	20 %	157155987
114	NC_009801	ACTTT	2	10	196171	196180	20 %	60 %	0 %	20 %	157155987
115	NC_009801	GACGT	2	10	200091	200100	20 %	20 %	40 %	20 %	157155563
116	NC_009801	CGACG	2	10	201918	201927	20 %	0 %	40 %	40 %	157154842
117	NC_009801	ATGCC	2	10	204486	204495	20 %	20 %	20 %	40 %	157158059
118	NC_009801	GGATG	2	10	204748	204757	20 %	20 %	60 %	0 %	157158059
119	NC_009801	TGGCC	2	10	205812	205821	0 %	20 %	40 %	40 %	157158983
120	NC_009801	GTAAC	2	10	206555	206564	40 %	20 %	20 %	20 %	157158983
121	NC_009801	AGCCG	2	10	207183	207192	20 %	0 %	40 %	40 %	157158983
122	NC_009801	GGTGG	2	10	207292	207301	0 %	20 %	80 %	0 %	157158983
123	NC_009801	TTAAC	2	10	215435	215444	40 %	40 %	0 %	20 %	157156424
124	NC_009801	GAAAG	2	10	217725	217734	60 %	0 %	40 %	0 %	157157308
125	NC_009801	ACGGT	2	10	219580	219589	20 %	20 %	40 %	20 %	157156008
126	NC_009801	TGATT	2	10	222422	222431	20 %	60 %	20 %	0 %	157159295
127	NC_009801	TAATT	2	10	234574	234583	40 %	60 %	0 %	0 %	157156387
128	NC_009801	ACTTA	2	10	236544	236553	40 %	40 %	0 %	20 %	157157699
129	NC_009801	ACTGG	2	10	237512	237521	20 %	20 %	40 %	20 %	157155536
130	NC_009801	CGCGG	2	10	238557	238566	0 %	0 %	60 %	40 %	157156660
131	NC_009801	TGATC	2	10	242291	242300	20 %	40 %	20 %	20 %	157155635
132	NC_009801	GCGCG	2	10	243996	244005	0 %	0 %	60 %	40 %	157155738
133	NC_009801	CCAGA	2	10	244065	244074	40 %	0 %	20 %	40 %	157155738
134	NC_009801	ATCGC	2	10	246433	246442	20 %	20 %	20 %	40 %	157155738
135	NC_009801	CGCTG	2	10	248326	248335	0 %	20 %	40 %	40 %	157156439
136	NC_009801	GCGCA	2	10	250761	250770	20 %	0 %	40 %	40 %	157157697
137	NC_009801	GGTCA	2	10	253476	253485	20 %	20 %	40 %	20 %	157159130
138	NC_009801	GGGCA	2	10	253507	253516	20 %	0 %	60 %	20 %	157159130
139	NC_009801	ATTTC	2	10	254017	254026	20 %	60 %	0 %	20 %	157159130
140	NC_009801	ATGCT	2	10	256010	256019	20 %	40 %	20 %	20 %	157159137
141	NC_009801	CCAGC	2	10	256249	256258	20 %	0 %	20 %	60 %	157158454
142	NC_009801	CCAGG	2	10	256906	256915	20 %	0 %	40 %	40 %	157158454
143	NC_009801	CGGGT	2	10	257465	257474	0 %	20 %	60 %	20 %	157155723
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147	NC_009801	CTGCC	2	10	265641	265650	0 %	20 %	20 %	60 %	157158534
148	NC_009801	CGGGG	2	10	265872	265881	0 %	0 %	80 %	20 %	157158534
149	NC_009801	ACGGT	2	10	266859	266868	20 %	20 %	40 %	20 %	157158534
150	NC_009801	GAAGG	2	10	266945	266954	40 %	0 %	60 %	0 %	157158534
151	NC_009801	TGACC	2	10	267509	267518	20 %	20 %	20 %	40 %	157158534
152	NC_009801	GGTGT	2	10	268755	268764	0 %	40 %	60 %	0 %	157158534
153	NC_009801	AGCAA	2	10	269648	269657	60 %	0 %	20 %	20 %	157158534
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159	NC_009801	CGATG	2	10	283720	283729	20 %	20 %	40 %	20 %	157157459
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167	NC_009801	CTGGG	2	10	311984	311993	0 %	20 %	60 %	20 %	157157518
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169	NC_009801	CAGCA	2	10	315556	315565	40 %	0 %	20 %	40 %	157159365
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171	NC_009801	TTGAT	2	10	319718	319727	20 %	60 %	20 %	0 %	157155411
172	NC_009801	GTCGG	2	10	323278	323287	0 %	20 %	60 %	20 %	157156885
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174	NC_009801	CGTGC	2	10	324349	324358	0 %	20 %	40 %	40 %	157156885
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187	NC_009801	ATGTT	2	10	350579	350588	20 %	60 %	20 %	0 %	157158990
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246	NC_009801	TCGCT	2	10	454939	454948	0 %	40 %	20 %	40 %	157155440
247	NC_009801	CAAAG	2	10	455435	455444	60 %	0 %	20 %	20 %	157156114
248	NC_009801	TGGCT	2	10	456266	456275	0 %	40 %	40 %	20 %	157156114
249	NC_009801	CCTGG	2	10	456807	456816	0 %	20 %	40 %	40 %	157156114
250	NC_009801	TGGCG	2	10	461244	461253	0 %	20 %	60 %	20 %	157156778
251	NC_009801	CTTGC	2	10	461888	461897	0 %	40 %	20 %	40 %	157156778
252	NC_009801	TGACC	2	10	462964	462973	20 %	20 %	20 %	40 %	157156867
253	NC_009801	AGTTC	2	10	464075	464084	20 %	40 %	20 %	20 %	157157758
254	NC_009801	CTCGT	2	10	465923	465932	0 %	40 %	20 %	40 %	157157082
255	NC_009801	GGCGC	2	10	466854	466863	0 %	0 %	60 %	40 %	157156281
256	NC_009801	GCGCT	2	10	469268	469277	0 %	20 %	40 %	40 %	157157291
257	NC_009801	AGCGT	2	10	471467	471476	20 %	20 %	40 %	20 %	157158400
258	NC_009801	AAGGC	2	10	473321	473330	40 %	0 %	40 %	20 %	157155867
259	NC_009801	CAGAA	2	10	475765	475774	60 %	0 %	20 %	20 %	157156951
260	NC_009801	CGCCA	2	10	478486	478495	20 %	0 %	20 %	60 %	157159049
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262	NC_009801	GGGCA	2	10	478834	478843	20 %	0 %	60 %	20 %	157159049
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381	NC_009801	GGGCT	2	10	723031	723040	0 %	20 %	60 %	20 %	157155303
382	NC_009801	CGCGA	2	10	726345	726354	20 %	0 %	40 %	40 %	157159152
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384	NC_009801	GCGAT	2	10	728559	728568	20 %	20 %	40 %	20 %	157155109
385	NC_009801	CTGGT	2	10	729608	729617	0 %	40 %	40 %	20 %	157159259
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387	NC_009801	CGTGA	2	10	732805	732814	20 %	20 %	40 %	20 %	157158347
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389	NC_009801	TGATT	2	10	736709	736718	20 %	60 %	20 %	0 %	157155077
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