MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 62739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
2	NC_009801	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
3	NC_009801	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
4	NC_009801	CCG	2	6	571	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
5	NC_009801	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
6	NC_009801	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
7	NC_009801	ACT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
8	NC_009801	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
9	NC_009801	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
10	NC_009801	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
11	NC_009801	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
12	NC_009801	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
13	NC_009801	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
14	NC_009801	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
15	NC_009801	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
16	NC_009801	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
17	NC_009801	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
18	NC_009801	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
19	NC_009801	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
20	NC_009801	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158747
21	NC_009801	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
22	NC_009801	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
23	NC_009801	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
24	NC_009801	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
25	NC_009801	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
26	NC_009801	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158747
27	NC_009801	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158747
28	NC_009801	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
29	NC_009801	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
30	NC_009801	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
31	NC_009801	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
32	NC_009801	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
33	NC_009801	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
34	NC_009801	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
35	NC_009801	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
36	NC_009801	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
37	NC_009801	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
38	NC_009801	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
39	NC_009801	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158747
40	NC_009801	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
41	NC_009801	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
42	NC_009801	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157158747
43	NC_009801	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
44	NC_009801	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
45	NC_009801	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
46	NC_009801	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158096
47	NC_009801	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158096
48	NC_009801	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158096
49	NC_009801	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158096
50	NC_009801	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
51	NC_009801	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158096
52	NC_009801	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158096
53	NC_009801	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
54	NC_009801	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158096
55	NC_009801	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
56	NC_009801	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
57	NC_009801	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
58	NC_009801	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
59	NC_009801	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
60	NC_009801	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
61	NC_009801	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
62	NC_009801	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157451
63	NC_009801	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
64	NC_009801	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
65	NC_009801	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
66	NC_009801	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157451
67	NC_009801	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157157451
68	NC_009801	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157157451
69	NC_009801	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157451
70	NC_009801	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
71	NC_009801	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157451
72	NC_009801	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
73	NC_009801	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
74	NC_009801	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157451
75	NC_009801	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156558
76	NC_009801	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156558
77	NC_009801	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156558
78	NC_009801	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156558
79	NC_009801	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156558
80	NC_009801	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156558
81	NC_009801	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156558
82	NC_009801	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156558
83	NC_009801	TAT	2	6	5600	5605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156558
84	NC_009801	GTC	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
85	NC_009801	GTC	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
86	NC_009801	CCA	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156183
87	NC_009801	GAT	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156183
88	NC_009801	CTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
89	NC_009801	CGC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156183
90	NC_009801	CCA	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156183
91	NC_009801	GGC	2	6	6640	6645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156183
92	NC_009801	GAT	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156183
93	NC_009801	GCG	2	6	6761	6766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156183
94	NC_009801	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
95	NC_009801	GGA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157155229
96	NC_009801	TCA	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155229
97	NC_009801	AAG	2	6	7019	7024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155229
98	NC_009801	AAT	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157155229
99	NC_009801	TCA	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155229
100	NC_009801	TGA	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155229
101	NC_009801	TTC	2	6	7145	7150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155229
102	NC_009801	TTC	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155229
103	NC_009801	CAC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155229
104	NC_009801	TGC	2	6	7255	7260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
105	NC_009801	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155229
106	NC_009801	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155229
107	NC_009801	CTG	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
108	NC_009801	GTG	2	6	7679	7684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155229
109	NC_009801	CAT	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154855
110	NC_009801	GCC	2	6	8038	8043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154855
111	NC_009801	GTT	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157154855
112	NC_009801	AGA	2	6	8109	8114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157154855
113	NC_009801	ATC	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154855
114	NC_009801	CGC	2	6	8380	8385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154855
115	NC_009801	CGC	2	6	8482	8487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154855
116	NC_009801	GCC	2	6	8488	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154855
117	NC_009801	TTA	2	6	8562	8567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157154855
118	NC_009801	CAG	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154855
119	NC_009801	AAT	2	6	8686	8691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157154855
120	NC_009801	CGG	2	6	8979	8984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157154855
121	NC_009801	CAA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157154855
122	NC_009801	TAA	2	6	9213	9218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157154855
123	NC_009801	ACC	2	6	9549	9554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158697
124	NC_009801	CAG	2	6	9696	9701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158697
125	NC_009801	CAG	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158697
126	NC_009801	TGC	2	6	9938	9943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158697
127	NC_009801	AAG	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158697
128	NC_009801	CTG	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158697
129	NC_009801	TTG	2	6	10048	10053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158697
130	NC_009801	AGA	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158697
131	NC_009801	TAC	2	6	10149	10154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158697
132	NC_009801	CTG	2	6	10257	10262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158697
133	NC_009801	GCA	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158697
134	NC_009801	CTG	2	6	10461	10466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158697
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138	NC_009801	ATC	2	6	10740	10745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158038
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371	NC_009801	GCA	2	6	30317	30322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155637
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374	NC_009801	GCC	2	6	30545	30550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156462
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500	NC_009801	GAT	2	6	39699	39704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155167

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