MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli HS

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009800	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009800	TTTCAC	2	12	20946	20957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009800	AAGGGA	2	12	86086	86097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009800	TCTCCC	2	12	163592	163603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009800	TCACCC	2	12	163643	163654	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009800	GTAGTG	2	12	198537	198548	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009800	TCAATA	2	12	302445	302456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009800	TGAGTG	2	12	326839	326850	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009800	ATGGAA	2	12	340124	340135	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009800	TAAGGG	2	12	359170	359181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009800	CTATTT	2	12	371740	371751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009800	AATTTC	2	12	378447	378458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009800	TTTATT	2	12	410139	410150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009800	TATTGA	2	12	448939	448950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009800	AACAAT	2	12	471164	471175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009800	TATTGA	2	12	474010	474021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009800	TTTTCA	2	12	538543	538554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009800	CAGGCG	2	12	557386	557397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009800	TGCAAA	2	12	648734	648745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009800	TTCTTT	2	12	699400	699411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009800	ATTTTT	2	12	738626	738637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009800	TTTTCT	2	12	821553	821564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009800	AATATT	2	12	847363	847374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009800	CAGAAA	2	12	859594	859605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009800	AAAGAT	2	12	908517	908528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009800	GCCGTT	2	12	917111	917122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009800	TAACCG	2	12	983119	983130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009800	AAATAA	2	12	1014955	1014966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009800	CTGGAA	2	12	1024519	1024530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009800	TGGCAA	2	12	1026443	1026454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009800	GCATCG	2	12	1026710	1026721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009800	AAAGAT	2	12	1048760	1048771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009800	TGTCCA	2	12	1069390	1069401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009800	TAAGGA	2	12	1091658	1091669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009800	ATAATG	2	12	1093072	1093083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009800	GCGGTT	2	12	1107571	1107582	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009800	TGTTAA	2	12	1136382	1136393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009800	TTCACT	2	12	1154622	1154633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009800	CAAAAA	2	12	1184899	1184910	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009800	AGAAAC	2	12	1263196	1263207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009800	TTTTGT	2	12	1267955	1267966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009800	CACAGG	2	12	1270307	1270318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009800	ACGCTT	2	12	1288565	1288576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009800	ACTCGA	2	12	1288585	1288596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009800	CAGGCT	2	12	1288717	1288728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009800	CTTATT	2	12	1340683	1340694	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009800	CAAAAG	2	12	1347577	1347588	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009800	CGGGGG	2	12	1355796	1355807	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009800	CTGATC	2	12	1358055	1358066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009800	CTATAA	2	12	1404719	1404730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009800	ATTAAT	2	12	1548082	1548093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009800	AAAAAC	2	12	1572573	1572584	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009800	ACCGTT	2	12	1587450	1587461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009800	TGGTTA	2	12	1596278	1596289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009800	ACCGCT	2	12	1611156	1611167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009800	CGTACC	2	12	1613067	1613078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009800	TGCCTG	2	12	1613762	1613773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009800	GATATA	2	12	1613856	1613867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009800	CAAAAA	2	12	1652192	1652203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009800	TAAATA	2	12	1653992	1654003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009800	TGACAG	2	12	1666108	1666119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009800	AAGGAA	2	12	1669320	1669331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009800	GAGCGA	2	12	1672929	1672940	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009800	TCAATG	2	12	1673162	1673173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009800	ATACTT	2	12	1763157	1763168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009800	AAAATA	2	12	1776813	1776824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009800	TGTTTT	2	12	1777446	1777457	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009800	AAGACT	2	12	1777706	1777717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009800	GAACAG	2	12	1820263	1820274	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009800	TATTAC	2	12	1889887	1889898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009800	TTTCTT	2	12	1908127	1908138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009800	ACTGTC	2	12	1956503	1956514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009800	TTAATG	2	12	1997912	1997923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009800	AATTCA	2	12	2006269	2006280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009800	TCTTAT	2	12	2020087	2020098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009800	GTGTAT	2	12	2032168	2032179	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009800	GTATCA	2	12	2064360	2064371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009800	CCTGAC	2	12	2084834	2084845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009800	ACGCTG	2	12	2085354	2085365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009800	ACAGAC	2	12	2089370	2089381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009800	ATTTTT	2	12	2096575	2096586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009800	CTGATA	2	12	2105664	2105675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009800	ACGCTT	2	12	2109381	2109392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009800	GATGCG	2	12	2121965	2121976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009800	AAATAA	2	12	2155647	2155658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009800	ATAGAT	2	12	2181505	2181516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009800	TGCCGC	2	12	2183346	2183357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009800	GTTTAG	2	12	2187568	2187579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009800	GCACTG	2	12	2188005	2188016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009800	TGGGAG	2	12	2188833	2188844	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009800	TCCCCC	2	12	2197569	2197580	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_009800	GAGATC	2	12	2210385	2210396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009800	TCTTCC	2	12	2306014	2306025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009800	CCACTA	2	12	2390607	2390618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009800	TAAATG	2	12	2448471	2448482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009800	TGTCAC	2	12	2462105	2462116	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009800	ATAAGG	2	12	2464714	2464725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009800	AGAAAA	2	12	2472385	2472396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009800	CTGATG	2	12	2526406	2526417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009800	GCGATC	2	12	2542505	2542516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009800	GTTATG	2	12	2544246	2544257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009800	CAAGTG	2	12	2558870	2558881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009800	GGCGCG	2	12	2624794	2624805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009800	ACGTTG	2	12	2626886	2626897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009800	AATGAT	2	12	2650582	2650593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009800	GCTCCC	2	12	2658911	2658922	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009800	ATCGTT	2	12	2660434	2660445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009800	TCCTTC	2	12	2676926	2676937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009800	TGGACA	2	12	2727891	2727902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009800	CAGTTT	2	12	2742480	2742491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009800	GACCAA	2	12	2796785	2796796	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009800	ATCTTA	2	12	2874259	2874270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009800	GGTTTT	2	12	2936236	2936247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009800	ACAAGA	2	12	2940567	2940578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009800	TTTGTT	2	12	2965503	2965514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009800	GTAAGG	2	12	3084359	3084370	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009800	GTAATG	2	12	3106266	3106277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009800	ACTGAG	2	12	3109464	3109475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009800	ACGCAG	2	12	3159085	3159096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009800	TTTTCG	2	12	3165731	3165742	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009800	GAGCAG	2	12	3237123	3237134	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009800	GAAGCA	2	12	3237535	3237546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009800	AGTTGT	2	12	3254473	3254484	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009800	AATGAT	2	12	3259984	3259995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009800	GTAACC	2	12	3314899	3314910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009800	TGCATT	2	12	3325552	3325563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009800	TTTTAT	2	12	3327449	3327460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009800	ATATAA	2	12	3338217	3338228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_009800	ATTACG	2	12	3535903	3535914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009800	AATTTA	2	12	3590683	3590694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009800	GAAATA	2	12	3694958	3694969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.