MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON16

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009796	AAAT	2	8	911	918	75 %	25 %	0 %	0 %	157149616
2	NC_009796	TCTA	2	8	1152	1159	25 %	50 %	0 %	25 %	157149616
3	NC_009796	AACC	2	8	1753	1760	50 %	0 %	0 %	50 %	157149634
4	NC_009796	AAGA	2	8	2886	2893	75 %	0 %	25 %	0 %	157149633
5	NC_009796	CTAG	2	8	2907	2914	25 %	25 %	25 %	25 %	157149633
6	NC_009796	AGCA	2	8	2969	2976	50 %	0 %	25 %	25 %	157149633
7	NC_009796	TATG	2	8	3301	3308	25 %	50 %	25 %	0 %	157149615
8	NC_009796	TTGC	2	8	3525	3532	0 %	50 %	25 %	25 %	157149615
9	NC_009796	GATC	2	8	3920	3927	25 %	25 %	25 %	25 %	157149631
10	NC_009796	AATA	2	8	3966	3973	75 %	25 %	0 %	0 %	157149631
11	NC_009796	CTAG	2	8	4034	4041	25 %	25 %	25 %	25 %	157149619
12	NC_009796	AACA	2	8	4486	4493	75 %	0 %	0 %	25 %	157149619
13	NC_009796	AACT	2	8	4542	4549	50 %	25 %	0 %	25 %	157149619
14	NC_009796	AAGC	2	8	4681	4688	50 %	0 %	25 %	25 %	157149630
15	NC_009796	ATAG	2	8	5380	5387	50 %	25 %	25 %	0 %	157149630
16	NC_009796	AAAC	2	8	6168	6175	75 %	0 %	0 %	25 %	157149627
17	NC_009796	AATA	2	8	6270	6277	75 %	25 %	0 %	0 %	157149627
18	NC_009796	ATTG	2	8	6526	6533	25 %	50 %	25 %	0 %	157149635
19	NC_009796	TGTT	2	8	6565	6572	0 %	75 %	25 %	0 %	157149635
20	NC_009796	AAAT	2	8	6600	6607	75 %	25 %	0 %	0 %	157149635
21	NC_009796	CTTT	2	8	6849	6856	0 %	75 %	0 %	25 %	157149620
22	NC_009796	CGTG	2	8	6898	6905	0 %	25 %	50 %	25 %	157149620
23	NC_009796	GTCT	2	8	6933	6940	0 %	50 %	25 %	25 %	157149620
24	NC_009796	TCTA	2	8	7498	7505	25 %	50 %	0 %	25 %	157149614
25	NC_009796	AACT	2	8	8115	8122	50 %	25 %	0 %	25 %	157149614
26	NC_009796	ATGA	2	8	9324	9331	50 %	25 %	25 %	0 %	157149626
27	NC_009796	TGGT	2	8	10109	10116	0 %	50 %	50 %	0 %	157149623
28	NC_009796	TTGT	2	8	10204	10211	0 %	75 %	25 %	0 %	157149623
29	NC_009796	AGAT	2	8	10493	10500	50 %	25 %	25 %	0 %	157149623
30	NC_009796	ATTT	2	8	11277	11284	25 %	75 %	0 %	0 %	157149613
31	NC_009796	CATA	2	8	11735	11742	50 %	25 %	0 %	25 %	157149613
32	NC_009796	CTAT	2	8	11899	11906	25 %	50 %	0 %	25 %	157149613
33	NC_009796	ATCA	2	8	12792	12799	50 %	25 %	0 %	25 %	157149618
34	NC_009796	TCAC	2	8	13180	13187	25 %	25 %	0 %	50 %	157149621
35	NC_009796	TCAT	2	8	13649	13656	25 %	50 %	0 %	25 %	157149629
36	NC_009796	ATTT	2	8	14178	14185	25 %	75 %	0 %	0 %	157149617
37	NC_009796	ATCA	2	8	14547	14554	50 %	25 %	0 %	25 %	157149625
38	NC_009796	AGTG	2	8	14942	14949	25 %	25 %	50 %	0 %	157149624
39	NC_009796	CAAT	2	8	15122	15129	50 %	25 %	0 %	25 %	157149624
40	NC_009796	CGCA	2	8	15165	15172	25 %	0 %	25 %	50 %	157149624
41	NC_009796	ATCA	2	8	15635	15642	50 %	25 %	0 %	25 %	157149624
42	NC_009796	CAAG	2	8	16005	16012	50 %	0 %	25 %	25 %	157149624
43	NC_009796	GAAC	2	8	16041	16048	50 %	0 %	25 %	25 %	157149624

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.