MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON16

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009796	TAC	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149616
2	NC_009796	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149616
3	NC_009796	AGA	2	6	822	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149616
4	NC_009796	TGG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149616
5	NC_009796	TGA	2	6	1124	1129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149616
6	NC_009796	ACA	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149634
7	NC_009796	CTA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149634
8	NC_009796	GTA	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149634
9	NC_009796	GGT	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149634
10	NC_009796	AGG	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149634
11	NC_009796	AGA	2	6	1582	1587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149634
12	NC_009796	TGT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149634
13	NC_009796	TAT	2	6	1726	1731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149634
14	NC_009796	GAT	2	6	1801	1806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149634
15	NC_009796	TTA	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149633
16	NC_009796	AAC	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149633
17	NC_009796	TAA	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149633
18	NC_009796	TGA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
19	NC_009796	TAG	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
20	NC_009796	CAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149633
21	NC_009796	CGA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149633
22	NC_009796	TTA	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149633
23	NC_009796	TGA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
24	NC_009796	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
25	NC_009796	CGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149615
26	NC_009796	ATG	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149615
27	NC_009796	GTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149615
28	NC_009796	GGA	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149615
29	NC_009796	GTA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149615
30	NC_009796	AGC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149615
31	NC_009796	TCT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149615
32	NC_009796	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149615
33	NC_009796	GCT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149615
34	NC_009796	ATA	2	6	3687	3692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149615
35	NC_009796	AAT	2	6	3693	3698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149615
36	NC_009796	GGC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149631
37	NC_009796	GTG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
38	NC_009796	ATA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149619
39	NC_009796	TGG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
40	NC_009796	ACA	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149619
41	NC_009796	GTT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149619
42	NC_009796	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
43	NC_009796	AAG	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149619
44	NC_009796	ATG	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149619
45	NC_009796	CAA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149619
46	NC_009796	TAA	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149619
47	NC_009796	AAC	3	9	4636	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
48	NC_009796	CCA	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149630
49	NC_009796	TAA	2	6	4776	4781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
50	NC_009796	AAT	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
51	NC_009796	AGT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
52	NC_009796	GAT	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
53	NC_009796	AGG	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149630
54	NC_009796	CAA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
55	NC_009796	AAC	3	9	5191	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
56	NC_009796	GGC	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149630
57	NC_009796	GTG	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149630
58	NC_009796	TAA	2	6	5262	5267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
59	NC_009796	AGC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149630
60	NC_009796	ACA	2	6	5312	5317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
61	NC_009796	ACA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
62	NC_009796	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149630
63	NC_009796	GAT	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
64	NC_009796	TAG	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
65	NC_009796	GTA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
66	NC_009796	TAT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149627
67	NC_009796	ATA	2	6	6132	6137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
68	NC_009796	CAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149627
69	NC_009796	TAA	2	6	6194	6199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
70	NC_009796	ATA	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
71	NC_009796	ATG	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
72	NC_009796	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149635
73	NC_009796	ATG	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
74	NC_009796	ATT	2	6	6552	6557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149635
75	NC_009796	GAT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
76	NC_009796	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149635
77	NC_009796	AAT	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149635
78	NC_009796	CCA	2	6	6763	6768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149620
79	NC_009796	AAT	2	6	6769	6774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149620
80	NC_009796	TAC	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149614
81	NC_009796	CAT	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149614
82	NC_009796	CAT	2	6	7440	7445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149614
83	NC_009796	CAT	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149614
84	NC_009796	CTT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149614
85	NC_009796	CTA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149614
86	NC_009796	GTA	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149614
87	NC_009796	TTA	2	6	7820	7825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149614
88	NC_009796	CTT	2	6	8052	8057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149614
89	NC_009796	TTA	2	6	8085	8090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149614
90	NC_009796	CAT	3	9	8387	8395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149622
91	NC_009796	TAA	2	6	8586	8591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149622
92	NC_009796	AAG	2	6	8598	8603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149622
93	NC_009796	CTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149628
94	NC_009796	CCA	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149628
95	NC_009796	TCA	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149628
96	NC_009796	AGC	2	6	9037	9042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149628
97	NC_009796	AGG	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149626
98	NC_009796	CAA	2	6	9444	9449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149626
99	NC_009796	TTA	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149626
100	NC_009796	TAG	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149626
101	NC_009796	ACA	2	6	9613	9618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149626
102	NC_009796	AGA	2	6	9654	9659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149626
103	NC_009796	GGT	2	6	9675	9680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149626
104	NC_009796	GAC	2	6	9744	9749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149623
105	NC_009796	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149623
106	NC_009796	AGT	2	6	9904	9909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149623
107	NC_009796	AGA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
108	NC_009796	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149623
109	NC_009796	CAA	2	6	10091	10096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149623
110	NC_009796	AGA	3	9	10128	10136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
111	NC_009796	AGA	2	6	10146	10151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
112	NC_009796	ATG	2	6	10180	10185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149623
113	NC_009796	ATG	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149623
114	NC_009796	AGA	2	6	10230	10235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
115	NC_009796	AAG	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
116	NC_009796	AGA	2	6	10254	10259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
117	NC_009796	AGA	2	6	10311	10316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
118	NC_009796	GAA	2	6	10356	10361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
119	NC_009796	AAG	3	9	10381	10389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
120	NC_009796	AAG	2	6	10501	10506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149623
121	NC_009796	TGA	2	6	10730	10735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149632
122	NC_009796	ATC	2	6	10768	10773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149632
123	NC_009796	AGC	3	9	10858	10866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149632
124	NC_009796	ATG	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149632
125	NC_009796	CAC	2	6	10998	11003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149632
126	NC_009796	CTC	2	6	11047	11052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149632
127	NC_009796	TGC	2	6	11160	11165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149613
128	NC_009796	CCA	2	6	11359	11364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149613
129	NC_009796	AAT	2	6	11663	11668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149613
130	NC_009796	GCT	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149613
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.