MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON16

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009796	TA	3	6	276	281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009796	TC	3	6	411	416	0 %	50 %	0 %	50 %	157149616
3	NC_009796	AT	3	6	766	771	50 %	50 %	0 %	0 %	157149616
4	NC_009796	AT	3	6	946	951	50 %	50 %	0 %	0 %	157149616
5	NC_009796	AG	3	6	1072	1077	50 %	0 %	50 %	0 %	157149616
6	NC_009796	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	157149634
7	NC_009796	AG	3	6	1636	1641	50 %	0 %	50 %	0 %	157149634
8	NC_009796	CT	3	6	2039	2044	0 %	50 %	0 %	50 %	157149633
9	NC_009796	TC	3	6	2596	2601	0 %	50 %	0 %	50 %	157149633
10	NC_009796	AT	3	6	3037	3042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009796	TA	3	6	3057	3062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009796	TC	3	6	3622	3627	0 %	50 %	0 %	50 %	157149615
13	NC_009796	AT	3	6	4498	4503	50 %	50 %	0 %	0 %	157149619
14	NC_009796	TC	3	6	4923	4928	0 %	50 %	0 %	50 %	157149630
15	NC_009796	AC	3	6	4946	4951	50 %	0 %	0 %	50 %	157149630
16	NC_009796	GA	3	6	5249	5254	50 %	0 %	50 %	0 %	157149630
17	NC_009796	AG	3	6	5329	5334	50 %	0 %	50 %	0 %	157149630
18	NC_009796	AT	3	6	5493	5498	50 %	50 %	0 %	0 %	157149630
19	NC_009796	TA	3	6	5932	5937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009796	AT	3	6	6021	6026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009796	TG	3	6	6282	6287	0 %	50 %	50 %	0 %	157149635
22	NC_009796	TC	3	6	7263	7268	0 %	50 %	0 %	50 %	157149614
23	NC_009796	AT	3	6	7650	7655	50 %	50 %	0 %	0 %	157149614
24	NC_009796	AT	3	6	7696	7701	50 %	50 %	0 %	0 %	157149614
25	NC_009796	AT	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	157149614
26	NC_009796	GT	3	6	8289	8294	0 %	50 %	50 %	0 %	157149622
27	NC_009796	TA	3	6	9426	9431	50 %	50 %	0 %	0 %	157149626
28	NC_009796	AG	3	6	9501	9506	50 %	0 %	50 %	0 %	157149626
29	NC_009796	AT	3	6	9849	9854	50 %	50 %	0 %	0 %	157149623
30	NC_009796	AT	3	6	9885	9890	50 %	50 %	0 %	0 %	157149623
31	NC_009796	AG	3	6	10435	10440	50 %	0 %	50 %	0 %	157149623
32	NC_009796	AT	3	6	10656	10661	50 %	50 %	0 %	0 %	157149632
33	NC_009796	TA	3	6	10684	10689	50 %	50 %	0 %	0 %	157149632
34	NC_009796	TA	3	6	11435	11440	50 %	50 %	0 %	0 %	157149613
35	NC_009796	CT	4	8	11530	11537	0 %	50 %	0 %	50 %	157149613
36	NC_009796	TC	4	8	12103	12110	0 %	50 %	0 %	50 %	157149618
37	NC_009796	TG	3	6	13230	13235	0 %	50 %	50 %	0 %	157149621
38	NC_009796	TG	3	6	13920	13925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009796	TA	3	6	14016	14021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009796	GA	3	6	15649	15654	50 %	0 %	50 %	0 %	157149624
41	NC_009796	AG	3	6	15741	15746	50 %	0 %	50 %	0 %	157149624
42	NC_009796	AG	3	6	15864	15869	50 %	0 %	50 %	0 %	157149624
43	NC_009796	AT	3	6	16022	16027	50 %	50 %	0 %	0 %	157149624
44	NC_009796	AC	3	6	16033	16038	50 %	0 %	0 %	50 %	157149624
45	NC_009796	GA	3	6	16425	16430	50 %	0 %	50 %	0 %	157149624

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.