MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009795	TTTA	2	8	103	110	25 %	75 %	0 %	0 %	157149597
2	NC_009795	TTAT	2	8	488	495	25 %	75 %	0 %	0 %	157149597
3	NC_009795	GTAT	2	8	1177	1184	25 %	50 %	25 %	0 %	157149597
4	NC_009795	AAAT	2	8	1487	1494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009795	AGTC	2	8	1741	1748	25 %	25 %	25 %	25 %	157149586
6	NC_009795	ACCA	2	8	1911	1918	50 %	0 %	0 %	50 %	157149586
7	NC_009795	TTAT	2	8	2129	2136	25 %	75 %	0 %	0 %	157149586
8	NC_009795	CAAG	2	8	2337	2344	50 %	0 %	25 %	25 %	157149592
9	NC_009795	AAGG	2	8	2856	2863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009795	TAGC	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	157149590
11	NC_009795	AAAT	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	157149590
12	NC_009795	AGCT	2	8	4115	4122	25 %	25 %	25 %	25 %	157149590
13	NC_009795	TAAA	2	8	4283	4290	75 %	25 %	0 %	0 %	157149590
14	NC_009795	AGAT	2	8	4973	4980	50 %	25 %	25 %	0 %	157149588
15	NC_009795	TAAA	2	8	4994	5001	75 %	25 %	0 %	0 %	157149588
16	NC_009795	GTAT	2	8	5432	5439	25 %	50 %	25 %	0 %	157149588
17	NC_009795	CAAA	2	8	5603	5610	75 %	0 %	0 %	25 %	157149588
18	NC_009795	TAAA	2	8	5933	5940	75 %	25 %	0 %	0 %	157149588
19	NC_009795	AGAT	2	8	6875	6882	50 %	25 %	25 %	0 %	157149588
20	NC_009795	ATAG	2	8	7360	7367	50 %	25 %	25 %	0 %	157149588
21	NC_009795	ATCT	2	8	7441	7448	25 %	50 %	0 %	25 %	157149588
22	NC_009795	AAAG	2	8	7859	7866	75 %	0 %	25 %	0 %	157149588
23	NC_009795	AAGA	2	8	8142	8149	75 %	0 %	25 %	0 %	157149588
24	NC_009795	GCAA	2	8	8156	8163	50 %	0 %	25 %	25 %	157149588
25	NC_009795	AACA	2	8	9042	9049	75 %	0 %	0 %	25 %	157149588
26	NC_009795	CTAT	2	8	9280	9287	25 %	50 %	0 %	25 %	157149588
27	NC_009795	AAAG	2	8	10089	10096	75 %	0 %	25 %	0 %	157149609
28	NC_009795	TATC	2	8	10684	10691	25 %	50 %	0 %	25 %	157149604
29	NC_009795	AGTA	2	8	10840	10847	50 %	25 %	25 %	0 %	157149604
30	NC_009795	ACAA	2	8	11012	11019	75 %	0 %	0 %	25 %	157149604
31	NC_009795	TTTG	2	8	11640	11647	0 %	75 %	25 %	0 %	157149611
32	NC_009795	TATT	2	8	12398	12405	25 %	75 %	0 %	0 %	157149608
33	NC_009795	TAAA	2	8	12583	12590	75 %	25 %	0 %	0 %	157149608
34	NC_009795	TAAA	2	8	13158	13165	75 %	25 %	0 %	0 %	157149579
35	NC_009795	ATTT	2	8	13602	13609	25 %	75 %	0 %	0 %	157149580
36	NC_009795	CAGA	2	8	13758	13765	50 %	0 %	25 %	25 %	157149580
37	NC_009795	AAGA	2	8	13876	13883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009795	TAGA	2	8	14478	14485	50 %	25 %	25 %	0 %	157149610
39	NC_009795	ATGA	2	8	14537	14544	50 %	25 %	25 %	0 %	157149610
40	NC_009795	TGGA	2	8	14792	14799	25 %	25 %	50 %	0 %	157149610
41	NC_009795	TAAA	2	8	14814	14821	75 %	25 %	0 %	0 %	157149610
42	NC_009795	CAAT	2	8	15551	15558	50 %	25 %	0 %	25 %	157149583
43	NC_009795	GATG	2	8	15735	15742	25 %	25 %	50 %	0 %	157149583
44	NC_009795	TAAA	2	8	15944	15951	75 %	25 %	0 %	0 %	157149583
45	NC_009795	AGAT	2	8	15989	15996	50 %	25 %	25 %	0 %	157149583
46	NC_009795	AACA	2	8	16245	16252	75 %	0 %	0 %	25 %	157149583
47	NC_009795	ATAA	2	8	16588	16595	75 %	25 %	0 %	0 %	157149583
48	NC_009795	TCTA	2	8	17600	17607	25 %	50 %	0 %	25 %	157149583
49	NC_009795	AATA	2	8	18156	18163	75 %	25 %	0 %	0 %	157149583
50	NC_009795	GATA	2	8	18207	18214	50 %	25 %	25 %	0 %	157149583
51	NC_009795	GCTC	2	8	18521	18528	0 %	25 %	25 %	50 %	157149606
52	NC_009795	CCTG	2	8	18841	18848	0 %	25 %	25 %	50 %	157149594
53	NC_009795	TTGA	2	8	19193	19200	25 %	50 %	25 %	0 %	157149594
54	NC_009795	CTGG	2	8	19202	19209	0 %	25 %	50 %	25 %	157149594
55	NC_009795	ATTG	2	8	19210	19217	25 %	50 %	25 %	0 %	157149594
56	NC_009795	TTTA	2	8	19493	19500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009795	AACA	2	8	19592	19599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009795	AAAG	2	8	20616	20623	75 %	0 %	25 %	0 %	157149584
59	NC_009795	TTTC	2	8	20668	20675	0 %	75 %	0 %	25 %	157149584
60	NC_009795	TAGC	2	8	20888	20895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009795	TGCA	2	8	20899	20906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009795	ACCC	2	8	21014	21021	25 %	0 %	0 %	75 %	157149595
63	NC_009795	TTAT	2	8	21073	21080	25 %	75 %	0 %	0 %	157149595
64	NC_009795	CAAG	2	8	21473	21480	50 %	0 %	25 %	25 %	157149595
65	NC_009795	TGAG	2	8	21878	21885	25 %	25 %	50 %	0 %	157149595
66	NC_009795	ATTT	2	8	22364	22371	25 %	75 %	0 %	0 %	157149585
67	NC_009795	ATAG	2	8	23204	23211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009795	TTTG	2	8	23858	23865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009795	TCTT	2	8	23939	23946	0 %	75 %	0 %	25 %	157149603
70	NC_009795	TTGT	2	8	24515	24522	0 %	75 %	25 %	0 %	157149593
71	NC_009795	TCTT	2	8	24799	24806	0 %	75 %	0 %	25 %	157149591
72	NC_009795	TTTA	2	8	24948	24955	25 %	75 %	0 %	0 %	157149591
73	NC_009795	ATTT	2	8	25361	25368	25 %	75 %	0 %	0 %	157149591
74	NC_009795	TTTA	2	8	25935	25942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009795	ATAG	2	8	26258	26265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009795	TGAG	2	8	26604	26611	25 %	25 %	50 %	0 %	157149589
77	NC_009795	TTTA	2	8	26669	26676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009795	TGTT	2	8	26838	26845	0 %	75 %	25 %	0 %	157149582
79	NC_009795	ATAA	2	8	27748	27755	75 %	25 %	0 %	0 %	157149582
80	NC_009795	TTCA	2	8	28196	28203	25 %	50 %	0 %	25 %	157149587
81	NC_009795	AAAG	2	8	28345	28352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009795	GATA	2	8	28677	28684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009795	ATTA	2	8	30245	30252	50 %	50 %	0 %	0 %	157149601
84	NC_009795	GCAA	2	8	30494	30501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009795	CTTT	2	8	30592	30599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009795	GTTT	2	8	30616	30623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.