MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 plasmid pCKO2

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009794	GAA	3	9	14	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149317
2	NC_009794	TCG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149317
3	NC_009794	AGG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149317
4	NC_009794	CCG	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149317
5	NC_009794	GGA	2	6	159	164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149317
6	NC_009794	CAG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149318
7	NC_009794	CTG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149318
8	NC_009794	TGC	2	6	335	340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149318
9	NC_009794	AAC	2	6	361	366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149318
10	NC_009794	CGG	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149318
11	NC_009794	GGT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149318
12	NC_009794	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149318
13	NC_009794	GGC	2	6	533	538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149319
14	NC_009794	CTG	2	6	560	565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
15	NC_009794	GGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149319
16	NC_009794	GGC	2	6	804	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149319
17	NC_009794	CTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
18	NC_009794	TAC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149319
19	NC_009794	GTG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149319
20	NC_009794	CAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149319
21	NC_009794	AGC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
22	NC_009794	GCA	3	9	1241	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
23	NC_009794	GCC	2	6	1338	1343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149319
24	NC_009794	CTG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
25	NC_009794	TGC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149319
26	NC_009794	AGC	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
27	NC_009794	CAG	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
28	NC_009794	ACT	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149319
29	NC_009794	CAG	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
30	NC_009794	GCA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149319
31	NC_009794	TGA	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149321
32	NC_009794	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149321
33	NC_009794	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149321
34	NC_009794	CAG	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149321
35	NC_009794	CTG	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149321
36	NC_009794	GTG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149321
37	NC_009794	ACG	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149322
38	NC_009794	TGC	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149322
39	NC_009794	GCC	2	6	3023	3028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149322
40	NC_009794	CGC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149322
41	NC_009794	ACA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149323
42	NC_009794	TAT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149323
43	NC_009794	CAG	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149323
44	NC_009794	TAA	2	6	3197	3202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149324
45	NC_009794	ATA	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149324
46	NC_009794	ATC	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149324
47	NC_009794	AGC	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149324
48	NC_009794	TAC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149324
49	NC_009794	GTA	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149324
50	NC_009794	ATA	3	9	3615	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149325
51	NC_009794	AGC	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149325
52	NC_009794	TTC	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149325
53	NC_009794	TTC	2	6	3761	3766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149325
54	NC_009794	TGT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149325
55	NC_009794	TGT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149325
56	NC_009794	TAA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149325
57	NC_009794	TGC	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149325
58	NC_009794	CGT	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149326
59	NC_009794	CAT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149326
60	NC_009794	TAA	2	6	4177	4182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149326
61	NC_009794	TTC	2	6	4313	4318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149326
62	NC_009794	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149326
63	NC_009794	AGG	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149327
64	NC_009794	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149327
65	NC_009794	TCT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149327
66	NC_009794	GCT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149329
67	NC_009794	GAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149329
68	NC_009794	GCA	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149329
69	NC_009794	CAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149329
70	NC_009794	GCC	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149328
71	NC_009794	TCC	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149328

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.