MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 plasmid pCKO3

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009793	TTA	2	6	185	190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149301
2	NC_009793	GCT	2	6	201	206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149301
3	NC_009793	GGA	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149301
4	NC_009793	CCA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
5	NC_009793	CGG	2	6	377	382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149302
6	NC_009793	TCC	2	6	392	397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149302
7	NC_009793	ATC	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149302
8	NC_009793	ACC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
9	NC_009793	TCG	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149302
10	NC_009793	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149302
11	NC_009793	CAC	2	6	787	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149302
12	NC_009793	ATG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149302
13	NC_009793	TCC	2	6	845	850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149302
14	NC_009793	AAC	2	6	920	925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149303
15	NC_009793	TGC	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149303
16	NC_009793	TCG	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149303
17	NC_009793	GCG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149303
18	NC_009793	CAG	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149303
19	NC_009793	CCA	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149303
20	NC_009793	CCG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
21	NC_009793	GCC	2	6	1494	1499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
22	NC_009793	CCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149303
23	NC_009793	ATC	3	9	1638	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149304
24	NC_009793	CGC	2	6	1658	1663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
25	NC_009793	CTG	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
26	NC_009793	CCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149304
27	NC_009793	CGG	2	6	1915	1920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149304
28	NC_009793	CGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
29	NC_009793	CAG	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
30	NC_009793	ATG	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149304
31	NC_009793	TCG	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
32	NC_009793	GCC	3	9	2307	2315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
33	NC_009793	CGC	3	9	2436	2444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
34	NC_009793	CTG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149304
35	NC_009793	CGC	2	6	2496	2501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149304
36	NC_009793	CAG	2	6	2568	2573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
37	NC_009793	CAG	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
38	NC_009793	GCG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149304
39	NC_009793	ACC	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149304
40	NC_009793	TGG	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149304
41	NC_009793	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
42	NC_009793	AGC	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
43	NC_009793	CAG	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
44	NC_009793	GCA	2	6	3143	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149304
45	NC_009793	TAA	2	6	3151	3156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149304
46	NC_009793	TAT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149304
47	NC_009793	GGC	3	9	3665	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149305
48	NC_009793	GTG	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149305
49	NC_009793	CAC	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149305
50	NC_009793	GGA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149305
51	NC_009793	GGC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149305
52	NC_009793	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149305
53	NC_009793	AGC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149305
54	NC_009793	TGC	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149305
55	NC_009793	ATC	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149306
56	NC_009793	CTG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149306
57	NC_009793	GCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149306
58	NC_009793	AGG	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149307
59	NC_009793	AGA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149307
60	NC_009793	TTA	2	6	5420	5425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149308
61	NC_009793	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149308
62	NC_009793	CAC	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149308
63	NC_009793	ACC	4	12	5743	5754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
64	NC_009793	AAT	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149309
65	NC_009793	ATC	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
66	NC_009793	CAG	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
67	NC_009793	AGC	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
68	NC_009793	CTG	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149309
69	NC_009793	TCC	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149309
70	NC_009793	ACC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
71	NC_009793	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149309
72	NC_009793	CCA	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149309
73	NC_009793	TGC	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149309
74	NC_009793	CAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
75	NC_009793	ATC	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149309
76	NC_009793	GCA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149309
77	NC_009793	CAA	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149310
78	NC_009793	GTT	2	6	7557	7562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149310
79	NC_009793	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149310
80	NC_009793	GCA	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149312
81	NC_009793	ACA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149311
82	NC_009793	ATG	2	6	7825	7830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149311
83	NC_009793	GCA	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
84	NC_009793	CAG	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
85	NC_009793	GCA	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149311
86	NC_009793	TTC	2	6	8413	8418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149315
87	NC_009793	GAA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149315
88	NC_009793	CCG	2	6	8548	8553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149315
89	NC_009793	AAC	2	6	8587	8592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149315
90	NC_009793	ACG	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149314
91	NC_009793	GCG	2	6	8752	8757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149314
92	NC_009793	ATG	2	6	8852	8857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149314
93	NC_009793	TGA	2	6	8859	8864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149314
94	NC_009793	TAA	2	6	8929	8934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149314

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.